本發(fā)明涉及一種快速批量提取魚組織總RNA的方法,尤其是一種適合快速批量提取魚組織總RNA的方法,屬于魚類RNA提取技術(shù)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
總RNA提取技術(shù)是分子生物學(xué)的基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)技術(shù)之一。純度高、完整性好的總RNA是進(jìn)行基因克隆、基因表達(dá)、基因功能分析等研究的必要前提。目前試驗(yàn)室常用的總RNA提取技術(shù)是低溫勻漿后Trizol法提取。低溫勻漿一般采用液氮研磨法、手動(dòng)或電動(dòng)勻漿器研磨法。液氮研磨法處理樣品時(shí),由于液氮極易揮發(fā),研磨過程中需要持續(xù)地向研缽中添加液氮,耗費(fèi)時(shí)間長,操作不方便,存在安全隱患。手動(dòng)或者電動(dòng)勻漿器研磨法要求在冰上完成,防止樣品過熱引起RNA降解。但是實(shí)踐中極易引起樣品局部溫度升高。并且,兩者的共同不足之處在于(1)每次只能處理一個(gè)樣品,無法批量操作;(2)損耗部分樣品,這對于初始樣品量少的試驗(yàn)影響大;(3)處理過程中樣品位于開放容器中,容易引起樣品污染。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于克服上述不足之處,提供一種適合快速批量提取魚組織總RNA的方法,既實(shí)現(xiàn)樣品批量操作,又能降低樣品損耗和污染。
按照本發(fā)明提供的技術(shù)方案,一種快速批量提取魚組織總RNA的方法,步驟如下:
(1)處理前準(zhǔn)備:取研磨珠,用乙醇溶液浸泡15-30分鐘后晾干;取若干2mL凍存管,每個(gè)凍存管中均添加研磨珠,并加入1mL Trizol;
(2)魚的前處理:解剖魚,取得魚組織20-100mg,經(jīng)焦碳酸二乙酯DEPC處理過的水漂洗后,剪碎組織塊,迅速投入步驟(1)處理過的凍存管中,旋上管蓋,投入液氮冷凍;
(3)研磨:取步驟(2)處理后的樣品1-50個(gè),裝入高通量組織研磨儀,以100-120次/分的速度研磨5-10分鐘;
(4)離心:取步驟(3)處理后的若干樣品室溫放置4-6分鐘,分別轉(zhuǎn)移至1.5mL的離心管中,每支離心管加入0.2mL氯仿,劇烈振蕩15-30秒,室溫放置2-4分鐘;2-8℃、10000×g離心14-16分鐘;
(5)二次離心:取步驟(4)所得上清液轉(zhuǎn)移到新管中,加入等量異丙醇,室溫放置10分鐘;2-8℃、10000×g離心10分鐘,移去上清,得到RNA沉淀;
(6)干燥:用1mL乙醇溶液洗滌步驟(5)所得RNA沉淀,2-8℃、7500×g離心5分鐘,棄去上清,得到RNA沉淀;
(7)溶解:室溫放置干燥或真空抽干步驟(6)所得RNA沉淀,加入20-200μL無RNase的水,-70℃保存。
所述乙醇溶液的質(zhì)量濃度為70%-75%。
步驟(1)所述研磨珠為2mm的氧化鋯珠,每個(gè)2mL凍存管中加入研磨珠2-4顆。
本發(fā)明的有益效果:本發(fā)明將樣品、研磨珠和Trizol加入冷凍管中,經(jīng)液氮冷凍以后裝入高通量研磨儀中處理,一方面保證樣品研磨過程中始終處于Trizol保護(hù)和低溫狀態(tài),雙重保護(hù)RNA防止降解;另一方面,相比于液體狀態(tài)下(手動(dòng)或者電動(dòng)勻漿器勻漿)勻漿,低溫干磨能縮短勻漿時(shí)間、勻漿更徹底。同時(shí),研磨過程中樣品始終在封閉的凍存管中,基本無樣品損耗,因此本發(fā)明對初始樣品量要求低,適于微量組織樣品的總RNA提取。最后,本發(fā)明可同時(shí)研磨1-50個(gè)樣品,實(shí)現(xiàn)樣品的批量處理,大大縮短了試驗(yàn)時(shí)間。
附圖說明
圖1是實(shí)施例1對提取羅非魚肝總RNA后進(jìn)行瓊脂糖電泳后的結(jié)果。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合具體實(shí)施例對本發(fā)明作進(jìn)一步說明。
