Ndm-1 鎖核酸探針修飾電極及其制備方法和應(yīng)用的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了NDM-1鎖核酸探針修飾電極及其制備方法和應(yīng)用,具體是設(shè)計(jì)鎖核酸修飾探針,固定在電極表面為特異性探針,其中鎖核酸探針的5’端修飾有巰基,通過(guò)Au-S鍵的化學(xué)鍵合可將其固定到電極表面,鎖核酸探針與目標(biāo)基因的部分序列相互補(bǔ),本發(fā)明獲得的電極為多重耐藥菌的檢測(cè)提供了全新思路和檢測(cè)手段。
【專利說(shuō)明】NDM-I鎖核酸探針修飾電極及其制備方法和應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于電化學(xué)檢測(cè)領(lǐng)域,具體涉及NDM-I鎖核酸(Locked nucleic acid,LNA) 探針修飾電極,還涉及該電極的制備方法和應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002] 目前研究報(bào)道的傳感器表面固定的大多是DNA探針,存在諸多缺點(diǎn)。探針長(zhǎng)度一 般為20個(gè)堿基左右,DNA探針與較長(zhǎng)的祀序列雜交時(shí),結(jié)合力不高,堿基錯(cuò)配識(shí)別能力低。 另外,由于單鏈DNA無(wú)法與未解旋的雙鏈祀序列直接結(jié)合,所W待檢測(cè)的標(biāo)本需經(jīng)PCR擴(kuò)增 后才能與之反應(yīng)。同時(shí),NDM-I探針的反應(yīng)受離子強(qiáng)度的影響,酸性或堿性環(huán)境中DNA固定 數(shù)量最多,而中性條件下雜交效果最好,固定雙鏈探針比固定單鏈探針時(shí)雜交效果好,分析 原因可能是單鏈固定時(shí)會(huì)對(duì)雜交產(chǎn)生更大的空間障礙。眾多的研究者均未能很好地解決上 述問(wèn)題,從而無(wú)法提高DNA探針的特異性。而LNA的出現(xiàn)是解決W上問(wèn)題的理想途徑。
[0003] 鎖核酸是一種新型、特殊的雙環(huán)狀寡核巧酸衍生物,含有一個(gè)或多個(gè) 2' -0, 4' -C-亞甲基-B-D-巧喃核糖核酸單體,結(jié)構(gòu)中核糖的2' -0, 4' -C位通過(guò)不同的縮水 作用形成氧亞甲基橋、硫亞甲基橋或胺亞甲基橋,連接成環(huán)形,巧喃糖的結(jié)構(gòu)鎖定在C3內(nèi) 型的N構(gòu)型,形成了剛性的縮合結(jié)構(gòu),降低了核糖體構(gòu)象的可塑性,增強(qiáng)了磯酸鹽骨架局部 結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性,從而形成剛性縮合結(jié)構(gòu)。相比其他寡核巧酸,LNA具有諸多優(yōu)勢(shì);(1)和DNA、 RNA互補(bǔ)的雙鏈有很強(qiáng)的熱穩(wěn)定性;(2)抗3'脫氧核巧酸酶降解的穩(wěn)定性;(3)LNA-DNA雜 交物能激活RNaseH ; (4)與RNA/DNA雜交時(shí),具有較強(qiáng)的堿基錯(cuò)配識(shí)別力;(6)水溶性好; (7)高效的自動(dòng)寡聚化作用,合成方法簡(jiǎn)單。
