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基于文本和圖像識別的顱腦創(chuàng)傷臨床決策系統(tǒng)

文檔序號:40607804發(fā)布日期:2025-01-07 20:48閱讀:8來源:國知局
基于文本和圖像識別的顱腦創(chuàng)傷臨床決策系統(tǒng)

本發(fā)明涉及醫(yī)療器械領域,特別涉及基于文本和圖像識別的顱腦創(chuàng)傷臨床決策系統(tǒng)。


背景技術:

1、顱腦創(chuàng)傷(traumatic?brain?injury,tbi)作為神經(jīng)外科最常見的急危重癥之一,具有高發(fā)病率和高死殘率的特點,尤其對青壯年的生命健康造成嚴重威脅。同時,tbi不僅嚴重影響患者的身心健康和生活質量,還給家庭和社會帶來巨大經(jīng)濟損失和沉重的醫(yī)療負擔。因此,研究如何提高tbi救治效率,遏制其危害,具有重大社會效益和經(jīng)濟價值。

2、申請?zhí)枮?02311626792.9的發(fā)明專利公開了一種多任務混雜神經(jīng)網(wǎng)絡驅動的ct圖像處理方法和類腦診斷系統(tǒng),涉及人工智能醫(yī)學影像,方法包括生成混雜神經(jīng)網(wǎng)絡,輸入ct圖像,在每一層執(zhí)行混雜脈沖-卷積計算;生成共同編碼器和多任務解碼器,輸出多任務結果圖像。系統(tǒng)包括處理器和存儲器及顯示器,存儲器中存儲有至少一條指令,指令由處理器加載并執(zhí)行以實現(xiàn)如下步驟:獲取ct圖像;生成基于混雜神經(jīng)網(wǎng)絡建立的共同編碼器,調用編碼器對ct圖像進行編碼,生成聯(lián)合特征;生成基于混雜神經(jīng)網(wǎng)絡建立的多任務解碼器,調用解碼器對聯(lián)合特征進行分類操作和分割操作,得到多任務診斷結果。本發(fā)明可以提高ct圖像的多任務診斷效率,在保證多任務精度的同時降低診斷系統(tǒng)的計算功耗。

3、上述技術完成了對ct圖像的精確識別,依照圖像的分割識別圖像特征,得到ct圖像的多任務診斷結果,但是上述技術仍然需要醫(yī)生進行最終的決策診斷,現(xiàn)有的tbi診療模式存在諸多問題,對其救治效率產(chǎn)生不利影響,這些問題可歸納為三大“痛點”:“痛點”一:神經(jīng)外科醫(yī)生嚴重不足,無法應對日益增長的tbi患者?!巴袋c”二:長時間超負荷工作,導致醫(yī)生疲勞工作,降低醫(yī)生診治效率?!巴袋c”三:多種因素可能影響醫(yī)生判斷,從而影響tbi患者的救治。針對上述三個“痛點”,最簡單有效的解決辦法就是在短期內(nèi)增加大量精力充沛、不會疲倦、處變不驚且臨床經(jīng)驗豐富的神經(jīng)外科??漆t(yī)生,但這顯然無法辦到?,F(xiàn)需要一種技術能夠提升tbi救治效率。


技術實現(xiàn)思路

1、本發(fā)明提供了基于文本和圖像識別的顱腦創(chuàng)傷臨床決策系統(tǒng),能夠提升tbi救治效率。

2、為了解決上述技術問題,本技術提供如下技術方案:

3、基于文本和圖像識別的顱腦創(chuàng)傷臨床決策系統(tǒng),包括:

4、圖像識別模塊:用于對ct圖像進行識別后生成文本報告;建立ct征象與臨床病情和診療措施的映射關系;

5、關鍵命名實體識別模塊:在bert預訓練語言模型的基礎上,構建bert-idcnn-bilstm-crf模型,從文本報告的全局或局部中抽取關鍵的命名實體;

6、基于知識的語義表示模塊:對關鍵命名實體進行特征分析,建立word2vec模型,將相關醫(yī)學文本向量化表示,并基于知識建立醫(yī)學文本權重評分機制、醫(yī)學文本相似度度量方法,得到醫(yī)療文本;

