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一種利用近紅外光譜檢測油菜單株產(chǎn)量的方法與流程

文檔序號:12862320閱讀:888來源:國知局
一種利用近紅外光譜檢測油菜單株產(chǎn)量的方法與流程

本發(fā)明涉及油菜田間管理領(lǐng)域,更特別地,涉及一種利用近紅外光譜檢測油菜單株產(chǎn)量的方法。



背景技術(shù):

油菜作為食用油主要來源之一,在世界范圍內(nèi)均有較大面積種植。中國是世界第一油菜種植大國,其種植面積和總產(chǎn)量均已接近世界1/4。但與發(fā)達國家比,我國油菜在單產(chǎn)方面存在較大差距,主要原因是缺乏高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)品種、栽培管理粗放。因此,除了改良栽培措施外,選育優(yōu)良種質(zhì)資源是推動油菜高產(chǎn)栽培的重要手段。為評價新品種產(chǎn)量指標的優(yōu)劣,往往需要測定油菜產(chǎn)量。傳統(tǒng)的油菜產(chǎn)量測定方法,需要在成熟期進行收獲考種,耗時耗力,阻礙了油菜育種進程的推進。因此,急需一種簡單、快速、精確的方法來測定油菜單株產(chǎn)量指標。

正常條件下,油菜葉片、角果皮和莖稈光合為菜籽發(fā)育分別提供了37%、32%和31%的光合產(chǎn)物,直接影響油菜產(chǎn)量;而油菜成熟期莖稈倒伏的發(fā)生,影響了冠層的光合,加重了病蟲害的發(fā)生,間接影響了油菜產(chǎn)量的形成。因此,莖稈的生長發(fā)育狀態(tài)與油菜產(chǎn)量密切相關(guān),可將莖稈與產(chǎn)量直接關(guān)聯(lián),通過莖稈的關(guān)鍵性狀檢測油菜單株產(chǎn)量。



技術(shù)實現(xiàn)要素:

為解決以上問題,本發(fā)明提供了一種利用近紅外光譜檢測油菜單株產(chǎn)量的方法,其特征在于,包括以下步驟:

s1:建立油菜單株產(chǎn)量與菜莖稈切面上的近紅外光譜的對應(yīng)關(guān)系;

s2:測量待檢測的油菜莖稈切面上的近紅外光譜;

s3:根據(jù)s2得到的所述待檢測的油菜莖稈切面上的近紅外光譜以及s1得到的油菜單株產(chǎn)量與菜莖稈切面上的近紅外光譜的對應(yīng)關(guān)系,計算待檢測的油菜莖稈中的單株產(chǎn)量。

通過本發(fā)明的方法,可利用近紅外光譜儀檢測油菜莖稈切面上的近紅外光譜,并根據(jù)油菜單株產(chǎn)量與菜莖稈切面上的近紅外光譜的對應(yīng)關(guān)系,計算待檢測油菜莖稈中單株產(chǎn)量,與傳統(tǒng)使用化學(xué)分析法不同,在建立了對應(yīng)關(guān)系后,該方法無需再進行復(fù)雜的化學(xué)實驗操作,可實現(xiàn)高通量檢測。

在一個具體實施方案中,s1包括以下步驟:

s11:采集多個與待測油菜同品種的油菜莖稈樣品;

s12:測量所述多個油菜莖稈樣品的近紅外光譜;

s13:測量所述油菜莖稈樣品中的單株產(chǎn)量;

s14:根據(jù)s12和s13的結(jié)果建立所述油菜莖稈的單株產(chǎn)量與近紅外光譜的對應(yīng)關(guān)系。使用相同的品種的油菜莖稈樣品來建立對應(yīng)關(guān)系可使檢測結(jié)果更準確。

在一個優(yōu)選實施方案中,s12中對每個油菜莖稈樣品采集7個切面的近紅外光譜,所述油菜莖稈樣品的近紅外光譜由所述7個切面的近紅外光譜平均得到,所述7個切面分別為所述油菜莖稈樣品的兩端橫切面,從所述油菜莖稈樣品上不同部位橫切兩次得到的兩個新鮮橫切面,以及從所述油菜莖稈樣品的三個區(qū)段取的三個縱切面。

