两个人的电影免费视频_国产精品久久久久久久久成人_97视频在线观看播放_久久这里只有精品777_亚洲熟女少妇二三区_4438x8成人网亚洲av_内谢国产内射夫妻免费视频_人妻精品久久久久中国字幕

在代謝物組學(xué)分析方法中使用內(nèi)源參比代謝物進(jìn)行歸一化的方法

文檔序號:6641630閱讀:2060來源:國知局
專利名稱:在代謝物組學(xué)分析方法中使用內(nèi)源參比代謝物進(jìn)行歸一化的方法
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及代謝物組學(xué)領(lǐng)域。跟具體來說,本發(fā)明涉及用于對代謝物測定法中待比較的信號進(jìn)行歸一化的方法。這種新方法依賴使用內(nèi)源代謝物濃度作為內(nèi)標(biāo),并允許測定濃度和相對豐度以及在任何樣品之間進(jìn)行直接比較。因此,本發(fā)明涉及代謝物濃度的應(yīng)用和不同物種、組織之間和不同細(xì)胞之間代謝物水平的比較。本發(fā)明提供了參比、對照或歸一化代謝物的身份和應(yīng)用,所述代謝物的水平即使在不同條件下也在個體細(xì)胞中以及不同樣品、物種和來源的體液、細(xì)胞和組織之間保
持一致。
背景技術(shù)
在代謝物組學(xué)中,術(shù)語歸一化是指在信號提取與加工之后和數(shù)據(jù)分發(fā)與隨后的統(tǒng)計學(xué)處理之前的數(shù)據(jù)調(diào)整步驟(使用流動注射電噴霧質(zhì)譜代謝物指紋數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處 、分類建t莫禾口特(Preprocessing, classification modeling and feature selection using flow injection electrospray mass spectrometry metabolite fingerprint data),D. P. Enot, W. Lin, M. Beckmann, D. Parker, D. P. Overy 禾口 J. Draper Nature Protoco 1 s,2008,3,446-470 ;依靠數(shù)字的代謝物組學(xué)獲取和理解整體代謝物 ^L 據(jù)(Metabolomics by numbers-acquiring and understanding global metabolite data), R. Goodacre, S. Vaidyanathan, W. B. Dunn, . G. Harrigan 禾口 D. B. Kell TRENDS in Biotechnology 2004,22(5)245-252)。對代謝物組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化以比較在不同天、不同機器上、各種稀釋度下等產(chǎn)生的數(shù)據(jù)的方法仍然有許多爭論,遠(yuǎn)遠(yuǎn)達(dá)不到黃金標(biāo)準(zhǔn)或甚至達(dá)不到一致推薦。由于代謝物組學(xué)的首要目標(biāo)是研究代謝物對環(huán)境和遺傳改變做出響應(yīng)而發(fā)生的變化,因此歸一化是使測量值可比較的關(guān)鍵步驟,其中排除了含糊和不相關(guān)的變差來源。典型情況下,樣品間變化性源于樣品濃度和均質(zhì)性差異、靈敏度的喪失和分析系統(tǒng)的漂移或樣品隨時間的降解。當(dāng)考慮多個實驗并且當(dāng)代謝物測量值源于幾個實驗程序和不同分析平臺時,這種變化性變成了真正的挑戰(zhàn)(Enot等,2008)。取決于實驗設(shè)計,存在一些用于計算歸一化因子的有用方法。例如,人們可以在化學(xué)衍生之前或之后向樣品添加多種增加但等摩爾濃度的對照,并且這些點的強度總和應(yīng)該相等??蛇x地,可以添加含有恒定量化合物的混合物或提取物,例如來自于一批血漿的樣品。對于添加的等摩爾對照來說,測量到的強度應(yīng)該表現(xiàn)相似。更通用的方法利用板上的對照樣品控制整個板質(zhì)量的變差(例如標(biāo)準(zhǔn)制備物的標(biāo)準(zhǔn)批次和方法)或測量差異??刹捎玫臍w一化策略是基于關(guān)于每個實驗所使用的數(shù)據(jù)和策略的一些潛在假設(shè)。 因此必須對這些策略進(jìn)行調(diào)整以反映出所研究的系統(tǒng)和實驗設(shè)計這兩方面。首要假設(shè)是對于一些添加的對照組來說,在整個組中平均的測定濃度比應(yīng)該接近單一值。可以將用于對代謝物組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化的現(xiàn)有技術(shù)概括成三個主要類別1-第一類策略包括從數(shù)據(jù)本身推斷逐個樣品的偏差系數(shù)、也稱為稀釋或定標(biāo)系數(shù)(scaling factor)(關(guān)于生物流體ID 1H-NMR數(shù)據(jù)歸一化的意見(A note on normalization of biofluid ID IH-NMR data), R. J. 0. Torgrip, K. M. Aberg 1, E. Aim, I.Schuppe-Koistinen 和 J. Lindberg=Metabolomics,20084(2),114-121)。這種最簡單的方法是全局歸一化,其中定標(biāo)系數(shù)是跨樣品的所有測量值的和 (或與其相關(guān))(也稱為常和、整和(integrale)、總io計數(shù)歸一化(total io count normalisation))。這種初級方法的局限性已被廣泛討論(Torgrip等,2008 ;概率商數(shù)歸一化作為說明復(fù)雜生物混合物稀釋的強有力方法,在IH NMR代謝物組學(xué)中的應(yīng)用 (Probabilistic quotient normalization as robust method to account for dilution of complex biological mixtures. Application in IH NMR metabolomics),F(xiàn). Dieterle,
A.Ross,G. Schlotterbeck, H. Senn :Anal Chem.,2006,78 (13),4281-90),并且已提出了通過引入類型信息(Enot等,2008)、峰/信號的次選擇(用于尿樣代謝物組學(xué)分析的歸一化策略(Normalization strategies for metabolomic analysis of urine samples),
B.M. Warrack, S. Hnatyshyn, K. -H. Ott, M. D. Reily, M. Sanders, H. Zhang 禾口 D. Μ. Drexler Journal of Chromatography B,2009,877 (5-6),547-552 ;關(guān)于高通量質(zhì)譜數(shù)據(jù)中非隨機丟失值的歸一化(Normalization Regarding Non-Random Missing Values in High-Throughput Mass Spectrometry Data), P. Wang, H. Tang, H. Zhang, J. Whiteaker, A. G. Paulovich 禾口 M. Mcintosh :Pacific Symposium on Biocomputing, 2006,11 :315-326) 或通過將強度分布對參比樣品情況進(jìn)行作圖(Torgrip等,2008,Dieterle等,2006),來產(chǎn)生更充分的定標(biāo)系數(shù)估算值的可替選方法。許多這樣的方法屬于NMR領(lǐng)域(美國專利號 7, 277,807B2, Dieterle等,2006)。不論所使用的技術(shù)的精密性及其解決具體生物學(xué)問題的效用如何,產(chǎn)生的數(shù)據(jù)仍然采取無量綱和實驗依賴性數(shù)量的形式,不能在不同實驗設(shè)置或應(yīng)用領(lǐng)域之間有效轉(zhuǎn)移和比較。2-第二種歸一化類型使用來自生物背景的信息來調(diào)整樣品濃度(Warrack等, 2009)。就此而言,在基于尿液的研究中通常使用取樣時的肌酸酐、尿液體積或重量摩爾滲透壓濃度,并且植物提取物或組織重量也可用于標(biāo)度樣品測量值。除了這樣的信息在實踐中的可用性以及與它們的測量相關(guān)的固有誤差之外,當(dāng)研究致力于可能誘導(dǎo)實驗/臨床參數(shù)估算值的急劇變化的生物化學(xué)過程(例如腎損傷)時,不能保證這些參數(shù)適用于歸一化。3-最后,利用針對單一或多種內(nèi)標(biāo)的校準(zhǔn)進(jìn)行化合物濃度的絕對定量,是既能使個體間變差降到最低、又能對源于多個位點和實驗的數(shù)據(jù)集進(jìn)行比較的最可靠的方法(使用多種內(nèi)標(biāo)的最優(yōu)選擇對代謝物組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化的方法(Normalization method for metabolomics data using optimal selection of multiple internal standards),Μ· Sysi-Aho,M. Katajamaa,L. Yetukuril 禾口 Μ· Oresic BMC Bioinformatics 2007,8:93)。 然而,在高通量代謝物情況分析的情形中,由于化學(xué)多樣性,它的執(zhí)行可能變成令人畏懼的任務(wù)i)使用單一內(nèi)標(biāo)不保證其對于廣泛收集化合物的效能ii)大量內(nèi)標(biāo)的成本和商業(yè)可用性,以及iii)需要專用分析步驟的矩陣效應(yīng)(matrix effect) 0生物樣品的定量代謝物組學(xué)情況分析中的其他選項需要分離-分子ID方法,例如氣相色譜-質(zhì)譜(“GC-MS”)和原始樣品的衍生。(W0/2007/008307)。在原始代謝物衍生后,數(shù)據(jù)校正和驗證策略提供了代謝物衍生物的權(quán)重平均值。在這種情況分析方法中,將樣品與衍生試劑合并以產(chǎn)生衍生物,并在衍生物上執(zhí)行分離-分子ID和定量方法以獲得相應(yīng)的峰面積,包含測量衍生物的峰面積。參考文獻(xiàn)依靠數(shù)字的代謝物組學(xué)獲取和理解整體代謝物數(shù)據(jù)(Metabolomics by numbers -acquiring and understanding global metabolite data)R. Goodacre, S. Vaidyanathan, W. B. Dunn, . G. Harrigan 禾口 D. B. Kell TRENDS in Biotechnology 2004,22(5)245-252關(guān)于高通量質(zhì)譜數(shù)據(jù)中非隨機丟失值的歸一化(Normalization Regarding Non-Random Missing Values in High-Throughput Mass Spectrometry Data)P. Wang, H. Tang, H. Zhang, J. Whiteaker, A. G. Paulovich 禾口 Μ· McintoshPacific Symposium on Biocomputing,2006,11 :315-326使用多種內(nèi)標(biāo)的最優(yōu)選擇對代謝物組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化的方法(Normalization method for metabolomics data using optimal selection of multiple internal standards)M. Sysi-Aho, M. Katajamaa, L. Yetukuril 禾口 Μ· OresicBMC Bioinformatics 2007,8:93大規(guī)模人類代謝物組學(xué)研究用于數(shù)據(jù)(預(yù))處理和驗證的策略(Large-Scale Human Metabolomics Studies :A Strategy for Data (Pre-)Processing and Validation)S. Bi jlsma, I. Bobeldi jk, E. R. Verhei j, R. Ramaker, S. Kochhar, I. A. Macdonald, B. van Ommen 禾口 k. K. SmildeAnal. Chem.,2006 78 (2),567-574關(guān)于生物流體ID IH-NMR數(shù)據(jù)歸一化的意見(A note on normalization of biofluid ID IH-NMR data)R. J. 0. Torgrip, K. M. Aberg 1, E. Aim, I. Schuppe-Koistinen 禾口 J. LindbergMetabolomics,2008 4(2), 114-121用于尿樣代謝物組學(xué)分析的歸一化策略(Normalization strategies for metabolomic analysis of urine samples)B. M. ffarrack, S. Hnatyshyn, K. -H. Ott, M. D. Reily, M. Sanders, H. Zhang 禾口 D. Μ. DrexlerJournal of Chromatography B,2009,877 (5-6),547-552
23
概率商數(shù)歸一化作為說明復(fù)雜生物混合物稀釋的強有力方法,在IH NMR代謝物組學(xué)中的應(yīng)用(Probabilistic quotient normalization as robust method to account for dilution of complex biological mixtures. Application in IH NMR metabolomics)F. Dieterle, A. Ross, G. Schlotterbeck, H. SennAnal Chem. ,2006,78(13),4281-90使用流動注射電噴霧質(zhì)譜代謝物指紋數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理、分類建模和特點選擇(Preprocessing, classification modeling and feature selection using flow injection electrospray mass spectrometry metabolite fingerprint data)D. P. Enot, W. Lin, M. Beckmann, D. Parker, D. P. Overy 禾口 J. DraperNature Protocols,2008,3,446-470 (W0/2007/008307)用于定量高通量代謝物組學(xué)情況分析的數(shù)據(jù)校正、歸一 U 禾口驗 ilE (Data correction, normalization and validation for quantitative high-throughput metabolomic profiling)

發(fā)明內(nèi)容
