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海洋水產(chǎn)動(dòng)物及人類(lèi)病原菌-創(chuàng)傷弧菌基因診斷試劑盒及檢測(cè)方法

文檔序號(hào):5936146閱讀:511來(lái)源:國(guó)知局
專(zhuān)利名稱(chēng):海洋水產(chǎn)動(dòng)物及人類(lèi)病原菌-創(chuàng)傷弧菌基因診斷試劑盒及檢測(cè)方法
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及海洋水生經(jīng)濟(jì)動(dòng)物和人類(lèi)病原菌的診斷試劑盒及檢測(cè)方法,主要是針對(duì)創(chuàng)傷弧菌(Vibrio vulnificus)基因診斷的試劑盒及檢測(cè)方法。
背景技術(shù)
創(chuàng)傷弧菌(Vibrio vulnificus)是一種廣布于世界各地的靠海河道、海灣和海岸線(xiàn)區(qū)域以及海產(chǎn)品中的嗜鹽菌。此菌是一種條件致病菌,在一定條件下可暴發(fā)流行。近年來(lái),隨著養(yǎng)殖環(huán)境的日益惡化,我國(guó)沿海地區(qū)因創(chuàng)傷弧菌引起海產(chǎn)品發(fā)病或大面積死亡以及人類(lèi)食物中毒的報(bào)道日益增多。目前已知?jiǎng)?chuàng)傷弧菌可感染澳大利亞的尖吻鱸、歐洲鰻鱺、日本鰻鱺、羅非魚(yú)、中國(guó)對(duì)蝦、鰻鱺、石斑魚(yú)、牡蠣和皺紋盤(pán)鮑等多類(lèi)水產(chǎn)品;另外該菌可通過(guò)受污染的海產(chǎn)品和皮膚破損等外傷感染人類(lèi),引發(fā)人類(lèi)急性敗血癥,在1-3天內(nèi)即可致人死亡。因此,可以說(shuō)創(chuàng)傷弧菌是海洋水生經(jīng)濟(jì)動(dòng)物弧菌病主要病原菌,也是弧菌屬眾多弧菌中對(duì)人類(lèi)健康安全危害最大的一種。創(chuàng)傷弧菌病具有暴發(fā)快、流行廣、死亡率高等特點(diǎn),由于細(xì)菌極易對(duì)抗生素產(chǎn)生抗藥性,因此目前對(duì)創(chuàng)傷弧菌病還未有特效的治療方法,推行海洋水產(chǎn)品的健康養(yǎng)殖是最有效的預(yù)防措施,而這主要依賴(lài)于早期的快速檢測(cè)。目前對(duì)弧菌的檢測(cè)技術(shù)主要包括傳統(tǒng)的TCBS培養(yǎng)及進(jìn)一步的形態(tài)及生理生化鑒定法、免疫學(xué)方法(主要有單克隆抗體技術(shù)、酶聯(lián)免疫檢測(cè)法(ELISA))、免疫電鏡技術(shù)、分子生物學(xué)方法(主要有分子雜交技術(shù)、限制性?xún)?nèi)切酶長(zhǎng)度多態(tài)(RELP))等。這些檢測(cè)方法有些對(duì)技術(shù)條件要求高,檢測(cè)時(shí)間長(zhǎng)。有些所需的材料制備麻煩,費(fèi)用高,有些方法靈敏度不高,特異性不強(qiáng),因此廣大水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)主和醫(yī)生掌握的技術(shù)難度很大,很難推廣,限制了這些技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展。
早期快速診斷海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類(lèi)病原菌-創(chuàng)傷弧菌是目前海洋經(jīng)濟(jì)動(dòng)物養(yǎng)殖的主要措施和減少損失的有效途徑,因此,簡(jiǎn)便快速、特異性好又靈敏度高的診斷試劑盒及其檢測(cè)方法是廣大水產(chǎn)養(yǎng)殖者急切盼望的。