[0004] NDM-I多重耐藥菌是指攜帶NDM-I耐藥基因的細(xì)菌。NDM-I耐藥酶其全稱是"新德 里金屬-目-內(nèi)醜胺酶",是一種高效耐藥酶。研究顯示,抗生素濫用是NDM-I出現(xiàn)的首要原 因,目前DM-I多重耐藥菌正在全球快速傳播,其感染病例在全球均有分布,死亡率高。多重 耐藥菌所帶來(lái)的風(fēng)險(xiǎn)越來(lái)越大,防控形勢(shì)極為嚴(yán)峻,該類細(xì)菌對(duì)幾乎所有抗生素都具有抗 藥性。NDM-I耐藥基因可W在細(xì)菌之間傳播,從而使對(duì)抗生素敏感的細(xì)菌獲得耐藥性。因 此,研發(fā)NDM-I直接快速特異的檢測(cè)方法,具有重要意義。
[0005] 目前,NDM-I多重耐藥菌的診斷主要包括篩查、表型確認(rèn)和基因確證等3個(gè)步驟。 表型篩查是在細(xì)菌藥物敏感性測(cè)定中,W美洛培南或亞胺培南紙片法化-B法)或最低抑菌 濃度0OC)測(cè)定法對(duì)腸桿菌科細(xì)菌產(chǎn)酶情況進(jìn)行初步篩查;表型確認(rèn)是采用雙紙片協(xié)同實(shí) 驗(yàn)或亞胺培南(美洛培南)/邸TA復(fù)合紙片,進(jìn)行K-B法藥敏試驗(yàn)來(lái)判定產(chǎn)金屬酶;基因確 證是采用NDM-I的基因特異引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增及產(chǎn)物測(cè)序,確定菌株是否攜帶NDM-I基因。 但該些診斷方法存在著費(fèi)時(shí)煩瑣、敏感性和特異性較低及檢測(cè)成本高等缺陷。
[0006] 電化學(xué)DNA生物傳感器具有分析時(shí)間短、設(shè)備微型化、特異性強(qiáng)、靈敏度高、檢測(cè) 限低、使用簡(jiǎn)單W及成本低廉等顯著優(yōu)點(diǎn)。目前電化學(xué)生物傳感器的研究主要是致力于提 高傳感器的特異性和靈敏度,而特異性和靈敏度在很大程度上受探針與互補(bǔ)鏈間的相互作 用影響,因此,利用LNA探針提高電化學(xué)生物傳感器的特異性是檢測(cè)NDM-I的基因的關(guān)鍵。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0007] 有鑒于此,本發(fā)明的目的之一在于提供NDM-I鎖核酸探針修飾電極;本發(fā)明的目 的之二在于提供所述NDM-I鎖核酸探針修飾電極的制備方法;本發(fā)明的目的之H在于提供 含有檢測(cè)NDM-I的電化學(xué)生物傳感器;本發(fā)明的目的之四在于提供所述NDM-I鎖核酸探針 修飾電極或所述電化學(xué)傳感器的應(yīng)用;本發(fā)明的目的之五在于提供利用所述檢測(cè)NDM-I的 電化學(xué)生物傳感器檢測(cè)NDM-I基因的方法。
[000引為實(shí)現(xiàn)上述發(fā)明目的,本發(fā)明提供如下技術(shù)方案:
[0009] 1、NDM-I鎖核酸探針修飾電極,所述電極是在金電極表面固定5'端修飾琉基的 NDM-ILNA探針,最后封閉非特異性吸附位點(diǎn)而得。
[0010] 優(yōu)選的,所述5'端修飾琉基的NDM-I鎖核酸探針的核巧酸序列如SEQ ID NO. 1所 /Jn O
[0011] 2、所述NDM-I鎖核酸探針修飾電極的制備方法,包括如下步驟:
[001引 a.將金電極打磨,拋光,清潔,干燥,得清潔的金電極,備用;
[0013] b.向步驟a所得清潔的金電極表面滴加含5'端修飾琉基的NDM-I LNA探針的溶 液,修飾后用琉基己醇溶液封閉,超純水清洗得NDM-I鎖核酸探針修飾電極。
