本發(fā)明涉及結核病進展預測的標志物及應用，具體涉及兩種結核病進展預測用可變剪接標志物及其應用。

背景技術：

1、結核病是全球十大死因之一，疾病負擔位居世界前列。潛伏感染人群(ltbi)約17億，約占全球總人數的1/4，是造成上述結核病高負擔的主要原因。精準預測潛伏感染者的疾病進展是切斷結核病傳染源、防控結核病的關鍵所在。實驗室檢測是結核病防控的重要手段，但目前臨床上仍缺乏有效預測潛伏感染者疾病進展的標志物及對應方法。

2、宿主來源的轉錄組標志物被證實能夠反映結核病的發(fā)生發(fā)展，并且檢測成本低，周期短，是廣受關注的結核病新型標志物?，F有轉錄組標志物主要基于“表達量變化”進行篩選，忽略了基因內部異質性帶來的影響。可變剪接將一個基因視為多個不同的轉錄本，分析了不同轉錄本組成、表達及其間比例的變化，能夠從多角度反映結核病的發(fā)生發(fā)展，具有作為高敏感度標志物的特性。

3、為此，本發(fā)明旨在提供一種結核病進展預測用可變剪接標志物及其應用，以解決上述問題。

技術實現思路

1、本發(fā)明的目的是為了解決上述問題，提供一種結核病進展預測用可變剪接標志物及其應用，通過聯合大量高通量測序數據的生物信息學分析和體外實驗，挖掘并確定與潛伏性結核病以及進展性結核病密切相關的可變剪接標志物，為結核病進展預測以及診斷提供高效能的新工具。

2、為了達到上述目的，本發(fā)明的技術方案如下：

3、本發(fā)明提供了一種結核病進展預測用可變剪接標志物，所述可變剪接標志物為dnase1l2-ir和phf11-ir。

4、本發(fā)明提供了一種結核病進展預測用可變剪接標志物的應用，利用19個公共數據集的1729個樣本構建健康對照隊列(hc)、潛伏結核病隊列(ltbi)以及進展性結核病隊列；

5、應用irfinder(v?1.3.1)進行內含子保留事件ir分析，并篩選具有結核病進展預測潛能的差異可變剪接事件，相較于健康對照組，ltbi組中dnase1l2-ir發(fā)生比值顯著增加padj＝0.010，但其程度低于進展性結核病組padj＝0.007，而phf11-ir則是在ltbi顯著下調padj＝0.004，且其程度低于進展性結核病組padj＝0.0001；

6、dnase1l2-ir和phf11-ir用于預測結核病進展。

7、與現有技術相比，本方案的有益效果：

8、1.傳統(tǒng)轉錄組標志物主要通過基因整體表達量這一個角度進行篩選，本發(fā)明通過可變剪接把一個基因看成多個轉錄本，提高了研究的精細度；

9、2.本發(fā)明通過整合大量測序數據的生物信息學分析和體外實驗，已明確dnase1l2-ir和phf11-ir是ltbi和進展結核病的關鍵剪接事件，其剪接動力學有助于評估ltbi和tb的進展；聯合多種機器算法進一步整合兩個可變剪接事件，進一步提高對結核病的診斷性能；

10、3.本發(fā)明中涉及的可變剪接事件，在臨床中能夠使用qpcr進行檢測，qpcr的檢測周期短，成本低，精度相對高，因此本發(fā)明更容易在結核病高發(fā)的地區(qū)開展推廣；

11、4.本發(fā)明檢測可變剪接所使用的樣本類型為外周血，受取樣因素相對較小(相比結核病常用的痰液樣本來講)，且易獲得，易保存和運輸。

技術特征：

1.一種結核病進展預測用可變剪接標志物，其特征是：所述可變剪接標志物為dnase1l2-ir和phf11-ir。

2.如權利要求1所述的一種結核病進展預測用可變剪接標志物的應用，其特征是：所述可變剪接標志物用于預測結核病進展。

3.如權利要求2所述的一種結核病進展預測用可變剪接標志物的應用，其特征是：利用19個公共數據集的1729個樣本構建健康對照隊列hc、潛伏結核病隊列l(wèi)tbi以及進展性結核病隊列；

技術總結
本發(fā)明公開了一種結核病進展預測用可變剪接標志物及其應用，涉及結核病進展預測的標志物及應用技術領域，其技術要點為：所述可變剪接標志物為DNASE1L2?IR和PHF11?IR，所述標志物用于預測結核病進展；本發(fā)明通過聯合大量高通量測序數據的生物信息學分析和體外實驗，挖掘并確定與潛伏性結核病以及進展性結核病密切相關的可變剪接標志物，為結核病進展預測提供高效能的新工具。

技術研發(fā)人員：呂夢媛,應斌武,阮紅霞
受保護的技術使用者：四川大學華西醫(yī)院
技術研發(fā)日：
技術公布日：2025/1/9