概括來說,現(xiàn)有技術(shù)目前沒有在代謝物組學(xué)分析方法中提出可靠的歸一化方法。因此,本發(fā)明的目的是為代謝物組學(xué)分析方法提供可靠的歸一化。這個目的通過權(quán)利要求1的歸一化方法和權(quán)利要求13的內(nèi)源參比代謝物的應(yīng)用得以實現(xiàn)。具體來說,本發(fā)明涉及用于將對應(yīng)于哺乳動物對象的生物樣品中所選靶代謝物的量和/或濃度的強度數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化的方法,其中所述強度數(shù)據(jù)使用一種或多種內(nèi)源參比代謝物通過代謝物組學(xué)分析方法獲得,所述方法包含對所述生物樣品中的所述所選靶代謝物執(zhí)行至少一種體外代謝物組學(xué)分析方法;同時在同一樣品中執(zhí)行一種或多種內(nèi)源參比代謝物或其衍生物的定量分析,其中所述內(nèi)源參比代謝物是生物樣品中以基本上恒定的水平存在于對象中的化合物;其中所述內(nèi)源參比代謝物或其衍生物具有小于1500Da的分子質(zhì)量,并且選自氨基酸,特別是精氨酸、天冬氨酸、瓜氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、亮氨酸、異亮氨酸、 組氨酸、鳥氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、絲氨酸、色氨酸、酪氨酸、纈氨酸、犬尿氨酸;苯硫基氨甲酰基氨基酸(PTC-氨基酸),特別是PCT-精氨酸、PTC-谷氨酰胺、 PTC-組氨酸、PTC-甲硫氨酸、PTC-鳥氨酸、PTC-苯丙氨酸、PTC-脯氨酸、PTC-絲氨酸、 PTC-色氨酸、PTC-酪氨酸、PTC-纈氨酸; 二甲基精氨酸,特別是N,N- 二甲基-L-精氨酸;羧酸,即15(S)-羥基- ,8Z,llZ,13E-二十碳四烯酸[(5Z,8Z,llZ,13E, 15S)-15-羥基二十碳-5,8,11,13-四烯酸]、琥珀酸;肉毒堿類;在酰基殘基中具有1至20個碳原子的?;舛緣A;在酰基殘基中具有 3至20個碳原子并且在?;鶜埢芯哂?至4個雙鍵的酰基肉毒堿;在酰基殘基中具有1 至20個碳原子并且在?;鶜埢芯哂?至3個OH基的?;舛緣A;在酰基殘基中具有3
24至20個碳原子并在?;鶜埢芯哂?至4個雙鍵和1至3個OH基的酰基肉毒堿;磷脂類,特別是在?;鶜埢芯哂?至30個碳原子的溶血磷脂酰膽堿(單酰基磷脂酰膽堿);在?;鶜埢芯哂?至30個碳原子并在?;鶜埢芯哂?至6個雙鍵的溶血磷脂酰膽堿;在?;鶜埢芯哂锌偣?至50個碳原子的磷脂酰膽堿(二?;字D憠A);在?;鶜埢芯哂锌偣?至50個碳原子并在?;鶜埢芯哂锌偣?至8個雙鍵的磷脂酰膽堿;鞘磷脂類,特別是在酰基鏈中總碳原子數(shù)為10至30的神經(jīng)鞘磷脂;在?;溨锌偺荚訑?shù)為10至 30并具有1至5個雙鍵的神經(jīng)鞘磷脂;在?;鶜埢锌偺荚訑?shù)為10至30的羥基神經(jīng)鞘磷脂;在?;鶜埢锌偺荚訑?shù)為10至30并具有1至5個雙鍵的羥基神經(jīng)鞘磷脂;前列腺素類,即6-酮基-前列腺素Fl α、前列腺素D2 ;腐胺;并且其中每種所述所選靶代謝物的所述檢測到的強度與所述內(nèi)源參比代謝物的所述強度相關(guān)。在本發(fā)明的優(yōu)選方法中,對靶和內(nèi)源參比代謝物的多個強度進(jìn)行數(shù)學(xué)預(yù)處理,特別是變換例如使用算法、廣義化算法、冪變換。在本發(fā)明的優(yōu)選實施方案中,將所述內(nèi)源參比代謝物的多個強度歸并成一個參比值。在后一種情況下,通過計算幾何平均值、算術(shù)平均值、中位數(shù)值、權(quán)重算數(shù)平均值將內(nèi)源參比代謝物的多個強度歸并成一個參比值,可能是優(yōu)選的。優(yōu)選情況下,在線性強度的情況下形成靶代謝物的每個強度與測定到的參比值的比率,或者在對數(shù)強度的情況下從每個靶代謝物強度中減去測定到的參比值。一般來說,出于本發(fā)明的目的,所述代謝物組學(xué)分析方法包含通過質(zhì)譜術(shù)(MS)、特別是MS技術(shù)例如基質(zhì)輔助激光解吸/電離(MALDI)、電噴霧電離(ESI)、大氣壓化學(xué)電離 (APCI)、任選與MS偶聯(lián)的1H-J3C-和/或31P-核磁共振波譜(NMR)產(chǎn)生用于為內(nèi)源代謝物定量的強度數(shù)據(jù),通過使用與分離技術(shù)、特別是液相色譜(LC-MQ、氣相色譜(GC-MQ或毛細(xì)管電泳(CE-MQ偶聯(lián)的MS技術(shù)和/或方法來測定代謝物濃度,所述技術(shù)對于專業(yè)技術(shù)人員來說是公知的。本發(fā)明的優(yōu)選實施方案在于內(nèi)源參比代謝物,其選自
15 ⑶-羥基-5Z,8Z,11Z,13E- 二十碳四烯酸6-酮基-前列腺素Fl α不對稱二甲基精氨酸精氨酸PTC-精氨酸天冬氨酸肉毒堿(游離)癸?;舛緣A(反丁烯二?;舛緣A)
癸烯?;舛緣A癸二烯?;舛緣A十二?;舛緣A[月桂酰肉毒堿]十二烯酰基肉毒堿十二烷二?;舛緣A十四?;舛緣A十四烯酰基肉毒堿[肉豆蔻?;舛緣A]3-羥基十四烯?;舛緣A[3-羥基肉豆蔻?;舛緣A]3-羥基十四碳二烯?;舛緣A3-羥基十四?;舛緣A[羥基肉豆蔻?;舛緣A]十六烯?;舛緣A[棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六烯?;舛緣A[3-羥基棕櫚油?;舛緣A]十六碳二烯?;舛緣A3-羥基十六碳二烯?;舛緣A3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚?;舛緣A]十八碳?;舛緣A[硬脂?;舛緣A]十八碳烯酰基肉毒堿[油酰肉毒堿]3-羥基十八碳烯?;舛緣A[3-羥基油酰肉毒堿]乙酰肉毒堿丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿丁烯酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿異戊?;舛緣A/2-甲基丁酰肉毒堿/戊酰基肉毒堿甲基巴豆?;舛緣A/3-甲基-巴豆?;舛緣A戊二酸單?;舛緣A/羥基己酰基肉毒堿戊二酸單?;舛緣A/羥基己?;舛緣A甲基戊二酸單酰基肉毒堿3-羥基異戊?;舛緣A/3-羥基-2-甲基丁?;舛緣A己酰基肉毒堿己烯?;舛緣A庚二?;舛緣A辛?;舛緣A辛烯?;舛緣A壬?;舛緣A瓜氨酸肌酸酐谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺
谷氨酸組氨酸PTC-組氨酸犬尿氨酸亮氨酸酰基殘基為C14 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃16 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃16 1的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C18 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃18 1的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C18 2的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃20 3的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃20 4的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃M 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 0的溶血磷脂酰膽堿
?;鶜埢鶠橐? 1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃6 0的溶血磷脂酰膽堿PTC-甲硫氨酸鳥氨酸PTC-鳥氨酸二酰基殘基總和為C24:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑橐? 0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C28:1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃30:0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C30:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:3的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C34:1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34:2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C34:3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34:4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36 2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36:3的磷脂酰膽堿
二?;鶜埢偤蜑镃36:4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36 5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:6的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:1的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C38 3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38 6的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:1的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C40:3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃40 4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃40:5的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C40 6的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42 1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42 4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 5的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42 6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C30 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C30 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34:2的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C34 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:2的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C36 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:2的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:4的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38:5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 0的磷脂酰膽堿
酰基-烷基殘基總和為C40:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 2的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 5的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C40:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 0的磷脂酰膽堿
酰基-烷基殘基總和為C42 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44 6的磷脂酰膽堿前列腺素D2苯丙氨酸PTC-苯丙氨酸脯氨酸PTC-脯氨酸腐胺絲氨酸PTC-絲氨酸?;鶜埢偤蜑镃14:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22 1的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22:2的羥基神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C24:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:1的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C18:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃18:1的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C20 2的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22 3的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:1的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑橐? 0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為以6 1的神經(jīng)鞘磷脂琥珀酸總二甲基精氨酸ADMA+SDMA的總和色氨酸
29
PTC-色氨酸酪氨酸纈氨酸PTC-纈氨酸亮氨酸+異亮氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示?;?烷基殘基的鏈長,η表示酰基/烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。此外,特別優(yōu)選情況下使用這樣的代謝物作為根據(jù)統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性的內(nèi)源參比代謝物,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho)ο此外,使用這樣的代謝物作為根據(jù)至少2種統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性的內(nèi)源參比代謝物,可能是優(yōu)選的,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、 對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho),和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說選自PTC-精氨酸肉毒堿(游離)癸烯?;舛緣A癸?;舛緣A(反丁烯二?;舛緣A)十二烯?;舛緣A十二烷二?;舛緣A十二?;舛緣A[月桂酰肉毒堿]十四酰基肉毒堿3-羥基十四?;舛緣A[羥基肉豆蔻酰基肉毒堿]十六烯?;舛緣A[棕櫚油酰基肉毒堿]3-羥基十六烯?;舛緣A[3-羥基棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六碳二烯?;舛緣A3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚酰基肉毒堿]3-羥基十八碳烯酰基肉毒堿[3-羥基油酰肉毒堿]丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿甲基戊二酸單?;舛緣A3-羥基異戊酰基肉毒堿/3-羥基-2-甲基丁?;合;舛緣A己酰基肉毒堿庚二?;舛緣A辛烯?;舛緣A辛?;舛緣A
谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺PTC-組氨酸?;鶜埢鶠镃14 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 0的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為以6 1的溶血磷脂酰膽堿