[0014] 優(yōu)選的,步驟a是將金電極分別用0. 3 U m、0. 05 U m的Al2〇3粉末打磨拋光,每次打 磨后用水洗凈,再分別于硝酸、丙麗和超純水中各超聲洗涂,干燥,備用。
[0015] 優(yōu)選的,步驟b是向步驟a所得清潔的金電極表面滴加5'端修飾琉基的NDM-I LNA 探針濃度為0. 5?2. 5 y M的溶液,固定后用濃度為Immol/L的琉基己醇溶液封閉,清洗得 NDM-I鎖核酸探針修飾電極。
[0016] 更優(yōu)選的,所述5'端修飾琉基的NDM-I LNA探針的濃度為1. 5 y M。
[0017] 更優(yōu)選的,5'端修飾琉基的NDM-I LNA探針固定的條件為37C下恒溫1小時(shí)。
[0018] 3、檢測(cè)NDM-I的電化學(xué)生物傳感器,包括工作電極、對(duì)電極、參比電極和為測(cè)試底 液;所述工作電極為所述NDM-I鎖核酸探針修飾電極,所述對(duì)電極為笛電極,所述參比電極 為飽和甘隸電極,所述為測(cè)試底液為抑7.4的含2111111〇1/11(3化佑腳6-1(4。6化腳6和5111111〇1/1 KCl的PBS溶液。
[0019] 4、所述NDM-I鎖核酸探針修飾電極或所述檢測(cè)NDM-I的電化學(xué)生物傳感器在檢測(cè) NDM-I基因中的應(yīng)用。
[0020] 5、利用所述檢測(cè)NDM-I的電化學(xué)生物傳感器檢測(cè)NDM-I基因的方法,包括如 下步驟:將NDM-I鎖核酸探針修飾電極與樣品溶液雜交后,然后W NDM-I鎖核酸探針修 飾電極為工作電極,笛電極為對(duì)電極,飽和甘隸電極為參比電極,pH 7.4的含2mmol/L KjFe (CN) e-K/e (CN) e和5mmol/L KCl的PBS溶液為測(cè)試底液構(gòu)建電化學(xué)生物傳感器,采用 循環(huán)伏安法進(jìn)行掃描測(cè)定,電位掃描范圍為-0. 3V?0. 7V,電位掃描速率為50mv/s,根據(jù)雜 交前后峰電流變化檢測(cè)NDM-I基因。
[0021] 本發(fā)明的有益效果在于:本研究利用鎖核酸的高特異性,針對(duì)NDM-I全基因組,設(shè) 計(jì)針對(duì)NDM-I基因的LNA,將NDM-I LNA探針固定在金電極后獲得NDM-I鎖核酸探針修飾 電極,然后與電化學(xué)技術(shù)相融合獲得檢測(cè)NDM-I基因的電化學(xué)生物傳感器,從而構(gòu)建檢測(cè) NDM-I基因的技術(shù)平臺(tái),為多重耐藥菌的檢測(cè)提供簡(jiǎn)單、快速、靈敏、特異的檢測(cè)工具。
【專利附圖】
【附圖說(shuō)明】
[002引為了使本發(fā)明的目的、技術(shù)方案和有益效果更加清楚,本發(fā)明提供如下附圖:
[002引 圖1為不同修飾電極的循環(huán)伏安圖。a ;裸電極在抑7. 4含有2mmol/L K3Fe(CN)e-K/e(CN)e和5mmol/L KCl的PBS中循環(huán)伏安曲線;b ;電極表面修飾LNA探針后在 pH 7. 4 含有 2mmol/L Kg化(CN)e-K/e(CN)6 和 5mmol/L KCl 的 PBS 中循環(huán)伏安曲線;C ;LNA 探針修飾、琉基己醇封閉后的電極在抑7. 4含有2mmol/L K3化(CN) e-K4Fe (CN) e和5mmol/L KCl的PBS中循環(huán)伏安曲線;d ;檢測(cè)液中加入NDM-I祀序列后,電極在抑7. 4含有2mmol/ L KsFe(We-KJeKN)B和5mm0l/L KCl的PBS中循環(huán)伏安曲線;e ;裸電極在抑7. 4不含 2mmol/L K3Fe(CN)e-K/e(CN)e 和 5mmol/L KCl 的 PBS 中的循環(huán)伏安曲線。