以下實(shí)施例中液氮和Trizol均為市場上采購的常規(guī)產(chǎn)品。
實(shí)施例1 采用從羅非魚分離的肝作為樣品,具體包括以下工藝步驟:
(1)處理前準(zhǔn)備:取研磨珠,用乙醇溶液浸泡15分鐘后晾干;取若干2mL凍存管,每個(gè)凍存管中均添加研磨珠,并加入1mL Trizol;
(2)魚的前處理:解剖魚,取得魚組織30mg,經(jīng)焦碳酸二乙酯DEPC處理過的水漂洗后,剪碎組織塊,迅速投入步驟(1)處理過的凍存管中,旋上管蓋,投入液氮冷凍;
(3)研磨:取步驟(2)處理后的樣品6個(gè),裝入高通量組織研磨儀,以100次/分的速度研磨7分鐘;
(4)離心:取步驟(3)處理后的樣品室溫放置6分鐘,隨后轉(zhuǎn)移至1.5mL的離心管中,每支離心管加入0.2mL氯仿,劇烈振蕩30秒,室溫放置4分鐘;4℃、10000×g離心16分鐘;
(5)二次離心:取步驟(4)所得上清液轉(zhuǎn)移到新管中,加入等量異丙醇,室溫放置10分鐘;隨后在4℃、10000×g離心10分鐘,移去上清,得到RNA沉淀;
(6)干燥:用1mL乙醇溶液洗滌步驟(5)所得RNA沉淀,4℃、7500×g離心5分鐘,棄去上清,得到RNA沉淀;
(7)保存:室溫放置干燥或真空抽干步驟(6)所得RNA沉淀,加入30μL無RNase的水,-70℃保存。
所述乙醇溶液的質(zhì)量濃度為70%。
步驟(1)所述研磨珠為2mm的氧化鋯珠,每個(gè)2mL凍存管中加入研磨珠2顆。
實(shí)施例2采用從羅非魚分離的頭腎組織作為樣品,具體包括以下工藝步驟:
(1)處理前準(zhǔn)備:取研磨珠,用乙醇溶液浸泡30分鐘后晾干;取若干2mL凍存管,每個(gè)凍存管中均添加研磨珠,并加入1mL Trizol;
(2)魚的前處理:解剖魚,取得魚組織70 mg,經(jīng)焦碳酸二乙酯DEPC處理過的水漂洗后,剪碎組織塊,迅速投入步驟(1)處理過的凍存管中,旋上管蓋,投入液氮冷凍;
(3)研磨:取步驟(2)處理后的樣品40個(gè),裝入高通量組織研磨儀,以120次/分的速度研磨6分鐘;
(4)離心:取步驟(3)處理后的樣品室溫放置4分鐘,轉(zhuǎn)移至1.5mL的離心管中,每支離心管加入0.2mL氯仿,劇烈振蕩20秒,室溫放置2分鐘;4℃、10000×g離心15分鐘;
(5)二次離心:取步驟(4)所得上清液轉(zhuǎn)移到新管中,加入等量異丙醇,室溫放置10分鐘; 4℃、10000×g離心10分鐘,移去上清,得到RNA沉淀;
(6)干燥:用1mL乙醇溶液洗滌步驟(5)所得RNA沉淀,4℃、7500×g離心5分鐘,棄去上清,得到RNA沉淀;
(7)溶解:室溫放置干燥或真空抽干步驟(6)所得RNA沉淀,加入50μL無RNase的水,-70℃保存。
所述乙醇溶液的質(zhì)量濃度為75%。
步驟(1)所述研磨珠為2mm的氧化鋯珠,每個(gè)2mL凍存管中加入研磨珠3顆。
實(shí)施例3采用從羅非魚分離的肌肉組織作為樣品,具體包括以下工藝步驟:
(1)處理前準(zhǔn)備:取研磨珠,用乙醇溶液浸泡30分鐘后晾干;取若干2mL凍存管,每個(gè)凍存管中均添加研磨珠,并加入1mL Trizol;
(2)魚的前處理:解剖魚,取得魚組織90mg,經(jīng)焦碳酸二乙酯DEPC處理過的水漂洗后,剪碎組織塊,迅速投入步驟(1)處理過的凍存管中,旋上管蓋,投入液氮冷凍;
(3)研磨:取步驟(2)處理后的樣品50個(gè),裝入高通量組織研磨儀,以120次/分的速度研磨10分鐘;
(4)離心:取步驟(3)處理后的樣品室溫放置4分鐘,轉(zhuǎn)移至1.5mL的離心管中,每支離心管加入0.2mL氯仿,劇烈振蕩30秒,室溫放置2分鐘;4℃、10000×g離心15分鐘;
(5)二次離心:取步驟(4)所得上清液轉(zhuǎn)移到新管中,加入等量異丙醇,室溫放置10分鐘; 4℃、10000×g離心10分鐘,移去上清,得到RNA沉淀;
(6)干燥:用1mL乙醇溶液洗滌步驟(5)所得RNA沉淀,4℃、7500×g離心5分鐘,棄去上清,得到RNA沉淀;
(7)溶解:室溫放置干燥或真空抽干步驟(6)所得RNA沉淀,加入60μL無RNase的水,-70℃保存。
所述乙醇溶液的質(zhì)量濃度為75%。
步驟(1)所述研磨珠為2mm的氧化鋯珠,每個(gè)2mL凍存管中加入研磨珠4顆。