在一個優(yōu)選實施方案中,用于建立所述對應(yīng)關(guān)系的近紅外光譜的波段為6101.7cm-1-5449.8cm-1和4601.3cm-1-4246.5cm-1。

在一個實施方案中,用于建立所述對應(yīng)關(guān)系的近紅外光譜不進行預(yù)處理,或者進行了以下預(yù)處理方法中的任一種或幾種組合的預(yù)處理:一階導(dǎo)數(shù)法、矢量歸一化法、減去一條直線法、多元散射校正法、消除常數(shù)偏移量法、最小-最大歸一化法、msc法、二階導(dǎo)數(shù)法。

在一個優(yōu)選實施方案中,用于建立所述對應(yīng)關(guān)系的近紅外光譜不進行預(yù)處理。切面近紅外光譜與單株產(chǎn)量對應(yīng)關(guān)系模型的構(gòu)建中,不對光譜預(yù)處理得到的模型比使用常用的預(yù)處理方法得到的模型更佳,采取最原始的光譜有利于模型建立。在本發(fā)明中,獲得光譜信息的油菜莖稈是完整的。在進行掃描時,由于樣品池的大小是恒定的,而油菜莖稈直徑粗細各不相同,在樣品池上方加蓋鍍金積分球,防止自然光進入樣品池中干擾結(jié)果。

在一個具體實施方案中,s14中油菜單株產(chǎn)量與菜莖稈切面上的近紅外光譜的對應(yīng)關(guān)系為通過偏最小二乘法建立的預(yù)測模型。

在一個優(yōu)選實施方案中,在建立所述預(yù)測模型過程中,主成分數(shù)為8、9或10。

在一個優(yōu)選實施方案中,所述多個油菜莖稈樣品被分成校正集和驗證集,并且校正集與驗證集的數(shù)量比為2.5-4:1。

在一個優(yōu)選實施方案中,s2中對待測油菜莖稈7個切面的采集近紅外光譜,所述油菜莖稈樣品的近紅外光譜由所述7個切面的近紅外光譜平均得到,所述7個切面分別為所述油菜莖稈樣品的兩端橫切面,從所述油菜莖稈樣品上不同部位橫切兩次得到的兩個新橫切面,以及從所述油菜莖稈樣品的三個區(qū)段取的三個縱切面。

附圖說明

圖1為油菜莖稈樣品單株產(chǎn)量正態(tài)分布圖;

圖2為250個樣品預(yù)測值與實測值的相關(guān)性;

圖3為250個樣品預(yù)測殘差與實測值的關(guān)系;

圖4為剔除10個異常樣品后的240個樣品預(yù)測值與實測值的相關(guān)性;

圖5為剔除10個異常樣品后的240個樣品預(yù)測殘差與實測值的關(guān)系;

圖6為主成分對相關(guān)系數(shù)的影響;

圖7為主成分對rmsecv的影響。

具體實施方式

以下結(jié)合實例對本發(fā)明的原理和特征進行描述,所舉實例只用于解釋本發(fā)明,并非用于限定本發(fā)明的范圍。

構(gòu)建油菜近紅外光譜及單株產(chǎn)量關(guān)系所用試驗材料通過如下試驗獲得。

1.試驗地點及供試材料

試驗在華中農(nóng)業(yè)大學(xué)試驗基地進行。供試品種為甘藍型油菜雜交種華油雜62、灃油520,甘藍型油菜常規(guī)品種華航901、華雙5號,及由150個株系構(gòu)成的dh群體,由華中農(nóng)業(yè)大學(xué)提供。

