用作治療癌癥的療法的靶標(biāo)的falz的制作方法
【專利說明】用作治療癌癥的療法的卽標(biāo)的FALZ
[0001] 相關(guān)申請的交叉引用
[0002] 本申請按照美國法典第35篇第119條要求2013年3月15日提交的臨時(shí)申請序 列號61/790, 153的優(yōu)先權(quán)，該臨時(shí)申請的公開內(nèi)容W引用的方式并入本文。
[0003] 政府許可權(quán) 陽004] 本發(fā)明是在政府支持下根據(jù)美國國家衛(wèi)生研究院（化tionalInstitutesof Health)和美國國家癌癥研究所（化tionalCancerInstitute)授予的基金號CA114337和CA122947作出的。政府對本發(fā)明具有一定的權(quán)利。
技術(shù)領(lǐng)域
[0005] 本公開提供了基于測量FALZ的表達(dá)水平的癌癥診斷、受試者存活率、和/或癌癥 進(jìn)展的方法。本公開進(jìn)一步提供了一種通過抑制FALZ活性和/或表達(dá)來治療患有癌癥的 受試者的方法。
【背景技術(shù)】
[0006] 包括組蛋白的翻譯后修飾、DNA甲基化、組蛋白變體的滲入、W及核小體重塑在內(nèi) 的表觀遺傳學(xué)機(jī)制已經(jīng)發(fā)展到調(diào)節(jié)染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)W及設(shè)及DNA。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0007]BPTF(布羅莫結(jié)構(gòu)域化romodomain)P皿指轉(zhuǎn)錄因子；也被稱為FALZ(胎兒阿爾茨 海默氏病抗原（fetalAlzheimerantigen)))是在致瘤性轉(zhuǎn)化中的確切作用尚不明確的基 因。本公開證實(shí)了FALZ表達(dá)是原發(fā)性黑色素瘤的一種獨(dú)立的預(yù)后標(biāo)志物，并且可W代表一 種對在黑色素瘤中的祀向療法的響應(yīng)的預(yù)測性生物標(biāo)志物。此外，shRNA介導(dǎo)的對FALZ的 抑制在體外和/或體內(nèi)使得黑色素瘤細(xì)胞、成膠質(zhì)細(xì)胞瘤細(xì)胞、W及乳腺癌細(xì)胞的生長顯 著減少，運(yùn)表明了在黑色素瘤W及其它實(shí)體腫瘤的療法中祀向FALZ的潛在治療效用。
[0008] 本公開提供了一種癌癥預(yù)后的方法，所述方法包括：（i)從受試者獲得生物樣品； (ii)測量所述受試者的樣品中BPTF的水平；（iii)將所述受試者的樣品中BPTF的水平與 來自一種或多種對照生物樣品的BPTF的平均水平相比較；（iv)基于與所述對照中BPTF的 平均水平相比，具有更低（或更高）的BPTF水平，提供所述受試者可能患有癌癥的預(yù)后。在 一個(gè)實(shí)施方案中，所述癌癥選自由黑色素瘤、乳腺癌W及腦癌組成的組。在另一個(gè)實(shí)施方案 中，所述受試者的生物樣品來自于組織活檢。在又另一個(gè)實(shí)施方案中，所述一種或多種對照 生物樣品來自于良性捷的組織活檢。在另一個(gè)實(shí)施方案中，所述對照生物樣品包括來自所 述受試者的樣品。在再另一個(gè)實(shí)施方案中，所述對照生物樣品包括并非來自所述受試者的 樣品。在一個(gè)實(shí)施方案中，本公開使用分別與BPTF多膚或BPTF多核巧酸特異性結(jié)合的標(biāo) 記的抗體或核酸片段。
