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一種?;o酶a合成酶及其應(yīng)用的制作方法

文檔序號:462688閱讀:725來源:國知局
一種酰基輔酶a合成酶及其應(yīng)用的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了一種?;o酶A合成酶及其應(yīng)用,其氨基酸序列如SEQ?ID?NO.1所示。進一步構(gòu)建能夠分泌?;o酶A合成酶的基因工程菌,利用重組菌發(fā)酵生產(chǎn)?;o酶A合成酶。本發(fā)明提供的酰基輔酶A合成酶是迄今為止所發(fā)現(xiàn)的第一個對反式8-甲基-6-壬烯酸或8-甲基壬酸有活性的酶,可為克隆辣椒素合成酶基因提供直接底物。本發(fā)明提供的酰基輔酶A合成酶對中鏈脂肪酸有活性,還可用于生物柴油領(lǐng)域。
【專利說明】一種?;o酶A合成酶及其應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及一種酰基輔酶A合成酶及其應(yīng)用,屬于酶工程【技術(shù)領(lǐng)域】。
【背景技術(shù)】
[0002]辣椒素,學(xué)名反式-8-甲基-N-香草基-壬烯酰胺,是辣胡椒(辣椒屬)的一種具有刺激性味道的次生代謝產(chǎn)物。辣椒素是由辣椒素合成酶(CS )合成的,辣椒素合成酶是一種?;D(zhuǎn)移酶。雖然編碼CS的基因目前尚未被破譯,但已知其主要作用是從8-甲基壬烯酰輔酶A上將8-甲基壬烯酰基轉(zhuǎn)移到香草胺上,從而形成酰胺復(fù)合物。CS的底物,8-甲基壬烯酰是在?;o酶A合成酶(ACS)的作用下,由反式-8-甲基-6壬酰酸轉(zhuǎn)化而來。
[0003]ACS催化羧酸轉(zhuǎn)變?yōu)橄鄳?yīng)?;o酶A硫酯的過程共經(jīng)歷兩個階段。第一階段,自由脂肪酸被轉(zhuǎn)變?yōu)橐环N可以釋放焦磷酸鹽的?;?AMP中間產(chǎn)物。第二階段,活化的酰基基團被連接到輔酶A的巰基上,并釋放AMP和酰基輔酶A產(chǎn)物(Groot et al.,1976)。ACS和一些相關(guān)蛋白被認(rèn)為是具有一段高度保守的12氨基酸序列,這一序列可以形成連接AMP連接主體的核心(PR0SITTEPS00455)。在阿拉伯芥的植物模型中,約有44個假定的ACS基因已被鑒定(Shockey et al.,2003)。目前,約有一半的生物化學(xué)功能已被鑒定,其中包括長鏈?;o酶A合成酶,?;?ACP合成酶,4-香豆酰基輔酶A連接酶,乙?;o酶A合成酶,0PC-8:0輔酶A連接酶,琥珀酰苯甲酰輔酶A連接酶,丙二酰輔酶A合成酶,草酰輔酶A合成酶(Shockey et al., 2003;Ko0., 2005;Koo et al., 2006;Kim et al., 2008;Lin andOliver, 2008;Chen et al.,2011 ;Foster et al.,2012)。在甜辣椒中,三種全長的假定ACS基因已被克隆(Lee et al., 2001;Mazourek et al.,2009)。然而,上述蛋白質(zhì)的生物化學(xué)功能尚未得到鑒定。
[0004]由于辣胡椒的基因組序列尚不可用, 申請人:使用RNA測序技術(shù)對印度鬼椒的綠色果實進行了轉(zhuǎn)錄物組分析。印度鬼椒是羊草與蓬蒿菊的一種雜交體。 申請人:通過對原RNA序列數(shù)據(jù)的重疊組裝獲得18987重疊群,其中有33種編碼與?;o酶A合成酶類似的蛋白質(zhì)。在這些重疊群中,Comp2147-l顯示了與CaSIG4能夠很好地匹配。CaSIG4是一種來自甜辣椒的病原體誘導(dǎo)型的cDNA編碼的假定?;o酶A合成酶(Lee et al.,2001 )。除此以外,Comp66462 和 Comp79520 能夠與辣椒 ACSl (GenBank:EU616571)匹配,Compl67_c0, Comp 167_Cl和Comp46218能夠與辣椒ACS2 (GenBank:EU616572)匹配。ACSl和ACS2是兩種酰基輔酶A合成酶從質(zhì)體中轉(zhuǎn)運脂肪酸的候選物(Mazourek et al.,2009)。
