中華絨螯蟹白斑癥病毒特異性pcr檢測試劑盒及檢測方法
【技術領域】
[0001] 本發(fā)明設及養(yǎng)殖技術領域,具體設及引起中華絨馨蟹發(fā)病病原白斑癥病毒特異性 PCR快速檢測試劑盒及檢測方法,特別設及一種中華絨馨蟹發(fā)病病原白斑癥病毒的基因檢 測試劑及檢測方法,適用于中華絨馨蟹白斑癥病毒的流行病學監(jiān)測、白斑癥病毒的檢測及 基因工程技術等領域。
【背景技術】
[0002] 白斑癥病毒(WSSV)是一種嚴重危害當前對郵養(yǎng)殖業(yè)的病毒,主要引起對郵甲殼 內(nèi)側白斑病變,并導致大批死亡。其流行范圍廣,在甲殼類、榜足類和昆蟲類中均有敏感宿 主。
[0003] 中華絨馨蟹又稱河蟹,是一種重要的經(jīng)濟蟹類,我國的中華絨馨蟹養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展迅 速,已成規(guī)?;?。在生產(chǎn)中,為了提高養(yǎng)殖效益,普遍采取多品種混養(yǎng)的養(yǎng)殖模式,如克氏原 馨郵與中華絨馨蟹混養(yǎng)等。但近幾年來,經(jīng)常發(fā)生克氏原馨郵大批量死亡后,處于相同養(yǎng)殖 塘中的中華絨馨蟹同時出現(xiàn)大量死亡的現(xiàn)象。薛晤等在2010年對江蘇部分地區(qū)養(yǎng)殖池塘 發(fā)病的克氏原馨郵和中華絨馨蟹進行采樣調(diào)查,證實引起該兩種淡水甲殼類動物發(fā)病死亡 的病原為白斑癥病毒。
[0004]目前對于白斑癥病毒病的診斷手段主要包括病理學方法、生物學方法、免疫學方 法、分子雜交方法及PCR方法等。但是還未見檢測中華絨馨蟹的快速、準確的方法,為了及 早發(fā)現(xiàn)養(yǎng)殖中華絨馨蟹是否被白斑癥病毒感染,有必要建立一種快速、準確、靈敏的檢測方 法。PCR方法具有操作簡單、特異、快速、敏感等優(yōu)點,正逐步應用于病原微生物的檢測與研 究中。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0005] 本發(fā)明所要解決的技術問題是,克服現(xiàn)有技術的不足,提供一種中華絨馨蟹白斑 癥病毒特異性PCR檢測方法,能快速、高效地用于中華絨馨蟹白斑癥病毒的檢測。
[0006] 本發(fā)明通過下述技術方案實現(xiàn)的。
[0007] 中華絨馨蟹白斑癥病毒的PCR快速檢測試劑盒,所述試劑盒包括:
[000引 (1)2X反應混合緩沖液,包含W下成分;KC1,MgCls,Tris-肥1抑5. 8,dNTP;
[0009] (2)檢測引物的設計合成:根據(jù)GenBank中發(fā)布的白斑癥病毒基因的保守序列, 設計一對特異性檢測引物,上游引物WSSV-F; 5' -GTGTACTAGGAATATTGGAAT-3',下游引物 WSSV-R;5' -CGGCATTCTTCATGGCTTCTG-3';
[0010] (3)Taq酶;
[0011] (4)滅菌的dd&O;
[001引 妨陽性對照液:白斑癥病毒基因組DNA;
[001引 (6)陰性對照液;dd&O。
[0014] 采用試劑盒檢測中華絨馨蟹白斑癥病毒的方法為:
[0015] (1)中華絨馨蟹白斑癥病毒DM的提??;取中華絨馨蟹的觸、肝膜腺、肌肉組織,加 入滅菌處理的雙蒸水,用玻璃勻漿器充分研磨后,置于-20°C冰箱反復凍融3次,600化pm低 溫離屯、10分鐘,取上清,加入Tris-飽和酪,充分振蕩混勻后,靜置5分鐘,然后1200化pm離 屯、5分鐘,取上清液加入等量的酪;氯仿;異戊醇抽提二次,取上清加入2倍體積的異丙醇, 混勻后,靜置10分鐘,12000rpm離屯、10分鐘,去掉上清后,加入75 %的己醇,靜置5分鐘, 1200化pm離屯、10分鐘,去掉上清,置于真空干燥箱干燥后,用d地2〇溶解,即為試驗用DNA 模板,提取的DNA模板置于-70°C保存?zhèn)溆茫?br>[0016] (2)PCR反應體系;采用PCR反應體系,在PCR反應管內(nèi)分別加入2X反應混合緩沖 液,上游引物、下游引物,5U/yLTaqDNA聚合酶,DNA模板,加滅菌超純水,同時分別用陽性 對照液和陰性對照液作為模板,設置陽性和陰性對照組,混合均勻后離屯、數(shù)秒,置于PCR反 應儀上;
[0017] (4)PCR反應條件;95°C預變性5分鐘;然后95°C變性30秒,56°C退火30秒,72°C 延伸40秒,共循環(huán)30次;72 °C延伸10分鐘,最后4°C保存;