多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,簡(jiǎn)稱(chēng)PCR技術(shù)),是上世紀(jì)80年代發(fā)展起來(lái)的一種體外擴(kuò)增特異DNA片斷的技術(shù),由于具有快速、敏感、特異性強(qiáng)等特點(diǎn),所以這種方法建立后,很快就被應(yīng)用于實(shí)踐中。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是利用創(chuàng)傷弧菌基因保守序列設(shè)計(jì)的一對(duì)引物,建立創(chuàng)傷弧菌PCR反應(yīng)體系,在此基礎(chǔ)上優(yōu)化和設(shè)計(jì),提供海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類(lèi)病原菌-創(chuàng)傷弧菌的基因診斷試劑盒及檢測(cè)方法。該試劑盒可批量生產(chǎn),操作簡(jiǎn)單,簡(jiǎn)便快速,特異性好,靈敏度高;可用于海洋水產(chǎn)動(dòng)物各時(shí)期養(yǎng)殖過(guò)程中的細(xì)菌跟蹤檢測(cè),也可用于人類(lèi)急性敗血癥的臨床檢測(cè),還可以用于環(huán)境監(jiān)測(cè),避免病菌傳播流行,具有很高的實(shí)用價(jià)值。
本發(fā)明的海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類(lèi)病原菌-創(chuàng)傷弧菌的基因診斷試劑盒包括下列部件1).樣品稀釋液A液,1管,內(nèi)裝1×PBS,pH7.4;2).PCR反應(yīng)液B液,1管,內(nèi)裝PCR擴(kuò)增反應(yīng)液,包括ddH2O、含Mg2+的10×Buffer、dNTP、引物VvF、引物VvR和TaqE;3).陽(yáng)性對(duì)照液C液,1管,內(nèi)裝創(chuàng)傷弧菌的總DNA,作為陽(yáng)性模板;4).盒子;5).一塊泡沫板,其大小與盒子的底面相同,裝于盒子中;泡沫板上有不少于上述小管數(shù)量的小孔,上述各小管分別對(duì)應(yīng)放置于這些小孔中。
上述海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類(lèi)病原菌-創(chuàng)傷弧菌的基因診斷試劑盒中所述的一對(duì)引物VvF和VvR是根據(jù)創(chuàng)傷弧菌基因保守區(qū)序列設(shè)計(jì)的,其DNA序列分別如下VvF5’-TAC GAT GAT TAT TGC G-3’;VvR5’-TAA AAG TGA CAT TCC C-3’用本發(fā)明上述試劑盒檢測(cè)海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類(lèi)病原菌-創(chuàng)傷弧菌的方法,按下列步驟進(jìn)行1).取新鮮待檢樣品,加入樣品稀釋液A液稀釋10~20倍,于無(wú)菌勻漿器中冰浴勻漿;待檢樣品可以是直接取自待檢動(dòng)物的任何部位組織,最好是消化道或肌肉組織;對(duì)于人,可取糞便或傷口膿液作為待檢樣品。
2).6000~8000r/min離心5~10min;3).取上清200μl,煮沸15min,立刻放于冰上5~10min;4).6000~8000r/min離心10min,上清作PCR模板;5).分別取模板和C液,加入到PCR反應(yīng)液B液中,混勻后離心數(shù)秒(通常為500~1000r/min離心5~10sec),置于PCR儀上;6).按下列條件擴(kuò)增95℃ 3min預(yù)變性→94℃ 1min 34個(gè)循環(huán)→72℃ 10min→4℃保存49℃ 45sec72℃ 1min7).反應(yīng)結(jié)束后取5~10μl加2μl溴酚藍(lán)混勻,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳20~30分鐘后于紫外儀上觀(guān)察,若在402bp處出現(xiàn)明亮的反應(yīng)條帶,則為創(chuàng)傷弧菌陽(yáng)性;若無(wú)反應(yīng)條帶顯示,則為陰性。
