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參與花青苷生物合成調(diào)控的菊花bHLH轉(zhuǎn)錄因子的制作方法

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參與花青苷生物合成調(diào)控的菊花bHLH轉(zhuǎn)錄因子的制作方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于植物分子生物技術(shù)和基因工程領(lǐng)域,涉及一個(gè)參與花青苷生物合成調(diào) 控的新型菊花轉(zhuǎn)錄因子仏似(SEQ :N0. 1)。
【背景技術(shù)】
[0002] 菊花是世界重要花卉之一,為僅次于玫瑰的世界第二大切花。菊花亦是我國(guó)傳統(tǒng) 名花,具有悠久的歷史和深厚的文化積淀。至今,我國(guó)研究者已自主培育了近250個(gè)切花菊 品種,其中單頭切花大菊占切花產(chǎn)量總數(shù)的一半左右。花色是菊花重要的觀賞性狀之一,單 頭切花大菊的花色多以原始色系黃、白為主,除此黃、白色系之外,我國(guó)自主培育的菊花品 種還有綠、青、粉紅、紅、紫和間色等其他色系。分析紫紅粉色系菊花的呈色機(jī)制,是培育多 色系菊花重要的理論基礎(chǔ),有助于改善切花菊文化的發(fā)揚(yáng)及其產(chǎn)業(yè)的多元化。
[0003] 花青苷是眾多紫紅粉色系菊花品種的主要呈色色素,其積累量越高花色越偏紅紫 色。花青苷,又名花色素苷,屬黃酮類化合物,由花青素和糖基結(jié)合而成?;ㄇ嘬赵谥参矬w 內(nèi)的生物合成起始于苯丙氨酸途徑,由多個(gè)酶參與催化,而編碼這些酶的基因在轉(zhuǎn)錄水平 上則受到從MZ辨卩勝必轉(zhuǎn)錄因子形成的MBW轉(zhuǎn)錄復(fù)合體的協(xié)同調(diào)控。在這三類轉(zhuǎn)錄 因子中,盡管i/ra轉(zhuǎn)錄因子對(duì)花青苷的生物合成調(diào)控具有較高的特異性,然而專錄因 子的協(xié)同作用亦不容忽視。
[0004] 是植物中第2大轉(zhuǎn)錄因子家族,其基因序列中擁有保守的bHLH結(jié)構(gòu)域,由 約60個(gè)氨基酸組成。典型的bHLH結(jié)構(gòu)域的N端包含13 ~ 17個(gè)親水的堿性氨基酸殘基, 其后連接被任意長(zhǎng)度的環(huán)一分為二的a螺旋(HLH,helix-loop-helix)。在bHLH結(jié)構(gòu)域 的堿性氨基酸序列中,ffiR (His5-Glu9-Argl3)基序具有高度的保守性,可結(jié)合啟動(dòng)子序列 中的六核苷酸E-box基序(CANNTG),進(jìn)而調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄??蓞⑴c植物心皮、花藥和 表皮細(xì)胞的發(fā)育,光敏色素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和逆境響應(yīng),黃酮類化合物的生物 合成調(diào)控等生命進(jìn)程。參與植物花青苷生物合成調(diào)控的威員,已在眾多植物體內(nèi)得到 鑒定,然而菊花中參與花青苷生物合成轉(zhuǎn)錄調(diào)控的成員至今未見(jiàn)報(bào)道,極大地限制了 菊花花色品質(zhì)改良育種及其產(chǎn)業(yè)多元化的發(fā)展。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0005] 本發(fā)明的目的是提供一個(gè)參與花青苷生物合成調(diào)控的新型菊花祕(mì)£辟專錄因子 (仏祕(mì)£似),具有SEQ :N0. 1的核苷酸序列,其編碼序列全長(zhǎng)為1842個(gè)核苷酸,可編碼一個(gè) 含614氨基酸的蛋白。CmbHLH2氨基酸序列中含有堿性螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)域,且在堿性結(jié) 構(gòu)域內(nèi)含有高度保守的ffiR (His5-Glu9-Argl3)基序,可結(jié)合啟動(dòng)子序列中六核苷酸E-box 基序(CANNTG);在其氨基酸序列的C端分布著MIR結(jié)構(gòu)域,可與轉(zhuǎn)錄因子相互作用。
