rs1800818在檢測(cè)新布尼亞病毒引起的發(fā)熱伴血小板減少綜合征中的應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中rsl800818在檢測(cè)新布尼亞病毒引起的發(fā)熱伴血小 板減少綜合征中的應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002] 發(fā)熱伴血小板減少綜合征（Severe fever with thrombocytopenia syndrome, SFTS)，也有人稱(chēng)之為發(fā)熱，血小板和白細(xì)胞減少綜合征 (Fever, Thrombocytopenia and Leukopenia Syndrome，F(xiàn)TLS)，是出現(xiàn)在我國(guó)的一種新型布 尼亞病毒（發(fā)熱伴血小板減少綜合征布尼亞病毒，Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus，SFTSV，簡(jiǎn)稱(chēng)新布尼亞病毒）通過(guò)血液感染的新發(fā)傳染病，主要臨床表現(xiàn)為 急性發(fā)熱（多在38°C以上），血小板和白細(xì)胞減少，部分病例出現(xiàn)牙齦出血、皮膚瘀斑等出 血癥狀，少數(shù)患者可因多器官損害而死亡。該病尚無(wú)有效的疫苗和治療方法。已有研宄顯 示，健康人群中存在SFTSV隱性感染。
[0003] 單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphism，SNP)是存在于某一（些） 群體、正常個(gè)體的基因組DNA中單堿基的序列差異，是繼限制性酶切長(zhǎng)度多態(tài)性和微衛(wèi)星 之后的第三代遺傳標(biāo)記。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0004] 本發(fā)明所要解決的技術(shù)問(wèn)題是如何篩查新布尼亞病毒引起的發(fā)熱伴血小板減少 綜合征患者。
[0005] 為解決上述技術(shù)問(wèn)題，本發(fā)明首先提供了下述Al)-A6)中的任一種用途：
[0006] A1)檢測(cè)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在制備篩查發(fā)熱伴血小 板減少綜合征患者產(chǎn)品中的應(yīng)用；
[0007] A2)檢測(cè)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在制備檢測(cè)發(fā)熱伴血小 板減少綜合征易感性產(chǎn)品中的應(yīng)用；
[0008] A3)檢測(cè)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在制備檢測(cè)與發(fā)熱伴血 小板減少綜合征相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性的產(chǎn)品中的應(yīng)用；
[0009] A4)檢測(cè)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在制備鑒定或輔助鑒定 與發(fā)熱伴血小板減少綜合征相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性的產(chǎn)品中的應(yīng)用；
[0010] A5)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型在制備篩查發(fā)熱伴血小板減少綜合 征患者的產(chǎn)品中的應(yīng)用；
[0011] A6)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型在制備檢測(cè)發(fā)熱伴血小板減少綜合 征易感性產(chǎn)品中的應(yīng)用。
[0012]rsl800818是人染色體上的一個(gè)二等位多態(tài)性的SNP位點(diǎn)，該變異是轉(zhuǎn)換（A/G，在 其互補(bǔ)鏈上則為T(mén)/C)。所述rsl800818基因型是AA、AG或GG。所述AA是rsl800818位點(diǎn) 為A的純合型，所述GG是rsl800818位點(diǎn)為G的純合型，所述AG是rsl800818位點(diǎn)為A和 G的雜合型。所述檢測(cè)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型具體可通過(guò)檢測(cè)rsl800818 的核苷酸種類(lèi)確定。
[0013] 上述用途中，所述檢測(cè)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)可包括擴(kuò) 增包括rsl800818在內(nèi)的基因組DNA片段的PCR引物對(duì)和/或單堿基延伸引物。
[0014] 上述用途中，所述GG和所述AG基因型的個(gè)體在發(fā)熱伴血小板減少綜合征患者群 體中的比例分別高于對(duì)應(yīng)的基因型在新布尼亞病毒隱性感染者中的比例。