2.試驗設(shè)計

2.1不同油菜品種不同肥料用量試驗獲得不同特征的油菜莖稈

采用四因素裂區(qū)試驗設(shè)計,3次重復(fù),以4個油菜品種(灃油520,華航901,華雙5號)為主區(qū);以施肥種類(氮、磷、鉀)為主裂區(qū);以氮(純氮為0kg/hm2、180kg/hm2、360kg/hm2)、磷(p2o5用量為0kg/hm2、120kg/hm2、240kg/hm2)和鉀(k2o用量為0kg/hm2、150kg/hm2、300kg/hm2)為副裂區(qū),108個氮磷鉀處理,田間管理方式按照常規(guī)。

2.2利用氮肥及密度裂區(qū)試驗獲得不同特征的油菜莖稈

以華油雜62位試驗材料,采用裂區(qū)設(shè)計,以120kg/hm2、240kg/hm2、360kg/hm2三個氮肥為主區(qū),以15×104株hm-2,30×104株hm-2,45×104株hm-2三個密度為副區(qū),3次重復(fù)。分別于2013年9月21日、2014年9月25日播種。以含氮量為46.7%的尿素為氮源,氮肥按基肥∶苗肥∶薹肥為6∶2∶2施用。磷肥(p2o5)和鉀肥(k2o)用量均為150kg/hm2。其他管理同常規(guī)。

2.3利用油菜dh群體株系獲得不同特征的油菜莖稈

兩親本和dh群體株系于2014年9月28日播種,次年五月份收獲。采取完全隨機排列,3次重復(fù)?;适┯?15-15-15)復(fù)合肥750kg/hm2,苗期時追施尿素75kg/hm2,硼砂用量7.5kg/hm2,田間管理方式按照常規(guī)。

3.試驗樣品的采集與收藏

于成熟期各小區(qū)取樣10株,分別測定單株產(chǎn)量,莖稈于105℃殺青,80℃烘至恒重,干燥保存。

4.油菜莖稈的近紅外光譜采集

近紅外光譜儀為德國布魯克儀器公司生產(chǎn)的brukerft-nir(vector33n型)傅里葉近紅外光譜儀,配有有pbs檢測器、石英旋轉(zhuǎn)樣品杯、鍍金積分球、opus分析軟件、波數(shù)為12000cm-1—4000cm-1。根據(jù)儀器性能及掃描油菜產(chǎn)品常用參數(shù)(呂麗娜等2004;丁小霞等2004)設(shè)定近紅外光譜的掃描參數(shù):分辨率:8cm-1;樣品掃描次數(shù):64scans;背景掃描次數(shù):64scans;數(shù)據(jù)保存范圍:12000cm-1—4000cm-1,光譜類型:aborbance;光源:tungsten(nir);分束器:石英(quartz);狹縫:1.4mm;檢測通道:external3;檢測器:pbs;-3350;0.9;掃描速度:6:10.0khz;光譜數(shù)據(jù)點數(shù):1960。每次掃描前將近紅外光譜預(yù)熱20min以上,再在室溫下進行掃描,每次樣品杯放在同一檢測位置,將油菜莖稈的高度剪為剛好放在樣品杯里,上方用鍍金積分球覆蓋,防漏光,每個油菜莖桿掃描7個切面得到7條光譜,確保掃描信息完整,所述7個切面分別為所述油菜莖稈樣品的兩端橫切面,從所述油菜莖稈樣品上不同部位橫切兩次得到的兩個新橫切面,以及從所述油菜莖稈樣品的三個區(qū)段取的三個縱切面。

5.油菜單株產(chǎn)量的近紅外光譜定量分析

5.1實測單株產(chǎn)量的結(jié)果

直接測定340個樣品單株產(chǎn)量,進行初步統(tǒng)計,結(jié)果如表1,340個樣品單株產(chǎn)量范圍為0.355-26.790g。同時從圖1中可以看出,單株產(chǎn)量符合正態(tài)分布,數(shù)據(jù)具有代表性。

