專(zhuān)利名稱(chēng):一種香菇廣香菌種的ssr標(biāo)記指紋圖譜與應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明屬于香菇菌種的檢測(cè)領(lǐng)域,特別涉及ー種香菇廣香菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜與應(yīng)用。
背景技術(shù):
我國(guó)香菇產(chǎn)量已從1983年的I. 95萬(wàn)噸迅速發(fā)展到2005年的242萬(wàn)噸,占全球香菇總產(chǎn)量的70%以上,改寫(xiě)了世界食用菌產(chǎn)量的排行榜,并不斷縮小與排行第一的雙孢蘑菇產(chǎn)量差距,有專(zhuān)家預(yù)測(cè),由于中國(guó)香菇產(chǎn)業(yè)的迅猛發(fā)展,在近10年內(nèi)其將成為世界產(chǎn)量最高的食用菌。中國(guó)香菇以其驚人的發(fā)展速度,優(yōu)質(zhì)的品質(zhì)及低廉的成本為世界菇業(yè)人士矚目,中國(guó)香菇已風(fēng)靡世界。優(yōu)質(zhì)菌種在香菇單產(chǎn)和質(zhì)量中的貢獻(xiàn)率舉足輕重,這決定了香菇菌種在香菇產(chǎn)業(yè)中的重要地位。1999年我國(guó)簽署了《國(guó)際植物新品種保護(hù)法》,這不僅要求我們尊重其它國(guó)家的品種知識(shí)產(chǎn)權(quán),同時(shí)也要加強(qiáng)保護(hù)我們國(guó)家自己的品種知識(shí)產(chǎn)權(quán),為了建立食用菌新品種登記制度來(lái)真正保護(hù)我國(guó)的品種產(chǎn)權(quán),必須首先建立成熟的品種鑒定技術(shù),為新品種登記奠定基礎(chǔ)。尤其日本2004年4月I日開(kāi)始實(shí)行《種苗法修正案》,對(duì)我國(guó)食用菌尤其是香菇的出口構(gòu)成了極大的威脅。就國(guó)內(nèi)而言,香菇栽培菌種“同種異名,異種同名”的現(xiàn)象,不僅給菇農(nóng)帶來(lái)了極大的損失,影響了他們的栽培積極性,也極大地影響了中國(guó)香菇的快速發(fā)展;而且,隨著大規(guī)模的エ廠化栽培方式的出現(xiàn),對(duì)香菇栽培菌株質(zhì)量的要求越來(lái)越高,需要發(fā)展更為簡(jiǎn)便、快速、準(zhǔn)確的菌株鑒定技木,以保證每批次的用種都準(zhǔn)確無(wú)誤。面對(duì)這種局勢(shì),就需要我們進(jìn)一歩加快菌種鑒定技術(shù)的研究,在香菇的研究中引進(jìn)更為有效的菌種鑒定體系。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明所要解決的技術(shù)問(wèn)題是提供ー種香菇廣香菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜及其構(gòu)建方法與應(yīng)用,該指紋圖譜與常規(guī)形態(tài)學(xué)檢測(cè)、拮抗試驗(yàn)、出菇試驗(yàn)相比,具有檢測(cè)時(shí)間短,準(zhǔn)確性高,重復(fù)性好的優(yōu)點(diǎn)。本發(fā)明的ー種香菇廣香菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜,該指紋圖譜由7對(duì)SSR標(biāo)記組成,是基于香菇基因組簡(jiǎn)單重復(fù)序列片段開(kāi)發(fā)SSR引物,擴(kuò)增帶型好,重復(fù)性高的SSR引物,標(biāo)記詳細(xì)信息如表I。表I SSR標(biāo)記詳細(xì)信息列表
引物名稱(chēng)擴(kuò)增的重復(fù)序列正/反_引物Tm(°°)
LefpOOO I (CT)7ACGCGTATCCTCCCCTAAG17OU
A AGCG ATATGG ATTTGACGC
權(quán)利要求
1.一種香菇廣香菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜,其特征在于該指紋圖譜由7對(duì)基于香菇基因組序列開(kāi)發(fā)的SSR標(biāo)記的特異等位片段組合而成,7對(duì)SSR標(biāo)記在香菇廣香菌種上擴(kuò)增的等位片段信息具體為 Le_fp0001的等位片段的數(shù)量為2,等位片段I相對(duì)于50bp DNA ladder的分子量為600bp,等位片段2相對(duì)于50bp DNA ladder的分子量為530bp ; Le_fp0002的等位片段的數(shù)量為2,等位片段I相對(duì)于50bp DNA ladder的分子量為290bp,等位片段3相對(duì)于50bp DNA ladder的分子量為230bp ; Le_fp0003的等位片段的數(shù)量為1,等位片段I相對(duì)于50bp DNA ladder的分子量為900bp ; Le_fp0004的等位片段的數(shù)量為O ; Le_fp0005的等位片段的數(shù)量為2,等位片段I相對(duì)于50bp DNA ladder的分子量為720bp,等位片段3相對(duì)于50bp DNA ladder的分子量為540bp ; Le_fp0006的等位片段的數(shù)量為1,等位片段2相對(duì)于50bp DNA ladder的分子量為780bp ; Le_fp0007的等位片段的數(shù)量為2,等位片段I相對(duì)于50bp DNA ladder的分子量為700bp,等位片段2相對(duì)于50bp DNA ladder的分子量為600bp。
2.根據(jù)權(quán)利要求I所述的一種香菇廣香菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜,其特征在于所述7對(duì)SSR標(biāo)記等位片段的特異編號(hào)組合為(1+2) (1+3)10 (1+3)2 (1+2)。
3.—種如權(quán)利要求I所述的香菇廣香菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜的應(yīng)用,其特征在于應(yīng)用于鑒定香菇廣香菌種的特異等位變異組合以及鑒定香菇廣香菌種相對(duì)于其他國(guó)審香菇品種的特異性。
全文摘要
本發(fā)明涉及一種香菇廣香菌種的SSR標(biāo)記指紋圖譜與應(yīng)用,該指紋圖譜由7對(duì)基于香菇基因組序列開(kāi)發(fā)的SSR標(biāo)記的特異等位片段組合而成。應(yīng)用包括對(duì)香菇菌種進(jìn)行SSR標(biāo)記擴(kuò)增,將得到的帶型與指紋圖譜對(duì)照,與該指紋圖譜一致即為香菇廣香菌種。本發(fā)明與常規(guī)形態(tài)學(xué)檢測(cè)、拮抗試驗(yàn)、出菇試驗(yàn)相比,具有檢測(cè)時(shí)間短、準(zhǔn)確性高、可重復(fù)性好的優(yōu)點(diǎn),在收集的我國(guó)25個(gè)國(guó)審的香菇主栽菌種中具有香菇廣香菌種的專(zhuān)一性。
文檔編號(hào)C12Q1/04GK102851376SQ20121033502
公開(kāi)日2013年1月2日 申請(qǐng)日期2012年9月11日 優(yōu)先權(quán)日2012年9月11日
發(fā)明者巫萍, 譚琦, 尚曉冬, 宋春艷, 鮑大鵬, 楊慧, 章?tīng)t軍, 張丹 申請(qǐng)人:上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院