專利名稱:新型DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII,其編碼序列及用途的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明屬于生物技術(shù)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,具體地說,本發(fā)明涉及新的編碼新型DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII多肽的多核苷酸,以及此多核苷酸編碼的多肽。本發(fā)明還涉及此多核苷酸和多肽的用途和制備。DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII是一種新的與細(xì)胞感受外界應(yīng)激和產(chǎn)生保護(hù)性效應(yīng)的分子,它在保護(hù)細(xì)胞免于受到熱休克、細(xì)菌脂多糖LPS和腫瘤壞死因子(TNF-α)誘導(dǎo)損傷的作用。
背景技術(shù):
DnaJ/Hsp40分子是一種在各物種間非常保守的熱休克蛋白分子,由三個結(jié)構(gòu)域組成,分別為氨基端的J功能域,中間的G/F富含區(qū)和羧基端的鋅指結(jié)構(gòu)域(Lindquist,S.,Annu.Rev.Genet.1988,22631;Cyr,D.M.Trends Biochem.Sci.1994,19176)。其中J功能域是所有DnaJ/Hsp40所共有的,介導(dǎo)DnaJ/Hsp40與伴侶分子的結(jié)合,是DnaJ/Hsp40的特征性功能域。J功能域中的HPD三氨基酸基序?qū)τ诮閷?dǎo)ATP酶調(diào)控活性至關(guān)重要。DnaJ/Hsp40分子與細(xì)胞的惡性轉(zhuǎn)化(transformation)、DNA復(fù)制、風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等自身免疫病、細(xì)胞凋亡的調(diào)控、干擾素的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄活性調(diào)控、高溫耐受等密切相關(guān)。最近研究發(fā)現(xiàn)DnaJ/Hsp40也可以作為免疫佐劑提高DNA疫苗的抗腫瘤效果,而且其與腫瘤細(xì)胞對化療的敏感性也有密切關(guān)系。
DnaJ/Hsp40分子通過與DnaK/Hsp70家族分子之間的相互作用,通過調(diào)節(jié)DnaK/Hsp70的ATP酶活性調(diào)節(jié)后者ATP/ADP的結(jié)合狀態(tài),促進(jìn)后者與變性蛋白或其他作用底物的結(jié)合,在細(xì)胞感受熱應(yīng)激和其他危害性刺激以及調(diào)控保護(hù)性基因的表達(dá)中起著非常重要的作用(Kelley.W.L.Curr.Biol.1999,9R305)。DnaJ/Hsp40和DnaK/Hsp70分子共同組成分子伴侶機(jī)制,在防止變性蛋白聚集、調(diào)控分子正確折疊、調(diào)控蛋白準(zhǔn)確定位和運(yùn)輸?shù)冗^程中起著重要的作用(Clarke,A.R.Curr.Opin.Struc.Biol.1996,643)。最近DnaK/Hsp70分子作為一種分泌到細(xì)胞外的佐劑樣分子和細(xì)胞因子樣分子正引起越來越多的關(guān)注,在腫瘤疫苗、生物制藥、自身免疫病和免疫理論研究領(lǐng)域具有重要的理論意義和實(shí)際意義。
鑒于熱休克蛋白分子的重要作用,本領(lǐng)域迫切需要開發(fā)新的熱休克蛋白分子。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是提供一種新型人DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII蛋白以及其片段、類似物和衍生物。
本發(fā)明的另一目的是提供編碼這些多肽的多核苷酸。
本發(fā)明的另一目的是提供生產(chǎn)這些多肽的方法以及該多肽和編碼序列的用途。
在本發(fā)明的第一方面,提供新穎的分離出的DC-DJIII多肽,該多肽是人源的,它包含具有SEQ ID NO2氨基酸序列的多肽、或其保守性變異多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。較佳地,該多肽選自下組(a)具有SEQ ID NO2氨基酸序列的多肽;(b)將SEQ ID NO2氨基酸序列經(jīng)過一個或多個氨基酸殘基的取代、缺失或添加而形成的,且具有保護(hù)細(xì)胞免于受到熱休克、細(xì)菌脂多糖LPS或腫瘤壞死因子(TNF-α)誘導(dǎo)損傷功能的,由(a)衍生的多肽。
在本發(fā)明的第二方面,提供編碼分離的這些多肽的多核苷酸,該多核苷酸包含一核苷酸序列,該核苷酸序列與選自下組的一種核苷酸序列有至少50%同源性(a)編碼上述人DC-DJIII的多核苷酸;和(b)與多核苷酸(a)互補(bǔ)的多核苷酸。較佳地,該多核苷酸編碼具有SEQ ID NO2所示氨基酸序列的多肽。更佳地,該多核苷酸的序列是選自下組的一種(a)具有SEQ ID NO1中50-829位的序列;(b)具有SEQ ID NO1中1-1431位的序列。
在本發(fā)明的第三方面,提供了含有上述多核苷酸的載體,以及被該載體轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)的宿主細(xì)胞或者被上述多核苷酸直接轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)的宿主細(xì)胞。
在本發(fā)明的第四方面,提供了制備具有DC-DJIII蛋白活性的多肽的方法,該方法包含(a)在適合表達(dá)人DC-DJIII蛋白的條件下,培養(yǎng)上述被轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)的宿主細(xì)胞;(b)從培養(yǎng)物中分離出具有人DC-DJIII蛋白活性的多肽。
在本發(fā)明的第五方面,提供了與上述的人DC-DJIII多肽特異性結(jié)合的抗體。還提供了可用于檢測的核酸分子,它含有上述的多核苷酸中連續(xù)的10-1431個核苷酸。
在本發(fā)明的第六方面,提供了模擬、促進(jìn)、拮抗人DC-DJIII多肽活性的化合物,以及抑制人DC-DJIII多肽的表達(dá)的化合物。還提供了篩選和/或制備這些化合物的方法。較佳地,該化合物是人DC-DJIII多肽的編碼序列或其片段的反義序列。
在本發(fā)明的第七方面,提供了檢測樣品中是否存在DC-DJIII蛋白的方法,它包括將樣品與DC-DJIII蛋白的特異性抗體接觸,觀察是否形成抗體復(fù)合物,形成了抗體復(fù)合物就表示樣品中存在DC-DJIII蛋白。
在本發(fā)明的第八方面,提供了一種檢測與人DC-DJIII多肽異常表達(dá)相關(guān)的疾病或疾病易感性的方法,該方法包括檢測編碼所述多肽的核酸序列中是否存在突變。
在本發(fā)明的第九方面,提供了本發(fā)明多肽和編碼序列的用途。例如本發(fā)明多肽可被用于篩選促進(jìn)人DC-DJIII多肽活性的激動劑,或者篩選抑制人DC-DJIII多肽活性的拮抗劑、或者被用于肽指紋圖譜鑒定。本發(fā)明的人DC-DJIII蛋白的編碼序列或其片段,可被作為引物用于PCR擴(kuò)增反應(yīng),或者作為探針用于雜交反應(yīng),或者用于制造基因芯片或微陣列。
在本發(fā)明的第十方面,提供了一種藥物組合物,它含有安全有效量的本發(fā)明的人DC-DJIII多肽或其激動劑、拮抗劑以及藥學(xué)上可接受的載體。
在本發(fā)明的第十一方面,提供了DC-DJIII具有抵抗TNF-α等應(yīng)激因素誘導(dǎo)細(xì)胞死亡的生物學(xué)活性的實(shí)驗證明。
本發(fā)明的其它方面由于本文的技術(shù)的公開,對本領(lǐng)域的技術(shù)人員而言是顯而易見的。
圖1是本發(fā)明DC-DJIII mRNA的細(xì)胞系分布RT-PCR檢測。
圖2是本發(fā)明DC-DJIII mRNA的組織分布檢測。
