本發(fā)明屬于分子標(biāo)記輔助育種,具體涉及與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記、檢測該分子標(biāo)記的引物對及應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、花生作為重要的油料作物之一,含油量是評價高油種質(zhì)的重要指標(biāo)?;ㄉ土繉儆跀?shù)量性狀,表型變異呈連續(xù)性且受多基因控制,通過近紅外儀器檢測時由于花生籽仁間存在空隙導(dǎo)致檢測過程存在誤差,其次花生體內(nèi)油脂成分也會隨時間變化而變化,僅通過物理檢測方法無法真正解析其控制油脂合成機理。因此探究其與高油相關(guān)分子標(biāo)記,對于挖掘花生優(yōu)異遺傳位點,培育高油花生新品種具有重要理論意義。迄今為止已克隆出許多花生品質(zhì)性狀相關(guān)分子標(biāo)記,包括氨基酸、油酸,蔗糖;但對于花生中高油相關(guān)基因的定位鮮有研究?;诨ㄉ蚪M數(shù)據(jù)平臺與高通量測序的發(fā)展和完善,四倍體野生種、四倍體栽培種的全基因組數(shù)據(jù)也可以公開獲取,這就使研究者花生基因組數(shù)據(jù)的掌握越來越完善,使基因的精細(xì)定位和圖位克隆成為可能。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、針對現(xiàn)有技術(shù)中存在的問題,本發(fā)明的目的在于提供與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記、檢測該分子標(biāo)記的引物對及應(yīng)用。
2、為了達(dá)到上述目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:
3、與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記,所述分子標(biāo)記為arahy36753720;其核酸序列如seq?id?no:1所示。
4、上述與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記的應(yīng)用,為a-c中的至少一種;
5、a.?用于制備預(yù)測花生含油量的試劑;
6、b.?用于預(yù)測花生含油量;
7、c.?用于高油含量花生選育。
8、在上述方案的基礎(chǔ)上,所述預(yù)測花生含油量的試劑包含檢測分子標(biāo)記arahy36753720的引物對。
9、在上述方案的基礎(chǔ)上,所述檢測arahy36753720分子標(biāo)記的引物對如seq?id?no:2和seq?id?no:3所示。
10、在上述方案的基礎(chǔ)上,用于預(yù)測花生含油量時,以待測花生基因組dna為模板,采用seq?id?no:2和seq?id?no:3所示的引物對進(jìn)行pcr擴增,檢測擴增產(chǎn)物;
11、當(dāng)擴增產(chǎn)物為274bp的單一條帶時,則待測花生樣品為低油含量花生品種;
12、當(dāng)擴增產(chǎn)物為252bp的單一條帶,或274bp和252bp兩條帶時,待測花生樣品為高油含量花生品種。
13、在上述方案的基礎(chǔ)上,所述用于高油含量花生選育,是在育種過程中采用arahy36753720分子標(biāo)記鑒定或篩選群體中高油的花生品種。
14、在上述方案的基礎(chǔ)上,所述高油含量花生選育方法如下:
15、以高油和低油的花生品種作為親本進(jìn)行雜交,采用近紅外光譜法篩選f1代雜交種中含油量≥54%的花生材料;將篩選的具有高油性狀的f1自交種植獲得f2;f2連續(xù)自交通過單粒傳法構(gòu)建重組自交系群體,每次自交后篩選綜合性狀良好的單株,輔助采用arahy36753720分子標(biāo)記對其含油表型進(jìn)行鑒定,篩選群體中綜合性狀良好且高油性狀穩(wěn)定的花生品系,用作擴繁材料。
16、在上述方案的基礎(chǔ)上,在育種過程中采用arahy36753720分子標(biāo)記來鑒定或篩選群體中高油的花生品種時,以待測花生基因組dna為模板,采用seq?id?no:2和seq?id?no:3所示的引物對進(jìn)行pcr擴增,檢測擴增產(chǎn)物;
17、當(dāng)擴增產(chǎn)物為274bp的單一條帶時,則待測花生樣品為低油含量花生品種;
18、當(dāng)擴增產(chǎn)物為252bp的單一條帶,或274bp和252bp兩條帶時,待測花生樣品為高油含量花生品種。
19、檢測上述與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記的引物對,檢測arahy36753720分子標(biāo)記的引物對如seq?id?no:2和seq?id?no:3所示。
20、本發(fā)明技術(shù)方案的優(yōu)點
21、(1)本發(fā)明開發(fā)了一個花生高低油基因相關(guān)位點,并提供了與花生高低油含油量連鎖的分子標(biāo)記arahy36753720。
22、(2)通過檢測本發(fā)明分子標(biāo)記預(yù)測花生含油量的方法快速簡便,選擇效率高,直接通過pcr擴增及電泳即可實現(xiàn),只需要檢測這些標(biāo)記的擴增條帶的大小,技術(shù)要求簡單,采用常規(guī)儀器可操作;具有快速、高效、成本低的特點。由此有目的的篩選高油花生品種或品系,一方面有助于基因的精細(xì)定位及克隆,另一方面對于花生分子育種,加快花生高油品系的培育過程都具有重要的應(yīng)用價值。
23、(3)輔助育種選擇目標(biāo)明確,節(jié)約成本。通過標(biāo)記檢測花生高油基因位點,可以在收獲種子后即可鑒定出含油量較高的單株,選擇保留,淘汰其他單株,可有效控制育種規(guī)模,提高高油品種選擇育種的進(jìn)程和效率。
24、綜上,通過檢測本發(fā)明分子標(biāo)記預(yù)測花生含油量的方法具有快速簡便,選擇效率高,直接通過pcr擴增及電泳即可實現(xiàn),在預(yù)測花生含油量以及選育高油含量花生中具有重要的應(yīng)用價值。
1.與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記,其特征在于,所述分子標(biāo)記為arahy36753720;其核酸序列如seq?id?no:1所示。
2.一種根據(jù)權(quán)利要求1所述的與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記的應(yīng)用,其特征在于,為a-c中的至少一種;
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記的應(yīng)用,其特征在于,所述預(yù)測花生含油量的試劑包含檢測分子標(biāo)記arahy36753720的引物對。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記的應(yīng)用,其特征在于,所述檢測arahy36753720分子標(biāo)記的引物對如seq?id?no:2和seq?id?no:3所示。
5.根據(jù)權(quán)利要求2所述與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記的應(yīng)用,其特征在于,用于預(yù)測花生含油量時,以待測花生基因組dna為模板,采用seq?id?no:2和seq?id?no:3所示的引物對進(jìn)行pcr擴增,檢測擴增產(chǎn)物;
6.根據(jù)權(quán)利要求2所述與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記的應(yīng)用,其特征在于,所述用于高油含量花生選育,是在育種過程中采用arahy36753720分子標(biāo)記鑒定或篩選群體中高油的花生品種。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記的應(yīng)用,其特征在于,所述高油含量花生選育方法如下:
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記的應(yīng)用,其特征在于,在育種過程中采用arahy36753720分子標(biāo)記來鑒定或篩選群體中高油的花生品種時,以待測花生基因組dna為模板,采用seq?id?no:2和seq?id?no:3所示的引物對進(jìn)行pcr擴增,檢測擴增產(chǎn)物;
9.一種檢測權(quán)利要求1所述與花生含油量性狀緊密連鎖的indel分子標(biāo)記的引物對,其特征在于,檢測arahy36753720分子標(biāo)記的引物對如seq?id?no:2和seq?id?no:3所示。