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一株具有抑制水稻紋枯病的內(nèi)生芽孢桿菌菌株ZY122及其應(yīng)用的制作方法

文檔序號:11192955閱讀:920來源:國知局
一株具有抑制水稻紋枯病的內(nèi)生芽孢桿菌菌株ZY122及其應(yīng)用的制造方法與工藝

本發(fā)明涉及植物病害生物防治技術(shù)領(lǐng)域,具體地,涉及一株具有抑制水稻紋枯病的內(nèi)生芽孢桿菌菌株zy122及其應(yīng)用。



背景技術(shù):

水稻作為世界三大主糧之一,是全球約50%人口的主糧。其主要集中分布在熱帶或亞熱帶的高溫多雨地區(qū),如我國長江流域、珠江三角洲和四川盆地,中南半島等,其中近90%產(chǎn)于亞洲。目前世界水稻種植面積約15500萬公頃,我國水稻種植面為3100萬公頃,約占世界種植面積的20%;我國的水稻總產(chǎn)量居世界第一,單產(chǎn)居世界第五。水稻在我國主要分布于六大產(chǎn)區(qū),分別為:華南雙季稻作帶;華東、華中單雙季稻作帶;西北干燥稻作帶;華北單季稻作帶;東北早熟稻作帶和西南高原稻作帶。隨著人口不斷的增加,我國對稻谷的需求量也越來越大,如何保障稻米生產(chǎn)和消費的平衡已經(jīng)給我國稻米產(chǎn)業(yè)的發(fā)展提出嚴峻挑戰(zhàn)。在我國淡水資源緊張、勞動力短缺和生產(chǎn)成本增加等因素的影響下,水稻種植增糧與增收矛盾日益突出,再加上全球氣候及生態(tài)環(huán)境日益惡化,導(dǎo)致水稻的各種病蟲害呈現(xiàn)增加的態(tài)勢。

水稻紋枯病是當(dāng)前水稻生產(chǎn)上的主要病害之一,該病是由瓜亡革菌thanatephoruscucumeris所引起,瓜亡革菌thanatephoruscucumeris屬擔(dān)子菌亞門真菌,發(fā)生范圍廣、危害嚴重、防治困難。該病使水稻不能抽穗,或抽穗的秕谷較多,粒重下降。對于水稻紋枯病的防治既有傳統(tǒng)的化學(xué)藥劑,也有新興的生物防控技術(shù)。國內(nèi)涉及到水稻紋枯病的專利技術(shù)約有400余項,其中化學(xué)藥劑相關(guān)的專利約占60%;生物技術(shù)約占30%;化學(xué)與生物防治兩者結(jié)合的專利技術(shù)約占10%。

芽孢桿菌廣泛地存在于自然界,具有繁殖快速、代謝快的特點;該屬細菌的重要特性是能夠產(chǎn)生對不利條件具有特殊抵抗力的芽孢。它們也存在于土壤、植物組織內(nèi)、水和空氣中,與自然界物質(zhì)轉(zhuǎn)化、土壤肥力、環(huán)境衛(wèi)生均密切相關(guān)。同時它們對有機質(zhì)分解力強,增殖的同時,會釋出高活性的分解酵素,合成多種有機酸、酶、生理活性等物質(zhì),及其它多種容易被利用的養(yǎng)分,促進作物生長。隨著土壤的生物多樣性退化及土壤堿化,芽孢桿菌能夠在逆境中存活和生長,為土壤提供各種酶類和增加土壤微生物的多樣性。植物內(nèi)生菌是一定階段或全部階段生活于健康植物的組織和器官內(nèi)部的真菌或細菌。其普遍存在于高等植物中,木本、草本植物,單子葉植物和雙子葉植物內(nèi)均有內(nèi)生細菌。內(nèi)生菌不僅可以給植物提供所需營養(yǎng)物質(zhì)及一些激素,對植物的生長發(fā)育、抵抗病蟲侵襲及不良環(huán)境等具有廣泛的生物學(xué)作用,還可以增強植物抗逆境、抗病蟲害的能力,目前已成為生物防治中有潛力的微生物農(nóng)藥、增產(chǎn)菌或作為潛在的生防載體菌而加以利用。

內(nèi)生菌存在于植物體內(nèi),可在植物體內(nèi)長期定殖并傳導(dǎo),不易受外界環(huán)境條件的影響,有研究顯示,51%的從植物內(nèi)生菌分離的生物活性物質(zhì)是以前沒有發(fā)現(xiàn)的化合物,這對抗菌活性物質(zhì)來源的新領(lǐng)域的開發(fā)將具有十分重大的經(jīng)濟意義。篩選能夠?qū)Σ≡修卓棺饔玫难挎邨U菌在病害的生物防治、促進作物生長、改善土壤生態(tài)環(huán)境等方面具有重要的意義。



