本發(fā)明涉及用于膠質(zhì)瘤的診斷和/或預后的試劑盒、方法和計算機可讀介質(zhì),更具體地,涉及通過檢測ciapin1表達來提供膠質(zhì)瘤的診斷和/或預后。
背景技術(shù):
1、膠質(zhì)瘤是一種發(fā)生在大腦和脊髓中的腫瘤,約占所有原發(fā)性腦腫瘤的30%和所有惡性腦腫瘤的80%。膠質(zhì)瘤的臨床特點是發(fā)病率高、術(shù)后復發(fā)率高、治愈率低。
2、根據(jù)腫瘤細胞與正常腦膠質(zhì)細胞在形態(tài)上的相似程度,膠質(zhì)瘤可分為星形細胞瘤(星形膠質(zhì)細胞)、少突膠質(zhì)細胞瘤(少突膠質(zhì)細胞)、室管膜瘤(室管膜細胞)和混合型膠質(zhì)瘤(例如少突膠質(zhì)細胞瘤和星形細胞瘤,包括混合型膠質(zhì)細胞)。根據(jù)腫瘤分子病理學特征及生物學行為,膠質(zhì)瘤惡性程度從低到高可分為who?i~iv級。i級膠質(zhì)瘤通常是良性的。ii級的平均生存期約為7年。ii級膠質(zhì)瘤可以進展為iii級(高級別膠質(zhì)瘤),最終是iv級(繼發(fā)性膠質(zhì)母細胞瘤),其中iv級膠質(zhì)母細胞瘤占比超過50%,惡性程度最高,預后效果極差。iii級和iv級的膠質(zhì)瘤統(tǒng)稱為高級別膠質(zhì)瘤(high-grade?glioma,hgg),包括間變性星形細胞瘤、間變性少突膠質(zhì)細胞瘤、以及惡性程度最高的膠質(zhì)母細胞瘤(glioblastoma,gbm)。hgg是最為常見的一種侵襲性顱內(nèi)原發(fā)性腫瘤,臨床上常聯(lián)合應用手術(shù)以及放化療進行綜合治療,但治療效果仍不理想,并且極易出現(xiàn)復發(fā)的情況。
3、目前膠質(zhì)瘤的輔助診斷分子標志物有idh、mgmt、egfr、p53、pten等。通常檢查idh1/2的體細胞突變、egfr的基因組擴增以及染色體臂1p和19q的共缺失來進行準確診斷。idh1/2突變常見于低級別膠質(zhì)瘤和繼發(fā)性膠質(zhì)母細胞瘤,眾所周知,它對膠質(zhì)瘤患者的延長生存期產(chǎn)生深遠影響。此外,約50%的膠質(zhì)母細胞瘤顯示egfr的局灶性擴增。再者,已知egfr基因擴增促進細胞增殖,因此,egfr抑制劑的臨床試驗經(jīng)常用于癌癥治療。
4、在此背景下,為了有效診斷膠質(zhì)瘤,通常使用免疫組織化學(ihc)和熒光原位雜交(fish)對被認為是膠質(zhì)瘤增殖的必需基因idh1的目標突變和egfr的局灶性擴增進行病理診斷。然而,越來越需要以更簡單的方式有效診斷膠質(zhì)瘤。
5、ciapin1(cytokine?induced?apoptosis?inhibitor?1,細胞因子誘導凋亡抑制因子1)是一種防止細胞凋亡或程序性細胞死亡的蛋白質(zhì)。一系列報告表明,ciapin1與bcl-2、胱天蛋白酶、iap家族或其他信號轉(zhuǎn)導分子沒有同源性。ciapin1的表達依賴于生長因子的刺激。它自然存在于各種器官中,特別是那些可以再生或增殖的器官。ciapin1在ncbi中的基因id為57019,編碼的蛋白在uniprot的參考號為q6fi81。
6、ciapin1是非同源ras信號傳導通路中的調(diào)節(jié)因子和重要效應因子,與多種惡性腫瘤的凋亡及多藥耐藥密切相關,如胃癌、膽管癌等。ciapin1也被證明在胃癌、肝細胞癌、腎癌等惡性腫瘤中發(fā)揮關鍵作用。此外,發(fā)現(xiàn)ciapin1在正常胎兒和腫瘤組織中普遍存在,在活躍代謝組織中高表達。因此,ciapin1可能參與癌癥的重要生理功能。
7、然而,ciapin1的表達和功能在膠質(zhì)瘤細胞中從未被報道過。目前尚未見研究和報道ciapin1在膠質(zhì)瘤診斷和/或預后中的應用。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本技術(shù)的發(fā)明人意外地發(fā)現(xiàn)相對于正常組織,膠質(zhì)瘤組織中ciapin1顯著高表達,并且ciapin1高表達與膠質(zhì)瘤不良預后顯著相關。發(fā)明人利用能夠與ciapin1的表達產(chǎn)物結(jié)合的試劑檢測腦組織中ciapin1的存在和/或水平,從而高效、準確地提供膠質(zhì)瘤的診斷和/或預后。