[0005]在本發(fā)明中, 申請人:提供的ACSl是一種中/長鏈?;o酶A合成酶,可以將反式-8-甲基-6-壬烯酸轉(zhuǎn)化到相關(guān)8-甲基壬烯基輔酶A上,是一種辣椒素生物合成途徑中關(guān)鍵的中間產(chǎn)物。

【發(fā)明內(nèi)容】
[0006]本發(fā)明提供了一種?;o酶A合成酶,氨基酸序列如SEQ ID N0.1所示。
[0007]本發(fā)明還提供了一種含有酰基輔酶A合成酶基因工程菌的構(gòu)建方法,包含如下步驟:
[0008](I)利用ACSl-sumo-F和ACSl-sumo-R引物擴增印度鬼椒綠色果實的ACSl基因;
[0009](2)將步驟(1)所得基因PCR擴增并純化后,連接到線性化的pETite N-His SUMOKan表達(dá)載體上,得到重組質(zhì)粒;
[0010](3)將步驟(2)所得的重組質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌H1-controllOG細(xì)胞中,得到基因工程菌。
[0011]本發(fā)明還提供了一種發(fā)酵生產(chǎn)?;o酶A合成酶的方法,是將?;o酶A合成酶在微生物中表達(dá),收集發(fā)酵產(chǎn)物中的?;o酶A合成酶。
[0012]進一步,本發(fā)明提供的生產(chǎn)?;o酶A合成酶的方法,包含如下步驟:
[0013](I)利用ACSl-sumo-F和ACSl-sumo-R引物擴增印度鬼椒綠色果實的ACSl基因;
[0014](2)將步驟(1)所得基因PCR擴增并純化后,連接到線性化的pETite N-His SUMOKan表達(dá)載體上,得到重組質(zhì)粒;
[0015](3)將步驟(2)所得的重組質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌H1-controllOG細(xì)胞中,得到基因工程菌;
[0016](4)利用步驟(3)所得的基因工程菌發(fā)酵生產(chǎn)?;o酶A合成酶。
[0017]本發(fā)明還提供了一種?;o酶A合成酶的應(yīng)用,其特征在于,是將?;o酶A合成酶在微生物中表達(dá),收集發(fā)酵產(chǎn)物中的?;o酶A合成酶,使底物轉(zhuǎn)化為?;o酶A。
[0018]所述底物為中長鏈脂肪酸。
[0019]所述底物為反式8-甲基-6-壬烯酸或8-甲基壬酸。
[0020]本發(fā)明提供了一種新的?;o酶A合成酶,可為辣椒素合成酶提供底物。所述新酶也可在生物燃料工業(yè)中用于制備中等鏈長的脂肪酸衍生物。
[0021]ACSl 一個重要性在于,通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)可使其具有潛在的調(diào)節(jié)植物中辣椒素水平的作用。通過ACSl的過度表達(dá)實現(xiàn)提高辣椒植物中辣椒素含量水平。通過敲除或敲低ACSl基因,降低辣椒植物的辣椒素含量水平。
[0022]天然辣椒中除積累辣椒素,二氫辣椒素外,還生產(chǎn)其它許多不同側(cè)鏈長度的辣椒素類似物(7-11個碳原子)。ACSl可以為辣椒素合成酶(CS)提供不同鏈長的?;o酶A,從而控制辣椒素類似物的結(jié)構(gòu)。在當(dāng)今的生物燃料工業(yè)中,中鏈酰基輔酶A合成酶有廣泛的應(yīng)用。因此,ACSl具有在生物燃料工業(yè)中應(yīng)用的前景。
[0023]所述?;o酶A合成酶基因可以通過細(xì)菌或酵母的細(xì)胞體系表達(dá)。所述ACS基因可以來自鬼椒ACSl、擬南芥的LCAS4和LCAS5基因,或其他來源。
[0024]本發(fā)明有益效果:本發(fā)明所提供的?;o酶A合成酶對中鏈脂肪酸有活性可用于生物柴油領(lǐng)域,是迄今為止所發(fā)現(xiàn)的第一個對反式8-甲基-6-壬烯酸或8-甲基壬酸有活性的酶,可為克隆辣椒素合成酶基因提供直接底物。
【專利附圖】

【附圖說明】
[0025]圖1 為 His-SUMO-ACSl 在 BL21 (DE3)細(xì)胞中表達(dá)的 SDS-PAGE 圖;
[0026](0,20分別代表1PTG誘導(dǎo)前和誘導(dǎo)20小時后的總蛋白;C為IPTG誘導(dǎo)20小時后可溶性粗蛋白提取物;E1-E4為N1-NTA柱的分離組分)。