技術(shù)實現(xiàn)要素:

本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)的不足,提供一株具有抑制水稻紋枯病的內(nèi)生芽孢桿菌菌株zy122,本發(fā)明提供的內(nèi)生芽孢桿菌菌株zy122可用于抑制水稻紋枯病,其對水稻紋枯病的病原菌瓜亡革菌thanatephoruscucumeris的抑菌率可達81.9%,防治效果可達70.0%以上。

本發(fā)明的另一目的在于提供上述內(nèi)生芽孢桿菌菌株zy122在水稻紋枯病的生物防治中的應(yīng)用。

本發(fā)明的另一目的在于提供內(nèi)生芽孢桿菌菌株zy122在制備抑制水稻紋枯病的生物制劑中的應(yīng)用。

本發(fā)明的另一目的在于提供一種具有抑制水稻紋枯病的的生物制劑。

為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:

一株具有抑制水稻紋枯病的內(nèi)生芽孢桿菌菌株zy122(bacillusvanilleazy122),所述菌株于2017年4月11日保藏于廣東省微生物菌種保藏中心(gdmcc),保藏地址為廣州市先烈中路100號,保藏編號為gdmccno.60161。

本發(fā)明中所述菌株含有如seq1所示的16srdna基因序列。

本發(fā)明的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122菌落形態(tài)特征:該菌株在lb培養(yǎng)基上生長速度較快(37℃,20h),呈灰白狀,為黏液型菌株,細胞微透明,呈(長1.3~1.8um寬0.4~0.7um)桿狀,菌落中間有凸起,能夠產(chǎn)生芽孢,周生鞭毛。

本發(fā)明的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122的生理生化特性:

革蘭氏陽性菌,兼性厭氧,ph生長范圍ph4.0~8.0(最佳為5.0~7.0),耐nacl可在0~8%(w/v)條件下可生長(最佳為1~4%),可適應(yīng)生長溫度區(qū)間為20~45℃(最佳為28~7℃),dna的g+c含量為46.4mol%。產(chǎn)氨試驗、乙酰甲醛甲醇測定均為陽性;尿酶試驗、甲基紅測定、過氧化氫酶試驗、檸檬酸利用試驗為陰性。能高效利用龍膽二糖、α–d–乳糖、β–甲基–d–葡萄糖苷、肝糖、d-木糖作為碳源,而以阿拉伯糖、蜜二糖、海藻糖和松二糖作為碳源則生長緩慢。菌株對50μg/ml氨芐青霉素、100μg/ml鏈霉素、300μg/ml四環(huán)素均具有耐受性;而對卡拉霉素、慶大霉素、氯霉素,新霉素、紅霉素耐受性差、低濃度(5μg/ml)的這幾種抗生素就能抑制其生長。

本發(fā)明提供的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122經(jīng)16srdna序列比對(ezbiocloud數(shù)據(jù)庫)與bacillusvanilleaxy18(t)芽孢桿菌的同源性為99.42%;該菌株的16srdna序列如序列表所示。

本發(fā)明芽孢桿菌bacillusvanilleazy122的分子分類地位的確定:

采用細菌16srrna基因通用引物25f和1492r進行擴增,將pcr產(chǎn)物直接進行序列測定。將獲得的dna序列輸入ezbiocloud進行比對,初步確定本發(fā)明的菌株在分類學(xué)中的屬、種的位置。結(jié)果發(fā)現(xiàn)本發(fā)明的芽孢桿菌屬于芽孢桿菌屬bacillus,與bacillusvanilleaxy18(t)芽孢桿菌的同源性為99.42%,但二者的序列不完全一致,有0.58%的差異,表明二者是同種內(nèi)不同的菌株。結(jié)合上述的生理生化特性、16srdna序列分析,本發(fā)明的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122應(yīng)歸屬于芽孢桿菌屬bacillus。

本發(fā)明的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122可用于水稻紋枯病的生物防治。更具體地,所述芽孢桿菌菌株zy122可應(yīng)用于抑制水稻紋枯病病原菌瓜亡革菌thanatephoruscucumeris。芽孢桿菌bacillusvanilleazy122對水稻紋枯病的病原菌瓜亡革菌thanatephoruscucumeris抑菌率可達81.9%,對水稻紋枯病的病原菌瓜亡革菌thanatephoruscucumeris防治效果可達70.0%以上。