[0015] 上述用途中，所述發(fā)熱伴血小板減少綜合征具體為新布尼亞病毒引起的發(fā)熱伴血 小板減少綜合征。
[0016] 為解決上述技術(shù)問(wèn)題，本發(fā)明還提供了含有檢測(cè)人基因組中rsl800818的多態(tài)性 或基因型的物質(zhì)的產(chǎn)品。
[0017] 本發(fā)明所提供的含有檢測(cè)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)的產(chǎn) 品，為a) _d)中的任一種：
[0018] a)檢測(cè)與發(fā)熱伴血小板減少綜合征相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性或基因型的產(chǎn)品；
[0019] b)鑒定或輔助鑒定與發(fā)熱伴血小板減少綜合征相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性或基因型 的廣品；
[0020] c)篩查發(fā)熱伴血小板減少綜合征患者產(chǎn)品；
[0021] d)檢測(cè)發(fā)熱伴血小板減少綜合征易感性產(chǎn)品。
[0022] 上述產(chǎn)品中，所述檢測(cè)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)可包括擴(kuò) 增包括rsl800818在內(nèi)的基因組DNA片段的PCR引物對(duì)和/或單堿基延伸引物。
[0023] 上述產(chǎn)品中，所述GG和所述AG基因型的個(gè)體在發(fā)熱伴血小板減少綜合征患者群 體中的比例分別高于對(duì)應(yīng)的基因型在新布尼亞病毒隱性感染者中的比例。
[0024] 上述產(chǎn)品中，所述發(fā)熱伴血小板減少綜合征具體為新布尼亞病毒引起的發(fā)熱伴血 小板減少綜合征。
[0025] 在本發(fā)明的實(shí)施例中，所述發(fā)熱伴血小板減少綜合征具體為中國(guó)人群發(fā)熱伴血小 板減少綜合征。
[0026] 本發(fā)明中，所述擴(kuò)增包括rsl800818在內(nèi)的基因組DNA片段的PCR引物對(duì)可由序 列表中SEQ ID No. 1所示的單鏈DNA和序列表中SEQ ID No. 2所示的單鏈DNA組成；所述 單堿基延伸引物的核苷酸序列可如序列表中SEQ ID No. 3所示。
[0027] 實(shí)驗(yàn)證明，rsl800818的G等位在病例組中的比例高于該等位在對(duì)照組中的比 例，具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異，說(shuō)明 rsl8〇〇8l8的G等位為發(fā)熱伴血小板減少綜合征的風(fēng)險(xiǎn)等位。 rsl800818的三個(gè)基因型中，GG基因型和AG基因型在病例組中的比例高于這兩個(gè)基因型在 對(duì)照組中的比例；AA基因型在病例組中的比例低于在對(duì)照組中的比例。與攜帶rsl800818 位點(diǎn)AA基因型的個(gè)體相比，攜帶rs 1800818位點(diǎn)GG基因型以及AG基因型的個(gè)體發(fā)熱伴血 小板減少綜合征發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加，比值比（Odds ratio,0R)為3. 85，P〈0. 001，說(shuō)明rsl800818 多態(tài)性位點(diǎn)與發(fā)熱伴血小板減少綜合征的發(fā)生顯著關(guān)聯(lián)。
[0028] 在實(shí)際應(yīng)用中，可將檢測(cè)rs 1800818的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)與其它物質(zhì)（如檢 測(cè)其它的與發(fā)熱伴血小板減少綜合征相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性或基因型的物質(zhì)）聯(lián)合在一 起制備篩查發(fā)熱伴血小板減少綜合征患者的產(chǎn)品。
[0029] 其中，檢測(cè)人基因組中rsl800818的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)可為通過(guò)下述至少 一種方法確定rsl800818的多態(tài)性或基因型所需的試劑和/或儀器：DNA測(cè)序、限制性 酶切片段長(zhǎng)度多態(tài)性、單鏈構(gòu)象多態(tài)性、變性高效液相色譜、SNP芯片、TaqMan探針技術(shù) 和 Sequenom MassArray 技術(shù)。其中，利用 Sequenom MassArray 技術(shù)確定 rsl800818 的 多態(tài)性或基因型所需的試劑和/或儀器包括PCR引物對(duì)、基于單堿基延伸反應(yīng)的延伸 引物、磷酸酶（如奸堿性磷酸酶（shrimp alkaline phosphatase，SAP))、樹(shù)脂、芯片、 MALDI-TOF(matrix-assisted laser desorption/ionization - time of fligh，基質(zhì)輔 助激光解吸附電離