?;鶜埢鶠橐? 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 1的溶血磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C24:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑橐? 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃30 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃30 2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32 2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36 0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36 2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:4的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C38 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38 1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 1的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C30 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36 0的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38 4的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38 6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44 6的磷脂酰膽堿苯丙氨酸PTC-苯丙氨酸脯氨酸
?;鶜埢偤蜑镃16 0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C16:1的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃18:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃18:1的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C20 2的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C24:1的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃14:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22:2的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂琥珀酸PTC-色氨酸纈氨酸PTC-纈氨酸亮氨酸+異亮氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示酰基/烷基殘基的鏈長,η表示?;?烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。在本發(fā)明的另一個優(yōu)選實施方案中,所述所選內(nèi)源參比代謝物根據(jù)至少3種統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、 對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho),和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說選自肉毒堿(游離)癸?;舛緣A(反丁烯二酰基肉毒堿)十二烷二?;舛緣A十二?;舛緣A[月桂酰肉毒堿]十六烯?;舛緣A[棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六烯酰基肉毒堿[3-羥基棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚?;舛緣A]丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿甲基戊二酸單酰基肉毒堿己?;舛緣A庚二?;舛緣A辛烯?;舛緣A辛?;舛緣A谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺
PTC-組氨酸?;鶜埢鶠镃14 0的溶血磷脂酰膽堿
酰基殘基為以6 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 1的溶血磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑橐? 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32 2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 1的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:4的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C40 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 0的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44 6的磷脂酰膽堿?;鶜埢偤蜑镃16:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C16:1的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃20 2的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C24:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂纈氨酸PTC-纈氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示?;?烷基殘基的鏈長,η表示?;?烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。本發(fā)明的另一個優(yōu)選方法使用根據(jù)所有統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性的內(nèi)源參比代謝物,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geN0rm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho), 和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說是二?;鶜埢偤蜑镃42:6的磷脂酰膽堿,其中名稱“C42:6”表示?;鶜埢逆滈L,42表示?;鶜埢械目偺荚訑?shù),6表示殘基中的總雙鍵數(shù)。在本發(fā)明的范圍內(nèi),所述多種內(nèi)源參比代謝物包含2至80種、特別是2至60種、 優(yōu)選2至50種、優(yōu)選2至30種、更優(yōu)選2至10種、特別優(yōu)選2至10種、優(yōu)選3至5種內(nèi)源參比代謝物。本發(fā)明的另一個實施方案是一種或多種化合物或其衍生物在代謝物組學(xué)分析方法中作為內(nèi)源參比代謝物的應(yīng)用,其中所述化合物具有小于1500Da的分子質(zhì)量,其中所述內(nèi)源參比代謝物選自氨基酸,特別是精氨酸、天冬氨酸、瓜氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、亮氨酸、異亮氨酸、組氨酸、鳥氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、絲氨酸、色氨酸、酪氨酸、纈氨酸、犬尿氨酸;苯硫基氨甲?;被?PTC-氨基酸),特別是PCT-精氨酸、PTC-谷氨酰胺、 PTC-組氨酸、PTC-甲硫氨酸、PTC-鳥氨酸、PTC-苯丙氨酸、PTC-脯氨酸、PTC-絲氨酸、 PTC-色氨酸、PTC-酪氨酸、PTC-纈氨酸;二甲基精氨酸,特別是N,N- 二甲基-L-精氨酸;羧酸,即15(S)-羥基- ,8Z,llZ,13E-二十碳四烯酸[(5Z,8Z,llZ,13E, 15S)-15-羥基二十碳-5,8,11,13-四烯酸]、琥珀酸;肉毒堿類;在?;鶜埢芯哂?至20個碳原子的酰基肉毒堿;在酰基殘基中具有 3至20個碳原子并且在?;鶜埢芯哂?至4個雙鍵的酰基肉毒堿;在酰基殘基中具有1 至20個碳原子并且在?;鶜埢芯哂?至3個OH基的?;舛緣A;在?;鶜埢芯哂? 至20個碳原子并在?;鶜埢芯哂?至4個雙鍵和1至3個OH基的?;舛緣A;磷脂類,特別是在?;鶜埢芯哂?至30個碳原子的溶血磷脂酰膽堿(單酰基磷脂酰膽堿);在酰基殘基中具有3至30個碳原子并在?;鶜埢芯哂?至6個雙鍵的溶血磷脂酰膽堿;在?;鶜埢芯哂锌偣?至50個碳原子的磷脂酰膽堿(二?;字D憠A);在?;鶜埢芯哂锌偣?至50個碳原子并在酰基殘基中具有總共1至8個雙鍵的磷脂酰膽堿;鞘磷脂類,特別是在?;溨锌偺荚訑?shù)為10至30的神經(jīng)鞘磷脂;在?;溨锌偺荚訑?shù)為10至 30并具有1至5個雙鍵的神經(jīng)鞘磷脂;在?;鶜埢锌偺荚訑?shù)為10至30的羥基神經(jīng)鞘磷脂;在?;鶜埢锌偺荚訑?shù)為10至30并具有1至5個雙鍵的羥基神經(jīng)鞘磷脂;前列腺素類,即6-酮基-前列腺素Fl α、前列腺素D2 ;腐胺。正如前面提到的,所述代謝物組學(xué)分析方法包含通過質(zhì)譜術(shù)(MQ、特別是MS技術(shù)例如基質(zhì)輔助激光解吸/電離(MALDI)、電噴霧電離(ESI)、大氣壓化學(xué)電離(APCI)、任選與 MS偶聯(lián)的1H-J3C-和/或Mp-核磁共振波譜(NMR)對內(nèi)源靶和參比代謝物進(jìn)行定量,通過使用與分離技術(shù),特別是液相色譜(LC-MQ、氣相色譜(GC-MQ或毛細(xì)管電泳(CE-MQ偶聯(lián)的MS技術(shù)和/或方法來測定代謝物濃度??梢杂米鞅景l(fā)明的內(nèi)源參比代謝物的特別優(yōu)選的化合物選自15 (S)-羥基-5Ζ, 8Ζ,11Ζ,13Ε-二十碳四烯酸6-酮基-前列腺素Fl α不對稱二甲基精氨酸精氨酸PTC-精氨酸天冬氨酸肉毒堿(游離)癸酰基肉毒堿(反丁烯二?;舛緣A)癸烯?;舛緣A癸二烯?;舛緣A
34
十二?;舛緣A[月桂酰肉毒堿]十二烯?;舛緣A十二烷二酰基肉毒堿十四?;舛緣A十四烯?;舛緣A[肉豆蔻?;舛緣A]3-羥基十四烯酰基肉毒堿[3-羥基肉豆蔻?;舛緣A]3-羥基十四碳二烯?;舛緣A3-羥基十四?;舛緣A[羥基肉豆蔻?;舛緣A]十六烯?;舛緣A[棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六烯?;舛緣A[3-羥基棕櫚油酰基肉毒堿]十六碳二烯?;舛緣A3-羥基十六碳二烯酰基肉毒堿3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚?;舛緣A]十八碳酰基肉毒堿[硬脂?;舛緣A]十八碳烯酰基肉毒堿[油酰肉毒堿]3-羥基十八碳烯?;舛緣A[3-羥基油酰肉毒堿]乙酰肉毒堿丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿丁烯酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿異戊酰基肉毒堿/2-甲基丁酰肉毒堿/戊?;舛緣A甲基巴豆?;舛緣A/3-甲基-巴豆?;舛緣A戊二酸單?;舛緣A/羥基己酰基肉毒堿戊二酸單?;舛緣A/羥基己酰基肉毒堿甲基戊二酸單?;舛?br> 3-羥基異戊?;舛緣A/3-羥基-2-甲基丁?;乎;舛緣A己烯酰基肉毒堿庚二?;舛緣A辛?;舛緣A辛烯?;舛緣A壬?;舛緣A瓜氨酸肌酸酐谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺谷氨酸組氨酸
PTC-組氨酸犬尿氨酸亮氨酸?;鶜埢鶠镃14 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃16 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃16 1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃18 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃18 1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃18 2的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃20 3的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C20 4的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃M 0的溶血磷脂酰膽堿
酰基殘基為以6 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 1的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C6 0的溶血磷脂酰膽堿PTC-甲硫氨酸鳥氨酸PTC-鳥氨酸二?;鶜埢偤蜑镃M 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑橐? 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃28:1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃30 0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C30 2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32 0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C32 1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32 2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C32 3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34 1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34 2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34 3的磷脂酰膽堿
二?;鶜埢偤蜑镃34 4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36 0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36 1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36 2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36 3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36 4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36 5的磷脂酰膽堿