[0024] 圖2為不同濃度探針修飾電極的循環(huán)伏安圖。
【具體實(shí)施方式】
[0025] 下面將結(jié)合附圖,對(duì)本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施例進(jìn)行詳細(xì)的描述。實(shí)施例中未注明具體 條件的實(shí)驗(yàn)方法,通常按照常規(guī)條件或按照制造廠商所建議的條件。
[0026] 本發(fā)明的思路是利用鎖核酸的高特異性,針對(duì)NDM-I全基因組,設(shè)計(jì)并合成NDM-I LNA探針,并在LNA探針5'端修飾琉基,NDM-I LNA探針的序列為5' -SH-(Og。-gcttttggt K£ct£cctgat-3'(甜代表琉基基團(tuán),下劃線部分堿基經(jīng)鎖核酸修飾)(SEQ ID NO. 1),將LNA 技術(shù)與電化學(xué)技術(shù)相融合創(chuàng)建了用于檢測(cè)NDM-I基因的電化學(xué)DNA生物傳感器。具體方法 是;先設(shè)計(jì)針對(duì)NDM-I全系列的特異性LNA探針,并在LNA探針5'端修飾有琉基,利用Au-S 鍵的化學(xué)鍵合可將鎖核酸探針固定到電極表面;檢測(cè)時(shí)利用特異性探針與目標(biāo)基因的部分 序列相互補(bǔ),當(dāng)雜交溶液中含有目標(biāo)基因時(shí),特異性探針與其對(duì)應(yīng)的互補(bǔ)序列雜交形成復(fù) 合物,該復(fù)合物在電極表面發(fā)生還原-氧化反應(yīng),從而產(chǎn)生電化學(xué)信號(hào);如果雜交溶液中不 含目標(biāo)序列,則與特異性鎖核酸探針不能發(fā)生雜交反應(yīng),所檢測(cè)的目標(biāo)基因無(wú)法通過(guò)雜交 修飾到電極表面,其產(chǎn)生電化學(xué)信號(hào)的強(qiáng)度很弱,同時(shí)還可W通過(guò)檢測(cè)電流信號(hào)大小來(lái)判 斷互補(bǔ)序列與錯(cuò)配序列。
[0027] 實(shí)施例1
[0028] NDM-I鎖核酸探針修飾電極的制備方法,包括如下步驟:
[002引 a.金電極的清洗:取直徑為3mm的金電極,分別用0. 3 y m、0. 05 U m的AI2O3粉末 打磨拋光成鏡面,每次打磨后均用超純水沖洗,再分別于硝酸、丙麗及超純水中各超聲洗涂 Smin,干燥,得清洗的金電極,備用。
[0030] b. LNA探針的固定;取20 y L 5'端修飾琉基的濃度為1. 5 y mol/L的NDM-I LNA 探針溶液滴加于已清洗的金電極表面,然后于37C下恒溫箱中恒溫1小時(shí),使鎖核酸通過(guò) Au-S鍵的化學(xué)鍵合將其修飾到電極的表面,再將電極浸入濃度為Immol/L的琉基己醇溶 液中封閉非特異性吸附位點(diǎn)1小時(shí),封閉后用水清洗電極,即得鎖核酸修飾NDM-I探針的 NDM-I電極,4°C避光保存?zhèn)溆谩?br>
[0031] C.雜交反應(yīng):將NDM-I LNA探針修飾電極分別浸泡在150 y 1終濃度為100 y g/L 的NDM-I祀序列溶液(pH7. 40. Imol/L PB巧中,于37°C恒溫雜交45分鐘。