[0006] 本發(fā)明提供的菊花祕(mì)£辟專錄因子(在紅色菊花品種中的基因表達(dá)最高, 粉色次之,黃色品種中最低。的這一表達(dá)模式與不同菊花品種積累花青苷的能力呈 顯著正向相關(guān)。CmbHLH2可與CmMYB6相互作用形成轉(zhuǎn)錄蛋白復(fù)合體,結(jié)合花青苷合成關(guān)鍵 基因啟動(dòng)子并增強(qiáng)其表達(dá)活性,進(jìn)而誘導(dǎo)花青苷的積累。
[0007] 本發(fā)明的另一個(gè)目的是提供菊花辟專錄因子在改變植物色澤中的應(yīng)用。 仏MM2與仏#/及徹、同在煙草葉片中瞬時(shí)過(guò)量表達(dá)時(shí),可強(qiáng)烈誘導(dǎo)花青苷的積累,使得原 本綠色的葉片變成紅色。因此,通過(guò)轉(zhuǎn)基因的手段,使得在植物中過(guò)量表達(dá),或者 抑制菊花植株中的表達(dá),即可分別獲得花青苷合成受到增強(qiáng)或者抑制的轉(zhuǎn)基因植 株,其色澤會(huì)因花青苷合成的變化而變化。 仏似(SEQ :N0. 1)是菊花中首例克隆并經(jīng)過(guò)功能鑒定的可調(diào)控花青苷生物合成, 進(jìn)而修飾植株色澤的成員。
[0008] 本發(fā)明以三種不同花色的菊花品種Z1 (紅色),Z2 (粉色)和Z3 (黃色)為試材,應(yīng) 用RACE、實(shí)時(shí)定量PCR、酵母雙雜交、瞬時(shí)表達(dá)等生物學(xué)技術(shù),分離鑒定出參與菊花花青苷 生物合成調(diào)控的成員仏(SEQ :N0. 1)。研究發(fā)現(xiàn),仏MM2的基因表達(dá)與菊花 花色中紅色程度呈良好正向相關(guān),即越紅的菊花品種中,仏MM2的表達(dá)量越高; 可與仏俗相互作用形成轉(zhuǎn)錄蛋白復(fù)合體,增強(qiáng)菊花花青苷生物合成關(guān)鍵基因啟動(dòng) 子活性,進(jìn)而顯著誘導(dǎo)煙草葉片花青苷的積累。
【附圖說(shuō)明】
[0009] 圖1菊花2個(gè)基因在不同菊花品種中的表達(dá)模式分析。
[0010] 圖2菊花2個(gè)基因?qū)ㄇ嘬蘸铣苫騿?dòng)子的調(diào)控效應(yīng)分析。
[0011] 圖3菊花2個(gè)bHLH與CmMYB6轉(zhuǎn)錄蛋白質(zhì)間的相互作用分析。
[0012] 圖4仏(SEQ:N0. 1)誘導(dǎo)花青苷生物合成功能的鑒定。
【具體實(shí)施方式】
[0013] 下面結(jié)合附圖和實(shí)施例,對(duì)本發(fā)明做進(jìn)一步闡述,但實(shí)施例不限制本發(fā)明的保護(hù) 范圍。在下述實(shí)施例中常規(guī)的基因操作方法參照《分子克隆實(shí)驗(yàn)指南》(第三版)。
[0014] 實(shí)施例1:菊花仏MZ似基因克隆 依據(jù)菊花RNA-Seq數(shù)據(jù)庫(kù)信息,篩選出可能參與菊花花青苷生物合成調(diào)控的辟專錄 因子仏MM2部分序列(SEQ:N0. 2)。應(yīng)用基因特異引物2(GSP2)SEQ:N0. 3,以及巢式基 因特異引物2(NGSP2)SEQ:N0. 4,利用3' cDNA末端快速擴(kuò)增(3' RACE)技術(shù)獲得仏 的3'非編碼區(qū)(3'UTR)序列(SEQ:N0. 5)。進(jìn)而應(yīng)用基因特異引物1 (GSP1)SEQ:N0. 6, 以及巢式基因特異引物1(NGSP1)SEQ:N0. 7,利用5' cDNA末端快速擴(kuò)增(5' RACE)技術(shù) 獲得仏MM2的5'非編碼區(qū)(5' UTR)序列(SEQ:N0. 8)。根據(jù)所得的3'和5' UTR拼接 得到自起始密碼子(ATG)至終止密碼子的仏似(SEQ :N0. 1)的全長(zhǎng)序列。