[0009] 本公開提供了一種確定受試者是否患有癌癥的方法，所述方法包括：（i)從受試 者獲得生物樣品；（ii)測量所述受試者的樣品中BPTF的水平；（iii)將所述受試者的樣品 中BPTF的水平與來自一種或多種對照生物樣品的BPTF的平均水平相比較；W及（iv)基 于與所述對照中BPTF的平均水平相比，具有顯著更低（或更高）的BPTF水平，確定所述受 試者是否患有癌癥。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述癌癥選自由黑色素瘤、乳腺癌W及腦癌組成的 組。在另一個(gè)實(shí)施方案中，所述受試者的生物樣品來自于組織活檢。在又另一個(gè)實(shí)施方案 中，所述一種或多種對照生物樣品來自于良性捷的組織活檢。在另一個(gè)實(shí)施方案中，所述對 照生物樣品包括來自所述受試者的樣品。在又另一個(gè)實(shí)施方案中，所述對照生物樣品包括 并非來自所述受試者的樣品。在一個(gè)實(shí)施方案中，本公開使用分別與BPTF多膚或BPTF多 核巧酸特異性結(jié)合的標(biāo)記的抗體或核酸片段。
[0010] 本公開提供了一種確定受試者的癌癥是正在進(jìn)展還是處在緩解期的方法，所述方 法包括：（i)在第一時(shí)間點(diǎn)從受試者獲得生物樣品；（ii)測量來自所述第一時(shí)間點(diǎn)的所述 受試者的樣品中BPTF的水平；（iii)在第二時(shí)間點(diǎn)從受試者獲得生物樣品；（iv)測量來自 所述第二時(shí)間點(diǎn)的所述受試者的樣品中BPTF的水平；(V)將來自所述第一時(shí)間點(diǎn)的BPTF 水平與來自所述第二時(shí)間點(diǎn)的水平相比較；W及（Vi)基于來自運(yùn)兩個(gè)時(shí)間點(diǎn)的BPTF水平 的變化，確定癌癥是正在進(jìn)展還是處在恢復(fù)期，其中在所述第一時(shí)間點(diǎn)與所述第二時(shí)間點(diǎn) 之間BPTF水平升高則表明所述癌癥處在緩解期，并且其中在所述第一時(shí)間點(diǎn)與所述第二 時(shí)間點(diǎn)之間BPTF水平升高則表明所述癌癥正在進(jìn)展。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述癌癥選自由 黑色素瘤、乳腺癌W及腦癌組成的組。在另一個(gè)實(shí)施方案中，所述生物樣品來自于組織活 檢。在又另一個(gè)實(shí)施方案中，所述方法包括在獲得所述第一樣品之后向所述受試者施用抗 癌治療劑。在又另一個(gè)實(shí)施方案中，所述方法包括如果所述BPTF水平升高，那么向所述受 試者施用BPTF抑制劑。在一個(gè)實(shí)施方案中，本公開使用分別與BPTF多膚或BPTF多核巧酸 特異性結(jié)合的標(biāo)記的抗體或核酸片段。
[0011] 本公開提供了一種提供患有癌癥的受試者的存活率預(yù)后的方法，所述方法包括： (i)在第一時(shí)間點(diǎn)從受試者獲得生物樣品；（ii)測量來自所述第一時(shí)間點(diǎn)的所述受試者的 樣品中BPTF的水平；（iii)在第二時(shí)間點(diǎn)從受試者獲得生物樣品；（iv)測量來自所述第二 時(shí)間點(diǎn)的所述受試者的樣品中BPTF的水平；(V)將來自所述第一時(shí)間點(diǎn)的BPTF水平與來 自所述第二時(shí)間點(diǎn)的水平相比較；W及（Vi)基于來自運(yùn)兩個(gè)時(shí)間點(diǎn)的BPTF水平的變化， 提供所述受試者的存活率的預(yù)后，其中在所述第一時(shí)間點(diǎn)與所述第二時(shí)間點(diǎn)之間BPTF的 水平升高則表明所述受試者的存活率不良，并且其中在所述第一時(shí)間點(diǎn)與所述第二時(shí)間點(diǎn) 之間BPTF的水平降低則表明所述受試者的存活率較好。