二?;鶜埢偤蜑镃36 6的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38 1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38 4的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C38 5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38 6的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42 1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃40 3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃40 4的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C40 5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃40 6的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42 0的磷脂酰膽堿
二?;鶜埢偤蜑镃42 1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42 4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C30 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C30 1的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C34 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34 1的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C34 2的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34:3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36 0的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C36 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36 2的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36 3的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C36 4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38 0的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38 2的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38 3的磷脂酰膽堿
?;?烷基殘基總和為C38 4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38 5的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38 6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 2的磷脂酰膽堿
37
酰基-烷基殘基總和為C40 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44 6的磷脂酰膽堿前列腺素D2苯丙氨酸PTC-苯丙氨酸脯氨酸PTC-脯氨酸腐胺絲氨酸PTC-絲氨酸酰基殘基總和為C14:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C22 1的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22 2的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:1的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃18:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃18:1的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃20 2的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22 3的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C24:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:1的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為以6 0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑橐? 1的神經(jīng)鞘磷脂琥珀酸總二甲基精氨酸ADMA+SDMA的總和色氨酸PTC-色氨酸酪氨酸
纈氨酸PTC-纈氨酸亮氨酸+異亮氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示?;?烷基殘基的鏈長,η表示?;?烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。本發(fā)明的另一個有利實施方案是使用這樣的化合物作為根據(jù)統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性的內(nèi)源參比代謝物,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù) (CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geN0rm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho)。優(yōu)選情況下,這樣的化合物可以用作根據(jù)至少2種統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性的內(nèi)源參比代謝物,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho),和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說選自PTC-精氨酸肉毒堿(游離)癸烯?;舛緣A癸?;舛緣A(反丁烯二?;舛緣A)十二烯?;舛緣A十二烷二?;舛緣A十二?;舛緣A[月桂酰肉毒堿]十四?;舛緣A3-羥基十四?;舛緣A[羥基肉豆蔻?;舛緣A]十六烯酰基肉毒堿[棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六烯酰基肉毒堿[3-羥基棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六碳二烯酰基肉毒堿3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚?;舛緣A]3-羥基十八碳烯?;舛緣A[3-羥基油酰肉毒堿]丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿甲基戊二酸單酰基肉毒堿3-羥基異戊?;舛緣A/3-羥基-2-甲基丁酰基己烯?;舛緣A己?;舛緣A庚二?;舛緣A辛烯?;舛緣A辛?;舛緣A谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺
PTC-組氨酸?;鶜埢鶠镃14 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 0的溶血磷脂酰膽堿
酰基殘基為以6 1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 0的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為以8 1的溶血磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃M 0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為以6 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃30 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃30 2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32 2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34 2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36 0的磷脂酰膽堿
二?;鶜埢偤蜑镃36 2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36 4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38 1的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42 1的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C30 1的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C34 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38 4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38 6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 6的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C42 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42:5的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C44 6的磷脂酰膽堿苯丙氨酸PTC-苯丙氨酸脯氨酸?;鶜埢偤蜑镃16:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C16:1的神經(jīng)鞘磷脂
?;鶜埢偤蜑镃18:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃18:1的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃20:2的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:1的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃14:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22 2的羥基神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C24:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂琥珀酸PTC-色氨酸纈氨酸PTC-纈氨酸亮氨酸+異亮氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示?;?烷基殘基的鏈長,η表示?;?烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。本發(fā)明的另一種有利應(yīng)用是使用這種根據(jù)至少3種統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性的內(nèi)源參比代謝物,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho),和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說選自肉毒堿(游離)癸?;舛緣A(反丁烯二?;舛緣A)十二烷二?;舛緣A十二?;舛緣A[月桂酰肉毒堿]十六烯?;舛緣A[棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六烯?;舛緣A[3-羥基棕櫚油酰基肉毒堿]3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚?;舛緣A]丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿甲基戊二酸單酰基肉毒堿己?;舛緣A庚二?;舛緣A辛烯?;舛緣A辛?;舛緣A谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺PTC-組氨酸?;鶜埢鶠镃14 0的溶血磷脂酰膽堿
?;鶜埢鶠橐? 0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠橐? 1的溶血磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑橐? 0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C32 2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36 0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C38 0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42 1的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿
二?;鶜埢偤蜑镃42 6的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38 4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44 6的磷脂酰膽堿酰基殘基總和為C16:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C16:1的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃20 2的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C24:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:1的羥基神經(jīng)鞘磷脂纈氨酸PTC-纈氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示酰基/烷基殘基的鏈長,η表示酰基/烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。本發(fā)明的另一個優(yōu)選實施方案使用這樣的化合物作為根據(jù)所有統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性的內(nèi)源參比代謝物,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù) (CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho),和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說是二酰基殘基總和為C42 6 的磷脂酰膽堿,其中名稱“C42:6”表示?;鶜埢逆滈L,42表示酰基殘基中的總碳原子數(shù), 6表示殘基中的總雙鍵數(shù)。此外,優(yōu)選使用2至80種、特別是2至60種、優(yōu)選2至50種、優(yōu)選2至30種、更優(yōu)選2至10種、特別優(yōu)選2至10種、優(yōu)選3至5種化合物作為內(nèi)源參比代謝物。對用于代謝物組學(xué)數(shù)據(jù)歸一化的好方法的需求再怎么強調(diào)也不為過,并且這種方法是需要定量數(shù)據(jù)或與參比值進(jìn)行比較的應(yīng)用、例如診斷學(xué)中所需的先決條件。存在大量技術(shù)性變差的來源,例如試劑的裝載影響、批次影響、稀釋影響、內(nèi)標(biāo)在向組織添加后的不可重現(xiàn)的分布以及實驗條件中被忽視的變化。理想情況下,歸一化也應(yīng)該允許對從不同樣品類型、不同物種獲得的以及在不同測定平臺上和由不同實驗室測定的數(shù)據(jù)進(jìn)行直接比較。此外,更具體來說,與質(zhì)譜相關(guān)的未解決問題包括對數(shù)據(jù)的跨矩陣、跨組織和跨物種比較來說有害的矩陣特異性信號抑制或離子抑制。
