度,峰的高度代表產(chǎn)物的豐度,峰的顏色為熒光經(jīng)激發(fā)后產(chǎn)生的顏 色,其中,藍(lán)色的峰代表經(jīng)FAM染料標(biāo)記的擴(kuò)增產(chǎn)物,綠色的峰代表經(jīng)HEX染料標(biāo)記的擴(kuò)增 產(chǎn)物,黑色的峰代表TAMRA染料標(biāo)記的擴(kuò)增產(chǎn)物,紅色峰代表經(jīng)R0X染料標(biāo)記的擴(kuò)增產(chǎn)物 (圖3-圖7B中,每幅圖從上到下四行峰分別為藍(lán)色、綠色、黑色、紅色)。在不同的分析儀 中,熒光染料經(jīng)激發(fā)后產(chǎn)生的光可能與其本身帶有的顏色不同,這對(duì)本領(lǐng)域技術(shù)人員來(lái)說(shuō) 是可以理解的。
[0076] 7.分型分析
[0077] 用片段分析軟件GeneMapper分析上述步驟中遺傳分析儀檢測(cè)收集的數(shù)據(jù),將樣 品分析數(shù)據(jù)與等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物(Allelic Ladder)(見(jiàn)附圖3)比較,得到實(shí)際樣品的基 因分型數(shù)據(jù)。
[0078] 8.結(jié)果
[0079] 根據(jù)以上1-7的步驟對(duì)以下樣品進(jìn)行檢測(cè)。
[0080] 1)取標(biāo)準(zhǔn)品9948,由定量PCR方法進(jìn)行定量后,分別以2. 0、1. 0、0. 5、0. 25、0. 125、 0. 0625、0. 03125ng的模板量分別以30和32擴(kuò)增循環(huán)數(shù)(模板量不同,循環(huán)數(shù)是可變的,本 領(lǐng)域技術(shù)人員可以根據(jù)需要對(duì)二者進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整),并使用本申請(qǐng)的系統(tǒng)檢驗(yàn)并重復(fù)1次。 經(jīng)測(cè)試,本發(fā)明中25個(gè)基因座的熒光標(biāo)記復(fù)合擴(kuò)增檢驗(yàn)系統(tǒng)在DNA模板量最低至0. 125ng, 擴(kuò)增循環(huán)數(shù)為32下,可檢出全部25個(gè)基因座。如圖1所示,圖4為標(biāo)準(zhǔn)品9948的已知分 型結(jié)果。
[0081] 2)使用本申請(qǐng)的系統(tǒng)檢測(cè)黑猩猩、大猩猩、猴、羊、豬、狗、兔等各類(lèi)物種DNA樣本, 對(duì)本發(fā)明方法的種屬特異性進(jìn)行驗(yàn)證,經(jīng)過(guò)多次重復(fù)試驗(yàn),結(jié)果如圖2所示,可以看出,使 用本發(fā)明系統(tǒng)的分型結(jié)果在分型區(qū)無(wú)25個(gè)基因座之外的擴(kuò)增產(chǎn)物,說(shuō)明本發(fā)明的方法和 系統(tǒng)具有高的種屬特異性。
[0082] 3)使用本申請(qǐng)的系統(tǒng)檢測(cè)兩個(gè)無(wú)關(guān)個(gè)體DNA樣品,結(jié)果見(jiàn)圖5A-5B,分型結(jié)果支持 這兩個(gè)個(gè)體為無(wú)關(guān)個(gè)體。
[0083] 4)使用本申請(qǐng)的系統(tǒng)檢測(cè)已確定親權(quán)關(guān)系的三聯(lián)體實(shí)例樣品,獲得的分型結(jié)果見(jiàn) 圖6A-圖6C,其中6A是父親的分型結(jié)果,6B是孩子的分型結(jié)果,6C是母親的分型結(jié)果。
[0084] 對(duì)應(yīng)于圖6A-圖6C的所述三聯(lián)體實(shí)例樣品父-孩子-母DNA樣本的分型結(jié)果如 下:
[0085]
[0086] 由結(jié)果可以看出,本發(fā)明系統(tǒng)和方法的結(jié)果支持該三聯(lián)體具有親權(quán)關(guān)系。
[0087] 5)使用本申請(qǐng)的系統(tǒng)檢測(cè)已確定親權(quán)關(guān)系二聯(lián)體實(shí)例(單親)的DNA樣本,最終 獲得分型驗(yàn)證結(jié)果,見(jiàn)圖7A-圖7B。
[0088] 對(duì)應(yīng)于圖7A-圖7B的得到二聯(lián)體實(shí)例(單親)的DNA樣本的分型結(jié)果如下:
[0089]
[0090] 由結(jié)果可以看出,本發(fā)明系統(tǒng)和方法的結(jié)果支持該二聯(lián)體具有親權(quán)關(guān)系。說(shuō)明本 申請(qǐng)的系統(tǒng)可以實(shí)現(xiàn)對(duì)單親案件的親權(quán)鑒定。
[0091] 實(shí)施例2
[0092] 根據(jù)在209例中國(guó)北方漢族人群無(wú)關(guān)個(gè)體中調(diào)查獲得的數(shù)據(jù),計(jì)算出熒光標(biāo)記 STR復(fù)合擴(kuò)增檢驗(yàn)體系中國(guó)漢族人群中的等位基因頻率、基因型頻率、觀察雜合度、個(gè)體識(shí) 別能力、多態(tài)性信息含量及非父排除率。本研究所構(gòu)建的體系的全部23個(gè)非C0DIS系統(tǒng) STR基因座累計(jì)匹配概率(PM)為8. 4528X 10 22,累計(jì)個(gè)體識(shí)別力(TDP)為0.999 999 999 999 999 999 999 154 72,累計(jì)非父排除概率(CEP)為0.999 999 672。所述各STR基因座 在中國(guó)漢族人群中具較高的多態(tài)性,可用于法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別和親權(quán)鑒定。
【主權(quán)項(xiàng)】
1. 一種用于對(duì)中國(guó)人群個(gè)體進(jìn)行個(gè)體識(shí)別和親子鑒定的方法,其特征在于,所述方法 包括: 1) 獲得待檢測(cè)個(gè)體的DNA; 2) 獲得所述DNA的23個(gè)常染色體STR基因座、性別決定基因座Amelogenin以及Y-STR 基因座DYS391的分型結(jié)果; 其中所述 23 個(gè)常染色體STR基因座為D1S1627、D3S4529、D2S441、D17S974、D6S1017、D4S2408、D9S2157、D17S1301、D1GATA113、D18S853、D20S482、D14S1434、D20S1082、D6S474、 D12ATA63、D22S1045、D10S1248、D1S1677、D11S4463、D9S1122、D2S1776、D5S2500 和D18S51; 3) 根據(jù)分型結(jié)果進(jìn)行個(gè)體識(shí)別和親子鑒定。2. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述基因座的分型結(jié)果通過(guò)測(cè)序獲得。3. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述基因座的分型結(jié)果通過(guò)STR基因座復(fù) 合檢測(cè)體系獲得,所述STR基因座復(fù)合檢測(cè)體系包括所述23個(gè)常染色體STR基因座、性別 決定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391,還包括用于對(duì)所述23個(gè)常染色體STR 基因座、性別決定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391進(jìn)行擴(kuò)增以獲得擴(kuò)增產(chǎn)物 的擴(kuò)增引物。4. 根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征在于, 所述23個(gè)常染色體STR基因座的擴(kuò)增引物為序列表中SEQIDNo. 1至SEQIDNo. 46 的核苷酸序列; 所述性別決定基因座和Y-STR基因座的擴(kuò)增引物為序列表中SEQIDN0.47至SEQID No. 50的核苷酸序列。5. -種STR基因座復(fù)合檢測(cè)體系,其特征在于,所述STR基因座復(fù)合檢測(cè)體系包括所 述23個(gè)常染色體STR基因座、性別決定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391,還 包括用于對(duì)所述23個(gè)常染色體STR基因座、性別決定基因座Amelogenin以及Y-STR基因 座DYS391進(jìn)行擴(kuò)增以獲得擴(kuò)增產(chǎn)物的擴(kuò)增引物,其中所述23個(gè)常染色體STR基因座為 D1S1627、D3S4529、D2S441、D17S974、D6S1017、D4S2408、D9S2157、D17S1301、D1GATA113、 D18S853、D20S482、D14S1434、D20S1082、D6S474、D12ATA63、D22S1045、D10S1248、D1S1677、 D11S4463、D9S1122、D2S1776、D5S2500 和D18S51。