7、深度學習決策模塊:用于在提取醫(yī)療文本特征后,理解醫(yī)學詞之間的差異,對tbi患者醫(yī)療文本進行智能識別和判讀,并做出診療決策。

8、本方案的基本原理及有益效果:在前期基礎、臨床及應用研究的基礎上,深入研究和模擬神經(jīng)外科??漆t(yī)生對tbi的診療思路,從而構建全新的針對顱腦創(chuàng)傷的cdss,即“t-system”。t-system將直接從患者電子病歷(emr)中獲取包括病史、體格檢查,以及重要輔助檢查等在內(nèi)的關鍵醫(yī)療圖像和文本信息,避免信息來源渠道不一致導致的數(shù)據(jù)缺失。該系統(tǒng)獲取病史、體征、ct表現(xiàn)等的關鍵信息后,通過臨床分析后得出診療結論。同時,該系統(tǒng)將tbi的診療方案進行細化,并按照病情危重程度對處置措施優(yōu)先級進行排序,既包括了排除診斷所需的診療措施,又包括了搶救性措施。t-system包括四大模塊:(1)圖像識別模塊;(2)關鍵命名實體識別系統(tǒng);(3)基于知識的語義表示系統(tǒng);(4)深度學習決策系統(tǒng)。在圖像識別模塊中,ct表現(xiàn)將被仔細識別后生成文本報告,作為t-system判讀病情和作出決策重要數(shù)據(jù)來源,并在此基礎上,建立重要ct征象與臨床病情和診療措施的映射關系。同時,我們在bert預訓練語言模型的基礎上,構建了bert-idcnn-bilstm-crf模型,能夠很好地從全局和局部文本中抽取出關鍵的命名實體,尤其在醫(yī)學文本識別中展示了很好的識別效果。深度學習決策系統(tǒng)中基于醫(yī)學知識的詞向量空間更適合于醫(yī)療場景,在提取醫(yī)療文本特征后,模型能夠更好地理解醫(yī)學詞之間的差異。基于深度學習的模型還可以為文本提供足夠的表征能力,以快速、高質量地解決問題,數(shù)據(jù)中的信息可以在模型中被有效地“編碼”。

9、通過對ct圖像的識別,生成文本信息展示出ct圖像中的特征,然后對文本信息中的特征進行語義識別,獲得該特征下病癥的診療措施,然后做出對應的決策。該決策是基于病情對應的處理措施完成的,通過數(shù)據(jù)模型的智能學習醫(yī)生的處理方式,實現(xiàn)了機器決策,解放了人力,減少了人長久勞作容易出現(xiàn)的識別誤差問題,且提升了處理效率,能夠為眾多患者進行同時診斷。

10、進一步,所述圖像識別模塊還用于,對頭顱ct圖像進行預處理:以dicom格式保存所有正常人和患者的頭顱ct圖像,改進卡爾曼濾波算法對ct圖像去噪,利用lableimg工具對頭顱ct圖像進行標注;然后將tbi患者的頭顱ct圖像分為顱骨損傷和腦損傷,分別在頭顱ct影像的骨窗和腦窗兩個窗位,采用co-unet模型對tbi患者頭顱ct影像進行圖像分割,設計單連通域邊界插值的深度卷積網(wǎng)絡模型提取正常頭顱ct的圖像特征信息,基于densenet網(wǎng)絡實現(xiàn)異常信息的識別,改進閾值分割算法對識別結果進行二次篩選,對tbi患者頭顱ct二維圖像中不同種類的顱骨損傷和腦損傷進行定側、定位、定性和定量識別。有益效果:以dicom格式保存所有正常人和患者的頭顱ct圖像,改進卡爾曼濾波算法對ct圖像去噪,利用lableimg工具對頭顱ct圖像進行標注,為識別提供數(shù)據(jù)保障。

11、進一步,所述深度學習決策模塊還用于:以tbi患者急診電子病歷(emr)為醫(yī)療文本信息來源,采集內(nèi)容主要包括病史、體格檢查和輔助檢查結果;其中,頭顱ct檢查結果為圖像識別模塊輸出的文本結果;和以最新的國內(nèi)外顱腦創(chuàng)傷診療指南為指導,結合臨床實踐經(jīng)驗和本研究團隊前期的基礎、臨床和應用研究結果,將顱腦創(chuàng)傷患者的病史、體格檢查、ct等重要輔助檢查予以不同權重評分;同時,將顱腦創(chuàng)傷的各種診療措施進行細化,經(jīng)過反復的臨床數(shù)據(jù)驗證,研究和構建多維、多源、異構數(shù)據(jù)與相應診療決策的映射關系;并通過對tbi患者的頭顱ct圖像和emr進行智能識別,得到以中文文本形式輸出的診療結果,包括急診診斷性結論和急診診療性決策。

12、進一步,在針對頭顱ct識別時;對正常頭顱ct圖像進行識別:將正常人頭顱ct圖像的骨窗和腦窗位圖像進行分別存儲和分析;在骨窗位,通過co-unet模型對顱骨進行分割,包括面顱骨和腦顱骨,提取這些骨標志性結構的特征;在腦窗位,采用co-unet模型對腦實質區(qū)域進行分割,包括幕上和幕下腦實質區(qū)域,提取這些腦實質內(nèi)標志性結構的特征,并計算出正常人不同頭顱ct層面雙側側腦室平均面積;

