本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域,具體是涉及基于磁珠的蠟樣芽孢桿菌分離方法。
背景技術(shù):
蠟樣芽孢桿菌是一種產(chǎn)芽孢的革蘭氏陽性菌,廣泛分布于土壤、灰塵和水中,因此很容易污染各類食品,是常見的食品污染菌和條件致病菌。食品在20℃以上的條件下放至時,蠟樣芽孢桿菌能迅速繁殖并產(chǎn)生腸毒素,同時,由于本菌不分解蛋白質(zhì),因此,食品在感官上無明顯變化,無異味,很容易誤食而發(fā)生食物中毒。因蠟樣芽孢桿菌污染引起食物中毒事件顯示,多數(shù)是由剩米飯、米粉、剩菜、甜點、肉類制品等富含碳水化合物的食物造成,最常見可導(dǎo)致兩種不同類型的食物中毒:腹瀉型和嘔吐型。鑒于需要建立一種高效,快速的檢測方法,基于功能化的磁性納米粒子的分離技術(shù)在致病菌監(jiān)測中得到了迅速發(fā)展。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
針對現(xiàn)有技術(shù)的缺陷,本發(fā)明的目的是提供一種捕獲效率高、簡便、分離時間短,低梯度磁場下從復(fù)雜基質(zhì)中快速、特異分離目的菌蠟樣芽孢桿菌的方法。
蠟樣芽孢桿菌的快速分離方法,包括以下步驟:(1)吸取2ml的磁珠,加入到8mlph=7.4的滅菌的pbs溶液中,然后在外加磁場的作用下,將對磁珠進行洗滌,重復(fù)3次,將洗滌好的磁珠重懸于10ml滅菌的pbs溶液中;(2)5.8mgedc,溶于290μl滅菌的pbs中,6.5mgnhss,溶于325μl滅菌的pbs中,然后將溶解后的edc和nhss加入到洗滌過的磁珠中,活化1h;(3)將活化后磁珠用滅菌的pbs洗滌3次,重懸于8ml滅菌的pbs溶液中;(4)稱取牛血清白蛋白24mg,溶解到3ml滅菌的pbs溶液中,然后加入到活化后的磁珠溶液中,反應(yīng)3h,然后用滅菌的pbs洗滌3次,重懸于8ml滅菌的pbs溶液中,得到牛血清白蛋白修飾的磁珠;(5)稱取200mg萬古霉素,169.31mgedc和47.98mgnhss,分別溶于滅菌的pbs溶液中,然后混合通過碳化二亞胺法,活化萬古霉素表面羧基,活化10min;(6)將活化后的萬古霉素加入到牛血清白蛋白修飾的磁珠中,孵育6h;(7)反應(yīng)完畢后,用滅菌的pbs洗滌3次,重懸于10ml滅菌的pbs溶液中,得到濃度為2mg/ml的萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物,用于富集蠟樣芽孢桿菌。(8)取10ml待測樣品溶液,加入0.7mg萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物,置于培養(yǎng)箱上,以200rpm的轉(zhuǎn)速37℃孵育45min;插入磁力架分離3min;(9)磁分離后,無菌pbs溶液清洗后,用無菌的pbs緩沖液混重懸即得富集有蠟樣芽孢桿菌-萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物。
所述牛血清白蛋白,其分子量為66000da。
所述磁珠粒徑為180nm,表面羧基。
由于牛血清白蛋白表面有多個氨基,故萬古霉素通過羧基與牛血清白蛋白的氨基相連,也可以牛血清白蛋白的氨基與磁珠表面的羧基相連,然后萬古霉素通過五個氫鍵與蠟樣芽孢桿菌表面的d-丙氨酰-d-丙氨酸(d-ala-d-ala)分子相連。
具體原理見圖1。
本方法適用于從樣品基質(zhì)中的分離目的菌,特別適用從復(fù)雜基質(zhì)中分離目的菌。食品樣品包括各類新鮮或冷凍加工后的食品材質(zhì),如新鮮蔬菜、肉類、海鮮類和奶類等產(chǎn)品。樣品處理按照常規(guī)處理方法即可,如將樣品粉碎后制成待測溶液。
采用本發(fā)明技術(shù)方案具有如下有益效果:
1、本發(fā)明采用的是180nm的磁性納米粒子,主要用于基質(zhì)中目標菌的快速富集,而采用30nm或者50nm納米磁珠結(jié)合樹狀分子的富集方法是用于磁信號的放大。