本發(fā)明的有益效果本發(fā)明的海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類(lèi)病原菌-創(chuàng)傷弧菌的基因診斷試劑盒及檢測(cè)方法,是以根據(jù)創(chuàng)傷弧菌基因保守區(qū)序列設(shè)計(jì)的一對(duì)引物為主體而設(shè)計(jì)的。利用該對(duì)引物,可以特異性地?cái)U(kuò)增攜帶創(chuàng)傷弧菌的待測(cè)樣品的有關(guān)基因片斷,所建立的優(yōu)化的PCR體系保證檢測(cè)結(jié)果的快速性、準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。因此,使用本發(fā)明的試劑盒及檢測(cè)方法,可以簡(jiǎn)便、快速、靈敏而特異的地檢測(cè)感染創(chuàng)傷弧菌的海洋水產(chǎn)動(dòng)物,大大高于傳統(tǒng)和常規(guī)的生物學(xué)方法,可運(yùn)用于海洋水產(chǎn)動(dòng)物各時(shí)期養(yǎng)殖過(guò)程細(xì)菌中的細(xì)菌跟蹤檢測(cè),也可用于人類(lèi)急性敗血癥的臨床檢測(cè),還可以用于環(huán)境監(jiān)測(cè),避免病菌傳播流行,具有很高的實(shí)用價(jià)值。


圖1是感染創(chuàng)傷弧菌的雜色鮑肝臟組織樣品的PCR擴(kuò)增結(jié)果。其中MDNA分子量標(biāo)準(zhǔn);1創(chuàng)傷弧菌陽(yáng)性對(duì)照;2創(chuàng)傷弧菌陰性對(duì)照;3檢測(cè)樣品;具體實(shí)施方式
以下通過(guò)具體實(shí)施例對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步說(shuō)明。
實(shí)施例1創(chuàng)傷弧菌的基因診斷試劑盒該試劑盒由下列部分構(gòu)成(10樣份)1).樣品稀釋液(A液),1管,5ml/管,內(nèi)裝1×PBS,pH7.4。
2).PCR反應(yīng)液(B液),1管,250μl/管,內(nèi)裝PCR擴(kuò)增反應(yīng)液(25μl體系),包括ddH2O、含Mg2+的10×Buffer、dNTP、引物VvF、引物VvR和TaqE。
3).陽(yáng)性對(duì)照液(C液),1管,20μl/管,內(nèi)裝創(chuàng)傷弧菌總DNA,作為陽(yáng)性模板;4).長(zhǎng)方體盒子,8.5×5.8×6.2cm3。
5).一塊泡沫板,其大小與盒子的底面相同,高2.2cm,有四排孔,第一排四個(gè)孔,孔徑1.3cm,第二排五個(gè)孔,孔徑1.0cm,第三、四排分別六個(gè)孔,孔徑0.6cm。上述各小管分別對(duì)應(yīng)放置于這些小孔中,裝于長(zhǎng)方體盒子中。
該試劑盒中的一對(duì)引物的DNA序列如下VvF5’-TAC GAT GAT TAT TGC G-3’;VvR5’-TAA AAG TGA CAT TCC C-3’PCR擴(kuò)增反應(yīng)液體系(25μl體系)如下ddH2O 21μl10×Buffer 1.8μldNTP 0.4μl引物VvF0.3μl引物VvR0.3μlTaqE 0.2μl
實(shí)施例2海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類(lèi)病原菌-創(chuàng)傷弧菌的檢測(cè)方法使用實(shí)施例1的試劑盒,按下列步驟進(jìn)行1).用無(wú)菌操作方法,取新鮮雜色鮑肝臟組織0.05g,加入樣品稀釋液(A液)500μl稀釋10倍,于無(wú)菌勻漿器中冰浴勻漿;2).6000r/min離心5min;3).取上清100μl,煮沸15min,立刻放于冰上5min;4).6000r/min離心10min,上清作為PCR模板;5).分別取模板和C液1μl,加入到PCR反應(yīng)液(B液)中,混勻后,1000r/min離心10sec,置于PCR儀上;6).按下列條件擴(kuò)增95℃ 3min預(yù)變性→94℃ 1min 34個(gè)循環(huán)→72℃ 10min→4℃保存49℃ 45sec72℃ 1min7).反應(yīng)結(jié)束后取5~10μl加2μl溴酚藍(lán)混勻,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳20~30分鐘(5V/cm)后于紫外儀上觀(guān)察,若在402bp處出現(xiàn)一明亮的反應(yīng)條帶(與陽(yáng)性對(duì)照在同一位置),則為創(chuàng)傷弧菌陽(yáng)性,說(shuō)明檢測(cè)樣品中攜帶創(chuàng)傷弧菌;若無(wú)反應(yīng)條帶顯示,則為陰性,表明檢測(cè)樣品中不含創(chuàng)傷弧菌(見(jiàn)圖1)。