上述內(nèi)生芽孢桿菌菌株zy122在制備抑制水稻紋枯病的生物制劑中的應(yīng)用也在本發(fā)明的保護范圍之內(nèi)。

一種具有抑制水稻紋枯病的的生物制劑,所述生物制劑中含有權(quán)利要求1所述內(nèi)生芽孢桿菌菌株zy122。

與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有如下有益效果:

本發(fā)明通過采用選擇性培養(yǎng)基,以水稻紋枯病的病原菌瓜亡革菌為防治對象,對生長于長期未施肥的健康野生稻植株中存在的拮抗內(nèi)生細菌進行分離、純化,得到一株拮抗水稻紋枯病的芽孢桿菌,為水稻紋枯病的生物防治奠定了基礎(chǔ)。本發(fā)明提供的內(nèi)生芽孢桿菌菌株zy122的合理應(yīng)用可以減少化學(xué)藥劑對環(huán)境造成的污染,有利于保護生態(tài)平衡,對水稻的栽培和增收增產(chǎn)都能夠起到很大的提高和促進作用,具有一定的研究意義。

附圖說明

圖1為實施例1提供的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122在lb培養(yǎng)基上稀釋涂布的菌落圖片;

圖2為水稻紋枯病的病原菌瓜亡革菌thanatephoruscucumeris對照組在pda培養(yǎng)基上的生長圖;

圖3為實施例1提供的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122對病原菌瓜亡革菌thanatephoruscucumeris的拮抗效果圖;

圖4為實施例1提供的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122全基因組dna及16srdna的pcr產(chǎn)物1%的瓊脂糖凝膠電泳圖。

具體實施方式

下面結(jié)合圖表對本發(fā)明的技術(shù)方案作進一步的說明,但此說明并不做任何形式方面的限定,凡是對本發(fā)明技術(shù)方案進行修改或者等同替換,而不脫離本發(fā)明技術(shù)方案的精神和范圍,均應(yīng)涵蓋在本發(fā)明的保護范圍中。

實施例1芽孢桿菌bacillusvanilleazy122的分離、篩選以及分子分類學(xué)地位的確定本實施提供的抑制水稻紋枯病的生防菌株芽孢桿菌bacillusvanilleazy122保藏于廣東省微生物菌種保藏中心(gdmcc),保藏地址廣州市先烈中路100號,保藏日期為2017年4月11日,保藏編號為gdmccno.60161。

本實施方式的芽孢桿菌bacilluszy122來源于廣西梧州野生稻田,采用選擇性培養(yǎng)基對野生稻健康植株進行內(nèi)生細菌分離獲得,具體方法如下:

(1)野生稻內(nèi)生菌的分離

將采集的野生稻材料用蒸餾水洗凈,選取適量的根、莖、葉組織,用無菌剪刀剪成碎片狀,放入無菌培養(yǎng)皿中,用75%乙醇浸泡3min,然后在2%naclo溶液中浸泡3min,取出后用無菌水沖洗3次,每次5min,最后一次清洗的無菌水涂布lb,作為對照檢測是否材料消毒徹底。在無菌研缽內(nèi)加入無菌水研磨成勻漿,將勻漿稀釋十倍以后,用移液槍分別吸取100ul至無菌lb固體平板上,涂抹均勻后放入37℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng),觀察菌體的生長情況,用接種環(huán)挑取長勢好且形態(tài)不同的菌苔,用平板劃線法進行反復(fù)傳代培養(yǎng),直至菌落的顏色、形狀、大小、質(zhì)地和透明度一樣。最后通過簡單染色(石碳酸復(fù)紅染色)和顯微鏡鏡檢(油鏡),進一步觀察其形態(tài),以長度均一、寬度一致、染色情況統(tǒng)一為菌株純化標(biāo)準(zhǔn)。純化后的菌株于15%的甘油中-20℃和-80℃分別保存。

(2)內(nèi)生菌拮抗水稻紋枯病原菌的初篩

采用平板對峙法對野生稻內(nèi)生菌拮抗紋枯病病原真菌進行初篩。將水稻紋枯病病原菌用無菌水制成濃度為108/ml-1的菌懸液,取20ul平板涂布在pda培養(yǎng)基上,然后在涂布的pda平板上劃十字線分出4個區(qū)域,在每個區(qū)域中心分別用無菌牙簽接入少量已純化出的野生稻內(nèi)生菌,放于28℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),5天后觀察記錄抑菌圈的有無及大小,共重復(fù)3次。選出抑菌圈寬度最大的5株內(nèi)生菌進行復(fù)篩。