2、本發(fā)明采用的萬古霉素是傳統(tǒng)的商業(yè)藥物,相比于抗體,具有穩(wěn)定好,成本低,質(zhì)量可控等優(yōu)點?;谏鲜鰞?yōu)點,在單次分離過程中,本發(fā)明構(gòu)建的分離萬古霉素-牛血清白蛋白-磁性納米粒子復(fù)合物在成本上比免疫磁分離陳本降低了195倍;在材料保存方面比免疫磁珠保質(zhì)期也更長。
3、在食品基質(zhì)或者血液中,是多種致病菌共存的環(huán)境。本發(fā)明采用的萬古霉素是廣譜的識別革蘭氏陽性菌的分子識別劑,用于分離基質(zhì)中的革蘭氏陽性菌是一種通用的分離策略,可以將基質(zhì)中的大多數(shù)革蘭氏陽性菌都分離出來,然后通過聚合酶鏈式反應(yīng)(pcr)或者選擇性培養(yǎng)進行鑒別。相比之下,抗體因其只能專一的識別,從而分離出對應(yīng)的目標菌,其他存在于機制中的致病菌無法鑒別。
4、本發(fā)明合成的萬古霉素-牛血清白蛋白-磁性納米粒子復(fù)合物是先將牛血清白蛋白偶聯(lián)到磁性納米粒子的表面,然后再將萬古霉素修飾到牛血清白蛋白-磁性納米粒子表面,相比于萬古霉素先與牛血清白蛋白偶聯(lián)后,再與結(jié)合多聚賴氨酸(pll)修飾磁性納米粒子的方法,本發(fā)明的萬古霉素-牛血清白蛋白-磁性納米粒子復(fù)合物不僅可以達更好的分離效率,而且在材料合成中耗時更短時間和成本更低。
5、本發(fā)明將牛血清白蛋白分子先偶聯(lián)在磁性納米粒子表面,然后再將萬古霉素分子偶聯(lián)于牛血清白蛋白包被的磁性納米粒子上,避免了常規(guī)方法中將萬古霉素分子偶聯(lián)于磁珠表面或者直接將萬古霉素分子直接接在磁性納米粒子表面,導(dǎo)致萬古霉素或者萬古霉素分子活性降低和空間位阻大的缺點。同時牛血清白蛋白作為分子臂具有很好的靈活性,有利于萬古霉素分子與蠟樣芽孢桿菌表面的d-丙氨酰-d-丙氨酸(d-ala-d-ala)分子相連,提高了捕獲效率。相比于直接偶聯(lián)或者借助萬古霉素分子中氨基作為反應(yīng)基團的方法,該方法分離蠟樣芽孢桿菌能力更強,特別適用于復(fù)雜樣品蠟樣芽孢桿菌的分離,如食品樣品、全血樣品等。
6、磁性納米粒子偶聯(lián)萬古霉素時,一般采用疏水吸附或化學(xué)偶聯(lián)方式將具有活性的萬古霉素聯(lián)接在磁性納米粒子表面。萬古霉素與磁性納米粒子表面距離太近,磁性納米粒子本身性質(zhì)及其表面殘留的疏水或強親水基團容易引起萬古霉素空間構(gòu)象發(fā)生改變,導(dǎo)致萬古霉素生物活性下降。然而本實驗方案在偶聯(lián)過程中引入牛血清白蛋白分子,其具有一定的空間長度,從而使萬古霉素分子遠離磁性納米粒子和磁性納米粒子表面,避免了磁性納米粒子本身性質(zhì)及表面對萬古霉素分子的影響。同時,引入牛血清白蛋白卻不會影響萬古霉素分子的空間構(gòu)象,從而起到了保護萬古霉素分子生物活性的作用。
7、本發(fā)明采用牛血清白蛋白分子,提高磁性納米粒子在溶液的穩(wěn)定性,避免發(fā)生沉淀,增加復(fù)合物的水溶性和生物相容性。
附圖說明
圖1本發(fā)明所涉及的磁分離技術(shù)的操作流程圖;
具體實施方式
為了使本發(fā)明更加清楚明白,以下結(jié)合實施例,對本發(fā)明進行進一步詳細說明。應(yīng)當理解,此處所描述的具體實施例僅用以解釋本發(fā)明,并不用于限定本發(fā)明。
磁珠(180nm)購買于上海奧潤有限公司。
牛血清白蛋白66000da,購自于威海晨源化工新材料有限公司。
萬古霉素分子購自于上海阿拉丁有限公司。
n-羥基丁二酰亞胺nhss,乙基3-(3-二甲氨基)碳二亞胺鹽酸鹽edc等均為常規(guī)試劑,不再贅述。
0.01mpbs配制方法:8.0gnacl、0.2gkcl、0.24gkh2po4、1.44gna2hpo4溶解于800ml蒸餾水中,用5mnaoh調(diào)整ph至7.4,再定容至1000ml即得0.01mpbs。
實施例1