權(quán)利要求
1.海洋水產(chǎn)動(dòng)物及人類(lèi)病原菌-創(chuàng)傷弧菌的基因診斷試劑盒,其特征是該試劑盒包括下列部件1).樣品稀釋液A液,1管,內(nèi)裝1×PBS,pH7.4;2).PCR反應(yīng)液B液,1管,內(nèi)裝PCR擴(kuò)增反應(yīng)液,包括ddH2O、含Mg2+的10×Buffer、dNTP、引物VvF、引物VvR和TaqE;VvF為5’-TAC GAT GAT TAT TGC G-3’,VvR為5’-TAA AAG TGA CAT TCC C-3’;3).陽(yáng)性對(duì)照液C液,1管,內(nèi)裝創(chuàng)傷弧菌的總DNA;4).盒子;5).一塊泡沫板,其大小與盒子的底面相同,裝于盒子中;泡沫板上有不少于上述小管數(shù)量的小孔,上述各小管分別對(duì)應(yīng)放置于這些小孔中。
2.一種檢測(cè)海洋水產(chǎn)動(dòng)物及人類(lèi)病原菌-創(chuàng)傷弧菌的方法,其特征是使用權(quán)利要求1所述試劑盒,按下列步驟進(jìn)行1).取新鮮待檢樣品,加入樣品稀釋液A液稀釋10~20倍,于無(wú)菌勻漿器中冰浴勻漿;2).6000~8000r/min離心5~10min;3).取上清200μl,煮沸15min,立刻放于冰上5~10min;4).6000~8000r/min離心10min,上清作PCR模板;5).分別取模板和C液,加入到PCR反應(yīng)液B液中,混勻后離心數(shù)秒,置于PCR儀上;6).按下列條件擴(kuò)增95℃ 3min預(yù)變性→94℃ 1min 34個(gè)循環(huán)→72℃ 10min→4℃保存49℃ 45sec72℃ 1min7).反應(yīng)結(jié)束后取5~10μl加2μl溴酚藍(lán)混勻,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳20~30分鐘后于紫外儀上觀(guān)察,若在402bp處出現(xiàn)明亮的反應(yīng)條帶,則為創(chuàng)傷弧菌陽(yáng)性;若無(wú)反應(yīng)條帶顯示則為陰性。
全文摘要
本發(fā)明提供一種海洋水產(chǎn)動(dòng)物(如鰻鱺、石斑魚(yú),鮑和對(duì)蝦等)及人類(lèi)病原菌—?jiǎng)?chuàng)傷弧菌(Vibrio vulnificus)的基因診斷試劑盒及檢測(cè)方法。該試劑盒及檢測(cè)方法是以創(chuàng)傷弧菌基因保守區(qū)序列設(shè)計(jì)的一對(duì)引物為主體而設(shè)計(jì)的。本發(fā)明采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù),對(duì)海洋水產(chǎn)動(dòng)物(如鰻鱺、石斑魚(yú),鮑和對(duì)蝦等)及人類(lèi)的病原菌—?jiǎng)?chuàng)傷弧菌的特異性DNA片斷進(jìn)行定性檢測(cè),簡(jiǎn)便快速,特異性好,靈敏度高;可用于海洋水產(chǎn)動(dòng)物各時(shí)期養(yǎng)殖過(guò)程中的細(xì)菌跟蹤檢測(cè),也可用于人類(lèi)敗血癥和軟組織感染的臨床檢測(cè),還可以用于環(huán)境監(jiān)測(cè),避免病菌傳播流行,具有很高的實(shí)用價(jià)值。
文檔編號(hào)G01N21/31GK1560604SQ20041001546
公開(kāi)日2005年1月5日 申請(qǐng)日期2004年2月26日 優(yōu)先權(quán)日2004年2月26日
發(fā)明者鄧先余, 何建國(guó), 王智學(xué), 黃志堅(jiān), 翁少萍 申請(qǐng)人:中山大學(xué), 珠海福德隆生物技術(shù)有限公司
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