[001引 巧)PCR擴增產(chǎn)物的檢測;PCR反應結束后,取產(chǎn)物在1. 5 %瓊脂糖凝膠(含漠化己 錠0. 5yg/mL)上,使用TAE緩沖液進行電泳,在紫外透射儀下觀察PCR產(chǎn)物,檢查PCR產(chǎn)物 的預期大小;
[0019] (6)結果與判定;在紫外燈下觀察并與標準分子量相對照,若檢測樣品在44化P處 出現(xiàn)明亮的條帶,而陰性對照沒有目的條帶,則為白斑癥病毒陽性;若陽性對照可見目的條 帶,而檢測樣品無目的條帶出現(xiàn),則為陰性,沒有或不是所要檢測的目的白斑癥病毒。
[0020] 優(yōu)選的試劑盒包括:
[0021] (3) 2X反應混合緩沖液1. 0血,包含W下成分:
[0022]
[0023]
[0024] (4)檢測引物的設計合成:根據(jù)GenBank中發(fā)布的白斑癥病毒基因的保守序列, 設計一對特異性檢測引物,上游引物WSSV-F;5' -GTGTACTAGGAATATTGGAAT-3',下游引物 WSSV-R;5' -CGGCATTCTTCATGGCTTCTG-3',濃度為 10yM;
[00巧]0)Taq酶 5U/yL;
[0026] (4)滅菌的(1地2〇 1.0血;
[0027] 妨陽性對照液:白斑癥病毒基因組DNA;
[0028] (6)陰性對照液;d地2〇。
[0029] 優(yōu)選的采用試劑盒檢測中華絨馨蟹白斑癥病毒的方法為:
[0030] (1)中華絨馨蟹白斑癥病毒DNA的提取:取50-100mg中華絨馨蟹的觸、肝膜腺、肌 肉組織,加入600yL滅菌處理的雙蒸水,用玻璃勻漿器充分研磨后,置于-20°C冰箱反復凍 融3次,6000巧m低溫離屯、10分鐘,取上清,加入200化Tris-飽和酪,充分振蕩混勻后,靜 置5分鐘,然后1200化pm離屯、5分鐘,取上清液加入等量的酪;氯仿;異戊醇抽提二次,取 上清加入2倍體積的異丙醇,混勻后,靜置10分鐘,12000rpm離屯、10分鐘,去掉上清后,加 入ImL預冷的75 %的己醇,靜置5分鐘,12000巧m離屯、10分鐘,去掉上清,置于真空干燥箱 干燥后,用100yL的d地2〇溶解,即為試驗用DNA模板,提取的DNA模板置于-70°C保存?zhèn)?用;
[0031] (2)PCR反應體系;采用20yL的PCR反應體系,在0. 2血PCR反應管內(nèi)分別加入 2X反應混合緩沖液10化,上游引物、下游引物各0. 5化,抓/化TaqDNA聚合酶0. 5化,DNA模板3. 0yL,用滅菌超純水加至總體積,同時分別用陽性對照液和陰性對照液作為模 板,設置陽性和陰性對照組,混合均勻后離屯、數(shù)秒,置于PCR反應儀上;
[003引 (4)PCR反應條件;95°C預變性5分鐘;然后95°C變性30秒,56°C退火30秒,72°C 延伸40秒,共循環(huán)30次;72 °C延伸10分鐘,最后4°C保存;
[003引 巧)PCR擴增產(chǎn)物的檢測;PCR反應結束后,取10化產(chǎn)物在1. 5%瓊脂糖凝膠(含 漠化己錠0. 5yg/血)上,使用TAE緩沖液進行電泳,在紫外透射儀下觀察PCR產(chǎn)物,檢查PCR產(chǎn)物的預期大?。?br>[0034] (6)結果與判定;在紫外燈下觀察并與標準分子量相對照,若檢測樣品在44化P處 出現(xiàn)明亮的條帶,而陰性對照沒有目的條帶,則為白斑癥病毒陽性;若陽性對照可見目的條 帶,而檢測樣品無目的條帶出現(xiàn),則為陰性,沒有或不是所要檢測的目的白斑癥病毒。
[0035] 與現(xiàn)有技術相比,本發(fā)明所述的中華絨馨蟹白斑癥病毒的特異性PCR快速檢測試 劑盒及其檢測方法具有W下特點及優(yōu)點:
[0036] (1)本發(fā)明采用聚合酶鏈式反應(polymerasechainreaction,PCR)技術檢測中 華絨馨蟹白斑癥病毒的方法,適用于對中華絨馨蟹白斑癥病毒進行快速檢測。
[0037] (2)與現(xiàn)有技術相比,本發(fā)明的有益效果包括;①檢測快速、效率高;從核酸提取、 聚合酶鏈反應(PCR)到結果判定僅需要3小時;一次可W進行多個樣品的檢測,具有高效 性。②檢測準確:檢測引物只與中華絨馨蟹白斑癥病毒特異性地結合,與其他病原都沒有交 叉反應。⑨檢測靈敏度高,適合用于中華絨馨蟹白斑癥病毒的早期監(jiān)控。
【附圖說明】
[0038] 圖1為感染白斑癥病毒中華絨馨蟹觸、肝膜腺、肌肉組