圖3是在應(yīng)激誘導(dǎo)后本發(fā)明DC-DJIII mRNA和蛋白的檢測。結(jié)果提示,DC-DJIII在熱休克、LPS、PMA、TNFα誘導(dǎo)后表達(dá)上調(diào)。磷酸肌醇3激酶(phosphoinositide3-kinase,PI3K)是Wester印跡蛋白定量對照。
圖4是本發(fā)明DC-DJIII在小鼠L929細(xì)胞穩(wěn)定表達(dá)后抵抗TNFα誘導(dǎo)凋亡的檢測。
具體實(shí)施例方式
本發(fā)明人在對樹突狀細(xì)胞的cDNA文庫進(jìn)行大規(guī)模測序的過程中發(fā)現(xiàn)了并分離了一個與DnaJ/HsP40家族分子高度同源的分子DC-DJIII(相似性超過50%),在保守的J功能域同源性超過65%。蛋白基序分析顯示其氨基端含有一個J功能域(1-80),另外還含有與蛋白激酶A和蛋白激酶C磷酸化相關(guān)的位點(diǎn),以及其他與翻譯后修飾相關(guān)的位點(diǎn)。根據(jù)其結(jié)構(gòu)的不同,DC-DJIII分子在氨基端含有J功能域卻沒有G/F富含區(qū)和鋅指功能域,因此屬于III型DnaJ/Hsp40分子,將其命名為“樹突狀細(xì)胞衍生的III型DnaJ蛋白”,縮寫為DC-DJIII(dendritic cell-derived DnaJ type III protein)。
在組織內(nèi)通過Norther印記分析,發(fā)現(xiàn)其以1.5kb的轉(zhuǎn)錄本廣泛分布于心臟、肝臟、骨骼肌、腎臟、胰腺、脾臟、胸腺、前列腺、睪丸、卵巢、小腸、結(jié)腸、外周血白細(xì)胞等組織內(nèi)。利用RT-PCR方法,發(fā)現(xiàn)其在血液系腫瘤和實(shí)體瘤內(nèi)均有廣泛的表達(dá)。利用DC-DJIII陰性表達(dá)的肺上皮細(xì)胞癌A549細(xì)胞系,發(fā)現(xiàn)在熱休克、細(xì)菌脂多糖、氟波脂PMA、腫瘤壞死因子TNFα等因素的誘導(dǎo)下,DC-DJIII可以迅速表達(dá)。利用羧基端73個氨基酸制備抗體后我們發(fā)現(xiàn)其在蛋白水平也受到上述因素的調(diào)控。本發(fā)明人還發(fā)現(xiàn)在腫瘤壞死因子TNFα敏感細(xì)胞株L929內(nèi)穩(wěn)定表達(dá)DC-DJIII后,腫瘤壞死因子TNFα誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡明顯減少,提示在腫瘤壞死因子TNFα誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡抵抗機(jī)制中DC-DJIII可能發(fā)揮重要的作用。
在本發(fā)明中,術(shù)語“DC-DJIII蛋白”、“DC-DJIII多肽”、“樹突狀細(xì)胞衍生的III型DnaJ蛋白”或“DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII”可互換使用,都指具有人樹突狀細(xì)胞衍生的III型DnaJ蛋白DC-DJIII氨基酸序列(SEQ ID NO2)的蛋白或多肽。
如本文所用,“分離的”是指物質(zhì)從其原始環(huán)境中分離出來(如果是天然的物質(zhì),原始環(huán)境即是天然環(huán)境)。如活體細(xì)胞內(nèi)的天然狀態(tài)下的多聚核苷酸和多肽是沒有分離純化的,但同樣的多聚核苷酸或多肽如從天然狀態(tài)中同存在的其他物質(zhì)中分開,則為分離純化的。
如本文所用,“分離的DC-DJIII蛋白或多肽”是指DC-DJIII多肽基本上不含天然與其相關(guān)的其它蛋白、脂類、糖類或其它物質(zhì)。本領(lǐng)域的技術(shù)人員能用標(biāo)準(zhǔn)的蛋白質(zhì)純化技術(shù)純化DC-DJIII蛋白。基本上純的多肽在非還原聚丙烯酰胺凝膠上能產(chǎn)生單一的主帶。
本發(fā)明的多肽可以是重組多肽、天然多肽、合成多肽,優(yōu)選重組多肽。本發(fā)明的多肽可以是天然純化的產(chǎn)物,或是化學(xué)合成的產(chǎn)物,或使用重組技術(shù)從原核或真核宿主(例如,細(xì)菌、酵母、高等植物、昆蟲和哺乳動物細(xì)胞)中產(chǎn)生。根據(jù)重組生產(chǎn)方案所用的宿主,本發(fā)明的多肽可以是糖基化的,或可以是非糖基化的。本發(fā)明的多肽還可包括或不包括起始的甲硫氨酸殘基。
本發(fā)明還包括人DC-DJIII蛋白的片段、衍生物和類似物。如本文所用,術(shù)語“片段”、“衍生物”和“類似物”是指基本上保持本發(fā)明的天然人DC-DJIII蛋白相同的生物學(xué)功能或活性的多肽。本發(fā)明的多肽片段、衍生物或類似物可以是(i)有一個或多個保守或非保守性氨基酸殘基(優(yōu)選保守性氨基酸殘基)被取代的多肽,而這樣的取代的氨基酸殘基可以是也可以不是由遺傳密碼編碼的,或(ii)在一個或多個氨基酸殘基中具有取代基團(tuán)的多肽,或(iii)成熟多肽與另一個化合物(比如延長多肽半衰期的化合物,例如聚乙二醇)融合所形成的多肽,或(iv)附加的氨基酸序列融合到此多肽序列而形成的多肽(如前導(dǎo)序列或分泌序列或用來純化此多肽的序列或蛋白原序列,或與抗原IgG片段的形成的融合蛋白)。根據(jù)本文的教導(dǎo),這些片段、衍生物和類似物屬于本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員公知的范圍。
在本發(fā)明中,術(shù)語“人DC-DJIII多肽”指具有人DC-DJIII蛋白活性的SEQID NO.2序列的多肽。該術(shù)語還包括具有與人DC-DJIII蛋白相同功能的、SEQID NO.2序列的變異形式。這些變異形式包括(但并不限于)若干個(通常為1-50個,較佳地1-30個,更佳地1-20個,最佳地1-10個)氨基酸的缺失、插入和/或取代,以及在C末端和/或N末端添加一個或數(shù)個(通常為20個以內(nèi),較佳地為10個以內(nèi),更佳地為5個以內(nèi))氨基酸。例如,在本領(lǐng)域中,用性能相近或相似的氨基酸進(jìn)行取代時,通常不會改變蛋白質(zhì)的功能。又比如,在C末端和/或N末端添加一個或數(shù)個氨基酸通常也不會改變蛋白質(zhì)的功能。該術(shù)語還包括人DC-DJIII蛋白的活性片段和活性衍生物。
該多肽的變異形式包括同源序列、保守性變異體、等位變異體、天然突變體、誘導(dǎo)突變體、在高或低的嚴(yán)緊度條件下能與人DC-DJIII DNA雜交的DNA所編碼的蛋白、以及利用抗人DC-DJIII多肽的抗血清獲得的多肽或蛋白。本發(fā)明還提供了其他多肽,如包含人DC-DJIII多肽或其片段的融合蛋白。除了幾乎全長的多肽外,本發(fā)明還包括了人DC-DJIII多肽的可溶性片段。通常,該片段具有人DC-DJIII多肽序列的至少約10個連續(xù)氨基酸,通常至少約30個連續(xù)氨基酸,較佳地至少約50個連續(xù)氨基酸,更佳地至少約80個連續(xù)氨基酸,最佳地至少約100個連續(xù)氨基酸。
發(fā)明還提供人DC-DJIII蛋白或多肽的類似物。這些類似物與天然人DC-DJIII多肽的差別可以是氨基酸序列上的差異,也可以是不影響序列的修飾形式上的差異,或者兼而有之。這些多肽包括天然或誘導(dǎo)的遺傳變異體。誘導(dǎo)變異體可以通過各種技術(shù)得到,如通過輻射或暴露于誘變劑而產(chǎn)生隨機(jī)誘變,還可通過定點(diǎn)誘變法或其他已知分子生物學(xué)的技術(shù)。類似物還包括具有不同于天然L-氨基酸的殘基(如D-氨基酸)的類似物,以及具有非天然存在的或合成的氨基酸(如β、γ-氨基酸)的類似物。應(yīng)理解,本發(fā)明的多肽并不限于上述例舉的代表性的多肽。
修飾(通常不改變一級結(jié)構(gòu))形式包括體內(nèi)或體外的多肽的化學(xué)衍生形式如乙?;螋然?。修飾還包括糖基化,如那些在多肽的合成和加工中或進(jìn)一步加工步驟中進(jìn)行糖基化修飾而產(chǎn)生的多肽。這種修飾可以通過將多肽暴露于進(jìn)行糖基化的酶(如哺乳動物的糖基化酶或去糖基化酶)而完成。修飾形式還包括具有磷酸化氨基酸殘基(如磷酸酪氨酸,磷酸絲氨酸,磷酸蘇氨酸)的序列。還包括被修飾從而提高了其抗蛋白水解性能或優(yōu)化了溶解性能的多肽。