表1340個樣品單株產(chǎn)量的實測結(jié)果統(tǒng)計

5.2異常樣品的剔除

將340個光譜信息分為兩個部分,分別為驗證集和校正集,為避免分為校正集和驗證集的偏差,將樣品含量從小到大依次排列,每四個為一組,在四個樣品中隨機選取一個數(shù)值作為驗證集、剩余三個作為校正驗,保證樣本劃分的合理性。本例中,校正集樣品為250個,驗證集樣品為90個,比例約為3:1。數(shù)據(jù)見表2。

表2340個樣品的校正集與驗證集的劃分

樣品剔除前,如圖2和3所示,當(dāng)主成分數(shù)為10時,相關(guān)系數(shù)r為0.969,內(nèi)部交叉驗證均方差rmsecv為1.570%,模型預(yù)測精度較好,預(yù)測殘差約為4.000%。

為了避免異常樣品存在對于實驗結(jié)果影響,采用基于預(yù)測濃度殘差的方法來剔除樣品,每剔除一次數(shù)據(jù),進行一次留一法交叉驗證,若相關(guān)系數(shù)增大,內(nèi)部交叉驗證均方差減小,則剔除樣品(夏俊芳,2007)?;谏鲜鲈瓌t,剔除出10個樣本數(shù)據(jù)后,剩余240個樣品采用偏最小二乘法建立模型。結(jié)果如圖4和5所示,主成分數(shù)為10時,相關(guān)系數(shù)提高到0.971,內(nèi)部交叉驗證均方差減少到153%,預(yù)測模型精度提高,預(yù)測殘差保持為4.000%不變。

5.3光譜預(yù)處理的評估

分別采用消除常數(shù)偏移量、減去一條直線等10種方法對剔除異常樣本后的光譜進行預(yù)處理。結(jié)果見表3。

表3預(yù)處理方法對預(yù)測模型的影響

據(jù)表3,不進行預(yù)處理得到的模型相關(guān)系數(shù)最大,為0.971,內(nèi)部驗證均方差最小,為1.530%。在建立單株產(chǎn)量模型時,最好不對光譜進行預(yù)處理。

5.4光譜波段的優(yōu)化

建立模型時,將光譜波段優(yōu)化,可減少運算量,提取更準確光譜信息。利用無預(yù)處理和偏最小二乘法建立模型,把光譜分為45個波段,確定適宜波段。結(jié)果如表4。

表4不同光譜波段對rmsecv的影響

分為45個不同波段后,不同波段有不同的rmsecv值,最佳波段為6101.7cm-1-5449.8cm-1,4601.3cm-1-4246.5cm-1,它所對應(yīng)的rmsecv值最小,為1.530%。

5.5主成分的優(yōu)化

用無光譜預(yù)處理的方法和光譜波段為6101.7cm-1-5449.8cm-1和4601.3cm-1-4246.5cm-1范圍,以相關(guān)系數(shù)r最大和內(nèi)部交叉驗證均方差rmsecv最小的標準來確定最佳主成分,連續(xù)選取1到10十個數(shù),偏最小二乘法建立模型,模型預(yù)測結(jié)果如圖6和7所示,在主成分數(shù)取9時相關(guān)系數(shù)最大為0.971,內(nèi)部交叉驗證均方差最小為1.530%,效果最佳。

綜上,油菜單株產(chǎn)量近紅外光譜建立,最佳光譜處理方法是無光譜預(yù)處理,光譜波段在6101.7cm-1-5449.8cm-1和4601.3cm-1-4246.5cm-1,主成分數(shù)是9時,建立模型相關(guān)系數(shù)r最大為0.971,內(nèi)部交叉驗證均方差rmsecv最小為1.530%。

5.6校正模型的驗證

將驗證集中90個樣品光譜圖導(dǎo)入所建立的模型中,結(jié)果見表5。表5模型驗證結(jié)果

由表中可以看出,殘差有正有負,經(jīng)過計算,驗證集相關(guān)系數(shù)r為0.897,rmsep為2.242%,滿足測定要求。

以上所述僅為本發(fā)明的較佳實施例,并不用以限制本發(fā)明,凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi),所作的任何修改、等同替換、改進等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護范圍之內(nèi)。

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