在一個(gè)實(shí)施方案中，所述癌癥選自 由黑色素瘤、乳腺癌W及腦癌組成的組。在另一個(gè)實(shí)施方案中，所述生物樣品來自于組織活 檢。在一個(gè)實(shí)施方案中，本公開使用分別與BPTF多膚或BPTF多核巧酸特異性結(jié)合的標(biāo)記 的抗體或核酸片段。
[0012] 本公開還提供了一種治療受試者的癌癥的方法，所述方法包括：通過施用有效量 的抑制性BPTF核酸和/或有效量的抑制BPTF表達(dá)的藥劑來抑制BPTF的表達(dá)。在一個(gè)實(shí) 施方案中，所述癌癥選自由黑色素瘤、多形性成膠質(zhì)細(xì)胞瘤W及乳腺癌組成的組。在另一個(gè) 實(shí)施方案中，抑制BPTF的表達(dá)使得對癌細(xì)胞的增殖或遷移進(jìn)行抑制或阻止。在又另一個(gè)實(shí) 施方案中，所述方法與一種或多種另外的抗癌治療劑組合使用。在另一個(gè)實(shí)施方案中，所述 一種或多種另外的治療劑選自由W下各項(xiàng)組成的組：銷類似物、燒化劑、烷基橫酸鹽、雄激 素、抗腎上腺劑、抗雄激素劑、抗生素、抗雌激素劑、芳香酶抑制性4(5)-咪挫、抗代謝物、葉 酸類似物、乙締亞胺W及甲基S聚氯胺（methylamelamines)、葉酸補(bǔ)充劑、氮芥（nitrogen mustard)、亞硝基脈、嚷嶺類似物、喀晚類似物、拓?fù)洚悩?gòu)酶抑制劑、胸巧酸合酶抑制劑、抗 癌抗體、化學(xué)治療劑、脫甲基化劑、W及祀向治療劑。在又另一個(gè)實(shí)施方案中，所述方法包括 向所述受試者施用包含抑制性BPTF核酸的載體。在又另一個(gè)實(shí)施方案中，所述載體包括表 達(dá)載體。在再另一個(gè)實(shí)施方案中，所述載體包括復(fù)制型逆轉(zhuǎn)錄病毒載體。
[0013] 本公開還提供了一種組合物，所述組合物包含BPTF抑制劑和第一線抗癌治療劑。
[0014] 本公開提供了在附圖和W下說明中所闡述的一個(gè)或多個(gè)實(shí)施方案。根據(jù)所述說明 和附圖W及權(quán)利要求書，本發(fā)明的其它特征、目的W及優(yōu)勢將是顯而易見的。
【附圖說明】
[0015] 圖1A-F示出了shRNA介導(dǎo)的對化tf表達(dá)的抑制對鼠類黑色素瘤的作用。A)在 B16-F10鼠類黑色素瘤細(xì)胞中由兩種不同的shRNA在mRNA水平上使化tf表達(dá)下調(diào)。B)在 化tf基因敲低之后對細(xì)胞增殖的抑制。C-D)Bptf基因敲低顯著地抑制了體內(nèi)腫瘤細(xì)胞生 長和轉(zhuǎn)移性肺腫瘤負(fù)荷。E-F)在化tf基因敲低之后在mRNA水平和蛋白質(zhì)水平上對CCND2 表達(dá)和B化-XL表達(dá)的抑制。