[0015] RACE 中第一輪 PCR 程序?yàn)?94°C 5min ; 94°C 10 s,72°C 2 min 30 s,5 個(gè)循環(huán); 94〇C 10 s,70°C 30s,72°C 2 min 30 s,5 個(gè)循環(huán);94°C 10 s,67°C 30s,72°C 2 min 30 s, 30 個(gè)循環(huán);72°C 10 min,16°Chold。第二輪 PCR 程序?yàn)?94°C 5min;94°C 10 s,65°C 30s, 72〇C 2 min 30 s,30 個(gè)循環(huán);72〇C 10 min,16〇Chold。
[0016] RACE第一輪PCR體系為10 X Ex-Buffer 2 yL,2.5 mmol/L dNTPs 1.6 yL,10 ymol/L GSP1或GSP2 0.5 yL,下游引物UPM 2 yL,Ex-Taq 0.1 yL,cDNA 0.5 yL,加 滅菌雙蒸水至20yL。第二輪PCR體系為10 X Ex-Buffer 2 yL,2.5 mmol/L dNTPs 1.6 yL,10 ymol/LNGSPl或NGSP2 0.5 yL,下游引物NUP2 yL,Ex-Taq0.1 yL,稀釋10倍的第一輪PCR產(chǎn)物1 yL,加滅菌的雙蒸水至20yL。
[0017] 根據(jù)3'和5' UTR拼接得到自起始密碼子(ATG)至終止密碼子的仏(SEQ : NO. 1)的全長(zhǎng)序列。為更加明確闡述本發(fā)明的內(nèi)容,文中還應(yīng)用了仏(GenBank KC686698)和仏#/萬(wàn)6 (GenBank KR002097)兩個(gè)基因,其序列均來(lái)自已有的報(bào)道。
[0018] 實(shí)施例2:菊花仏MM2基因表達(dá)模式分析 (一)實(shí)驗(yàn)方法 利用 Primer Premier 5,依據(jù)~(SEQ :N0. 9)和~(SEQ :N0. 5)的 3' UTR序列分別設(shè)計(jì)實(shí)時(shí)定量PCR(QPCR)引物組合SEQ :N0. 10和SEQ :N0. 11以及SEQ :N0. 12和SEQ:N0. 13,PCR產(chǎn)物包含終止密碼子,長(zhǎng)度分別為201 bp和192 bp。以菊花actin 基因(SEQ :N0. 14)的表達(dá)為內(nèi)參分析仏和仏MM2的表達(dá)模式,其QPCR引物組合為 SEQ:N0. 15和SEQ:N0. 16。所有QPCR引物特異性經(jīng)熔點(diǎn)曲線分析、凝膠電泳分析和QPCR 產(chǎn)物再測(cè)序驗(yàn)證。
[0019] 分別提取三種不同花色的菊花品種的花瓣RNA,參照cDNA合成kit(Bi〇-Rad,USA) 說(shuō)明書,合成 cDNA。參照 Ssofast EvaGreen Supermix kit(Bi〇-Rad,USA)說(shuō)明書開(kāi)展 QPCR 分析,米用 20 ML體系:其中 10 ML 2 XSsofast EvaGreen Supermix (Bio_Rad,USA),1.0 ML上游引物(10剛),1.0 ML下游引物(10剛),2.0 ML稀釋的cDNA和6.0 ML H20。QPCR 程序?yàn)椋?4°C,10 min;94°C 10 s,60°C 30 s,45 個(gè)循環(huán)。
[0020] (二)實(shí)驗(yàn)結(jié)果 基因表達(dá)分析結(jié)果表明,仏似(SEQ :N0. 1)的基因表達(dá)與不同花色菊花品種中的 花青苷積累呈良好正向相關(guān)(附圖1),即在紅色菊花品種Z1中表達(dá)量最高,在粉色 菊花品種Z2中表達(dá)量次之,而在黃色菊花品種Z3中不表達(dá)。仏(SEQ :N0. 9)的基 因表達(dá)雖然也呈相
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