[0032] 實(shí)施例2、組建檢測(cè)NDM-I的電化學(xué)生物傳感器
[0033] W NDM-I鎖核酸探針修飾電極作為工作電極,飽和甘隸電極為參比電極,笛電極 作為對(duì)電極組建檢測(cè)NDM-I的電化學(xué)生物傳感器。將制備好的電化學(xué)傳感器聯(lián)入電化學(xué)工 作站,W pH 7. 4 的含 2mmol/L KjFe (CN) e-K/e (CN) e,Smmol KCl 的 PBS 為測(cè)試底液,然后在 室溫下利用循環(huán)伏安法進(jìn)行掃描測(cè)定,工作電位為-0. 3V?0. 7V,掃描速度為50mV/s。檢測(cè) NDM-I的電化學(xué)生物傳感器的檢測(cè)原理為:利用NDM-I鎖核酸探針修飾電極表面發(fā)生雜交 反應(yīng)后,生成的雜交復(fù)合物阻礙了電極表面的電子傳遞,使傳感器響應(yīng)電流變化值增大。該 信號(hào)變化的大小A I與雜交反應(yīng)的程度呈正相關(guān),A I值越大,表明與電極表面固定的LNA 探針結(jié)合的檢測(cè)物越多。NDM-I鎖核酸探針修飾電極測(cè)定的初始還原峰電流記為I。;當(dāng)核 酸雜交反應(yīng)結(jié)束后,測(cè)定的還原峰電流并記為I ;則峰電流在核酸雜交反應(yīng)前后變化A I = I - I。。W下W此原理為依據(jù)對(duì)NDM-I進(jìn)行檢測(cè)。
[0034] 實(shí)施例3、檢測(cè)NDM-I鎖核酸探針修飾電極的電化學(xué)特性
[0035] 利用循環(huán)伏安法表征電極在修飾及檢測(cè)過(guò)程中的電化學(xué)特性,具體檢測(cè)方法為: 將不同階段的電極按實(shí)施例2的方法組建電化學(xué)生物傳感器后,分別將電極浸泡在150 U L NDM-I祀序列終濃度為100 y g/L的溶液(pH7. 40. Imol/L磯酸鹽溶液)中,在37C恒溫箱 中雜交45分鐘。雜交過(guò)程中傳感器采用H電極體系測(cè)量傳感器電流,獲得的循環(huán)伏安曲線 如圖1所示。
[003引其中,曲線a為裸金電極在抑7. 4含有2mmol/L Ks [Fe (CN) 6] /? [Fe (CN) 6] 和5mmol/l KCl的PBS溶液中的循環(huán)伏安曲線,在PBS溶液中加入了氧化還原探針 IUFeKN)6]/KJFeKN)6],所W循環(huán)伏安曲線出現(xiàn)了一對(duì)準(zhǔn)可逆的氧化還原峰;曲線b為 NDM-I 鎖核酸探針修飾電極在抑7. 4 含有 2mmol/L Ks [Fe (CN) e] /? [Fe (CN) e]和 5mmol/ I KCl的PBS溶液中的循環(huán)伏安曲線,由于鎖核酸探針的磯酸骨架帶負(fù)電荷,溶液中的 [Fe (CN) 6] 3-同樣帶有負(fù)電荷,同種電荷相排斥,導(dǎo)致[Fe (CN) 6] 3-的電子在金電極表面?zhèn)鬟f 速度減慢,在一定程度上阻礙了溶液中導(dǎo)電離子在電極表面的電子傳遞,因此氧化還原峰 的峰電流值有所降低,當(dāng)LNA探針修飾電極后,為了防止LNA"倒伏"在電極表面而出現(xiàn)非特 異吸附,而采用琉基己醇封閉非特異性吸附位點(diǎn);曲線C為琉基己醇封閉后的循環(huán)伏安曲 線,可見琉基己醇在封閉非特異性吸附位點(diǎn)的同時(shí)也阻礙了電子的傳輸,因此峰電流值進(jìn) 一步減?。