[0027]圖2為ACSl對不同羧酸的活性;[0028](C2,乙酸;C4, 丁酸;C6,己酸;C8,辛酸;C10,羊蠟酸;C12,月桂酸;C14,豆蘧酸;C16,棕櫚酸;C18,硬脂酸)。
[0029]圖3為反式8-甲基-6-壬烯酸或8-甲基壬酸作為底物的酶反應(yīng)產(chǎn)物的HPLC譜圖。
[0030]圖4為陰離子模式下對純化后的反式8-甲基-6壬烯基輔酶A的MS/MS分析。
[0031]圖5為陰離子模式下對純化后的8-甲基壬基輔酶A的MS/MS分析。
[0032]圖6為-不同pH緩沖液對ACSl活性的影響;
[0033](- -:Acetate ;- -:Phosphate -:Tris ;_X_:Glycine)0【具體實施方式】
[0034]本發(fā)明公開了一種?;o酶A合成酶及其應(yīng)用,具體實施方案包括構(gòu)建含有?;o酶A合成酶的基因工程菌,微生物體系中?;o酶A合成酶的表達(dá),以及在反應(yīng)體系中加入酶作用底物,利用重組蛋白將底物轉(zhuǎn)化為酰基輔酶A。
[0035]底物為中/長鏈羧酸,其中長鏈羧酸一般為含有16或18個碳原子的羧酸,中等鏈則為含有10或12個碳原子的羧酸。
[0036]實施例1印度鬼椒ACSl基因工程菌的構(gòu)建與表達(dá)
[0037]利用ACSl-sumo-F和ACSl-sumo-R引物擴增印度鬼椒綠色果實的cDNA的ACSl基因,上述兩個引物的序列分別為:CGC GAA CAG ATT GGA GGT GCAACAGATAAAITTATTATTG和GTG GCG GCC GCT CTA TTA TCACTTGGTACCCTTGTACAT。PCR 擴增產(chǎn)物用 1% 的瓊脂糖凝膠純化,并與線性化的pETite N-His SUMO Kan表達(dá)載體混合(Lucigen, Middleton, WI )。通過熱沖擊方法將DNA混合物轉(zhuǎn)化至大腸桿菌H1-controllOG細(xì)胞中(Lucigen)。對插入后的基因進行測序,保證其序列正確。其編碼的氨基酸序列如SEQ ID N0.1所示。將pETiet N-HisSUMO-鬼椒 ACSI 基因轉(zhuǎn)化至 H1-ControI BL21(DE31)細(xì)胞(1^(^8611)中,把8-5.0-4051 的表達(dá)使用0.5mM的IPTG在16°C下,誘導(dǎo)20小時?;旌系鞍踪|(zhì)通過N1-NTA柱進行純化(見圖1)。ACSl 的分子量約為 73.5KDa,His-SUMO tag 的約為 12KDa。His-SUMO-鬼椒的 ACSl混合蛋白質(zhì)在SDS-PAGE中的遷移接近預(yù)測(85KDa,見圖1)。
[0038]實施例2ACS1活性測定
[0039]利用HPLC測定鬼椒ACSl的活性(Chen et al.,2011)。具體為,反應(yīng)混合體系(400yL)包括 0.1M 的 Tris-HCl,pH7.5,2mM 的 DTT,5mM ATP, IOmM MgC12, 0.5mM CoA,0.1%的三硝基甲苯和200 μ M羧酸。反應(yīng)通過添加20 μ L的純化酶開始,反應(yīng)30分鐘后添加20 μ L 乙酸終止反應(yīng)。HPLC 使用 Dioncx-UkiMatc1<:.3000LC 系統(tǒng)(Thermo Scientific),采
用 Acclaim? 120C18 反相色譜柱(Thermo Scientific ;3 μ , 120A, 150x3mm)。移動相的組成
有溶劑A (0.1%的三氟乙酸)和溶劑B (乙腈)。梯度洗脫的程序如下:0到5分鐘,5%溶劑B ;5到9分鐘,溶劑B濃度從5%到80%線性增加;9到11分鐘,溶劑B濃度80% ;11到12分鐘,溶劑B濃度5%。流速為0.6mL/min。二極管陣列檢測器的檢測范圍為200到400nm。底物和產(chǎn)物的定性定量通過計算257nm下譜峰的面積獲得。結(jié)果顯示:ACS1酶當(dāng)以8-甲基壬酸為底物時的Km值為0.57mM,Vmax值為0.14 μ mol/min/mg; ACSl酶當(dāng)以(6E)_8_甲基-6-壬烯酸為底物時的Km值為0.49mM, Vmax值為0.1214 μ mol/min/mg。
[0040]實施例3ACS作用底物的選擇[0041]在酶反應(yīng)體系中分別添加5mM乙酸、丁酸、己酸、辛酸、羊蠟酸、月桂酸、豆蘧酸、棕櫚酸和硬脂酸。