在本發(fā)明中,“人DC-DJIII蛋白保守性變異多肽”指與SEQ ID NO2的氨基酸序列相比,有至多10個,較佳地至多8個,更佳地至多5個,最佳地至多3個氨基酸被性質(zhì)相似或相近的氨基酸所替換而形成多肽。這些保守性變異多肽最好根據(jù)表1進(jìn)行氨基酸替換而產(chǎn)生。
表1
本發(fā)明的多核苷酸可以是DNA形式或RNA形式。DNA形式包括cDNA、基因組DNA或人工合成的DNA。DNA可以是單鏈的或是雙鏈的。DNA可以是編碼鏈或非編碼鏈。編碼成熟多肽的編碼區(qū)序列可以與SEQ ID NO1所示的編碼區(qū)序列相同或者是簡并的變異體。如本文所用,“簡并的變異體”在本發(fā)明中是指編碼具有SEQ ID NO2的蛋白質(zhì),但與SEQ ID NO1所示的編碼區(qū)序列有差別的核酸序列。
編碼SEQ ID NO2的成熟多肽的多核苷酸包括只編碼成熟多肽的編碼序列;成熟多肽的編碼序列和各種附加編碼序列;成熟多肽的編碼序列(和任選的附加編碼序列)以及非編碼序列。
術(shù)語“編碼多肽的多核苷酸”可以是包括編碼此多肽的多核苷酸,也可以是還包括附加編碼和/或非編碼序列的多核苷酸。
本發(fā)明還涉及上述多核苷酸的變異體,其編碼與本發(fā)明有相同的氨基酸序列的多肽或多肽的片段、類似物和衍生物。此多核苷酸的變異體可以是天然發(fā)生的等位變異體或非天然發(fā)生的變異體。這些核苷酸變異體包括取代變異體、缺失變異體和插入變異體。如本領(lǐng)域所知的,等位變異體是一個多核苷酸的替換形式,它可能是一個或多個核苷酸的取代、缺失或插入,但不會從實(shí)質(zhì)上改變其編碼的多肽的功能。
本發(fā)明還涉及與上述的序列雜交且兩個序列之間具有至少50%,較佳地至少70%,更佳地至少80%相同性的多核苷酸。本發(fā)明特別涉及在嚴(yán)格條件下與本發(fā)明所述多核苷酸可雜交的多核苷酸。在本發(fā)明中,“嚴(yán)格條件”是指(1)在較低離子強(qiáng)度和較高溫度下的雜交和洗脫,如0.2×SSC,0.l%SDS,60℃;或(2)雜交時加有變性劑,如50%(v/v)甲酰胺,0.1%小牛血清/0.1%Ficoll,42℃等;或(3)僅在兩條序列之間的相同性至少在90%以上,更好是95%以上時才發(fā)生雜交。并且,可雜交的多核苷酸編碼的多肽與SEQ ID NO2所示的成熟多肽有相同的生物學(xué)功能和活性。
本發(fā)明還涉及與上述的序列雜交的核酸片段。如本文所用,“核酸片段”的長度至少含15個核苷酸,較好是至少30個核苷酸,更好是至少50個核苷酸,最好是至少100個核苷酸以上。核酸片段可用于核酸的擴(kuò)增技術(shù)(如PCR)以確定和/或分離編碼DC-DJIII蛋白的多聚核苷酸。
本發(fā)明中的多肽和多核苷酸優(yōu)選以分離的形式提供,更佳地被純化至均質(zhì)。
本發(fā)明的人DC-DJIII核苷酸全長序列或其片段通??梢杂肞CR擴(kuò)增法、重組法或人工合成的方法獲得。對于PCR擴(kuò)增法,可根據(jù)本發(fā)明所公開的有關(guān)核苷酸序列,尤其是開放閱讀框序列來設(shè)計引物,并用市售的cDNA庫或按本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的常規(guī)方法所制備的cDNA庫作為模板,擴(kuò)增而得有關(guān)序列。當(dāng)序列較長時,常常需要進(jìn)行兩次或多次PCR擴(kuò)增,然后再將各次擴(kuò)增出的片段按正確次序拼接在一起。
一旦獲得了有關(guān)的序列,就可以用重組法來大批量地獲得有關(guān)序列。這通常是將其克隆入載體,再轉(zhuǎn)入細(xì)胞,然后通過常規(guī)方法從增殖后的宿主細(xì)胞中分離得到有關(guān)序列。
此外,還可用人工合成的方法來合成有關(guān)序列,尤其是片段長度較短時。通常,通過先合成多個小片段,然后再進(jìn)行連接可獲得序列很長的片段。
目前,已經(jīng)可以完全通過化學(xué)合成來得到編碼本發(fā)明蛋白(或其片段,或其衍生物)的DNA序列。然后可將該DNA序列引入本領(lǐng)域中已知的各種現(xiàn)有的DNA分子(或如載體)和細(xì)胞中。此外,還可通過化學(xué)合成將突變引入本發(fā)明蛋白序列中。
應(yīng)用PCR技術(shù)擴(kuò)增DNA/RNA的方法(Saiki,et al.Science1985;2301350-1354)被優(yōu)選用于獲得本發(fā)明的基因。特別是很難從文庫中得到全長的cDNA時,可優(yōu)選使用RACE法(RACE-cDNA末端快速擴(kuò)增法),用于PCR的引物可根據(jù)本文所公開的本發(fā)明的序列信息適當(dāng)?shù)剡x擇,并可用常規(guī)方法合成。可用常規(guī)方法如通過凝膠電泳分離和純化擴(kuò)增的DNA/RNA片段。
本發(fā)明也涉及包含本發(fā)明的多核苷酸的載體,以及用本發(fā)明的載體或DC-DJIII蛋白編碼序列經(jīng)基因工程產(chǎn)生的宿主細(xì)胞,以及經(jīng)重組技術(shù)產(chǎn)生本發(fā)明所述多肽的方法。
通過常規(guī)的重組DNA技術(shù)(Science,1984;2241431),可利用本發(fā)明的多聚核苷酸序列可用來表達(dá)或生產(chǎn)重組的DC-DJIII多肽。一般來說有以下步驟(1).用本發(fā)明的編碼人DC-DJIII多肽的多核苷酸(或變異體),或用含有該多核苷酸的重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)合適的宿主細(xì)胞;(2).在合適的培養(yǎng)基中培養(yǎng)的宿主細(xì)胞;(3).從培養(yǎng)基或細(xì)胞中分離、純化蛋白質(zhì)。
本發(fā)明中,人DC-DJIII多核苷酸序列可插入到重組表達(dá)載體中。術(shù)語“重組表達(dá)載體”指本領(lǐng)域熟知的細(xì)菌質(zhì)粒、噬菌體、酵母質(zhì)粒、植物細(xì)胞病毒、哺乳動物細(xì)胞病毒如腺病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒或其他載體。在本發(fā)明中適用的載體包括但不限于在細(xì)菌中表達(dá)的基于T7的表達(dá)載體(Rosenberg,et al.Gene,1987,56125);在哺乳動物細(xì)胞中表達(dá)的pMSXND表達(dá)載體(Lee and Nathans,J Bio Chem.2633521,1988)和在昆蟲細(xì)胞中表達(dá)的來源于桿狀病毒的載體??傊灰茉谒拗黧w內(nèi)復(fù)制和穩(wěn)定,任何質(zhì)粒和載體都可以用。表達(dá)載體的一個重要特征是通常含有復(fù)制起點(diǎn)、啟動子、標(biāo)記基因和翻譯控制元件。
本領(lǐng)域的技術(shù)人員熟知的方法能用于構(gòu)建含人DC-DJIII編碼DNA序列和合適的轉(zhuǎn)錄/翻譯控制信號的表達(dá)載體。這些方法包括體外重組DNA技術(shù)、DNA合成技術(shù)、體內(nèi)重組技術(shù)等(Sambroook,et al.Molecular Cloning,a LaboratoryManual,cold Spring Harbor Laboratory.New York,1989)。所述的DNA序列可有效連接到表達(dá)載體中的適當(dāng)啟動子上,以指導(dǎo)mRNA合成。這些啟動子的代表性例子有大腸桿菌的lac或trp啟動子;λ噬菌體PL啟動子;真核啟動子包括CMV立即早期啟動子、HSV胸苷激酶啟動子、早期和晚期SV40啟動子、反轉(zhuǎn)錄病毒的LTRs和其他一些已知的可控制基因在原核或真核細(xì)胞或其病毒中表達(dá)的啟動子。表達(dá)載體還包括翻譯起始用的核糖體結(jié)合位點(diǎn)和轉(zhuǎn)錄終止子。
此外,表達(dá)載體優(yōu)選地包含一個或多個選擇性標(biāo)記基因,以提供用于選擇轉(zhuǎn)化的宿主細(xì)胞的表型性狀,如真核細(xì)胞培養(yǎng)用的二氫葉酸還原酶、新霉素抗性以及綠色熒光蛋白(GFP),或用于大腸桿菌的四環(huán)素或氨芐青霉素抗性。
包含上述的適當(dāng)DNA序列以及適當(dāng)啟動子或者控制序列的載體,可以用于轉(zhuǎn)化適當(dāng)?shù)乃拗骷?xì)胞,以使其能夠表達(dá)蛋白質(zhì)。