[0016] 圖2A-G示出了抑制BPTF表達(dá)對人類黑色素瘤的作用。A)在1205-Lu細(xì)胞中在 mRNA水平上對BPTF表達(dá)的抑制。B)BPTF抑制誘導(dǎo)了G0/G1停滯并且減少了細(xì)胞周期的S 期。C-D)在BPTF基因敲低之后對細(xì)胞增殖的顯著抑制，如分別通過細(xì)胞存活測定和集落形 成測定所確定。巧BPTF基因敲低在黑色素瘤細(xì)胞中誘導(dǎo)了細(xì)胞調(diào)亡。F-G)BPTF基因敲低 顯著地抑制了體內(nèi)腫瘤細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移性腫瘤負(fù)荷。 陽017] 圖3A-D示出了BPTF表達(dá)對于對DNA酶-1處理的敏感性W及E服1/2通路的影 響。A-B)在1205-Lu細(xì)胞和C8161.9細(xì)胞中，抑制BPTF表達(dá)提高了DNA酶-I對B化-化和B化-2的啟動(dòng)子序列的超敏感性。C-D)在1205-Lu細(xì)胞和C8161. 9細(xì)胞中抑制BPTF之后， 在運(yùn)兩種黑色素瘤細(xì)胞系中CCND2、B化-XL W及B化-2在mRNA水平上的表達(dá)。C-F)示出 了在1205-Lu細(xì)胞和C8161. 9細(xì)胞中抑制BPTF之后各種蛋白質(zhì)表達(dá)的蛋白質(zhì)印跡分析。
[0018] 圖4A-D示出了原發(fā)性皮膚黑色素瘤中BPTF的水平。A-B)在具有最高的BPTF表 達(dá)水平的黑色素瘤患者（曲線1)中，相比于所有其它患者（曲線2)，對DMK和DSS進(jìn)行的 卡普蘭-邁耶分析化aplan-Meieranalysis)。C-D)示出了組織樣品中低的和高的BPTF 拷貝數(shù)的FI甜分析的代表性顯微照片。
[0019] 圖5A-H示出了調(diào)節(jié)BPTF表達(dá)對于對選擇性BRAF抑制劑的敏感性的作用。 A-B)BPTF基因敲低使1205-Lu黑色素瘤細(xì)胞對威羅菲尼（vemurafenib)和達(dá)拉菲尼 (ckbrafenib)敏感。C-D)在1205-Lu黑色素瘤細(xì)胞中BPTF的過表達(dá)賦予對BRAF抑制劑 的抗性。巧在對威羅菲尼具有獲得性抗性之后轉(zhuǎn)移性黑色素瘤樣品的肥染色。巧對巧） 中樣品的BPTF表達(dá)的免疫組織化學(xué)分析示出了異質(zhì)的BPTF染色模式。G)巧）中樣品的泛 黑色素瘤染色。H)對抗性樣品中BPTF拷貝的巧光原位雜交（FISH)分析。
[0020] 圖6A-I示出了抑制BPTF表達(dá)對人類成膠質(zhì)細(xì)胞瘤細(xì)胞的作用。A)在U251細(xì)胞 中由shRNA介導(dǎo)的在mRNA水平上對BPTF的抑制。B-C)在BPTF基因敲低之后對細(xì)胞增殖 的顯著抑制，如分別通過細(xì)胞存活測定和集落形成測定所確定。D)BPTF抑制誘導(dǎo)了G0/G1 停滯并且減少了細(xì)胞周期的S期。巧BPTF基因敲低在U251細(xì)胞中誘導(dǎo)了細(xì)胞調(diào)亡。巧在 抑制BPTF之后不同基因的mRNA表達(dá)。G)不出了各種蛋白質(zhì)表達(dá)的蛋白質(zhì)印跡分析。H) 在抑制BPTF之后U251細(xì)胞在裸小鼠中的體內(nèi)生長。I)在間充質(zhì)型和原神經(jīng)型GBM亞型中 BPTF的表達(dá)。
[0021] 圖7A-C示出了抑制BPTF抑制了B16-F10鼠類黑色素瘤（A)、1205-Lu人類黑色素 瘤度）、W及U251人類GBM似細(xì)胞的侵襲潛能。