2、在第一方面,本發(fā)明提供一種用于對象的膠質(zhì)瘤的診斷和/或預后的試劑盒,所述試劑盒包括用于檢測ciapin1的表達水平的試劑。
3、在第二方面,本發(fā)明提供用于檢測ciapin1的表達水平的試劑在制備用于對象的膠質(zhì)瘤的診斷和/或預后的試劑盒中的應用。
4、在第三方面,本發(fā)明提供用于ciapin1的表達水平的試劑用于對象的膠質(zhì)瘤的診斷和/或預后。
5、在第四方面,本發(fā)明提供一種用于對象的膠質(zhì)瘤的診斷和/或預后的方法,所述方法包括檢測來自所述對象的樣品中的ciapin1的表達水平。在一些實施方式中,所述方法包括將能夠與ciapin1的表達產(chǎn)物結(jié)合的試劑與來自所述對象的樣品接觸;檢測接觸后所述試劑與樣品中ciapin1的表達產(chǎn)物形成的復合物的存在和/或水平;以及基于所述復合物的存在和/或水平來提供所述對象的膠質(zhì)瘤的診斷和/或預后。
6、在第五方面,本發(fā)明提供一種計算機可讀存儲介質(zhì),其上存儲有供計算機讀取和執(zhí)行的計算機指令,所述計算機指令被執(zhí)行以進行用于對象的膠質(zhì)瘤的診斷和/或預后的方法,所述方法包括:(a)將來自所述對象的樣品與能夠與ciapin1的表達產(chǎn)物結(jié)合的試劑接觸;(b)檢測并讀取接觸后的樣品的信號,以確定所述試劑是否與樣品中的ciapin1的表達產(chǎn)物形成復合物;以及(c)判斷所述信號是否超過預定閾值,并且當所述信號超過預定閾值時,提供所述對象的膠質(zhì)瘤的診斷和/或預后。
7、在第六方面,本發(fā)明提供一種治療對象的膠質(zhì)瘤的方法,所述方法包括:(a)將來自所述對象的樣品與能夠與ciapin1的表達產(chǎn)物結(jié)合的試劑接觸;(b)檢測并讀取接觸后的樣品的信號,以確定所述試劑是否與樣品中的ciapin1的表達產(chǎn)物形成復合物;以及(c)判斷所述信號是否超過預定閾值,并且當所述信號超過預定閾值時,提供所述對象的膠質(zhì)瘤的診斷和/或預后;以及(d)向被確定患有膠質(zhì)瘤的對象施用抗腫瘤療法。在優(yōu)選的實施方式中,所述抗腫瘤療法是替莫唑胺。
8、在上述任一方面,來自所述對象的樣品中的ciapin1的水平與對照樣品水平或?qū)φ罩档牟町愄峁┧鰧ο蟮哪z質(zhì)瘤的診斷和/或預后。在一些實施方式中,來自所述對象的樣品中的ciapin1的水平高于未患疾病的對照的水平表示所述對象患有膠質(zhì)瘤。在一些實施方式中,來自所述對象的樣品中的ciapin1的更高的表達水平表示所述對象的膠質(zhì)瘤的不良預后。
9、在上述任一方面,所述用于檢測ciapin1的表達水平的試劑包括能夠與ciapin1的表達產(chǎn)物結(jié)合的試劑,以檢測所述樣品中的ciapin1的表達水平。在一些實施方式中,所述能夠與ciapin1的表達產(chǎn)物結(jié)合的試劑包括蛋白質(zhì)、核酸或小分子化合物。在一些實施方式中,所述能夠與ciapin1的表達產(chǎn)物結(jié)合的試劑是抗ciapin1單克隆抗體或其抗原結(jié)合片段,或是抗ciapin1多克隆抗體。
10、在一些實施方式中,所述能夠與ciapin1的表達產(chǎn)物結(jié)合的試劑被可檢測的標記物標記。在一些實施方式中,所述可檢測的標記物選自熒光標記、化學發(fā)光標記、順磁標記、放射性同位素標記和酶標記。
11、在上述任一方面,所述樣品為腦組織。在上述任一方面,所述膠質(zhì)瘤選自星形細胞瘤、少突膠質(zhì)細胞瘤、室管膜瘤和混合型膠質(zhì)瘤。在一些實施方式中,所述膠質(zhì)瘤選自間變性星形細胞瘤、間變性少突膠質(zhì)細胞瘤和膠質(zhì)母細胞瘤。在一些實施方式中,所述膠質(zhì)瘤是膠質(zhì)母細胞瘤。
12、本發(fā)明的其他方面和優(yōu)點將在具體實施方式中詳細描述,本領域技術(shù)人員能夠從下文的具體描述中意識到未在本公開中明確表述的其他方面和優(yōu)點。