宿主細(xì)胞可以是原核細(xì)胞,如細(xì)菌細(xì)胞;或是低等真核細(xì)胞,如酵母細(xì)胞;或是高等真核細(xì)胞,如哺乳動物細(xì)胞。代表性例子有大腸桿菌,鏈霉菌屬;鼠傷寒沙門氏菌的細(xì)菌細(xì)胞;真菌細(xì)胞如酵母;植物細(xì)胞;果蠅S2或Sf9的昆蟲細(xì)胞;CHO、COS、293細(xì)胞、或Bowes黑素瘤細(xì)胞的動物細(xì)胞等。
本發(fā)明的多核苷酸在高等真核細(xì)胞中表達(dá)時,如果在載體中插入增強(qiáng)子序列時將會使轉(zhuǎn)錄得到增強(qiáng)。增強(qiáng)子是DNA的順式作用因子,通常大約有10到300個堿基對,作用于啟動子以增強(qiáng)基因的轉(zhuǎn)錄??膳e的例子包括在復(fù)制起始點(diǎn)晚期一側(cè)的100到270個堿基對的SV40增強(qiáng)子、在復(fù)制起始點(diǎn)晚期一側(cè)的多瘤增強(qiáng)子以及腺病毒增強(qiáng)子等。
本領(lǐng)域一般技術(shù)人員都清楚如何選擇適當(dāng)?shù)妮d體、啟動子、增強(qiáng)子和宿主細(xì)胞。
用重組DNA轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞可用本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知的常規(guī)技術(shù)進(jìn)行。當(dāng)宿主為原核生物如大腸桿菌時,能吸收DNA的感受態(tài)細(xì)胞可在指數(shù)生長期后收獲,用CaCl2法處理,所用的步驟在本領(lǐng)域眾所周知。另一種方法是使用MgCl2。如果需要,轉(zhuǎn)化也可用電穿孔的方法進(jìn)行。當(dāng)宿主是真核生物,可選用如下的DNA轉(zhuǎn)染方法磷酸鈣共沉淀法,常規(guī)機(jī)械方法如顯微注射、電穿孔、脂質(zhì)體包裝等。
獲得的轉(zhuǎn)化子可以用常規(guī)方法培養(yǎng),表達(dá)本發(fā)明的基因所編碼的多肽。根據(jù)所用的宿主細(xì)胞,培養(yǎng)中所用的培養(yǎng)基可選自各種常規(guī)培養(yǎng)基。在適于宿主細(xì)胞生長的條件下進(jìn)行培養(yǎng)。當(dāng)宿主細(xì)胞生長到適當(dāng)?shù)募?xì)胞密度后,用合適的方法(如溫度轉(zhuǎn)換或化學(xué)誘導(dǎo))誘導(dǎo)選擇的啟動子,將細(xì)胞再培養(yǎng)一段時間。
在上面的方法中的重組多肽可在細(xì)胞內(nèi)、或在細(xì)胞膜上表達(dá)、或分泌到細(xì)胞外。如果需要,可利用其物理的、化學(xué)的和其它特性通過各種分離方法分離和純化重組的蛋白。這些方法是本領(lǐng)域技術(shù)人員所熟知的。這些方法的例子包括但并不限于常規(guī)的復(fù)性處理、用蛋白沉淀劑處理(鹽析方法)、離心、滲透破菌、超處理、超離心、分子篩層析(凝膠過濾)、吸附層析、離子交換層析、高效液相層析(HPLC)和其它各種液相層析技術(shù)及這些方法的結(jié)合。
重組的人DC-DJIII蛋白或多肽有多方面的用途。這些用途包括(但不限于)直接做為藥物治療DC-DJIII蛋白功能低下或喪失所致的疾病,和用于篩選促進(jìn)或?qū)笵C-DJIII蛋白功能的抗體、多肽或其它配體。用表達(dá)的重組人DC-DJIII蛋白篩選多肽庫可用于尋找有治療價值的能抑制或刺激人DC-DJIII蛋白功能的多肽分子。
另一方面,本發(fā)明還包括對人DC-DJIIIDNA或是其片段編碼的多肽具有特異性的多克隆抗體和單克隆抗體,尤其是單克隆抗體。這里,“特異性”是指抗體能結(jié)合于人DC-DJIII基因產(chǎn)物或片段。較佳地,指那些能與人DC-DJIII基因產(chǎn)物或片段結(jié)合但不識別和結(jié)合于其它非相關(guān)抗原分子的抗體。本發(fā)明中抗體包括那些能夠結(jié)合并抑制人DC-DJIII蛋白的分子,也包括那些并不影響人DC-DJIII蛋白功能的抗體。本發(fā)明還包括那些能與修飾或未經(jīng)修飾形式的人DC-DJIII基因產(chǎn)物結(jié)合的抗體。
本發(fā)明不僅包括完整的單克隆或多克隆抗體,而且還包括具有免疫活性的抗體片段,如Fab’或(Fab)2片段;抗體重鏈;抗體輕鏈;遺傳工程改造的單鏈Fv分子(Ladner等人,美國專利No.4,946,778);或嵌合抗體,如具有鼠抗體結(jié)合特異性但仍保留來自人的抗體部分的抗體。
本發(fā)明的抗體可以通過本領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)人員已知的各種技術(shù)進(jìn)行制備。例如,純化的人DC-DJIII基因產(chǎn)物或者其具有抗原性的片段,可被施用于動物以誘導(dǎo)多克隆抗體的產(chǎn)生。與之相似的,表達(dá)人DC-DJIII蛋白或其具有抗原性的片段的細(xì)胞可用來免疫動物來生產(chǎn)抗體。本發(fā)明的抗體也可以是單克隆抗體。此類單克隆抗體可以利用雜交瘤技術(shù)來制備(見Kohler等人,Nature256;495,1975;Kohler等人,Eur.J.Immunol.6511,1976;Kohler等人,Eur.J.Immunol.6292,1976;Hammerling等人,In Monoclonal Antibodiesand T Cell Hybridomas,Elsevier,N.Y.,1981)。本發(fā)明的抗體包括能阻斷人DC-DJIII蛋白功能的抗體以及不影響人DC-DJIII蛋白功能的抗體。本發(fā)明的各類抗體可以利用人DC-DJIII基因產(chǎn)物的片段或功能區(qū),通過常規(guī)免疫技術(shù)獲得。這些片段或功能區(qū)可以利用重組方法制備或利用多肽合成儀合成。與人DC-DJIII基因產(chǎn)物的未修飾形式結(jié)合的抗體可以用原核細(xì)胞(例如E.Coli)中生產(chǎn)的基因產(chǎn)物來免疫動物而產(chǎn)生;與翻譯后修飾形式結(jié)合的抗體(如糖基化或磷酸化的蛋白或多肽),可以用真核細(xì)胞(例如酵母或昆蟲細(xì)胞)中產(chǎn)生的基因產(chǎn)物來免疫動物而獲得。
抗人DC-DJIII蛋白的抗體可用于免疫組織化學(xué)技術(shù)中,檢測活檢標(biāo)本中的人DC-DJIII蛋白。此外,與人DC-DJIII蛋白結(jié)合的單克隆抗體也可用放射性同位素標(biāo)記,注入體內(nèi)可跟蹤其位置和分布。這種放射性標(biāo)記的抗體可作為一種非創(chuàng)傷性診斷方法用于腫瘤細(xì)胞的定位和判斷是否有轉(zhuǎn)移。
本發(fā)明中的抗體可用于治療或預(yù)防與人DC-DJIII蛋白相關(guān)的疾病。給予適當(dāng)劑量的抗體可以刺激或阻斷人DC-DJIII蛋白的產(chǎn)生或活性。
抗體也可用于設(shè)計成針對體內(nèi)某一特殊部位的免疫毒素。如人DC-DJIII蛋白高親和性的單克隆抗體可與細(xì)菌或植物毒素(如白喉毒素,蓖麻蛋白,紅豆堿等)共價結(jié)合。一種通常的方法是用巰基交聯(lián)劑如SPDP,攻擊抗體的氨基,通過二硫鍵的交換,將毒素結(jié)合于抗體上,這種雜交抗體可用于殺滅人DC-DJIII蛋白陽性的細(xì)胞(例如淋巴結(jié)細(xì)胞等)。
多克隆抗體的生產(chǎn)可用人DC-DJIII蛋白或多肽免疫動物,如家兔,小鼠,大鼠等。多種佐劑可用于增強(qiáng)免疫反應(yīng),包括但不限于弗氏佐劑等。
利用本發(fā)明蛋白,通過各種常規(guī)篩選方法,可篩選出與DC-DJIII蛋白發(fā)生相互作用的物質(zhì),如配體、抑制劑、激動劑或拮抗劑等。
本發(fā)明蛋白及其抗體、抑制劑、激動劑、拮抗劑或受體等,當(dāng)在治療上進(jìn)行施用(給藥)時,可提供不同的效果。通常,可將這些物質(zhì)配制于無毒的、惰性的和藥學(xué)上可接受的水性載體介質(zhì)中,其中pH通常約為5-8,較佳地pH約為6-8,盡管pH值可隨被配制物質(zhì)的性質(zhì)以及待治療的病癥而有所變化。配制好的藥物組合物可以通過常規(guī)途徑進(jìn)行給藥,其中包括(但并不限于)肌內(nèi)、腹膜內(nèi)、靜脈內(nèi)、皮下、皮內(nèi)、或局部給藥。