[0042]如圖2所示,在不同底物中,印度鬼椒ACSl最高活性是羊蠟酸。相反地,ACSl對乙酸和丁酸沒有任何活性。
[0043]實施例4酰基輔酶A的生產(chǎn)
[0044]利用辣椒素生物合成途徑中內(nèi)生的中間產(chǎn)物反式-8-甲基-6壬酸(6E)和8_甲基壬酸(8M),作為底物,生產(chǎn)?;o酶A。
[0045]如圖3所示,ACSl在以上述兩物質(zhì)為底物的測量中,對6E的活性較高。收集了相應(yīng)的HPLC分離峰,利用SpeedVac集中器干燥后,用MS/MS做進一步分析。
[0046]每個干燥樣品使用40 μ L甲醇:水:乙腈比例為1: 1:2的緩沖溶液。用TriVersa Nanomatcli (Advion, Ithaca, NY)直接注入 10 μ L。質(zhì)譜儀(LTQ-QrbitrapVelo (Thermo Fisher Scientif ic, Waltham, MA))采用陰離子模式進行。質(zhì)量掃描的范圍是300-2000m/zo分辨率設(shè)為60000@400m/z。CID破碎采用MS/MS,檢測采用分離窗口 1.5m/z的分離阱。破碎用歸一化碰撞能量的35%。如圖4和圖5所示,質(zhì)譜數(shù)據(jù)與反式-8-甲基-6-壬烯基輔酶A和8-甲基壬基輔酶A的分子量相吻合。
[0047]實施例5酰基輔酶A合成酶的pH穩(wěn)定性
[0048]采用乙酸鹽,磷酸鹽,Tris和甘氨酸/NaOH緩沖溶液,調(diào)節(jié)pH4.0至10.5,測定生產(chǎn)的?;o酶A合成酶的p H穩(wěn)定性。結(jié)果如圖6所示,ACSl的最適pH為9.5。
【權(quán)利要求】
1.一種酰基輔酶A合成酶,其特征在于,氨基酸序列如SEQ ID N0.1所示。
2.一種含有權(quán)利要求1所述酰基輔酶A合成酶基因工程菌的構(gòu)建方法,其特征在于,步驟如下: (1)利用ACSl-sumo-F和ACSl_sumo-R引物擴增印度鬼椒綠色果實的ACSl基因; (2)將步驟(1)所得基因PCR擴增并純化后,連接到線性化的pETiteN-His SUMO Kan表達(dá)載體上,得到重組質(zhì)粒; (3)將步驟(2)所得的重組質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌H1-controllOG細(xì)胞中,得到基因工程菌。
3.—種權(quán)利要求1所述?;o酶A合成酶的生產(chǎn)方法,其特征在于,是將氨基酸序列如SEQ ID N0.1所示的?;o酶A合成酶在微生物中表達(dá),收集發(fā)酵產(chǎn)物中的?;o酶A合成酶。
4.權(quán)利要求3所述方法,其特征在于,步驟如下: (1)利用ACSl-sumo-F和ACSl_sumo-R引物擴增印度鬼椒綠色果實的ACSl基因; (2)將步驟(1)所得基因PCR擴增并純化后,連接到線性化的pETiteN-His SUMO Kan表達(dá)載體上,得到重組質(zhì)粒; (3)將步驟(2)所得的重組質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌H1-controllOG細(xì)胞中,得到基因工程菌; (4)利用步驟(3)所得的基因工程菌發(fā)酵生產(chǎn)酰基輔酶A合成酶。
5.權(quán)利要求1所述酰基輔酶A合成酶的應(yīng)用,其特征在于,是將酰基輔酶A合成酶在微生物中表達(dá),收集發(fā)酵產(chǎn)物中的?;o酶A合成酶,使底物轉(zhuǎn)化為?;o酶A。
6.權(quán)利要求5所述方法,其特征在于,所述底物為中長鏈脂肪酸。
7.權(quán)利要求5所述方法,其特征在于,所述底物為反式8-甲基-6-壬烯酸或8-甲基壬酸。
【文檔編號】C12N15/70GK103725652SQ201310728420
【公開日】2014年4月16日 申請日期:2013年12月25日 優(yōu)先權(quán)日:2013年12月25日
【發(fā)明者】陳輝, 王泓雪, 余曉丹 申請人:無錫新和源發(fā)酵技術(shù)研究院有限公司
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