本發(fā)明涉及一種屬于阿克曼氏菌(akkermansia)屬的新穎微生物,更詳細(xì)而言,涉及該微生物、以及以其作為有效成分的用于活化nod2(nucleotide-bindingoligomerization?domain2,核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域2)的組合物及用于激活免疫的組合物等。
背景技術(shù):
1、在人體腸道內(nèi),多種多樣的腸內(nèi)微生物聚集并構(gòu)筑了復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng)。該生態(tài)系統(tǒng)也被稱為腸內(nèi)微生物菌群,會對作為宿主的人類的各種生理作用產(chǎn)生影響。因此,在人類健康并長壽的方面,棲息在腸道內(nèi)的微生物的種類及它們的多樣性較為重要。
2、關(guān)于作為腸內(nèi)微生物的1種的屬于阿克曼氏菌屬的微生物,已知其在腸道內(nèi)的豐度對于各種癥狀有效,譬如肥胖、2型糖尿病等代謝障礙、潰瘍性結(jié)腸炎、闌尾炎等炎癥性疾病。此外,近年來有腦-腸-微生物軸(brain-gut-microbiota?axis)這一概念,還報(bào)告有阿克曼氏菌的存在量與宿主的性格(社交能力高低)有關(guān)(非專利文獻(xiàn)1)。
3、另外,報(bào)告有在生活著許多百歲以上長壽者(百歲(centenarian)率較高)的奄美大島(日本),對高齡者的腸內(nèi)菌群進(jìn)行分析后發(fā)現(xiàn),相較于其他地區(qū)的同年代高齡者,阿克曼氏菌等的比率較高(非專利文獻(xiàn)2)。進(jìn)而,還報(bào)告有向早衰癥模型小鼠給予阿克曼氏菌后發(fā)現(xiàn),壽命得到延長(非專利文獻(xiàn)3),根據(jù)這些結(jié)果,提示了阿克曼氏菌在腸內(nèi)的豐度對宿主的壽命產(chǎn)生較好影響。
4、如上所述,阿克曼氏菌會對宿主的健康、性格等產(chǎn)生影響,甚至可能延長壽命,故而近年來備受關(guān)注,但屬于阿克曼氏菌屬的微生物僅明確有2種(嗜黏蛋白阿克曼氏菌(akkermansia?muchiniphila)、嗜聚糖阿克曼氏菌(akkermansia?glycaniphila))。
5、現(xiàn)有技術(shù)文獻(xiàn)
6、非專利文獻(xiàn)
7、非專利文獻(xiàn)1:katerina?v-a?johnson、hum?microb?j.、“gut?microbiomecomposition?and?diversity?are?related?to?human?personality?traits”,2020年3月15日,doi:10.1016/j.humic.2019.100069.
8、非專利文獻(xiàn)2:森田英利,科學(xué)研究費(fèi)助成事業(yè)研究成果報(bào)告書,“奄美群島の百壽者がもつ特徴的な腸內(nèi)細(xì)菌叢を指標(biāo)としたヒト長壽腸內(nèi)科學(xué)への展開”,2021年6月23日
9、非專利文獻(xiàn)3:clea?barcena等人,nat?med.、“healthspan?and?lifespanextension?by?fecal?microbiota?transplantation?into?progeroid?mice1”,2019年8月25日,8卷,1234~1242頁,doi:10.1038/s41591-019-0504-5.