本發(fā)明的多肽可直接用于疾病治療,例如,用于腫瘤、炎癥,神經(jīng)系統(tǒng)和心血管病方面的治療。在使用本發(fā)明DC-DJIII蛋白時,還可同時使用其他治療劑,如IFN-α、IFN-β等。
本發(fā)明還提供了一種藥物組合物,它含有安全有效量的本發(fā)明DC-DJIII多肽或其激動劑、拮抗劑以及藥學(xué)上可接受的載體或賦形劑。這類載體包括(但并不限于)鹽水、緩沖液、葡萄糖、水、甘油、乙醇、及其組合。藥物制劑應(yīng)與給藥方式相匹配。本發(fā)明的藥物組合物可以被制成針劑形式,例如用生理鹽水或含有葡萄糖和其他輔劑的水溶液通過常規(guī)方法進(jìn)行制備。諸如片劑和膠囊之類的藥物組合物,可通過常規(guī)方法進(jìn)行制備。藥物組合物如針劑、溶液、片劑和膠囊宜在無菌條件下制造?;钚猿煞值慕o藥量是治療有效量,例如每天約1微克/千克體重-約5毫克/千克體重。此外,本發(fā)明的多肽還可與其他治療劑一起使用。
使用藥物組合物時,是將安全有效量的DC-DJIII蛋白或其拮抗劑、激動劑施用于哺乳動物,其中該安全有效量通常至少約10微克/千克體重,而且在大多數(shù)情況下不超過約8毫克/千克體重,較佳地該劑量是約10微克/千克體重-約1毫克/千克體重。當(dāng)然,具體劑量還應(yīng)考慮給藥途徑、病人健康狀況等因素,這些都是熟練醫(yī)師技能范圍之內(nèi)的。
人DC-DJIII蛋白的多聚核苷酸也可用于多種治療目的?;蛑委熂夹g(shù)可用于治療由于DC-DJIII蛋白的無表達(dá)或異常/無活性的DC-DJIII蛋白的表達(dá)所致的細(xì)胞增殖、發(fā)育或代謝異常。重組的基因治療載體(如病毒載體)可設(shè)計成表達(dá)變異的DC-DJIII蛋白,以抑制內(nèi)源性的DC-DJIII蛋白活性。來源于病毒的表達(dá)載體如逆轉(zhuǎn)錄病毒、腺病毒、腺病毒相關(guān)病毒、單純皰疹病毒、細(xì)小病毒等可用于將DC-DJIII基因轉(zhuǎn)移至細(xì)胞內(nèi)。構(gòu)建攜帶DC-DJIII基因的重組病毒載體的方法可見于已有文獻(xiàn)(Sambrook,et al.)。另外重組人DC-DJIII基因可包裝到脂質(zhì)體中,然后再轉(zhuǎn)移至細(xì)胞內(nèi)。
抑制人DC-DJIIImRNA的寡聚核苷酸(包括反義RNA和DNA)以及核酶也在本發(fā)明的范圍之內(nèi)。核酶是一種能特異性分解特定RNA的酶樣RNA分子,其作用機(jī)制是核酶分子與互補(bǔ)的靶RNA特異性雜交后進(jìn)行核酸內(nèi)切作用。反義的RNA和DNA及核酶可用已有的任何RNA或DNA合成技術(shù)獲得,如固相磷酸酰胺化學(xué)合成法合成寡核苷酸的技術(shù)已廣泛應(yīng)用。反義RNA分子可通過編碼該RNA的DNA序列在體外或體內(nèi)轉(zhuǎn)錄獲得。這種DNA序列已整合到載體的RNA聚合酶啟動子的下游。為了增加核酸分子的穩(wěn)定性,可用多種方法對其進(jìn)行修飾,如增加兩側(cè)的序列長度,核糖核苷之間的連接應(yīng)用磷酸硫酯鍵或肽鍵而非磷酸二酯鍵。
多聚核苷酸導(dǎo)入組織或細(xì)胞內(nèi)的方法包括將多聚核苷酸直接注入到體內(nèi)組織中;或在體外通過載體(如病毒、噬菌體或質(zhì)粒等)先將多聚核苷酸導(dǎo)入細(xì)胞中,再將細(xì)胞移植到體內(nèi)等。
能與人DC-DJIII蛋白結(jié)合的多肽分子可通過篩選由各種可能組合的氨基酸結(jié)合于固相物組成的隨機(jī)多肽庫而獲得。篩選時,必須對人DC-DJIII蛋白分子進(jìn)行標(biāo)記。
本發(fā)明還涉及定量和定位檢測人DC-DJIII蛋白水平的診斷試驗方法。這些試驗是本領(lǐng)域所熟知的,且包括FISH測定和放射免疫測定。試驗中所檢測的人DC-DJIII蛋白水平,可以用作解釋人DC-DJIII蛋白在各種疾病中的重要性和用于診斷DC-DJIII蛋白起作用的疾病。
一種檢測檢測樣品中是否存在DC-DJIII蛋白的方法是利用DC-DJIII蛋白的特異性抗體進(jìn)行檢測,它包括將樣品與DC-DJIII蛋白特異性抗體接觸;觀察是否形成抗體復(fù)合物,形成了抗體復(fù)合物就表示樣品中存在DC-DJIII蛋白。
DC-DJIII蛋白的多聚核苷酸可用于DC-DJIII蛋白相關(guān)疾病的診斷和治療。在診斷方面,DC-DJIII蛋白的多聚核苷酸可用于檢測DC-DJIII蛋白的表達(dá)與否或在疾病狀態(tài)下DC-DJIII蛋白的異常表達(dá)。如DC-DJIIIDNA序列可用于對活檢標(biāo)本的雜交以判斷DC-DJIII蛋白的表達(dá)異常。雜交技術(shù)包括Southern印跡法,Northern印跡法、原位雜交等。這些技術(shù)方法都是公開的成熟技術(shù),相關(guān)的試劑盒都可從商業(yè)途徑得到。本發(fā)明的多核苷酸的一部分或全部可作為探針固定在微陣列(microarray)或DNA芯片(又稱為“基因芯片”)上,用于分析組織中基因的差異表達(dá)分析和基因診斷。用DC-DJIII蛋白特異的引物進(jìn)行RNA-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)體外擴(kuò)增也可檢測DC-DJIII蛋白的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。
檢測DC-DJIII基因的突變也可用于診斷DC-DJIII蛋白相關(guān)的疾病。DC-DJIII蛋白突變的形式包括與正常野生型DC-DJIIIDNA序列相比的點(diǎn)突變、易位、缺失、重組和其它任何異常等??捎靡延械募夹g(shù)如Southern印跡法、DNA序列分析、PCR和原位雜交檢測突變。另外,突變有可能影響蛋白的表達(dá),因此用Northern印跡法、Western印跡法可間接判斷基因有無突變。
本發(fā)明的序列對染色體鑒定也是有價值的。簡而言之,根據(jù)本發(fā)明DC-DJIII蛋白的cDNA制備PCR引物(優(yōu)選15-35bp),可以將序列定位于染色體上。然后,將這些引物用于PCR篩選含各條人染色體的體細(xì)胞雜合細(xì)胞。只有那些含有相應(yīng)于引物的人基因的雜合細(xì)胞會產(chǎn)生擴(kuò)增的片段。
一旦序列被定位到準(zhǔn)確的染色體位置,此序列在染色體上的物理位置就可以與基因圖數(shù)據(jù)相關(guān)聯(lián)。這些數(shù)據(jù)可見于例如,V.Mckusick,MendelianInheritance in Man(可通過與Johns Hopkins University Welch Medical Library聯(lián)機(jī)獲得)。然后可通過連鎖分析,確定基因與業(yè)已定位到染色體區(qū)域上的疾病之間的關(guān)系。
在本發(fā)明的一個實(shí)例中,提供了一種分離的多核苷酸,它編碼具有SEQ IDNO2所示氨基酸序列的多肽。本發(fā)明的多核苷酸是從人樹突狀細(xì)胞cDNA文庫中分離出的。其序列如SEQ ID NO1所示,它包含的多核苷酸序列全長為1431個堿基,其開放讀框位于50-829位,編碼全長為260個氨基酸的人DC-DJIII蛋白(SEQ ID NO2)。該DC-DJIII蛋白屬于細(xì)胞內(nèi)分子,與DnaJ/Hsp40氨基酸序列部分同源,一致性可高達(dá)40%,相似性則可達(dá)55%。此外,DC-DJIII蛋白也包含DnaJ/Hsp40保守的J功能域。Northern印跡和RT-PCR分析表明在組織和細(xì)胞中廣泛表達(dá)。已進(jìn)行的研究提示,DC-DJIII可能在細(xì)胞抵抗應(yīng)激反應(yīng)(如熱休克、感染、TNF-α、致瘤劑等)中起著重要的作用,可能為一佐劑樣分子參與蛋白折疊、凋亡信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、腫瘤免疫等重要環(huán)節(jié)。因此,DC-DJIII蛋白或其相關(guān)的拮抗劑、激動劑等可為治療感染、自身免疫病、惡性腫瘤等疾病提供新的治療途徑,在腫瘤疫苗和免疫佐劑的制備等領(lǐng)域具有巨大的應(yīng)用前景。