13、對tbi患者頭顱ct圖像的識別:將tbi患者的傷灶分為顱骨損傷和腦損傷,并將tbi患者頭顱ct圖像的骨窗和腦窗位進行分別存儲和分析,分別在不同窗位對腦傷和顱骨損傷進行識別。

14、進一步,對tbi患者頭顱ct圖像的腦窗位進行識別主要包括:對腦傷進行識別,包括定側、定位、定性、定量識別;對腦傷的定側、定位、定性和定量識別進行匯總;

15、對tbi患者頭顱ct圖像的骨窗位對顱骨損傷進行識別主要包括:對顱骨損傷部位及種類進行識別,包括定側、定位、定性、定量識別;對顱骨損傷的定側、定位、定性和定量識別進行匯總。

16、進一步,所述圖像處理模塊輸出的文本信息包括結論性結果和描述性結果;其中結論性結果:按照神經(jīng)外科和神經(jīng)影像診斷思維,輸出腦傷和/或顱骨損傷結果,包含定側、定位和定性結果;描述性結果:對頭顱ct圖像進行更加詳細的描述,包含了定側、定位、定性和定量結果。

17、進一步,所述關鍵命名實體識別模塊包括:

18、bert模塊:

19、bert采用了一種與完形填空題相似的掩碼語言模型來完成預訓練,掩碼語言模型的目的是隨機地掩蓋一個句子中的一些單詞,并用一個標記[mask]來取代原來的單詞,掩碼語言模型的進一步目標是根據(jù)標記的左邊和右邊的上下文來預測被屏蔽的詞,bert模型計算方法如公式(1)所示:

20、

21、其中,q、k、v為輸入向量矩陣,qkt表示計算出輸入向量的相似度矩陣,dk為輸入向量矩陣k的維度。

22、在bert的下游任務中,如蘊含和情感分析,是利用每個序列的第一個標記來處理的,這個標記稱為特殊分類令牌[cls],在bert模型中,對應于[cls]標記的最終隱藏狀態(tài)聚合了一個句子或一對句子的特征表示;

23、idcnn模塊:

24、idcnn采用膨脹卷積,通過調節(jié)卷積核的膨脹寬度,減小了數(shù)據(jù)丟失,擴展了感知范圍,實現(xiàn)了對文本的更長的捕捉;膨脹卷積的感受野計算公式為:

25、fi+1=(2i+2-1)2

26、在idcnn模塊中有三個卷積層,膨脹寬度分別為1、1和2;模塊一共經(jīng)過4次迭代,迭代過程中的參數(shù)共享有效地防止了模型過擬合;各參量隨層數(shù)的增大而線性增大,而感覺野值則呈現(xiàn)指數(shù)式的增長,使得感覺野能夠迅速地涵蓋全部的輸入序列;

27、bilstm模塊:

28、bilstm在遞歸循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡中引用了門控機制,即輸入門、輸出門和遺忘門;bilstm由雙向的lstm組成,分別從兩個方向提取全局上下文特征;

29、crf模塊:

30、對于一個輸入單詞序列x,存在表示單詞序列x的一般標簽序列y,條件隨機場的概率模型在給定輸入單詞序列x的所有可能的標簽序列y上定義了一個分布p(y|x),其形式如下:

31、

32、有益效果:針對醫(yī)療相關知識表示系統(tǒng)及其語義分析系統(tǒng)構建過程中,非結構化數(shù)據(jù)噪聲冗雜、存在多細粒度文本、信息抽取困難、識別準確率不穩(wěn)定的特點,我們擬專門針對醫(yī)學文本信息的特點,構建bert-idcnn-bilstm-crf這一模型,解決對醫(yī)療相關關鍵命名實體進行準確識別這一關鍵問題。

33、進一步,所述基于知識的語義表示模塊用于計算醫(yī)學文本的持續(xù)分布式表示;通過一個隱藏層的神經(jīng)網(wǎng)絡結構,從醫(yī)學文本語料庫的輸入中產(chǎn)生文本向量作為輸出;在word2vec模型中首先從輸入的文本生成一個詞匯表,然后通過反向傳播和隨機梯度方法學習單詞向量;

34、還用于:

35、建立相似度度量的方法以根據(jù)醫(yī)學表現(xiàn)權重評分來分析匹配相應的治療措施;借助word2vec生成的醫(yī)學文本詞向量來生成關鍵文本的句向量表示,句向量表示由如下公式所得。

36、

37、其中vs為句向量表示,?vi為i詞的詞向量表示,w(i)為權重,m為詞數(shù);