42
必須執(zhí)行上述步驟來轉(zhuǎn)變原始信號信息,以適合于隨后的數(shù)據(jù)分析和解釋的格式提呈數(shù)據(jù)。然而,即使使用對照點或外部對照樣品,不希望得到的實驗變差仍能污染數(shù)據(jù)。 在實驗中也可能遺漏一些或所有物理歸一化技術(shù),在這種情況下發(fā)現(xiàn)其他歸一化手段甚至更加重要。理論上說,用于代謝物組學(xué)的理想內(nèi)源標(biāo)準(zhǔn)品是一種化合物或一組化合物,其濃度水平在細(xì)胞周期中、細(xì)胞類型之間、各種疾病狀態(tài)之間、各種健康狀態(tài)之間或?qū)θ藗兿M麢z驗的實驗性治療做出響應(yīng)而不發(fā)生變化。此外,對于在代謝物組學(xué)中有效的內(nèi)源標(biāo)準(zhǔn)品 (其是內(nèi)源代謝物)來說,關(guān)鍵是它應(yīng)該與代謝物測定法中的測試和參比(或靶)代謝物具有相似的相對豐度。到目前為止還沒有描述過這樣的分子,也沒有描述過在定量多參數(shù)代謝物組學(xué)和使用質(zhì)譜或產(chǎn)生定量或相對濃度數(shù)據(jù)的任何其他方法進(jìn)行代謝物水平測定的情形中利用這些分子的方法。使用外源添加的標(biāo)準(zhǔn)品,具有使用戶對照超過所添加的化合物量的優(yōu)點,導(dǎo)致樣品間變差低。然而,使用外源標(biāo)準(zhǔn)品不能控制用于開始工作并隨后進(jìn)行分析的起始材料或組織的質(zhì)量的差異。如果在其他方面都一致的樣品之間存在代謝物完整性水平的差異,提取得率將反映出這種變差,盡管外部標(biāo)準(zhǔn)品仍將表現(xiàn)一致。在理論上,內(nèi)源標(biāo)準(zhǔn)品——其不能與也是從外部添加的內(nèi)標(biāo)混淆——可以避開許多上面列出的代謝物組學(xué)實驗中的問題。然而,盡管在基因表達(dá)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的背景下內(nèi)源持家基因的概念是已知的,但持家代謝物或組合的產(chǎn)生、鑒定和應(yīng)用以及它們的組合使用, 在代謝物組學(xué)中是未知的,并且盡管存在大量描述代謝數(shù)據(jù)在各種情形中的應(yīng)用的研究, 但在代謝物組學(xué)中使用對照、持家或內(nèi)源參比代謝物尚未被描述。然而,由于營養(yǎng)狀況或食物攝取量的變差,物種間代謝物濃度對生理和環(huán)境條件做出響應(yīng)而發(fā)生顯著變化,因此鑒定和使用內(nèi)源化合物或代謝物作為歸一化工具已被評估為高度不可能。鑒定在不同組織、不同物種之間、更不用說各種健康狀態(tài)之間或在患有不同疾病的對象中變差有限的內(nèi)源化合物,甚至更加不可能,并且在任何情況下都不明顯。具體來說,對于本技術(shù)領(lǐng)域的普通專業(yè)人員來說,令人吃驚的是在本申請中鑒定到的化合物可以用作內(nèi)源參比代謝物。在下面的實施例中描述的實驗結(jié)果進(jìn)一步顯示,在代謝物組學(xué)中獲得了明顯提高的預(yù)測力,正如在使用內(nèi)源參比代謝物與不使用內(nèi)源參比代謝物歸一化的實施例的比較中所顯示的。盡管存在現(xiàn)有技術(shù)中的障礙,本發(fā)明人仍調(diào)查了是否有可能鑒定具有最小濃度變化或“恒定”水平的多種代謝物,其可用于歸一化,因此是用于鑒定、測定、定量和應(yīng)用其他可變代謝物的疾病相關(guān)的濃度變化,以及將這些參比或?qū)φ沾x物與可變代謝物的測定相結(jié)合應(yīng)用于診斷工具中的先決條件。在本發(fā)明的方法中,本發(fā)明顯示出內(nèi)源參比代謝物或持家代謝物的子集確實存在,并且對于這些代謝物來說,水平的分布在確定限度內(nèi)保持恒定,或具有令人吃驚地不依賴于任何具體樣品、對象的生理狀況、樣品建立和組織的某些平均值和標(biāo)準(zhǔn)偏差。因此,本發(fā)明為歸一化代謝物數(shù)據(jù)的難題提供了通用方法和新的解決方案,提供了產(chǎn)生內(nèi)源參比代謝物的通用方法,提供了使用內(nèi)源參比代謝物的方法以及內(nèi)源參比化合物和代謝物的名單。本發(fā)明的另一個目的,是通過產(chǎn)生并提供用于對代謝物和代謝物組學(xué)測定中的相對信號強度進(jìn)行歸一化的新的內(nèi)源標(biāo)準(zhǔn)品的名單,提供用于將這些標(biāo)準(zhǔn)品應(yīng)用于歸一化并因此應(yīng)用于代謝物定量測定和診斷的方法,以致力于并解決上面概述的代謝物組學(xué)數(shù)據(jù)歸一化和數(shù)據(jù)應(yīng)用中的問題。本發(fā)明提供了對代謝物組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行比較、定量和歸一化以及因此應(yīng)用它們的解決方案,所述代謝物組學(xué)數(shù)據(jù)的產(chǎn)生是通過使用包括但不限于質(zhì)譜術(shù)(MQ、特別是MS技術(shù)例如MALDI、ESI、大氣壓化學(xué)電離(APCI)和其他方法來定量內(nèi)源代謝物,使用MS技術(shù)或與分離(LC-MS、LC-NMR、GC-MS, CE-MS)偶聯(lián)的可選方法來確定代謝物濃度,隨后進(jìn)行特征選擇和/或特征到分類物的組合,包括至少兩種分子或相同或不同分子的至少兩種被分析物的分子數(shù)據(jù),以及對從不同對象、不同物種、不同取樣時間點、由不同人處理和在不同實驗條件下獲得的這些數(shù)據(jù)進(jìn)行比較。我們證實了內(nèi)源參比代謝物組在來自不同物種、不同組織和建立條件的樣品間令人吃驚地顯示出濃度的最小變差。我們還演示了在疾病狀態(tài)表征或診斷中的應(yīng)用。因此,本發(fā)明提供了強有力的對照代謝物,其在各種物種、動物模型、健康狀況、樣品類型、樣品建立和實驗設(shè)置、組織類型或體液、樣品處理和測定條件以及內(nèi)含物分析測定中令人吃驚地顯示出幾乎不變的水平,允許對代謝物特征進(jìn)行歸一化、鑒定并應(yīng)用于不同的生物學(xué)狀態(tài),或與不同疾病、這些疾病相應(yīng)的等級及其在人類或哺乳動物模型系統(tǒng)中療法的響應(yīng)相關(guān)聯(lián),而不論使用何種實驗設(shè)置和測定平臺。本發(fā)明還涉及將代謝物測量值用于例如診斷、分類或鑒定疾病,對將來的發(fā)展預(yù)后,辨別各種疾病狀態(tài),控制治療方式或治療的時間長度,控制藥物攝取的結(jié)果或不同內(nèi)源藥物濃度的結(jié)果或由實驗條件引起的對內(nèi)源代謝物水平的任何結(jié)果。它提供了參比點和適合的基礎(chǔ)值,用于鑒定和識別與疾病相關(guān)的代謝變化,并因此可應(yīng)用于診斷和治療檢測。代謝物測量值的使用依賴于在體液、細(xì)胞和組織中檢測或測量代謝物的差異濃度的能力。被分析的代謝物包括以與目標(biāo)生物表型相關(guān)的方式被差異檢測的代謝物。在樣品或?qū)ο蟮募?xì)胞、組織或體液中測定一種或多種濃度有差異的代謝物的代謝物水平,然后直接使用一種或多種被分析物的代謝物濃度水平,或者在測定多種被分析物的情況下,對它們進(jìn)行相互比較來使用。后一種情況的一個非限制性實例是測定兩個樣品的代謝物濃度水平,然后使用一種與另一種的比率。當(dāng)將水平針對參比值進(jìn)行歸一化時,細(xì)胞、組織、體液中以及不同樣品和/或來源的樣本之間和跨實驗或?qū)嶒灉y量日期的代謝物水平的比較得到改進(jìn)。這可以被視為歸一化至單一標(biāo)度。例如但不限于當(dāng)使用代謝物組學(xué)或具有多個探針的代謝物組學(xué)試劑盒測定代謝物水平時,歸一化的使用允許直接進(jìn)行測定之間的比較,或者在多孔板上測定的情況下進(jìn)行板之間的比較?!百|(zhì)譜術(shù)”(MQ是用于測量和分析分子的技術(shù),其涉及將靶分子片段化,然后根據(jù)片段的質(zhì)量/電荷比分析片段,以產(chǎn)生用作“分子指紋”的質(zhì)譜圖。通過測定物體吸收電磁能的波長的手段來進(jìn)行物體的質(zhì)量/電荷比的確定。有幾種常用于測定離子的質(zhì)量電荷比的方法,其中一些測量離子軌道與電磁波的相互作用,其他的測量離子通過給定距離所花費的時間,或二者的組合。來自這些片段質(zhì)量測量的數(shù)據(jù)可以針對數(shù)據(jù)庫進(jìn)行搜索,以獲得靶分子的決定性鑒定。質(zhì)譜術(shù)也廣泛用于其他化學(xué)領(lǐng)域,例如石油化學(xué)或藥物質(zhì)量控制等寸。
“離子”是通過向原子添加電子或從原子移除電子而形成的帶電物體?!百|(zhì)譜圖”是由質(zhì)譜儀產(chǎn)生的數(shù)據(jù)圖,典型包含χ-軸上的m/z值和y_軸上的強度值。術(shù)語“m/z”是指用離子的質(zhì)量數(shù)除以其絕對電荷數(shù)而形成的無量綱的數(shù)量值。長期以來,它被稱為“質(zhì)荷”比。當(dāng)在本文中使用時,術(shù)語“代謝物”是指細(xì)胞、生物體、組織的,或存在于體液中和從上面提到的來源獲得的提取物中的內(nèi)源有機化合物,其具有典型低于1500道爾頓的分子量。代謝物的典型實例是糖類、脂類、磷脂、鞘脂類和鞘磷脂、氨基酸、膽留醇、留類激素和氧化留醇,以及其他化合物例如收集在人類代謝物數(shù)據(jù)庫[Wishart DS等,HMDB 人類代謝 ^1 (HMDB :the Human Metabolome Database), Nucleic Acids Res. 2007 Jan ;35(^ 據(jù)庫版):D521-6 (參見httD: //www, hmdb. ca/) 1和其他數(shù)據(jù)庫和文獻(xiàn)中的化合物。這包括通過代謝或通過代謝過程產(chǎn)生的任何物質(zhì)和參與代謝的任何物質(zhì)。術(shù)語“代謝”是指在生物體的組織內(nèi)發(fā)生的化學(xué)變化,包括“合成代謝”和“分解代射”。合成代謝是指分子的生物合成或形成,分解代射是指分子的分解。在本發(fā)明的范圍內(nèi)所理解的“代謝物組學(xué)”是指通過多種方法對幾種(兩千種)代謝物進(jìn)行的全面定量測量,所述方法例如但不限于質(zhì)譜術(shù),液相色譜、氣相色譜和其他分離方法與質(zhì)譜術(shù)或核磁共振(NMR)的偶聯(lián)?;|(zhì)是指用于分析或樣品建立的樣品類型,例如體液(血漿、血液)、不同組織(例如腦和肝臟)、來自生物體的不同部分例如從植物等獲得的葉與根的比較。不同的基質(zhì)也可以包括同樣的組織或體液類型,但是來自于不同物種,例如大鼠血漿與人類血漿的比較。在本發(fā)明的情形中,生物標(biāo)志物是特征,包含至少一種被測量和評估的代謝物的數(shù)據(jù),其可用作生物過程、病理過程或?qū)εc疾病狀態(tài)相關(guān)的治療干預(yù)或相關(guān)治療的響應(yīng)的指示物。當(dāng)在本文中使用時,組合生物標(biāo)志物可以選自至少兩種小的內(nèi)源分子和代謝物。被分析物是指被分析的化學(xué)實體或化合物的混合物。受限于技術(shù)(質(zhì)譜術(shù))對雙鍵位置、構(gòu)型不同的結(jié)構(gòu)異構(gòu)體(例如磷脂或甘油三酯中脂肪酸殘基的位置)的結(jié)構(gòu)解析力,因此一種被分析物可能在形式上包括一種以上代謝物。術(shù)語持家代謝物或被分析物、參比或?qū)φ沾x物在本發(fā)明中可以互換,并且是指當(dāng)對具有各種生理狀況、各種健康狀態(tài)或療法或先期治療的不同對象的不同樣品進(jìn)行比較時,在幾種樣品間量和濃度水平變差小的代謝物和被分析物。因此,對照、參比或持家代謝物是在幾種樣品中濃度變化最小并因此可用作內(nèi)源參比代謝物的代謝物。因此,這些內(nèi)源參比代謝物能夠補償與代謝物組學(xué)中的技術(shù)設(shè)置、樣品操作、實驗建立和隨機波動相關(guān)的可變性。內(nèi)源參比代謝物優(yōu)選不以統(tǒng)計學(xué)顯著的水平(例如ρ-值小于0. 05和/或q_值小于0. 05)差異存在。示例性的窒息特異性內(nèi)源參比代謝物描述在下面的詳細(xì)說明和實驗部分中。當(dāng)在本文中使用時,術(shù)語“疾病特異性內(nèi)源參比代謝物”是指與未患病生物體相比,不差異存在或差異濃縮在患病生物體中的代謝物。例如術(shù)語“窒息特異性內(nèi)源參比代謝物”是指在窒息生物體與未窒息生物體中相比具有低變化性的相同濃度水平的代謝物。當(dāng)在本文中使用時,術(shù)語“靶代謝物”是指在不同條件或不同治療下,例如患病生物體與未患病生物體相比、在治療的生物體與未治療生物體中相比等,差異存在或差異濃
45縮的代謝物。例如,術(shù)語“窒息特異性代謝物”是指在窒息生物體與未窒息生物體中相比差異存在或差異濃縮的代謝物。在本說明書和權(quán)利要求書中的術(shù)語“樣品”以其最廣泛的意義使用。一方面,它意味著包括樣本或培養(yǎng)物。有兩方面,它意味著包括生物和環(huán)境樣品兩者。樣品可以包括合成來源的樣本。生物樣品可以是動物包括人類的流體、固體(例如糞便)或組織,以及液體和固體食品和飼料制品和成分,例如乳制品、蔬菜、肉類和肉類副產(chǎn)品和垃圾。生物樣品可以從所有各種不同類型的馴養(yǎng)動物以及未馴養(yǎng)或野生動物獲得,包括但不限于例如有蹄類、熊類、 魚類、嚙齒類動物等。生物樣品可以包含適合于檢測所需生物標(biāo)志物的任何生物材料,并可以包含來自對象的細(xì)胞和/或非細(xì)胞材料。樣品可以從任何適合的生物組織或流體例如組織、血液、血漿、尿液或腦脊液(CSF)、植物提取物或加工過的生物材料(例如食品)來分離。當(dāng)在本文中使用時,術(shù)語“細(xì)胞”是指任何真核或原核細(xì)胞(例如細(xì)菌細(xì)胞例如大腸桿菌、酵母細(xì)胞、哺乳動物細(xì)胞、鳥類細(xì)胞、兩棲動物細(xì)胞、植物細(xì)胞、魚類細(xì)胞和昆蟲細(xì)胞),無論位于體外還是體內(nèi)。當(dāng)在本文中使用時,術(shù)語“檢測可以描述發(fā)現(xiàn)或察覺或特異性觀察可檢測標(biāo)記或未標(biāo)記成分的一般性行動。歸一化在本發(fā)明的背景中理解的歸一化是指通過減少或消除技術(shù)變異性使不同測定的代謝物組學(xué)數(shù)據(jù)可比的此方法。在這種比較性分析中,歸一化對于補償分離技術(shù)的變差、初始定量誤差、先前化學(xué)或酶修飾中的試管間變差和其他實驗變差來說,是必需的。本發(fā)明的方法的示意圖顯示如下
步驟1: 生物樣品獲得步驟 2:
原始數(shù)據(jù)(生物分子的濃度)的測量和在數(shù)據(jù)庫中的存放
步驟3:
來自數(shù)據(jù)庫的原始數(shù)據(jù)的預(yù)處理
權(quán)利要求