磺€d為NDM-I鎖核酸探針修飾電極與含100 y g/L的NDM-I的溶液反應(yīng)后的循 環(huán)伏安曲線,由于電極表面的雜交復(fù)合物是沒(méi)有電活性的生物大分子,進(jìn)一步阻礙了電極 表面的電子傳輸,與曲線C相比,氧化還原峰的峰電流在賠育前后響應(yīng)電流明顯降低;曲線 e為鎖核酸修飾NDM-I探針的NDM-I電極在抑7. 4不含2mmol/L Ks[Fe (CN) e] /? [Fe (CN) e] 和5mmol/l KCl的PBS中的循環(huán)伏安曲線,由于體系中缺少氧化還原活性物質(zhì),在-0. 3V? 0. 7V掃描范圍內(nèi),LNA探針修飾電極在PBS溶液中未出現(xiàn)明顯的氧化還原峰。W上實(shí)驗(yàn)結(jié) 果表明,NDM-I鎖核酸探針修飾電極能夠檢測(cè)NDM-I祀序列,并且組建的檢測(cè)NDM-I的電化 學(xué)生物傳感器也能檢測(cè)NDM-I祀序列。
[0037] -個(gè)檢測(cè)周期結(jié)束后,再進(jìn)行下一個(gè)LNA濃度的檢測(cè),操作步驟同上。通過(guò)檢測(cè)反 應(yīng)前后響應(yīng)電流的變化,檢測(cè)終濃度分別為0. 5、1. 0、1. 5、2. 0、2. 5 y mol/L探針溶液進(jìn)行 雜交反應(yīng)所引起的A I及反應(yīng)所需時(shí)間。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次取平均值,W驗(yàn)證傳感器的重復(fù)性。
[0038] 實(shí)施例4、LNA探針最佳濃度的優(yōu)化
[0039] 為了確定LNA探針的最佳濃度,本實(shí)施例對(duì)LNA的濃度進(jìn)行了優(yōu)化實(shí)驗(yàn)。首先將 LNA探針溶液配制成濃度分別為0. 5 y M、I. O y M、I. 5 y M、2. O y M、2. 5 y M的溶液,然后分別 將它們修飾于金電極表面,制備成不同濃度NDM-I鎖核酸探針修飾電極,并測(cè)定其循環(huán)伏 安響應(yīng)電流,實(shí)驗(yàn)結(jié)果見圖2所示。結(jié)果顯示,修飾LNA探針前后電極的循環(huán)伏安曲線有明 顯改變,說(shuō)明探針已成功固定于電極上。從圖2還可W看出,LNA修飾的電極的電流響應(yīng)變 化值隨LNA探針濃度的增大呈先增大后下降的趨勢(shì),當(dāng)LNA探針濃度由0. 5 y M依次增至 1. 5 y M時(shí),響應(yīng)電流變化值呈上升的趨勢(shì);而當(dāng)LNA探針濃度從1. 5 y M遞增至2. 5 y M時(shí), 響應(yīng)電流變化值則呈遞減趨勢(shì);其中,當(dāng)LNA探針濃度為1. 5 y M時(shí),傳感器的響應(yīng)電流變化 值最大。因此,LNA探針的最佳濃度為1. 5 y M。
[0040] 實(shí)施例5、NDM-I電化學(xué)生物傳感器的靈敏度和特異性試驗(yàn)
[0041] 為了證實(shí)LNA探針的高特異性,選用LNA探針和DNA探針?lè)謩e與幾種不同匹配程 度的祀序列進(jìn)行雜交反應(yīng),具體序列如下(下劃線部分堿基為錯(cuò)配堿基):
[0042] (1)完全匹配(Tl) ;5,-atcaggcagccaccaaaagc-3,(SEQ ID NO. 2);