[0022] 圖8A-F示出了抑制BPTF對C8161.9人類黑色素瘤細(xì)胞的作用。A)在C8161.9黑 色素瘤細(xì)胞中在mRNA水平上對BPTF的抑制。B-C)在BPTF基因敲低之后對細(xì)胞增殖的顯 著抑制，其分別通過細(xì)胞存活測定和集落形成測定所確定。D)BPTF基因敲低在C8161. 9黑 色素瘤細(xì)胞中誘導(dǎo)了細(xì)胞調(diào)亡。巧BPTF基因敲低抑制了C8161. 9黑色素瘤細(xì)胞的侵襲性。 巧通過BPTF基因敲低顯著地抑制了C8161. 9細(xì)胞的體內(nèi)腫瘤生長。
[0023] 圖9示出了B化-XL或邸K的過表達(dá)解除了抑制BPTF對1205-Lu黑色素瘤細(xì)胞存 活的作用。
[0024] 圖10A-C:A)在1205-Lu黑色素瘤細(xì)胞系中BPTF過表達(dá)增強(qiáng)了細(xì)胞增殖。B)在 BPTF過表達(dá)之后各種基因的表達(dá)水平。C)示出了在BPTF過表達(dá)之后各種蛋白質(zhì)表達(dá)的蛋 白質(zhì)印跡。
[00巧]圖11A-B示出了在組織微陣列中對BPTF表達(dá)的免疫組織化學(xué)分析，所述免疫組織 化學(xué)分析示出了BPTF表達(dá)的說明性顯微照片。A)表達(dá)低水平的BPTF的原發(fā)性黑色素瘤； B)表達(dá)高水平的BPTF的原發(fā)性黑色素瘤。 陽0%] 圖12A-B:A)BPTF基因敲低使L0X黑色素瘤細(xì)胞系對威羅菲尼處理敏感。B)在L0X 黑色素瘤細(xì)胞系中BPTF的過表達(dá)賦予了對威羅菲尼處理的抗性。
[0027]圖13A-D:A)在對達(dá)拉菲尼具有抗性之后轉(zhuǎn)移性腫瘤樣品的肥染色。B)示出了 異質(zhì)BPTF染色模式的腫瘤樣品的免疫組織化學(xué)染色。C)轉(zhuǎn)移性黑色素瘤的泛黑色素瘤染 色。D)對轉(zhuǎn)移性黑色素瘤中的BPTF拷貝數(shù)的巧光原位雜交（FISH)分析。 W2引 圖14A-F:A)在LN18人類成膠質(zhì)細(xì)胞瘤細(xì)胞中由shRNA介導(dǎo)的對BPTFmRNA的抑 審ij。B-C)在BPTF基因敲低之后對細(xì)胞增殖的抑制，其分別通過細(xì)胞存活測定和集落形成測 定所確定。D)BPTF基因敲低抑制了LN18細(xì)胞的侵襲性。E-F)在抑制BPTF之后各種基因 的表達(dá)水平。巧示出了在抑制BPTF之后各種蛋白質(zhì)表達(dá)的蛋白質(zhì)印跡分析。
[0029] 圖15示出了shRNA介導(dǎo)的對FALZ的抑制在MDA-231乳腺癌細(xì)胞系中抑制了腫瘤 細(xì)胞的增殖（左圖）和侵襲性（右圖）。
[0030] 圖16示出了shRNA介導(dǎo)的對FALZ的抑制在MDA-231乳腺癌細(xì)胞系中抑制了集落 形成能力（左圖）并且誘導(dǎo)了細(xì)胞調(diào)亡（右圖）。 陽03U 圖17示出了在MDA-231乳腺癌細(xì)胞系中FALZ基因敲低抑制了裸小鼠體內(nèi)的腫瘤 生長（左圖）。右圖示出了對人類乳腺癌組織樣品的FI甜分析，該FI甜分析表明了FALZ拷貝數(shù)增加。
【具體實(shí)施方式】
[0032] 除非上下文另外明確規(guī)定，否則如本文和所附權(quán)利要求書中所用的單數(shù)形式"a/ an( -和"所述"包括復(fù)數(shù)指代對象。因此，舉例來說，提到"apolynucleotide(-種/ 個(gè)多核巧酸）"時(shí)，包括多種/個(gè)運(yùn)樣的多核巧酸，并且提到"所述細(xì)胞"時(shí)，包括提到一個(gè) 或多個(gè)細(xì)胞，諸如此類。