下面結(jié)合具體實(shí)施例,進(jìn)一步闡述本發(fā)明。應(yīng)理解,這些實(shí)施例僅用于說明本發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。下列實(shí)施例中未注明具體條件的實(shí)驗方法,通常按照常規(guī)條件如Sambrook等人,分子克隆實(shí)驗室手冊(New YorkColdSpring Harbor Laboratory Press,1989)中所述的條件,或按照制造廠商所建議的條件。
實(shí)施例1人DC-DJIII cDNA的克隆用Trizol(Gibco公司)提取人樹突狀細(xì)胞總RNA。然后,從總RNA中分離poly(A)mRNA。將poly(A)mRNA經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄形成cDNA后,用SuperScriptII克隆試劑盒(購自Gibco)將cDNA片段定向插入到載體的多克隆位點(diǎn)上,轉(zhuǎn)化DH5α細(xì)菌形成cDNA質(zhì)粒文庫。用雙脫氧法測定隨機(jī)挑選克隆的5’末端的序列。將測定的cDNA序列與已有的公共DNA序列數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比較,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有一個cDNA克隆的DNA序列為新的全長cDNA。通過合成一系列引物對新克隆所含的DNA序列進(jìn)行雙向測定。計算機(jī)分析表明,克隆所含的全長cDNA是一個新的cDNA序列(如SEQ ID NO1所示),編碼一個新的蛋白質(zhì)(如SEQ ID NO2所示)。此蛋白質(zhì)被命名為人DC-DJIII,其編碼基因命名為人DC-DJIII基因。
序列SEQ ID NO1全長為1431bp,包括49bp的5’端非編碼區(qū)和599bp的3’端非編碼區(qū),編碼含260個氨基酸的多肽。理論上計算未糖基化的成熟分子的分子量約為29.9kD。
BLAST分析表明其與已知基因不同,與人DnaJ/Hsp40分子氨基酸序列高度同源,一致性達(dá)40%,相似性達(dá)55%。此外,在DC-DJIII蛋白中也包含1個DnaJ/Hsp40蛋白的保守J功能域,這也進(jìn)一步提示它是人TNF-α等應(yīng)激因素的抵抗分子。
實(shí)施例2用RT-PCR方法克隆人DC-DJIII的編碼序列用Trizol(Gibco公司)提取處于對數(shù)生長期B淋巴瘤細(xì)胞株Raji等血液學(xué)腫瘤細(xì)胞及人宮頸癌Hela等多種實(shí)體瘤細(xì)胞總RNA,取6mg細(xì)胞總RNA與0.5μg Oligo-dT12-18混合,進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。反轉(zhuǎn)錄體系為20μl,反應(yīng)結(jié)束后加80μl ddH20進(jìn)行稀釋。PCR擴(kuò)增所用的引物如下有義引物5’-GCGGATCCATGGGGCTGCTGGACCTTTG-3’(SEQ ID NO3),反義引物5’-GCGAATTCTTATTTCTTTTCTTTCTTGA-3’(SEQ ID NO4)。PCR反應(yīng)體積為50μl,其中含反轉(zhuǎn)錄模板10μl、0.4mM引物、0.2mM dNTP和1U ExTaq DNA聚合酶(TakaraInc.),擴(kuò)增參數(shù)為94℃ 30秒、60℃30秒、72℃45秒,25個循環(huán)后PCR產(chǎn)物行2%瓊脂糖凝膠電泳初步確認(rèn)。DNA序列分析結(jié)果表明該P(yáng)CR產(chǎn)物中含有與SEQ ID NO1所示的編碼區(qū)(50-832位)完全相同的DNA序列。
實(shí)驗結(jié)果(圖1)顯示在人的多種細(xì)胞系內(nèi)DC-DJIII均有表達(dá),在人肺上皮細(xì)胞癌A549和結(jié)腸癌LoVo細(xì)胞系內(nèi)為陰性表達(dá)。
此外,用同樣方法測定了在熱休克、LPS、PMA、TNFα等應(yīng)激因素的刺激下,A549細(xì)胞中DC-DJIII的表達(dá)情況。結(jié)果(圖3)表明,A549細(xì)胞在熱休克、LPS、PMA、TNFα等應(yīng)激因素的刺激下,DC-DJIII可以被誘導(dǎo)表達(dá)。
實(shí)施例3DC-DJIII的Northern印跡分析按如下常規(guī)方法進(jìn)行Northern印跡待檢濾膜置于10ml經(jīng)68℃預(yù)熱的雜交液,在雜交爐(Bellco)中于68℃預(yù)雜交30分鐘;將標(biāo)記好的cDNA探針于95~100℃變性2~5分鐘,置冰上迅速冷卻后加入雜交液(cDNA探針終濃度為2~10ng/ml或1~2×106cpm/ml),充分混勻,于68℃雜交2小時。雜交結(jié)束后,濾膜用2×SSC、0.05%SDS室溫淋洗數(shù)次,繼振蕩沖洗30~40分鐘,其間更換洗液數(shù)次。隨后用0.1×SSC、0.1%SDS于50℃振蕩沖洗20~40分鐘。最后濾膜用塑料保鮮膜包裹,于-70℃曝光X線膠片24~48小時。
Northern印跡雜交結(jié)果(圖2)顯示DC-DJIII以1.5kb的轉(zhuǎn)錄本廣泛分布于心臟、肝臟、骨骼肌、腎臟、胰腺、脾臟、胸腺、前列腺、睪丸、卵巢、小腸、結(jié)腸、外周血白細(xì)胞等組織內(nèi)。
實(shí)施例4人DC-DJIII原核重組表達(dá)在該實(shí)施例中,以實(shí)施例1中的全長質(zhì)粒為模板,用序列如下的5’和3’端的PCR寡核苷酸引物進(jìn)行擴(kuò)增,獲得人DC-DJIII DNA作為插入片段。
PCR反應(yīng)中使用的5’端寡核苷酸引物序列為5’-GCGGATCCATGGGGCTGCTGGACCTTTG-3’(SEQ ID NO3)該引物含有BamHI限制性內(nèi)切酶的酶切位點(diǎn),在該酶切位點(diǎn)之后是由起始密碼子開始的部分編碼序列;3’端引物序列為5’-GCGAATTCTTATTTCTTTTCTTTCTTGA-3’(SEQ ID NO4)該引物含有EcoRI限制性內(nèi)切酶的酶切位點(diǎn)、翻譯終止子和人DC-DJIII的部分編碼序列。
將獲得的PCR產(chǎn)物純化后經(jīng)BamHI/EcoRI酶切再與質(zhì)粒pGEM-3ZF按常規(guī)方法重組并轉(zhuǎn)化至感受態(tài)大腸桿菌DH5α,挑取陽性克隆鑒定后純化并測序(ABI公司的377型測序儀,BigDye Terminator試劑盒,PE公司)。將正確序列的人DC-DJIII cDNA BBBamHI/EcoRI酶切片段克隆至表達(dá)載體pGEX-2T(Pharmacia),形成載體pGEX-2T-DC-DJIII,然后轉(zhuǎn)化人DH5α。陽性克隆用BamHI/EcoRI酶切鑒定,酶切產(chǎn)物行2%瓊脂糖凝膠電泳分析。經(jīng)測序證實(shí),已插入了完整的DC-DJIII編碼序列。
挑表達(dá)DC-DJIII的陽性DH5α克隆接種于100ml 2×YTA培養(yǎng)基中,37℃300rpm振蕩培養(yǎng)12-15hr,1∶10稀釋于預(yù)熱的2×YTA培養(yǎng)基繼續(xù)振蕩培養(yǎng)1.5hr,加100mM IPTG至0.1mM后30℃誘導(dǎo)2-6hr,5,000g 4℃離心10min去上清,置冰上用50ml 1×PBS(0.14M NaCl,2.7mM KCl,10.1mM Na2HPO4,1.8mM KH2PO4,pH7.3)重懸,超聲(B.Braun Labsonic U)破碎后再加入20% Triton X-100至1%輕搖30min,然后12,000g 4℃離心10min,上清用0.8μm濾膜過濾后,過1ml 50%谷胱甘肽Sepharose 4B層析柱,1×PBS充分洗滌后,加入500ul谷胱甘肽洗脫緩沖液(10mM谷胱甘肽,50mM Tris-HCl,pH8.0)室溫靜置30分鐘后收集洗脫液,重復(fù)洗脫2-3次,得到人DC-DJIII-GST融合蛋白。融合蛋白的分子量與預(yù)測值相符。