(3)內(nèi)生菌拮抗水稻紋枯病原菌的復(fù)篩

采用平板對峙法對內(nèi)生菌拮抗病原真菌進行復(fù)篩。將水稻紋枯病病原菌用無菌水制成濃度為108/ml-1的菌懸液,然后取20ul在pda培養(yǎng)基上涂布,在已涂布平板上劃十字線分出4個區(qū)域,每個區(qū)域中心分別用無菌牙簽接入初步篩選出來有拮抗作用的內(nèi)生菌,設(shè)無菌水為對照,重復(fù)3次。置于28℃恒溫條件下培養(yǎng),5天后觀察抑菌效果,測量抑菌圈大小。選出效果最好的一株菌,保存?zhèn)溆谩?/p>

抑菌率(%)=(處理組抑菌圈直徑-對照組抑菌圈直徑/處理組抑菌圈直徑)×100%

本實施例中所應(yīng)用的培養(yǎng)基配方如下:

lb培養(yǎng)基:酵母提取物5g、細菌學(xué)蛋白胨10g、nacl5g、agar20g、無菌水1l,ph=7.0。

pda培養(yǎng)基:去皮馬鈴薯200g、葡萄糖20g、agar20g、無菌水1l,自然ph。

圖1為本實施例提供的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122在lb培養(yǎng)基上稀釋涂布的菌落圖片,左圖為菌落背面照,右圖為菌落正面照。由圖1可觀察到本發(fā)明的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122菌落形態(tài)特征:該菌株在lb培養(yǎng)基上生長速度較快(37℃,20h),呈灰白狀,為黏液型菌株,細胞微透明,呈(長1.3~1.8um寬0.4~0.7um)桿狀,菌落中間有凸起,能夠產(chǎn)生芽孢,周生鞭毛。

圖2為水稻紋枯病的病原菌瓜亡革菌thanatephoruscucumeris對照組在pda培養(yǎng)基上的生長圖,左圖為瓜亡革菌正面照,右圖為瓜亡革菌背面照;圖3為芽孢桿菌bacillusvanilleazy122對水稻紋枯病的病原菌瓜亡革菌thanatephoruscucumeris的抑菌效果圖,左圖為抑菌正面照,右圖為抑菌背面照。芽孢桿菌bacilluszy122對水稻紋枯病的病原菌瓜亡革菌thanatephoruscucumeris的抑菌率可達81.9%。

(4)芽孢桿菌bacillusvanilleazy122的分子分類學(xué)地位的確定

挑取拮抗芽孢桿菌bacillusvanilleazy122接種于lb固體培養(yǎng)基中,12h后收集菌體并提取菌株基因組dna,用1%瓊脂糖電泳驗證dna組片段的大小。圖4為本實施例提供的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122全基因組dna及16srdna的pcr產(chǎn)物1%的瓊脂糖凝膠電泳圖,其中左圖為全基因組dna的1%瓊脂糖凝膠電泳圖,右圖為16srdna的pcr產(chǎn)物1%的瓊脂糖凝膠電泳圖。由圖4可知:左圖中全基因組的電泳條帶單一清晰,全基因組大于10000bp;右圖中的pcr產(chǎn)物的電泳條帶單一清晰,片段長度約為1500bp左右。

以基因組dna為模板,應(yīng)用細菌16srdna基因通用引物:上游引物5’-agagtttgatc-ctggctcag-3’和下游引物5’-aaggaggtgatccagcc-3;

pcr反應(yīng)體系:10×pcrbuffer2.5μl,dntp2.0μl,上下游引物各0.5μl,dna模板1.0μl,taqdna聚合酶0.2μl,補雙蒸水至25μl。pcr反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5min;94℃變性45s,55℃退火45s,72℃延伸1.5min,循環(huán)擴增30次:最后72℃延伸10min。用1%瓊脂糖電泳驗證pcr產(chǎn)物dna片段的大小,如圖4可知,芽孢桿菌bacillusvanilleazy122dnapcr產(chǎn)物通過凝膠電泳擴增到單一條帶,條帶清晰,大小約為1500bp。將pcr產(chǎn)物委托北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司進行測序,獲得的dna序列輸入genbank進行blast比對,初步確定本發(fā)明的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122菌株在分類學(xué)中的屬、種的位置。結(jié)果發(fā)現(xiàn)所述的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122,與bacillusvanilleaxy18(t)芽孢桿菌的同源性為99.42%,結(jié)合上述形態(tài)學(xué)特征、生理生化特性、16srdna系統(tǒng)發(fā)育分析及文獻查閱,本發(fā)明的芽孢桿菌bacillusvanilleazy122應(yīng)歸屬于芽孢桿菌屬bacillus。