[0033] 除非另外定義，否則本文所用的所有技術(shù)術(shù)語和科學(xué)術(shù)語所具有的含義與本公開 所屬領(lǐng)域的普通技術(shù)人員通常所了解的含義相同。雖然在實(shí)施所公開的方法和組合物時(shí) 可W使用與本文所述的方法和材料相似或等同的方法和材料，但在本文中描述了示例性方 法、裝置W及材料。
[0034] 而且，除非另外說明，否則使用"或"意指"和/或"。類似地包含（comprise)"、 "包含（comprises)"、"包含（comprising)"、"包括（include)"、"包括（includes) 及"包 括（including)"是可互換的并且不意圖具限制性。
[0035] 應(yīng)當(dāng)進(jìn)一步了解的是，在對各種實(shí)施方案的說明使用術(shù)語"包含"的情況下，本 領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)了解，在一些具體情況下，可W替代性地使用語言"基本上由……組成"或 "由……組成"來描述一個(gè)實(shí)施方案。
[0036] 提供上文W及貫穿全文所論述的公布僅僅是因?yàn)槠湓诒旧暾埖纳暾埲罩肮_。 本文的任何信息并不被理解為承認(rèn)本申請的發(fā)明人無權(quán)因在先的公開而先于所述公開。此 夕F，對于在一篇或多篇出版物中存在的與在本公開中已經(jīng)明確定義的術(shù)語相似或相同的任 何術(shù)語，在所有方面將W如在本公開中所明確提供的術(shù)語的定義為準(zhǔn)。
[0037] 核小體重塑和組蛋白變體的滲入基本上是經(jīng)由ATP依賴性染色質(zhì)重塑復(fù)合體的 作用來實(shí)現(xiàn)的，所述復(fù)合體代表了控制基因表達(dá)的機(jī)制的關(guān)鍵組分。ATP依賴性染色質(zhì)重 塑因子基于相關(guān)ATP酶的序列同源性被分為四個(gè)主要的亞家族（ISWI、SWI/SNF、CHDW及 IN080)〇
[0038] 鑒于最新證實(shí)了在各種人類癌癥中染色質(zhì)調(diào)節(jié)因子中的突變，已經(jīng)認(rèn)識到染色質(zhì) 重塑因子在腫瘤發(fā)生中發(fā)揮了越來越重要的作用。此外，鑒于17q24基因座在許多腫瘤中 的擴(kuò)增，它一直W來已經(jīng)被假定含有致癌基因。布羅莫結(jié)構(gòu)域P皿指轉(zhuǎn)錄因子度PTF;還被 稱為FALZ)(它的基因存在于17q24上）是NURF復(fù)合體的最大組分，已經(jīng)牽設(shè)到胚胎發(fā)育、 胸腺細(xì)胞成熟、W及染色質(zhì)重塑。哺乳動(dòng)物中的NURF復(fù)合體是被充分表征的ATP依賴性染 色質(zhì)重塑復(fù)合體。然而，對BPTF在腫瘤發(fā)生中所發(fā)揮的功能作用知之甚少。
[0039] 在黑腹果蛹值roso地ilamelanogaster)中被鑒定出的核小體重塑因子（NURF) 是ATP依賴性染色質(zhì)重塑因子的ISWI家族的關(guān)鍵成員。在哺乳動(dòng)物中，BPTF(布羅莫結(jié)構(gòu)域 P皿指轉(zhuǎn)錄因子）代表了果蛹NURF301----即NURF染色質(zhì)重塑復(fù)合體的最大亞基-- 的直系同源物。在所有的真核生物物種間存在NURF301同源物并且所述同源物似乎在進(jìn)化 上是保守的。NURF301參與對engrailed1和engrailed2表達(dá)的調(diào)節(jié)，大概是通過改變核 小體的周期性對齊。