實(shí)施例5抗人DC-DJIII抗體的產(chǎn)生將用實(shí)施例4中方法獲得的重組蛋白人DC-DJIII用來免疫動物以產(chǎn)生抗體,具體方法如下。重組分子用層析法進(jìn)行分離后備用。也可用SDS-PAGE凝膠電泳法進(jìn)行分離,將電泳條帶從凝膠中切下,并用等體積的完全Freund’s佐劑乳化。用50-100μg/0.2ml乳化過的蛋白,對小鼠進(jìn)行腹膜內(nèi)注射。14天后,用非完全Freund’s佐劑乳化的同樣抗原,對小鼠以50-100μg/0.2ml的劑量進(jìn)行腹膜內(nèi)注射以加強(qiáng)免疫。每隔14天進(jìn)行一次加強(qiáng)免疫,至少進(jìn)行三次。獲得的抗血清的特異反應(yīng)活性用它在體外沉淀人DC-DJIII基因翻譯產(chǎn)物的能力加以評估。結(jié)果發(fā)現(xiàn),抗體可特異性地與本發(fā)明蛋白發(fā)生結(jié)合。
實(shí)施例6人DC-DJIII的生物學(xué)活性將實(shí)施例4中所獲得的含DC-DJIII全長編碼序列的重組pGEM-3ZF載體中正確序列的人DC-DJIII cDNA Xba I/EcoR I酶切片段克隆至pcDNA3.1/Myc-His(-)A真核表達(dá)載體,用脂質(zhì)體導(dǎo)入L929細(xì)胞內(nèi),用600μg/ml G418進(jìn)行篩選,獲得穩(wěn)定表達(dá)克隆。其中,穩(wěn)定表達(dá)DC-DJIII的細(xì)胞以L929-DC-DJIII表示,空載體轉(zhuǎn)染的細(xì)胞以L929-neo表示。抗myc抗體做Western印跡分析證實(shí)在細(xì)胞內(nèi)有實(shí)際分子量為約30Kda(含myc和His)的蛋白產(chǎn)生,與理論分子量一致。通過MTT法和臺盼藍(lán)染色法,分析了不同劑量和不同作用時間下TNF-α對經(jīng)過篩選的L929-DC-DJIII和L929-neo細(xì)胞的殺傷作用。
結(jié)果(圖4)發(fā)現(xiàn),L929-DC-DJIII細(xì)胞對TNF-α誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡有顯著的抵抗作用。
在本發(fā)明提及的所有文獻(xiàn)都在本申請中引用作為參考,就如同每一篇文獻(xiàn)被單獨(dú)引用作為參考那樣。此外應(yīng)理解,在閱讀了本發(fā)明的上述講授內(nèi)容之后,本領(lǐng)域技術(shù)人員可以對本發(fā)明作各種改動或修改,這些等價形式同樣落于本申請所附權(quán)利要求書所限定的范圍。
序列表<110>第二軍醫(yī)大學(xué)免疫學(xué)研究所<120>新型DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII,其編碼序列及用途<130>024972<160>4<170>PatentIn version 3.1<210>1<211>1431<212>DNA<213>智人(Homo sapiens)<220><221>CDS<222>(50)..(829)<223><400>1ggcgcagctg ggagcggctg cttcctccgg ggtcgtatct ccgcccggc atg ggg ctg 58Met Gly Leu1ctg gac ctt tgc gag gaa gtg ttc ggc acc gcc gac ctt tac cgg gtg106Leu Asp Leu Cys Glu Glu Val Phe Gly Thr Ala Asp Leu Tyr Arg Val5 10 15ctg ggc gtg cga cgc gag gcc tcc gac ggc gag gtc cga cga ggc tac154Leu Gly Val Arg Arg Glu Ala Ser Asp Gly Glu Val Arg Arg Gly Tyr20 25 30 35cac aag gtg tcc ctg cag gta cac ccg gac cgg gtg ggt gag ggc gac202His Lys Val Ser Leu Gln Val His Pro Asp Arg Val Gly Glu Gly Asp40 45 50aag gag gac gcc acc cgc cgc ttc cag atc ctg gga aaa gtc tat tcc250Lys Glu Asp Ala Thr Arg Arg Phe Gln Ile Leu Gly Lys Val Tyr Ser55 60 65gtt ctc agt gac aga gaa cag aga gca gtg tac gat gag cag gga aca298Val Leu Ser Asp Arg Glu Gln Arg Ala Val Tyr Asp Glu Gln Gly Thr70 75 80gtg gac gag gac tct cct gtg ctc acc caa gac cga gac tgg gag gcg346Val Asp Glu Asp Ser Pro Val Leu Thr Gln Asp Arg Asp Trp Glu Ala85 90 95tat tgg cgg cta ctc ttt aaa aag ata tct tta gag gac att caa gct394Tyr Trp Arg Leu Leu Phe Lys Lys Ile Ser Leu Glu Asp Ile Gln Ala100 105 110 115ttt gaa aag aca tac aaa ggt tcg gaa gaa gag ctg gct gat att aag442Phe Glu Lys Thr Tyr Lys Gly Ser Glu Glu Glu Leu Ala Asp Ile Lys120 125 130cag gcc tat ctg gac ttc aag ggt gac atg gat cag atc atg gag tct490Gln Ala Tyr Leu Asp Phe Lys Gly Asp Met Asp Gln Ile Met Glu Ser135 140 145gtg ctt tgc gtg cag tac aca gag gaa ccc agg ata agg aat atc att538Val Leu Cys Val Gln Tyr Thr Glu Glu Pro Arg Ile Arg Asn Ile Ile150 155 160cag caa gct att gac gcc gga gag gtc cca tcc tat aat gcc ttt gtc586Gln Gln Ala Ile Asp Ala Gly Glu Val Pro Ser Tyr Asn Ala Phe Val165 170 175aaa gaa tcg aaa caa aag atg aat gca agg aaa agg agg gct cag gaa634Lys Glu Ser Lys Gln Lys Met Asn Ala Arg Lys Arg Arg Ala Gln Glu180 185 190 195gag gcc aaa gaa gca gaa atg agc aga aag gag ttg ggg ctt gat gaa682Glu Ala Lys Glu Ala Glu Met Ser Arg Lys Glu Leu Gly Leu Asp Glu200 205 210ggc gtg gat agc ctg aag gca gcc att cag agc aga caa aag gat cgg730Gly Val Asp Ser Leu Lys Ala Ala Ile Gln Ser Arg Gln Lys Asp Arg215 220 225caa aag gaa atg gac aat ttt ctg gct cag atg gaa gca aag tac tgc778Gln Lys Glu Met Asp Asn Phe Leu Ala Gln Met Glu Ala Lys Tyr Cys230 235 240aaa tct tcc aaa gga gga ggg aaa aaa tct gct ctc aag aaa gaa aag826Lys Ser Ser Lys Gly Gly Gly Lys Lys Ser Ala Leu Lys Lys Glu Lys245 250 255aaa