1.萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物,按照如下步驟制備:
(1)取2mg磁珠,懸浮于8ml磷酸緩沖液(pbs,0.01mol/l,ph7.4)中,洗滌3次,加5.8mgedc,溶于290μl滅菌的pbs中,6.5mgnhss,溶于325μl滅菌的pbs中,然后將溶解后的edc和nhss加入到洗滌過的磁珠中,活化1h;;
(2)稱取牛血清白蛋白24mg,溶解到3ml滅菌的pbs溶液中,然后加入到活化后的磁珠溶液中,反應(yīng)2h,然后用滅菌的pbs洗滌3次,重懸于8ml滅菌的pbs溶液中,得到牛血清白蛋白修飾的磁珠;
(3)稱取200mg萬古霉素,169.31mgedc和47.98mgnhss,分別溶于滅菌的pbs溶液中,然后混合通過碳化二亞胺法,活化萬古霉素表面羧基,活化10min;將活化后的萬古霉素加入到牛血清白蛋白修飾的磁珠中,孵育6h;
(4)反應(yīng)完畢后,用滅菌的pbs洗滌3次,重懸于10ml滅菌的pbs溶液中,得到濃度為2mg/ml的萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物,用于富集蠟樣芽孢桿菌。
2.富集捕獲:取待測樣品溶液10ml,加入0.7mg萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物,置于混勻儀上,以200rpm的轉(zhuǎn)速室溫孵育45min形成蠟樣芽孢桿菌-萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物復(fù)合物;將離心管插入常規(guī)磁力架分離3min;
3.去離子水輕輕清洗后,用pbs緩沖液混重懸即得富集有蠟樣芽孢桿菌的蠟樣芽孢桿菌-萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物。
實施例2富集效果實驗
(1)取1ml濃度為105cfu/ml的蠟樣芽孢桿菌菌于1.5ml無菌離心管中,12000rpm離心5min,棄上清,用等體積無菌pbs溶液重懸。
(2)富集捕獲:分別設(shè)置本發(fā)明技術(shù)方案組:牛血清白蛋白-磁珠組、萬古霉素-磁珠、萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠組富集目的菌。
(3)磁分離后,將上清液倒入無菌離心管中,而分離出來捕獲有蠟樣芽孢桿菌的萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠則用pbs清洗兩次,混合均勻,并用1ml無菌pbs溶液重懸蠟樣芽孢桿菌-萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠。
(4)捕獲率計算:將各組富集的目的菌重懸液進行梯度稀釋后,用平板對每個梯度計數(shù),通過捕獲效率公式計算目標菌的捕獲效率,每次實驗重復(fù)三次。各組捕獲效率的計算公式如下:[被富集吸附的菌落總數(shù)/(上清液中菌落總數(shù)+被富集吸附的菌落總數(shù))]×100%。
所述各組富集捕獲目的菌的方案如下:
a.本發(fā)明技術(shù)方案組(萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠組)富集捕獲目的菌方案如實施例2,具體如下:
將0.7mg萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物加入到含目標菌離心管中,置于混勻儀上,以200rpm的轉(zhuǎn)速室溫孵育45min。將離心管插入常規(guī)磁力架分離3min。
b.萬古霉素-磁珠組富集捕獲目的菌方案具體如下:
將0.7mg制備好的萬古霉素-磁珠加入到含目標菌離心管中,置于混勻儀上,以200rpm的轉(zhuǎn)速室溫孵育45min。最后,將離心管插入常規(guī)磁力架分離3min。