6. 根據(jù)權(quán)利要求5所述的STR基因座復(fù)合檢測(cè)體系,所述23個(gè)常染色體STR基因座的 擴(kuò)增引物為序列表中SEQIDNo. 1至SEQIDNo. 46的核苷酸序列; 所述性別決定基因座和Y-STR基因座的擴(kuò)增引物為序列表中SEQIDN0.47至SEQID No. 50的核苷酸序列。7. -種用于對(duì)中國(guó)人群個(gè)體進(jìn)行個(gè)體識(shí)別和親子鑒定的系統(tǒng),其特征在于,所述系統(tǒng) 包括DNA提取體系、STR基因座復(fù)合檢測(cè)體系,和推斷體系; 所述DNA提取體系用于獲得待檢測(cè)個(gè)體的DNA; 所述STR基因座復(fù)合檢測(cè)體系用于獲得所述DNA的23個(gè)常染色體STR基因座、性別決 定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391的分型結(jié)果; 所述推斷體系用于根據(jù)分型結(jié)果進(jìn)行個(gè)體識(shí)別和親子鑒定。8. 根據(jù)權(quán)利要求7所述的系統(tǒng),其特征在于,所述STR基因座復(fù)合檢測(cè)體系包括所述 23個(gè)常染色體STR基因座、性別決定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391,還包 括用于對(duì)所述23個(gè)常染色體STR基因座、性別決定基因座Amelogenin以及Y-STR基因 座DYS391進(jìn)行擴(kuò)增以獲得擴(kuò)增產(chǎn)物的擴(kuò)增引物,其中所述23個(gè)常染色體STR基因座為 D1S1627、D3S4529、D2S441、D17S974、D6S1017、D4S2408、D9S2157、D17S1301、D1GATA113、 D18S853、D20S482、D14S1434、D20S1082、D6S474、D12ATA63、D22S1045、D10S1248、D1S1677、 D11S4463、D9S1122、D2S1776、D5S2500 和D18S51。9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的系統(tǒng),其特征在于,所述常染色體STR基因座的擴(kuò)增引物為序 列表中SEQIDNo. 1至SEQIDNo. 46的核苷酸序列; 所述性別決定基因座和Y-STR基因座的擴(kuò)增引物為序列表中SEQIDN0.47至SEQID No. 50的核苷酸序列。
【專(zhuān)利摘要】本發(fā)明提供一種用于對(duì)中國(guó)人群個(gè)體進(jìn)行個(gè)體識(shí)別和親子鑒定的方法和系統(tǒng),所述方法包括:獲得待檢測(cè)個(gè)體的DNA;獲得所述DNA常染色體STR基因座、性別決定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391的分型結(jié)果,根據(jù)分型結(jié)果進(jìn)行個(gè)體識(shí)別和親子鑒定。本發(fā)明還提供了一種用于對(duì)中國(guó)人群個(gè)體進(jìn)行個(gè)體識(shí)別和親子鑒定的系統(tǒng)。本發(fā)明的方案通過(guò)綜合分析常染色體基因座和性別決定基因座分型結(jié)果能有效獲得待檢測(cè)個(gè)體的分型結(jié)果,進(jìn)而為公安機(jī)關(guān)進(jìn)行個(gè)體識(shí)別和親子鑒定提供有力的技術(shù)支撐。
【IPC分類(lèi)】C12Q1/68
【公開(kāi)號(hào)】CN105441534
【申請(qǐng)?zhí)枴緾N201510303275
【發(fā)明人】白雪, 姚伊人, 趙興春, 葉健, 王樂(lè)
【申請(qǐng)人】公安部物證鑒定中心
【公開(kāi)日】2016年3月30日
【申請(qǐng)日】2015年6月5日