1.一種用于將對應(yīng)于哺乳動物對象的生物樣品中所選靶代謝物的量和/或濃度的強度數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化的方法,其中所述強度數(shù)據(jù)使用多種內(nèi)源參比代謝物通過代謝物組學(xué)分析方法獲得,所述方法包含對所述生物樣品中的所述所選靶代謝物執(zhí)行至少一種體外代謝物組學(xué)分析方法; 同時在同一樣品中執(zhí)行多種內(nèi)源參比代謝物或其衍生物的定量分析,其中所述內(nèi)源參比代謝物是生物樣品中以基本上恒定的水平存在于對象中的化合物;其中所述內(nèi)源參比代謝物或其衍生物具有小于1500Da的分子質(zhì)量,并且選自氨基酸,特別是精氨酸、天冬氨酸、瓜氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、亮氨酸、異亮氨酸、組氨酸、鳥氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、絲氨酸、色氨酸、酪氨酸、纈氨酸、犬尿氨酸;苯硫基氨甲?;被?PTC-氨基酸),特別是PCT-精氨酸、PTC-谷氨酰胺、PTC-組氨酸、PTC-甲硫氨酸、PTC-鳥氨酸、PTC-苯丙氨酸、PTC-脯氨酸、PTC-絲氨酸、PTC-色氨酸、PTC-酪氨酸、PTC-纈氨酸;二甲基精氨酸,特別是N,N- 二甲基-L-精氨酸;羧酸,即 15 (S)-羥基-5Z,8Z,11Z,13E- 二十碳四烯酸[(5Z,8Z, 11Z,13E,15 -15-羥基二十碳-5,8,11,13-四烯酸]、琥珀酸;肉毒堿類;在?;鶜埢芯哂?至20個碳原子的?;舛緣A;在?;鶜埢芯哂?至 20個碳原子并且在?;鶜埢芯哂?至4個雙鍵的?;舛緣A;在?;鶜埢芯哂?至20 個碳原子并且在酰基殘基中具有1至3個OH基的?;舛緣A;在?;鶜埢芯哂?至20 個碳原子并在酰基殘基中具有1至4個雙鍵和1至3個OH基的?;舛緣A; 磷脂類,特別是在?;鶜埢芯哂?至30個碳原子的溶血磷脂酰膽堿(單酰基磷脂酰膽堿);在?;鶜埢芯哂?至30個碳原子并在酰基殘基中具有1至6個雙鍵的溶血磷脂酰膽堿;在?;鶜埢芯哂锌偣?至50個碳原子的磷脂酰膽堿(二酰基磷脂酰膽堿);在?;鶜埢芯哂锌偣?至50個碳原子并在?;鶜埢芯哂锌偣?至8個雙鍵的磷脂酰膽堿; 鞘磷脂類,特別是在?;溨锌偺荚訑?shù)為10至30的神經(jīng)鞘磷脂;在酰基鏈中總碳原子數(shù)為10至30 并具有1至5個雙鍵的神經(jīng)鞘磷脂;在?;鶜埢锌偺荚訑?shù)為10至30的羥基神經(jīng)鞘磷脂;在?;鶜埢锌偺荚訑?shù)為10至30并具有1至5個雙鍵的羥基神經(jīng)鞘磷脂; 前列腺素類,即6-酮基-前列腺素Fl α、前列腺素D2 ; 腐胺; 并且其中每種所述所選靶代謝物的所述檢測到的強度與所述內(nèi)源參比代謝物的所述強度相關(guān)。
2.權(quán)利要求1的方法,其中對靶和內(nèi)源參比代謝物的多個強度進(jìn)行數(shù)學(xué)預(yù)處理,特別是變換例如使用算法、廣義化算法、冪變換。
3.權(quán)利要求1或2的方法,其中將內(nèi)源參比代謝物的多個強度歸并成一個參比值。
4.權(quán)利要求3的方法,其中通過計算幾何平均值、算術(shù)平均值、中位數(shù)值、權(quán)重算數(shù)平均值將內(nèi)源參比代謝物的多個強度歸并成一個參比值。
5.權(quán)利要求1至4任一項的方法,其中在線性強度的情況下形成靶代謝物的每個強度與測定到的參比值的比率,或者在對數(shù)強度的情況下從每個靶代謝物強度中減去測定到的參比值。
6.權(quán)利要求1至5任一項的方法,其中所述代謝物組學(xué)分析方法包含通過質(zhì)譜術(shù) (MS)、特別是MS技術(shù)例如基質(zhì)輔助激光解吸/電離(MALDI)、電噴霧電離(ESI)、大氣壓化學(xué)電離(APCI)、任選與MS偶聯(lián)的1H-J3C-和/或31P-核磁共振波譜(NMR)產(chǎn)生用于為內(nèi)源代謝物定量的強度數(shù)據(jù),通過使用與分離技術(shù),特別是液相色譜(LC-MQ、氣相色譜 (GC-MS)或毛細(xì)管電泳(CE-MQ偶聯(lián)的MS技術(shù)和/或方法來測定代謝物濃度。
7.權(quán)利要求1至6任一項的方法,其中所述內(nèi)源參比代謝物選自 15 (S)-羥基-5Z,8Z,11Z,13E- 二十碳四烯酸6-酮基-前列腺素Fl α 不對稱二甲基精氨酸精氨酸 PTC-精氨酸天冬氨酸肉毒堿(游離)癸?;舛緣A(反丁烯二酰基肉毒堿)癸烯?;舛緣A癸二烯?;舛緣A十二?;舛緣A[月桂酰肉毒堿]十二烯?;舛緣A十二烷二?;舛緣A十四?;舛緣A十四烯?;舛緣A[肉豆蔻?;舛緣A]3-羥基十四烯?;舛緣A[3-羥基肉豆蔻?;舛緣A]3-羥基十四碳二烯?;舛緣A3-羥基十四?;舛緣A[羥基肉豆蔻酰基肉毒堿]十六烯?;舛緣A[棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六烯?;舛緣A[3-羥基棕櫚油酰基肉毒堿]十六碳二烯?;舛緣A3-羥基十六碳二烯?;舛緣A3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚?;舛緣A]十八碳?;舛緣A[硬脂?;舛緣A]十八碳烯酰基肉毒堿[油酰肉毒堿]3-羥基十八碳烯?;舛緣A[3-羥基油酰肉毒堿]乙酰肉毒堿丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿丁烯酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿異戊酰基肉毒堿/2-甲基丁酰肉毒堿/戊?;舛緣A甲基巴豆酰基肉毒堿/3-甲基-巴豆?;舛緣A戊二酸單酰基肉毒堿/羥基己?;舛緣A戊二酸單?;舛緣A/羥基己酰基肉毒堿甲基戊二酸單?;舛緣A3-羥基異戊?;舛緣A/3-羥基-2-甲基丁?;舛緣A己?;舛緣A己烯?;舛緣A庚二酰基肉毒堿辛?;舛緣A辛烯酰基肉毒堿壬?;舛緣A瓜氨酸肌酸酐谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺谷氨酸組氨酸PTC-組氨酸犬尿氨酸亮氨酸酰基殘基為C14:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃16:0的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C16:1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃18:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃18:1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃18:2的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C20:3的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃20:4的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃24:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃26:0的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C26:1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃28:0的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C28:1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃6:0的溶血磷脂酰膽堿 PTC-甲硫氨酸鳥氨酸 PTC-鳥氨酸二?;鶜埢偤蜑镃24:0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C26:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃28:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃30:0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C30:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:3的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C34:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34:2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C34:3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34:4的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:l的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:6的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:l的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C38:3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:5的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C38:6的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:l的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C40:3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃40:4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃40:5的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C40:6的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:l的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C30:0的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C30:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34:2的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C34:3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:1的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C36 2的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38 2的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:4的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:6的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C40:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:1的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C40 2的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 3的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C40:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42:0的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C42:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44:6的磷脂酰膽堿前列腺素D2 苯丙氨酸 PTC-苯丙氨酸脯氨酸 PTC-脯氨酸腐胺絲氨酸 PTC-絲氨酸?;鶜埢偤蜑镃14:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C16:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22:2的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C16:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:l的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C18:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃18:l的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃20:2的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22:3的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C24:l的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃26:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C26:l的神經(jīng)鞘磷脂琥珀酸總二甲基精氨酸ADMA+SDMA的總和色氨酸PTC-色氨酸酪氨酸纈氨酸PTC-纈氨酸亮氨酸+異亮氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示?;?烷基殘基的鏈長,η表示?;? 烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。
8.權(quán)利要求1至7任一項的方法,其中這樣的代謝物被用作根據(jù)統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性的內(nèi)源參比代謝物,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù) (CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geN0rm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho)。