[0043] (2) 一個(gè)堿基錯(cuò)配(T2) ;5' -atca£gcagccaccaaaagc_3'(SEQ ID NO. 3);
[0044] (3) H個(gè)堿基錯(cuò)配訂3) ;5' -atcaccgagccaccaaaagc-3' (SEQ ID NO. 4);
[0045] (4)五個(gè)堿基錯(cuò)配(T4) 5' -atcaccgtcccaccaaaagc-3' (SEQ ID NO. 5);
[0046] 上述四種不同祀序列,在最佳反應(yīng)條件下,分別與固定在電極表面上的LNA及DM 探針進(jìn)行雜交反應(yīng),比較幾種不同情況下的電流變化差值A(chǔ) I之間的差異。結(jié)果顯示,當(dāng)與 完全互補(bǔ)的祀序列(Tl)雜交時(shí),所引起的A I (峰電流變化差值)為11. 33 + 0. 47 uA,而 DNA探針雜交反應(yīng)所引起的A I為10. 27 + 0. 40 uA,二者相比具有顯著性差異(P<0. 05)。 當(dāng)祀序列有一個(gè)堿基錯(cuò)配(T2)時(shí),LNA雜交所引起的A I值驟降至3. 37 + 0. 15 uA,而DNA 探針雜交反應(yīng)引起的A I值仍有9. 06 + 0. 49 y A,二者相比具有非常顯著性差異(P<0. 01)。 當(dāng)祀序列有H個(gè)堿基錯(cuò)配(T3)時(shí)LNA與祀序列結(jié)合峰電流的變化值極小,為0. 7 y A,但 DNA探針的A I值卻仍有6. 90 + 0. 36 uA,二者相比具有非常顯著性差異(P<0. 01)。當(dāng)祀 序列有五個(gè)堿基錯(cuò)配(T4)時(shí)LNA已無(wú)法與祀序列結(jié)合而檢測(cè)不到峰電流的變化,但DNA探 針的A I值卻仍有2. 26 + 0. 21 y A,二者相比具有非常顯著性差異(P<0. 01)。LNA與對(duì)應(yīng)的 NDM-I探針相比,其特異性明顯增強(qiáng)。產(chǎn)生上述結(jié)果的原因是LNA與核酸分子結(jié)合力強(qiáng)、特 異性高,且LNA/DNA、LNA/RNA的結(jié)合較DNA/DNA、DNA/RNA的雜交分子具有更高的熱穩(wěn)定性。 因此LNA與核酸序列的結(jié)合有著極高的特異性,LNA能夠區(qū)分正確配對(duì)及錯(cuò)配的序列,LNA 對(duì)互補(bǔ)DNA的錯(cuò)配容忍程度比相應(yīng)的DNA/DNA更低,本實(shí)施例中用LNA分別與祀序列雜交 時(shí),發(fā)現(xiàn)與不同的祀序列發(fā)生雜交反應(yīng)所引起的峰電流變化有顯著差異,當(dāng)與錯(cuò)配H個(gè)堿 基的祀序列雜交,基本檢測(cè)不到峰電流的改變,和上述理論基本符合,說(shuō)明LNA對(duì)堿基錯(cuò)配 的識(shí)別能力強(qiáng),用LNA作探針可大大提高核酸雜交檢測(cè)的特異性,同時(shí)由于LNA本身所具有 的優(yōu)越性,與普通的LNA相比可結(jié)合更多的祀序列,在一定程度上也可提高反應(yīng)的靈敏度。 兩種探針與不同互補(bǔ)程度的祀序列雜交反應(yīng)實(shí)時(shí)檢測(cè)結(jié)果見表1。
[0047] 表1、LNA和DNA探針與完全匹配及錯(cuò)配的祀序列雜交反應(yīng)結(jié)果P±S.D.)