所述萬古霉素修飾的磁珠制備:(1)取2ml的磁珠,加入到8mlph=7.4的無菌的pbs溶液中,然后在外加磁場的作用下,將對磁珠進行洗滌,重復(fù)3次,將洗滌好的磁珠重懸于10ml無菌的pbs溶液;(2)5.8mgedc,溶于290μl無菌的pbs中,6.5mgnhss,溶于325μl無菌的pbs中,然后將溶解后的edc和nhss加入到洗滌過的磁珠中,活化1h;(3)將活化后磁珠用無菌的pbs洗滌3次,重懸于8ml無菌的pbs溶液中;(4)稱取200mg萬古霉素溶于無菌的pbs溶液中,然后活化好的磁珠孵育2h;(7)反應(yīng)完畢后,用無菌的pbs洗滌3次,重懸于10ml無菌的pbs溶液中,得到濃度為2mg/ml的萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物,用于富集蠟樣芽孢桿菌。
c.牛血清白蛋白-磁珠組
(1)取2ml磁珠,懸浮于8ml磷酸緩沖液(pbs,0.01mol/l,ph7.4)中,洗滌3次,加5.8mgedc,溶于290μl滅菌的pbs中,6.5mgnhss,溶于325μl滅菌的pbs中,然后將溶解后的edc和nhss加入到洗滌過的磁珠中,活化1h;
(2)稱取牛血清白蛋白24mg,溶解到3ml滅菌的pbs溶液中,然后加入到活化后的磁珠溶液中,反應(yīng)2h,然后用滅菌的pbs洗滌3次,重懸于8ml滅菌的pbs溶液中,得到牛血清白蛋白修飾的磁珠;
(3)磁架回收牛血清白蛋白-磁珠,pbs洗滌三次,10mlpbs(ph=7.4),得到濃度為2mg/ml的萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物,用于富集蠟樣芽孢桿菌。
各組捕獲率如下:
實驗結(jié)果表明,萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠組的捕獲效率明顯高于萬古霉素修飾的磁珠組捕獲效率,這說明牛血清白蛋白作為載體分子增加了萬古霉素與目標菌的結(jié)合機會,使得目標菌的表面結(jié)合了更多的納米粒子,因此,在短時間內(nèi)就能分離富集較多的目標菌。牛血清白蛋白-磁珠組的捕獲效率很低,說明牛血清白蛋白同時也能很好的降低非特異性吸附。通過以上三組實驗數(shù)據(jù),說明以牛血清白蛋白作為分子,不僅可以提高分離效率,同時也能很好的降低非特異性吸附。說明用萬古霉素分子來捕獲目標菌具有良好的效果。
實施例3
無菌果汁為樣品待測樣品溶液,加入蠟樣芽孢桿菌調(diào)節(jié)菌落濃度至105cfu/ml備用。
將制備好萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠(0.7mg)分別加入到樣品溶液中,置于混勻儀上,以200rpm的轉(zhuǎn)速室溫孵育45min。然后常規(guī)磁力架分離3min。磁分離后,將上清液倒入無菌離心管中,而分離出來捕獲有蠟樣芽孢桿菌-古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物則用無菌pbs清洗兩次,混合均勻,并用1ml無菌pbs溶液重懸蠟樣芽孢桿菌-萬古霉素-牛血清白蛋白-磁珠復(fù)合物。捕獲率如實施例2方法獲得,其余同實施例2。結(jié)果見表1,表明本方案能高效富集分離樣品中的蠟樣芽孢桿菌。
實施例4
無菌牛奶為樣品待測樣品溶液,加入蠟樣芽孢桿菌調(diào)節(jié)菌落濃度至105cfu/ml。其余同實施例3。
實施例5
無菌飲用水為樣品待測樣品溶液,加入蠟樣芽孢桿菌調(diào)節(jié)菌落濃度至105cfu/ml。
實施例6
待測樣品為無菌全血,加入蠟樣芽孢桿菌調(diào)節(jié)菌落濃度至105cfu/ml。其余同實施例3。
表1不同實際樣品中蠟樣芽孢桿菌分離效果的比較
以上所述僅為本發(fā)明的較佳實施例,并不用以限制本發(fā)明,凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi)所作的任何修改、等同替換和改進等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護范圍之內(nèi)。