9.權(quán)利要求1至8任一項的方法,其中所述內(nèi)源參比代謝物根據(jù)至少2種統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho),和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說選自PTC-精氨酸肉毒堿(游離) 癸烯?;舛緣A癸酰基肉毒堿(反丁烯二?;舛緣A) 十二烯?;舛緣A十二烷二?;舛緣A十二酰基肉毒堿[月桂酰肉毒堿] 十四?;舛緣A3-羥基十四酰基肉毒堿[羥基肉豆蔻?;舛緣A]十六烯酰基肉毒堿[棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六烯酰基肉毒堿[3-羥基棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六碳二烯?;舛緣A3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚酰基肉毒堿]3-羥基十八碳烯?;舛緣A[3-羥基油酰肉毒堿]丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿甲基戊二酸單?;舛緣A3-羥基異戊?;舛緣A/3-羥基-2-甲基丁?;合;舛緣A己?;舛緣A庚二?;舛緣A辛烯?;舛緣A辛?;舛緣A谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺PTC-組氨酸酰基殘基為C14:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃26:0的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C26:1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃28:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃28:1的溶血磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃24:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃26:0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C30:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃30:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C34:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:4的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C38:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:l的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42:5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:6的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C30:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:1的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:1的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C40 5的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C40:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44:6的磷脂酰膽堿苯丙氨酸 PTC-苯丙氨酸脯氨酸?;鶜埢偤蜑镃16:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:l的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C18:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃18:l的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C20:2的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C24:l的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃14:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C16:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22:2的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂琥珀酸 PTC-色氨酸纈氨酸 PTC-纈氨酸亮氨酸+異亮氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示酰基/烷基殘基的鏈長,η表示?;? 烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。
10.權(quán)利要求1至8任一項的方法,其中所述內(nèi)源參比代謝物根據(jù)至少3種統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho),和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說選自 肉毒堿(游離)癸?;舛緣A(反丁烯二酰基肉毒堿)十二烷二?;舛緣A十二酰基肉毒堿[月桂酰肉毒堿]十六烯?;舛緣A[棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六烯?;舛緣A[3-羥基棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚?;舛緣A]丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿甲基戊二酸單?;舛緣A己酰基肉毒堿庚二?;舛緣A辛烯酰基肉毒堿辛?;舛緣A谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺PTC-組氨酸酰基殘基為C14:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃26:0的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C26:1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃28:1的溶血磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C26:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:5的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:4的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C40:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42:0的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44:6的磷脂酰膽堿?;鶜埢偤蜑镃16:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:l的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃20:2的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C24:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂纈氨酸 PTC-纈氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示?;?烷基殘基的鏈長,η表示酰基/ 烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。
11.權(quán)利要求1至8任一項的方法,其中所述內(nèi)源參比代謝物根據(jù)所有統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值 (rho),和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說是二?;鶜埢偤蜑镃42:6的磷脂酰膽堿, 其中名稱“C42 6”表示酰基殘基的鏈長,42表示?;鶜埢械目偺荚訑?shù),且6表示殘基中的總雙鍵數(shù)。
12.權(quán)利要求1至11任一項的方法,其中所述多種內(nèi)源代謝物包含2至80種、特別是 2至60種、優(yōu)選2至50種、優(yōu)選2至30種、更優(yōu)選2至10種、特別優(yōu)選2至10種、優(yōu)選3 至5種內(nèi)源代謝物。
13.多種化合物或其衍生物在代謝物組學(xué)分析方法中作為內(nèi)源參比代謝物的應(yīng)用,其中所述化合物具有小于1500Da的分子質(zhì)量,其中所述內(nèi)源參比代謝物選自氨基酸,特別是精氨酸、天冬氨酸、瓜氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、亮氨酸、異亮氨酸、組氨酸、鳥氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、絲氨酸、色氨酸、酪氨酸、纈氨酸、犬尿氨酸;苯硫基氨甲?;被?PTC-氨基酸),特別是PCT-精氨酸、PTC-谷氨酰胺、PTC-組氨酸、PTC-甲硫氨酸、PTC-鳥氨酸、PTC-苯丙氨酸、PTC-脯氨酸、PTC-絲氨酸、PTC-色氨酸、PTC-酪氨酸、PTC-纈氨酸;二甲基精氨酸,特別是N,N- 二甲基-L-精氨酸;羧酸,即 15 (S)-羥基-5Z,8Z,11Z,13E- 二十碳四烯酸[(5Z,8Z, 11Z,13E,15 -15-羥基二十碳-5,8,11,13-四烯酸]、琥珀酸;肉毒堿類;在?;鶜埢芯哂?至20個碳原子的?;舛緣A;在酰基殘基中具有3至 20個碳原子并且在?;鶜埢芯哂?至4個雙鍵的酰基肉毒堿;在酰基殘基中具有1至20 個碳原子并且在?;鶜埢芯哂?至3個OH基的?;舛緣A;在?;鶜埢芯哂?至20 個碳原子并在?;鶜埢芯哂?至4個雙鍵和1至3個OH基的酰基肉毒堿; 磷脂類,特別是在?;鶜埢芯哂?至30個碳原子的溶血磷脂酰膽堿(單?;字D憠A);在?;鶜埢芯哂?至30個碳原子并在酰基殘基中具有1至6個雙鍵的溶血磷脂酰膽堿;在?;鶜埢芯哂锌偣?至50個碳原子的磷脂酰膽堿(二酰基磷脂酰膽堿);在酰基殘基中具有總共3至50個碳原子并在?;鶜埢芯哂锌偣?至8個雙鍵的磷脂酰膽堿; 鞘磷脂類,特別是在?;溨锌偺荚訑?shù)為10至30的神經(jīng)鞘磷脂;在?;溨锌偺荚訑?shù)為10至30 并具有1至5個雙鍵的神經(jīng)鞘磷脂;在?;鶜埢锌偺荚訑?shù)為10至30的羥基神經(jīng)鞘磷脂;在?;鶜埢锌偺荚訑?shù)為10至30并具有1至5個雙鍵的羥基神經(jīng)鞘磷脂; 前列腺素類,即6-酮基-前列腺素Fl α、前列腺素D2 ; 腐胺。
14.權(quán)利要求13的應(yīng)用,其中所述代謝物組學(xué)分析方法包含通過質(zhì)譜術(shù)(MQ、特別是MS技術(shù)例如基質(zhì)輔助激光解吸/電離(MALDI)、電噴霧電離(ESI)、大氣壓化學(xué)電離 (APCI)、任選與MS偶聯(lián)的1H-J3C-和/或Mp-核磁共振波譜(NMR)對內(nèi)源靶和內(nèi)源參比代謝物進(jìn)行定量,通過使用與分離技術(shù),特別是液相色譜(LC-MQ、氣相色譜(GC-MQ或毛細(xì)管電泳(CE-MQ偶聯(lián)的MS技術(shù)和/或方法來測定代謝物濃度。
15.權(quán)利要求13或14的應(yīng)用,其中所述內(nèi)源參比代謝物選自 15 (S)-羥基-5Z,8Z,11Z,13E- 二十碳四烯酸 6-酮基-前列腺素Fl α 不對稱二甲基精氨酸精氨酸 PTC-精氨酸天冬氨酸肉毒堿(游離)癸?;舛緣A(反丁烯二?;舛緣A)癸烯?;舛緣A癸二烯?;舛緣A十二酰基肉毒堿[月桂酰肉毒堿]十二烯?;舛緣A十二烷二?;舛緣A十四?;舛緣A十四烯?;舛緣A[肉豆蔻?;舛緣A]3-羥基十四烯酰基肉毒堿[3-羥基肉豆蔻酰基肉毒堿]3-羥基十四碳二烯?;舛緣A3-羥基十四酰基肉毒堿[羥基肉豆蔻?;舛緣A]十六烯酰基肉毒堿[棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六烯?;舛緣A[3-羥基棕櫚油?;舛緣A]十六碳二烯?;舛緣A3-羥基十六碳二烯酰基肉毒堿3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚酰基肉毒堿]十八碳?;舛緣A[硬脂?;舛緣A]十八碳烯?;舛緣A[油酰肉毒堿]3-羥基十八碳烯酰基肉毒堿[3-羥基油酰肉毒堿]乙酰肉毒堿丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿丁烯酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿異戊?;舛緣A/2-甲基丁酰肉毒堿/戊?;舛緣A甲基巴豆酰基肉毒堿/3-甲基-巴豆?;舛緣A戊二酸單酰基肉毒堿/羥基己?;舛緣A戊二酸單?;舛緣A/羥基己?;舛緣A甲基戊二酸單酰基肉毒堿3-羥基異戊?;舛緣A/3-羥基-2-甲基丁?;乎;舛緣A己烯酰基肉毒堿庚二?;舛緣A辛?;舛緣A辛烯?;舛緣A壬?;舛緣A瓜氨酸肌酸酐谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺谷氨酸組氨酸PTC-組氨酸犬尿氨酸亮氨酸?;鶜埢鶠镃14:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃16:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃16:1的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C18:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃18:1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃18:2的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃20:3的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃20:4的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃24:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃26:0的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C26:1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃28:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃28:1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃6:0的溶血磷脂酰膽堿 PTC-甲硫氨酸鳥氨酸 PTC-鳥氨酸二?;鶜埢偤蜑镃24:0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C26:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃28:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃30:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃30:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:l的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C32:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34:3的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C34:4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:3的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36:4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:6的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C38:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:6的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃40:3的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃40:4的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C40:5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃40:6的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:4的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42:5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C30:0的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C30:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34:0的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C34:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C34:2的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C34:3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36 