taatggaatt tttctcttca aaggtcctta ggtgtaaatt gatgccatcg 879Lys260taggcaaggt gcaggcagga tttgaaggca aaagtcaatt cagctcttga gaaaaggtgt 939ctttccagcc tgaatttttc agattgacta gaccaagcag aatctctcaa cctgatctta 999gtatttccta gaaagcactt gacattgtgt gaggtctcac ctgaaggaac ttggtggtga 1059catttgggag ggtggaggga ggcagtgtcc ttcctgacag cacttgcctc catggatctt 1119ctgtacacag aactcttatc taggatgtgg ttctgttcat gctgctttct gcgatgtgcg 1179tgtctgttag aataggctct ctacccagct agaacacctt ccagacactt gctggacagc 1239tatcttccac atacttccca gtttacattt ggtcttaatg atcttgaata gatcctctct 1299tcattttact cagccaggtt ttgtactgat gtacaggtgt taaattactt caagcatttt 1359tgtaagaggt gtatataatt caataaaaaa ggtcaaaaat ggaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1419aaaaaaaaaa aa 1431<210>2<21l>260<212>PRT<213>智人(Homo sapiens)<400>2Met Gly Leu Leu Asp Leu Cys Glu Glu Val Phe Gly Thr Ala Asp Leu1 5 10 15Tyr Arg Val Leu Gly Val Arg Arg Glu Ala Ser Asp Gly Glu Val Arg20 25 30Arg Gly Tyr His Lys Val Ser Leu Gln Val His Pro Asp Arg Val Gly35 40 45Glu Gly Asp Lys Glu Asp Ala Thr Arg Arg Phe Gln Ile Leu Gly Lys50 55 60Val Tyr Ser Val Leu Ser Asp Arg Glu Gln Arg Ala Val Tyr Asp Glu65 70 75 80Gln Gly Thr Val Asp Glu Asp Ser Pro Val Leu Thr Gln Asp Arg Asp85 90 95Trp Glu Ala Tyr Trp Arg Leu Leu Phe Lys Lys Ile Ser Leu Glu Asp100 105 110Ile Gln Ala Phe Glu Lys Thr Tyr Lys Gly Ser Glu Glu Glu Leu Ala
115 120 125Asp Ile Lys Gln Ala Tyr Leu Asp Phe Lys Gly Asp Met Asp Gln Ile130 135 140Met Glu Ser Val Leu Cys Val Gln Tyr Thr Glu Glu Pro Arg Ile Arg145 150 155 160Asn Ile Ile Gln Gln Ala Ile Asp Ala Gly Glu Val Pro Ser Tyr Asn165 170 175Ala Phe Val Lys Glu Ser Lys Gln Lys Met Asn Ala Arg Lys Arg Arg180 185 190Ala Gln Glu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Met Ser Arg Lys Glu Leu Gly195 200 205Leu Asp Glu Gly Val Asp Ser Leu Lys Ala Ala Ile Gln Ser Arg Gln210 215 220Lys Asp Arg Gln Lys Glu Met Asp Asn Phe Leu Ala Gln Met Glu Ala225 230 235 240Lys Tyr Cys Lys Ser Ser Lys Gly Gly Gly Lys Lys Ser Ala Leu Lys245 250 255Lys Glu Lys Lys260<210>3<211>28<212>DNA<213>引物<400>3gcggatccat ggggctgctg gacctttg 28<210>4<211>28<212>DNA<213>引物<400>4gcgaattctt atttcttttc tttcttga 28
權(quán)利要求
1.一種分離的人DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII多肽,其特征在于,它包含具有SEQ ID NO2氨基酸序列的多肽、或其保守性變異多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。
2.如權(quán)利要求1所述的多肽,其特征在于,該多肽選自下組(a)具有SEQ ID NO2氨基酸序列的多肽;(b)將SEQ ID NO2氨基酸序列經(jīng)過一個或多個氨基酸殘基的取代、缺失或添加而形成的,且具有保護(hù)細(xì)胞免于受到熱休克、細(xì)菌脂多糖或腫瘤壞死因子誘導(dǎo)損傷功能的,由(a)衍生的多肽。
3.一種分離的多核苷酸,其特征在于,它包含一核苷酸序列,該核苷酸序列與選自下組的一種核苷酸序列有至少50%相同性(a)編碼如權(quán)利要求1和2所述多肽的多核苷酸;(b)與多核苷酸(a)互補(bǔ)的多核苷酸。
4.如權(quán)利要求3所述的多核苷酸,其特征在于,該多核苷酸編碼具有SEQ IDNO2所示氨基酸序列的多肽。
5.如權(quán)利要求3所述的多核苷酸,其特征在于,該多核苷酸的序列選自下組的一種(a)具有SEQ ID NO1中50-829位的序列;(b)具有SEQ ID NO1中1-1431位的序列。
6.一種載體,其特征在于,它含有權(quán)利要求3所述的多核苷酸。
7.一種遺傳工程化的宿主細(xì)胞,其特征在于,它含有權(quán)利要求6所述的載體。
8.一種具有人DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII多肽活性的多肽的制備方法,其特征在于,該方法包含(a)在適合表達(dá)人DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII多肽的條件下,培養(yǎng)權(quán)利要求7所述的宿主細(xì)胞;(b)從培養(yǎng)物中分離出具有人DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII多肽活性的多肽。
9.一種能與權(quán)利要求1所述的人DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII多肽特異性結(jié)合的抗體。
10.一種藥物組合物,其特征在于,它含有安全有效量的權(quán)利要求1所述的多肽以及藥學(xué)上可接受的載體。
全文摘要
本發(fā)明涉及了一種新型DnaJ/Hsp40分子DC-DJIII。本發(fā)明提供編碼此蛋白分子的多核苷酸和經(jīng)重組技術(shù)產(chǎn)生這種蛋白分子的方法。本發(fā)明還公開了這種新型DC-DJIII分子及其多核苷酸編碼序列的用途。本發(fā)明還證實(shí)了DC-DJIII在保護(hù)細(xì)胞免于受到熱休克、細(xì)菌脂多糖LPS和腫瘤壞死因子(TNF-α)誘導(dǎo)損傷的作用。本發(fā)明還公開了抗此蛋白分子用于疾病的診斷及治療的策略,特別是可用于免疫制藥、生物治療、自身免疫性疾病和惡性腫瘤的診斷和治療。
文檔編號A61K38/17GK1477118SQ0213655
公開日2004年2月25日 申請日期2002年8月19日 優(yōu)先權(quán)日2002年8月19日
發(fā)明者陳濤涌, 李楠, 萬濤, 曹雪濤 申請人:第二軍醫(yī)大學(xué)免疫學(xué)研究所