[0040] NURF復(fù)合體經(jīng)由與序列特異性轉(zhuǎn)錄因子相互作用來介導(dǎo)它的細(xì)胞功能中的一些。 在果蛹中，熱休克因子化SF)、GAGA、W及人工結(jié)構(gòu)域VP16已經(jīng)被證實(shí)與NURF301上的多個(gè) 表面相互作用并且與ISWI發(fā)生弱的相互作用。NURF301具有結(jié)合特異性組蛋白翻譯后修飾 的兩個(gè)被充分表征的結(jié)構(gòu)域。與布羅莫結(jié)構(gòu)域并列的P皿指與冊K4me2/3相互作用，并且 相鄰的布羅莫結(jié)構(gòu)域結(jié)合H4K16ac。此外，NURF可能W序列特異性方式直接與DNA相互作 用。BPTF(還被稱為FALZ)已經(jīng)被報(bào)道為在胚胎發(fā)育中是必要的并且設(shè)及ATP依賴性染色 質(zhì)重塑。
[0041] 本公開通過cDNA微陣列分析和FI甜證實(shí)了BPTF(在本文有時(shí)被稱為FAL幻在轉(zhuǎn) 移性黑色素瘤和乳腺癌中顯著過表達(dá)。人類BPTF基因（SEQIDN0:1)位于染色體17q24上，所述染色體17q24是許多腫瘤中染色體變化的熱點(diǎn)。已經(jīng)在乳腺癌中證實(shí)了17q24的 擴(kuò)增，并且已經(jīng)在其它實(shí)體腫瘤中觀測到17q24拷貝數(shù)增加。在肺胚胎細(xì)胞中證實(shí)了在涵 蓋了BPTF基因的17q24. 3基因座處出現(xiàn)的易位。FAC1 (胎兒Alz-50-反應(yīng)性克隆1)是 BPTF的一種截短形式，在神經(jīng)變性疾病中上調(diào)，表現(xiàn)出序列特異性DNA結(jié)合活性，并且可能 在轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)中起作用。雖然充分了解諸如NURF之類的重塑復(fù)合體的重要性，但是迄今為 止，BPTF在腫瘤發(fā)生中的功能作用仍被不完全地表征。
[0042] 本公開提供了BPTF在黑色素瘤、多形性成膠質(zhì)細(xì)胞瘤（GBM)W及乳腺癌中的功能 和生物學(xué)作用。盡管具體分析了運(yùn)些癌癥類型，但涵蓋了BPTF在其它腫瘤和癌癥中的作 用。本公開證實(shí)了祀向抑制BPTF抑制了黑色素瘤、GBMW及乳腺癌細(xì)胞增殖；在很大比例 的黑色素瘤和乳腺癌中BPTF拷貝數(shù)升高，W及BPTF過表達(dá)是人類黑色素瘤患者的存活率 降低的標(biāo)志物。此外，在BRAF突變型黑色素瘤細(xì)胞中，BPTF調(diào)節(jié)E服通路并且賦予對選擇 性BRAF抑制劑的獲得性抗性。
[0043] 本公開證實(shí)了BPTF在腫瘤進(jìn)展中的功能上的和生物學(xué)上的意義，具體集中在黑 色素瘤、成膠質(zhì)細(xì)胞瘤、W及乳腺癌。在鼠類黑色素瘤細(xì)胞和乳腺癌細(xì)胞中抑制BPTF表達(dá) 引起對腫瘤細(xì)胞的增殖和侵襲性的顯著抑制。體內(nèi)研究確認(rèn)了BPTF在黑色素瘤進(jìn)展中所 發(fā)揮的強(qiáng)大作用，運(yùn)是因?yàn)橥ㄟ^使用不同的祀向BPTF的shRNA觀測到腫瘤細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移 性腫瘤計(jì)數(shù)的顯著減少。在兩種人類黑色素瘤和GBM細(xì)胞系W及乳腺癌細(xì)胞中確認(rèn)了BPTF 對細(xì)胞周期進(jìn)展W及體外和體內(nèi)腫瘤