2的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C36 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:1的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38 2的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:0的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C40:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 2的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:6的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C42:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42:1的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C42 3的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44:6的磷脂酰膽堿前列腺素D2 苯丙氨酸 PTC-苯丙氨酸脯氨酸 PTC-脯氨酸腐胺絲氨酸 PTC-絲氨酸?;鶜埢偤蜑镃14:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C16:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C22:2的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C16:l的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃18:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C18:l的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃20:2的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C22:3的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:l的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃26:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C26:l的神經(jīng)鞘磷脂琥珀酸總二甲基精氨酸ADMA+SDMA的總和色氨酸PTC-色氨酸酪氨酸纈氨酸PTC-纈氨酸亮氨酸+異亮氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示?;?烷基殘基的鏈長,η表示?;? 烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。
16.權(quán)利要求13至15任一項的應(yīng)用,其中所述內(nèi)源參比代謝物根據(jù)統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值 (rho)ο
17.權(quán)利要求13至16任一項的應(yīng)用,其中所述內(nèi)源參比代謝物根據(jù)至少2種統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho),和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說選自PTC-精氨酸肉毒堿(游離) 癸烯?;舛緣A癸酰基肉毒堿(反丁烯二?;舛緣A) 十二烯?;舛緣A十二烷二?;舛緣A十二?;舛緣A[月桂酰肉毒堿] 十四?;舛緣A3-羥基十四酰基肉毒堿[羥基肉豆蔻?;舛緣A]十六烯?;舛緣A[棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六烯?;舛緣A[3-羥基棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六碳二烯?;舛緣A3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚?;舛緣A]3-羥基十八碳烯酰基肉毒堿[3-羥基油酰肉毒堿] 丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿甲基戊二酸單?;舛緣A3-羥基異戊?;舛緣A/3-羥基-2-甲基丁?;合;舛緣A己酰基肉毒堿庚二?;舛緣A辛烯?;舛緣A辛酰基肉毒堿谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺PTC-組氨酸?;鶜埢鶠镃14:0的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C26:0的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C26:1的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃28:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃28:1的溶血磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C24:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃26:0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C30:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃30:2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C32:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃34:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:0的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36:2的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃36:4的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:5的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C42:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C30:1的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C34:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C36:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:1的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C38:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:6的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C40:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:1的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:6的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C42:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C44:6的磷脂酰膽堿苯丙氨酸 PTC-苯丙氨酸脯氨酸?;鶜埢偤蜑镃16:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:l的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C18:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃18:l的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃20:2的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C24:l的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃14:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃22:2的羥基神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂琥珀酸 PTC-色氨酸纈氨酸 PTC-纈氨酸亮氨酸+異亮氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示酰基/烷基殘基的鏈長,η表示?;? 烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。
18.權(quán)利要求13至17任一項的應(yīng)用,其中所述內(nèi)源參比代謝物根據(jù)至少3種統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值(rho),和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說選自 肉毒堿(游離)癸?;舛緣A(反丁烯二酰基肉毒堿)十二烷二?;舛緣A十二酰基肉毒堿[月桂酰肉毒堿]十六烯?;舛緣A[棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六烯?;舛緣A[3-羥基棕櫚油?;舛緣A]3-羥基十六碳?;舛緣A[3-羥基棕櫚?;舛緣A] 丙烯酰肉毒堿羥基丙酰肉毒堿3-羥基丁酰肉毒堿/丙二酸單酰肉毒堿甲基戊二酸單?;舛緣A己酰基肉毒堿庚二?;舛緣A辛烯酰基肉毒堿辛?;舛緣A谷氨酰胺PTC-谷氨酰胺PTC-組氨酸?;鶜埢鶠镃14:0的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C26:0的溶血磷脂酰膽堿?;鶜埢鶠镃26:1的溶血磷脂酰膽堿酰基殘基為C28:1的溶血磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃26:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃32:2的磷脂酰膽堿二酰基殘基總和為C36:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃38:0的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:l的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:5的磷脂酰膽堿二?;鶜埢偤蜑镃42:6的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C38:4的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C40:0的磷脂酰膽堿酰基-烷基殘基總和為C42:0的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C42 5的磷脂酰膽堿?;?烷基殘基總和為C44:6的磷脂酰膽堿?;鶜埢偤蜑镃16:0的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃16:l的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C20:2的神經(jīng)鞘磷脂?;鶜埢偤蜑镃24:0的神經(jīng)鞘磷脂酰基殘基總和為C24:l的羥基神經(jīng)鞘磷脂纈氨酸 PTC-纈氨酸其中名稱“殘基Cn:m”或“殘基總和Cn:m”表示?;?烷基殘基的鏈長,η表示?;? 烷基殘基中的總碳原子數(shù),且m表示殘基中的總雙鍵數(shù)。
19.權(quán)利要求13至18任一項的應(yīng)用,其中所述內(nèi)源參比代謝物根據(jù)所有統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度顯示出穩(wěn)定性,所述統(tǒng)計學(xué)穩(wěn)定性量度選自原始強度數(shù)據(jù)的變差系數(shù)(CV)、對數(shù)強度數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)、geNorm算法的穩(wěn)定性量度(M)或NormFinder算法的穩(wěn)定性量度值 (rho),和/或這樣的內(nèi)源參比代謝物具體來說是二?;鶜埢偤蜑镃42:6的磷脂酰膽堿, 其中名稱“C42 6”表示?;鶜埢逆滈L,42表示?;鶜埢械目偺荚訑?shù),且6表示殘基中的總雙鍵數(shù)。
20.權(quán)利要求13至19任一項的應(yīng)用,其中所述多種內(nèi)源代謝物包含2至80種、特別是 2至60種、優(yōu)選2至50種、優(yōu)選2至30種、更優(yōu)選2至10種、特別優(yōu)選2至10種、優(yōu)選3 至5種內(nèi)源代謝物。
全文摘要
本發(fā)明涉及內(nèi)源參比代謝物的應(yīng)用,以及將對應(yīng)于哺乳動物對象的生物樣品中所選靶代謝物的量和/或濃度的強度數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化的方法,其中所述強度數(shù)據(jù)使用一種或多種內(nèi)源參比代謝物通過代謝物組學(xué)分析方法獲得,所述方法包含對所述生物樣品中的所述所選靶代謝物執(zhí)行至少一種體外代謝物組學(xué)分析方法,同時在同一樣品中執(zhí)行一種或多種內(nèi)源參比代謝物或其衍生物的定量分析,其中所述內(nèi)源參比代謝物是生物樣品中以基本上恒定的水平存在于對象中的化合物;并且其中所述內(nèi)源參比代謝物或其衍生物具有小于1500Da的分子質(zhì)量。
文檔編號G06F19/24GK102473208SQ201080030109
公開日2012年5月23日 申請日期2010年6月23日 優(yōu)先權(quán)日2009年7月2日
發(fā)明者戴維·伊諾特, 漢斯-彼得·迪格內(nèi), 特雷瑟·考爾, 瑪緹亞斯·克爾, 瑪緹亞斯·科勒 申請人:百奧科瑞茨生命科學(xué)公司
網(wǎng)友詢問留言 已有0條留言
  • 還沒有人留言評論。精彩留言會獲得點贊!
1
上虞市| 鹤庆县| 新晃| 巴彦淖尔市| 新安县| 当阳市| 伊吾县| 西畴县| 虹口区| 宁德市| 华坪县| 师宗县| 瓮安县| 东阿县| 民和| 大邑县| 天门市| 明光市| 依安县| 田阳县| 顺昌县| 珠海市| 原阳县| 宝丰县| 格尔木市| 揭西县| 绥阳县| 金寨县| 遂川县| 唐河县| 河西区| 汝南县| 通山县| 长寿区| 保康县| 大洼县| 鄂伦春自治旗| 鹿邑县| 老河口市| 萍乡市| 天津市|