測序結(jié)果如下:

gctataatgcagtcgagcggacagatgggagcttgctccctgatgttagcggcggacgggtgagtaacacgtgggtaacctgcctgtaagactgggataactccgggaaaccggggctaataccggatggttgtctgaaccgcatggttcagacataaaaggtggcttcggctaccacttacagatggacccgcggcgcattagctagttggtgaggtaacggctcaccaaggcgacgatgcgtagccgacctgagagggtgatcggccacactgggactgagacacggcccagactcctacgggaggcagcagtagggaatcttccgcaatggacgaaagtctgacggagcaacgccgcgtgagtgatgaaggttttcggatcgtaaagctctgttgttagggaagaacaagtgccgttcaaatagggcggcaccttgacggtacctaaccagaaagccacggctaactacgtgccagcagccgcggtaatacgtaggtggcaagcgttgtccggaattattgggcgtaaagggctcgcaggcggtttcttaagtctgatgtgaaagcccccggctcaaccggggagggtcattggaaactggggaacttgagtgcagaagaggagagtggaattccacgtgtagcggtgaaatgcgtagagatgtggaggaacaccagtggcgaaggcgactctctggtctgtaactgacgctgaggagcgaaagcgtggggagcgaacaggattagataccctggtagtccacgccgtaaacgatgagtgctaagtgttagggggtttccgccccttagtgctgcagctaacgcattaagcactccgcctggggagtacggtcgcaagactgaaactcaaaggaattgacgggggcccgcacaagcggtggagcatgtggtttaattcgaagcaacgcgaagaaccttaccaggtcttgacatcctctgacaatcctagagataggacgtccccttcgggggcagagtgacaggtggtgcatggttgtcgtcagctcgtgtcgtgagatgttgggttaagtcccgcaacgagcgcaacccttgatcttagttgccagcattcagttgggcactctaaggtgactgccggtgacaaaccggaggaaggtggggatgacgtcaaatcatcatgccccttatgacctgggctacacacgtgctacaatggacagaacaaagggcagcgaaaccgcgaggttaagccaatcccacaaatctgttctcagttcggatcgcagtctgcaactcgactgcgtgaagctggaatcgctagtaatcgcggatcagcatgccgcggtgaatacgttcccgggccttgtacacaccgcccgtcacaccacgagagtttgtaacacccgaagtcggtgaggtaacctttaggagccagccgccgaag

本實施例中的病原菌為從水稻莖基部分離得到的瓜亡革菌thanatephoruscucumeris。

實施例2芽孢桿菌bacillusvanilleazy122在水稻紋枯病的生物防治中的應(yīng)用

本實施方式中芽孢桿菌bacillusvanilleazy122可用于水稻紋枯病的生物防治,防治效果實驗如下:

設(shè)置三個實驗組進行盆栽實驗,分別為健康對照組、感病對照組和防治組,每組20株水稻。用瓜亡革菌thanatephoruscucumeris配置成濃度為1×108個/ml的孢子懸浮液。將水稻進行表面消毒后,用針刺法對健康對照組注入20μl無菌水,感病對照組和防治組各注入20μl瓜亡革菌懸浮液后接種于花盆中。并將防治組植株根部澆灌3ml拮抗芽孢桿菌培養(yǎng)液(濃度為0.6×107~1×109cfu/l)。保證每個實驗組的水稻在陰涼通風(fēng)處生長,每天進行澆灌,15d后觀察并記錄水稻發(fā)病情況。

防治效果=(感病組植株數(shù)-對照組感病植株數(shù)-防治組感病植株數(shù))/接種植株數(shù)×100%。

表1芽孢桿菌bacillusvanilleazy122抑制瓜亡革菌thanatephoruscucumeris的測試

據(jù)實驗結(jié)果可知,芽孢桿菌bacillusvanilleazy122對瓜亡革菌thanatephoruscucumeris的防治效果可達70.0%以上。

sequencelisting

<110>華南農(nóng)業(yè)大學(xué)

<120>一株具有抑制水稻紋枯病的內(nèi)生芽孢桿菌菌株zy122及其應(yīng)用

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<213>芽孢桿菌bacillusvanilleazy122的16srdna

<400>1

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