[0048]
【權(quán)利要求】
1. NDM-1鎖核酸探針修飾的電極,其特征在于,所述電極是在金電極表面固定5'端修 飾疏基的NDM-1LNA探針,最后用疏基乙醇封閉非特異性吸附位點(diǎn)而得。
2. 根據(jù)權(quán)利要求1所述NDM-1LNA探針修飾的電極,其特征在于:所述5'端修飾巰基 的NDM-1鎖核酸探針的核苷酸序列如SEQ ID NO. 1所示。
3. 權(quán)利要求1或2所述NDM-1LNA探針修飾電極的制備方法,其特征在于:包括如下步 驟: a. 將金電極打磨,拋光,清潔,干燥,得清潔的金電極,備用; b. 向步驟a所得清潔的金電極表面滴加含5'端修飾巰基的NDM-1LNA探針溶液,修飾 完成后用巰基己醇溶液封閉,超純水清洗得NDM-1LNA探針修飾電極。
4. 根據(jù)權(quán)利要求3所述的制備方法,其特征在于:步驟a是將金電極分別用0. 3 μ m、 0. 05 μ m的A1203粉末打磨拋光,每次打磨后用超純水洗凈,再分別于硝酸、丙酮和超純水中 各超聲洗滌,干燥,備用。
5. 根據(jù)權(quán)利要求3所述的制備方法,其特征在于:步驟b是向步驟a所得清潔的金電 極表面滴加5'端修飾巰基的NDM-1LNA探針,濃度為0. 5?2. 5 μ Μ的溶液,修飾后用濃度 為lmmol/L的巰基己醇溶液封閉,清洗得NDM-1LNA探針修飾電極。
6. 根據(jù)權(quán)利要求5所述的制備方法,其特征在于:所述5'端修飾巰基的NDM-1LNA探 針的濃度為1. 5 μ M,所述鎖核酸的濃度為1. 5 μ M。
7. 根據(jù)權(quán)利要求5所述的制備方法,其特征在于:5'端修飾巰基的NDM-1LNA探針固定 的條件為37°C下恒溫1小時(shí)。
8. 檢測(cè)NDM-1的電化學(xué)生物傳感器,其特征在于:包括工作電極、對(duì)電極、參比電 極和測(cè)試底液;所述工作電極為權(quán)利要求1或2所述NDM-1LNA探針修飾電極,所述對(duì) 電極為鉬電極,所述參比電極為飽和甘萊電極,所述為測(cè)試底液為pH7. 4的含2mmol/ LK3Fe (CN) 6-K4Fe (CN) 6 和 5mmol/L KC1 的 PBS 溶液。
9. 權(quán)利要求1?2任一項(xiàng)所述NDM-1LNA探針修飾電極或權(quán)利要求8所述檢測(cè)NDM-1 的電化學(xué)生物傳感器在檢測(cè)NDM-1基因中的應(yīng)用。
10. 利用權(quán)利要求8所述檢測(cè)NDM-1的電化學(xué)生物傳感器檢測(cè)NDM-1基因的方法,其 特征在于,包括如下步驟:將NDM-1LNA探針修飾電極與樣品溶液雜交后,然后以NDM-1LNA 探針修飾電極為工作電極,鉬電極為對(duì)電極,飽和甘汞電極為參比電極,PH7. 4的含2mmol/ LK3Fe (CN) 6-K4Fe (CN) 6和5mmol/L KC1的PBS溶液為測(cè)試底液構(gòu)建電化學(xué)生物傳感器,采用 循環(huán)伏安法進(jìn)行掃描測(cè)定,電位掃描范圍為-〇. 3V?0. 7V,電位掃描速率為50mv/s,根據(jù)雜 交前后峰電流變化檢測(cè)NDM-1基因。
【文檔編號(hào)】G01N27/327GK104237353SQ201410557136
【公開日】2014年12月24日 申請(qǐng)日期:2014年10月20日 優(yōu)先權(quán)日:2014年10月20日
【發(fā)明者】張立群, 王云霞, 府偉靈 申請(qǐng)人:中國(guó)人民解放軍第三軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院