本發(fā)明涉及結(jié)縷草種質(zhì)親緣關(guān)系鑒別,更具體地說是涉及一種鑒別不同結(jié)縷草種質(zhì)親緣關(guān)系的方法。
背景技術(shù):
1、結(jié)縷草屬(zoysiawilld.)隸屬于禾本科多年生低矮草本植物,一般分為11個種,多個變種以及變型,其中大多數(shù)結(jié)縷草可用于運(yùn)動場草坪、休憩草坪及保土草坪等的建植。結(jié)縷草屬植物在我國分布有5個種,2個變種和1個變型。5個種分別是結(jié)縷草(z.japonicasteud.)、細(xì)葉結(jié)縷草(z.tenuiflia?willd.extrin.)、溝葉結(jié)縷草(z.matrella(l.)merr.)、大穗結(jié)縷草(z.macorostachya?franch.etsva.)以及中華結(jié)縷草(z.sinicahance);2個變種分別是青結(jié)縷草(z.japonica?var.pollida?nakai?et?honda)和長花結(jié)縷草(z.sinica?var.nipponica?ohwi.);1個變型是大穗日本結(jié)縷草(z.japonicaf.macrostachya?h.d.dung?et?l.j.gong)。其中結(jié)縷草是該屬中分布范圍最廣、應(yīng)用面積最大的一個種,也是中國結(jié)縷草屬的代表種。
2、近年來,分子標(biāo)記技術(shù)在草坪草種質(zhì)資源的研究中的應(yīng)用越來越廣泛。在結(jié)縷草屬植物的研究中也有廣泛的應(yīng)用。est-ssr(expressed?sequence?tag-simplesequencerepeat)是基于表達(dá)序列標(biāo)簽開發(fā)微衛(wèi)星的一種分子標(biāo)記,與基因組ssr標(biāo)記相比具有更高的轉(zhuǎn)譯能力。由于est-ssr標(biāo)記是一類功能標(biāo)記,是以推測出est序列功能為基礎(chǔ)獲得的。目前,est-ssr被廣泛應(yīng)用于植物基因組學(xué)研究,遺傳圖譜的構(gòu)建、比較作圖、遺傳多樣性的評價等方面。很少應(yīng)用于結(jié)縷草屬種質(zhì)資源的研究。
3、因此,如何將est-ssr應(yīng)用于結(jié)縷草的分子標(biāo)記中,并開發(fā)鑒定不同結(jié)縷草種質(zhì)親緣關(guān)系的引物是本領(lǐng)域技術(shù)人員亟需解決的技術(shù)問題。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、有鑒于此,基于est-ssr分子標(biāo)記的諸多優(yōu)越性,本發(fā)明采用est-ssr分子標(biāo)記的方法對不同地理來源的結(jié)縷草屬種質(zhì)進(jìn)行遺傳變異研究,從分子水平上探討了結(jié)縷草種質(zhì)資源的遺傳多樣性,為結(jié)縷草屬種質(zhì)資源的研究奠定了良好的基礎(chǔ)。
2、為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:
3、一種鑒別不同結(jié)縷草種質(zhì)親緣關(guān)系的方法,以試劑盒進(jìn)行檢測,過程包括:
4、1)利用篩選出的20對est-ssr引物中任意3對引物對43份結(jié)縷草屬種質(zhì)進(jìn)行est-ssr的pcr擴(kuò)增,得到多態(tài)性條帶,并觀察每對引物擴(kuò)增出的等位基因數(shù)量;
5、2)根據(jù)est-ssr引物的多態(tài)性條帶,利用ntsys軟件對43份結(jié)縷草屬種質(zhì)進(jìn)行遺傳多樣性研究,確定遺傳系數(shù),分析親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近;
6、所述試劑盒包括seq?id?no.1~seq?id?no.40所示引物中任意一組或三組的結(jié)合;具體為:
7、
8、
9、優(yōu)選地,所述引物序列如seq?id?no.11~seq?id?no.12所示;
10、上游引物f:5’-tgctcaaacttgctttcctg-3’,如seq?id?no.11所示;
11、下游引物r:5’-ccgtgcaatcgtagtaccag-3’,如seq?id?no.12所示。
12、優(yōu)選地,seq?id?no.1~seq?id?no.10和seq?id?no.13~seq?id?no.40所述的引物中的任意兩組引物。
13、經(jīng)由上述的技術(shù)方案可知,與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明公開提供了一種鑒別不同結(jié)縷草種質(zhì)親緣關(guān)系的方法,該方法可以對不同種質(zhì)結(jié)縷草間的親緣關(guān)系進(jìn)行鑒定,為后續(xù)研究結(jié)縷草的遺傳性能奠定了基礎(chǔ)。
1.一種鑒別不同結(jié)縷草種質(zhì)親緣關(guān)系的方法,其特征在于,以試劑盒進(jìn)行檢測,過程包括:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的鑒別不同結(jié)縷草種質(zhì)親緣關(guān)系的方法,其特征在于,所述引物序列如seq?id?no.11~seq?id?no.12所示;
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的鑒別不同結(jié)縷草種質(zhì)親緣關(guān)系的方法,其特征在于,seq?idno.1~seq?id?no.10和seq?id?no.13~seq?id?no.40所述的引物中的任意兩組引物。