38、該方法采用余弦相似度來將關鍵醫(yī)學文本與醫(yī)學專家制定的權重評分表匹配,針對醫(yī)學表現(xiàn)分析出相應治療措施;余弦相似度在0到1之間,當余弦相似度接近1時,稱兩個向量相似,當余弦相似度接近0時,稱兩個向量不相似;針對不同醫(yī)學關鍵實體,我們通過實驗制定相應的相似度閾值;

39、

40、其中v1,v2為不同的句向量表示。

41、進一步,所述圖像識別模塊分析的ct圖像來源于ct檢測儀;包括機架,所述ct檢測儀包括設置在水平方向的x光發(fā)射器和與x光發(fā)射器對應的x光接收器;所述x光發(fā)射器和固定在機架上,所述x光發(fā)射器和x光接收器之間的機架上固定有支撐臺,所述支撐臺上固定有頭枕,頭枕兩側均鉸接有偏轉塊,偏轉塊底部鉸接有滑桿,所述支撐臺由上至下開有第一滑道和第二滑道,所述第一滑道和第二滑道呈八字形分布,所述支撐臺內(nèi)還開有通氣道,所述通氣道分別與第一滑道和第二滑道的底部連通,頭枕左右兩側的滑桿分別與第一滑道和第二滑道滑動連接,所述偏轉塊底部和支撐臺頂部固定有第一彈簧,所述第一彈簧套設在滑桿外部;靠近x光發(fā)射器一側的支撐臺上開設有豎直方向的第三滑道,所述第三滑道底部和通氣道連通,所述第三滑道內(nèi)滑動連接有第一鉛塊,第一鉛塊底部和第三滑動底部的內(nèi)壁之間固定連接有第二彈簧,第一鉛塊底部的第三滑道,兩個滑桿底部的第一滑道和第二滑道,和通氣道組成密閉空間;在滑桿未被按壓下移時,第一鉛塊未處于x光發(fā)射器的照射范圍內(nèi);在滑桿之上的偏轉塊受壓時,第一鉛塊被頂出,出現(xiàn)在x光的照射范圍內(nèi);數(shù)據(jù)處理模塊收集x光檢測儀繪制的圖片,并將有鉛塊圖像的ct圖片舍棄傳輸給圖像識別模塊。

42、進一步,所述第一滑道內(nèi)和第二滑道內(nèi)設置有位置傳感器,位置傳感器在滑桿在第一滑道/第二滑道內(nèi)下移時發(fā)出提醒信號;所述頭枕上方的機架上固定有電動伸縮桿,所述電動伸縮桿的自由端的移動方向朝下,訴訟電動伸縮桿底部固定有第二鉛塊;數(shù)據(jù)處理模塊接收到提醒信號,控制電動伸縮桿啟動,將第二鉛塊伸入x光的照射區(qū)域,在提醒信號消失后,電動伸縮桿復位。

43、有益效果:在對少兒進行頭部ct檢測時,由于少兒的自制力較差,可能會在檢測的過程中頭部晃動,產(chǎn)生多余的動作影響到最終的檢測結果;例如頭部的任何移動都可能導致圖像出現(xiàn)模糊,影響圖像質量。偽影產(chǎn)生:不適當?shù)囊苿涌赡茉趫D像上產(chǎn)生偽影,這會干擾圖像的解讀,可能導致誤診或漏診。本方案采用決策系統(tǒng)對患者的病癥出具診療意見,如果ct圖像出現(xiàn)偏差將會大大影響正確率,因此本方案通過設置鉛塊的伸縮,在患者移動時會觸發(fā)偏轉塊偏轉,從而擠壓通氣道,第一鉛塊在受壓時頂出,出現(xiàn)在x光的照射區(qū)域內(nèi),此時成像的圖片上將會出現(xiàn)明顯陰影,表示此張圖片不可用。數(shù)據(jù)處理模塊識別出有陰影的圖片進行舍棄,保證了傳輸至圖像處理模塊處的ct圖像是完全正確的,提升了數(shù)據(jù)樣本的準確度,進而減小了決策系統(tǒng)出現(xiàn)誤差的概率,且本方案是不停機,不間斷地檢測ct,能夠防止若圖像出現(xiàn)瑕疵時,多次照射造成的輻射危害。

44、為了防止出現(xiàn)測量誤差,通過設置伸縮桿的設置,在滑桿下移(即偏轉塊受壓)時才發(fā)出信號,控制伸縮桿頂出,即患者偏轉時所拍攝的圖像上可能出現(xiàn)兩個兩個陰影,即對陰影的產(chǎn)生誤差進行了消減,例如患者腦袋里存在金屬異物時,可能也會造成陰影,此時容易和腦袋移動造成混淆,通過伸縮桿的設置,能夠在伸出的同時提醒患者,也能夠在圖像上進行二次標記,減少樣本誤差。

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