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、發(fā)明要解決的問題
2、本發(fā)明的目的在于,單離出屬于阿克曼氏菌屬的新穎微生物,并提供該微生物。其目的還在于,明確上述微生物對宿主的影響,并提供一種基于該影響的用于改善宿主的健康狀態(tài)的組合物。
3、用于解決問題的方案
4、本發(fā)明人等為了達(dá)成上述目的而反復(fù)進(jìn)行了銳意研究,結(jié)果,成功地自5名受試者中3人的糞便中,檢測到屬于阿克曼氏菌屬的微生物株(won2089、won2090、won2093)的菌落形成。另外,確定并比較這些微生物株的16srrna(ribonucleic?acid,核糖核酸)序列,結(jié)果表明,均攜帶有包含相同序列(序列號:3所記載的序列)的16s?rrna基因。
5、然后,將上述微生物的16s?rrna序列相對于美國國家生物技術(shù)信息中心(以下,稱為ncbi)的rrna/its的基準(zhǔn)株數(shù)據(jù)庫來進(jìn)行blast+分析,結(jié)果,與已知的嗜黏蛋白阿克曼氏菌(序列號:1所記載的序列;genbank登錄編號ay271254)的同源性為98.0%,與已知的嗜聚糖阿克曼氏菌的同源性為94.0%(序列號:2所記載的序列;genbank登錄編號kt254068)。進(jìn)而,對won2089進(jìn)行全基因組測序,基于該序列,通過dfast進(jìn)行ani(average?nucleotideidentity,平均核苷酸一致性)分析,與阿克曼氏菌屬的2個(gè)菌株進(jìn)行比較。其結(jié)果,與已知的嗜黏蛋白阿克曼氏菌相比,ani值約為82.5%,與已知的嗜聚糖阿克曼氏菌相比,ani值約為77.4%。95%ani為當(dāng)前菌種的臨界值,由于低于該值,因此表明單離出的微生物株可能為阿克曼氏菌的新種。
6、另外,在使用api20a的酸產(chǎn)生試驗(yàn)的結(jié)果中,觀察到微生物株(won2089、won2090、won2093)均與已知的2種阿克曼氏菌同樣地在d-葡萄糖、乳糖、d-甘露糖中增殖,不同于已知的2種阿克曼氏菌的是,觀察到上述微生物株均在d-甘露醇中也增殖。
7、進(jìn)而,對配體活性進(jìn)行分析后發(fā)現(xiàn),對于已知的2種阿克曼氏菌,未觀察到nod2激動劑活性,但微生物株(won2089、won2090、won2093)均觀察到該活性。
8、需要說明的是,nod2為一種模式識別受體(pattern?recognition?receptor,prr),通過該受體的活化,能夠檢測到已入侵的病原體或變得異常的自體細(xì)胞,并將它們清除(所謂天然免疫、后天免疫)。
9、另外,關(guān)于won2089,對iga(immunoglobulin?a,免疫球蛋白a)分泌促進(jìn)作用進(jìn)行評價(jià),結(jié)果可知具有該作用,進(jìn)而還發(fā)現(xiàn)較已知的嗜黏蛋白阿克曼氏菌(標(biāo)準(zhǔn)株muc,strainatcc?baa-835)的iga分泌促進(jìn)作用高2倍以上,從而完成了本發(fā)明。
10、即,本發(fā)明提供以下的方式。
11、[1]一種微生物,其屬于阿克曼氏菌屬,
12、其具有包含相對于序列號:1所記載的核苷酸序列具有98.0%以下的同源性、相對于序列號:2所記載的核苷酸序列具有94.0%以下的同源性、或相對于序列號:3所記載的核苷酸序列具有超過98.0%的同源性的核苷酸序列的16s?rrna基因,并且
13、具有以下1)~4)的性質(zhì):
14、1)具有nod2激動劑活性;
15、2)具有對于d-甘露醇的同化性;
16、3)革蘭氏染色呈陰性,為球狀至短桿狀的厭氧性細(xì)菌;
17、4)氧化酶試驗(yàn)呈陰性,過氧化氫酶試驗(yàn)呈陽性。
18、[2]一種微生物,其為由保藏編號nite?bp-03622、nite?bp-03623或nite?bp-03624特定的微生物。
19、[3]根據(jù)[1]所述的微生物,其進(jìn)而相較于嗜黏蛋白阿克曼氏菌的標(biāo)準(zhǔn)株atccbaa-835,具有2倍以上的iga分泌促進(jìn)作用。
20、[4]一種用于激活免疫的組合物,其以[1]~[3]中任一項(xiàng)所述的微生物作為有效成分。
21、[5]一種用于活化nod2的組合物,其以[1]~[3]中任一項(xiàng)所述的微生物作為有效成分。
22、[6]一種用于促進(jìn)iga的分泌的組合物,其以[2]或[3]所述的微生物作為有效成分。
23、另外,本發(fā)明涉及一種[1]~[3]中任一項(xiàng)所述的微生物在用于制造用于激活免疫的組合物、用于活化nod2的組合物或用于促進(jìn)iga的分泌的組合物中的用途。
24、另外,本發(fā)明涉及一種[1]~[3]中任一項(xiàng)所述的微生物的用于激活免疫、用于活化nod2、或用于促進(jìn)iga的分泌的用途。
25、另外,本發(fā)明涉及一種[1]~[3]中任一項(xiàng)所述的微生物,其用于激活免疫、用于活化nod2、或用于促進(jìn)iga的分泌。
26、另外,本發(fā)明涉及一種用于激活免疫、活化nod2、或促進(jìn)iga的分泌的方法,其中,將[1]~[3]中任一項(xiàng)所述的微生物的有效量給予至對象。
27、發(fā)明的效果
28、根據(jù)本發(fā)明,可經(jīng)由nod2的活化等來激活免疫。