Vegf多態(tài)性和抗血管發(fā)生療法
【專利說(shuō)明】VEGF多態(tài)性和抗血管發(fā)生療法
[0001] 本申請(qǐng)是申請(qǐng)日為2008年11月26日、中國(guó)申請(qǐng)?zhí)枮?00880125826. 3、發(fā)明名稱 為"VEGF多態(tài)性和抗血管發(fā)生療法"的發(fā)明申請(qǐng)的分案申請(qǐng)。
[0002] 對(duì)相關(guān)申請(qǐng)的交叉引用
[0003] 本申請(qǐng)要求2007年11月30日提交的美國(guó)臨時(shí)申請(qǐng)No. 60/991，616和2008年3 月21日提交的美國(guó)臨時(shí)申請(qǐng)No. 61/038, 699的權(quán)益，通過(guò)述及將其公開(kāi)內(nèi)容完整收入本 文。
[0004] 生物材料的保藏
[0005] 以下生物材料已經(jīng)保藏于美國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心（American Type Culture Collection,12301 Parklawn Drive, Rockville, MD 20852, USA) (ATCC)：
[0006] 保藏物 保藏日期 保藏編號(hào)
[0007] 雜交瘤，Α4· 6. 1 (抗-hVEGF) 1991 年 03 月 29 日 ATCC HB-10709 發(fā)明領(lǐng)域
[0008] -般而言，本申請(qǐng)涉及與抗血管發(fā)生療法有關(guān)的人類疾病和病癥的治療。具體而 言，本發(fā)明涉及癌癥的抗血管發(fā)生療法，其或是單獨(dú)施用的或是與其它抗癌療法組合施用 的。
[0009] 發(fā)明背景
[0010] 癌癥仍然是人類健康的最致命威脅之一，在美國(guó)每年影響超過(guò)1百萬(wàn)新患者。實(shí) 體瘤對(duì)那些死亡大多負(fù)有責(zé)任。雖然某些癌癥的醫(yī)學(xué)治療取得了顯著進(jìn)展，但是當(dāng)前的治 療方法相對(duì)沒(méi)有選擇性：手術(shù)切除患病組織；放射療法縮小實(shí)體瘤；及化學(xué)療法殺死正在 快速分裂的細(xì)胞。這些治療方法可導(dǎo)致眾多副作用，在有些情況中嚴(yán)重到限制可給予的劑 量并如此排除潛在有效藥物的使用。
[0011] 血管發(fā)生是重要的細(xì)胞事件，其中血管內(nèi)皮細(xì)胞增殖、消減和重新組織，從而從 現(xiàn)有的血管網(wǎng)絡(luò)形成新血管。血管發(fā)生對(duì)于大多數(shù)原發(fā)瘤的生長(zhǎng)及其后續(xù)轉(zhuǎn)移是至關(guān)重 要的。血管內(nèi)皮細(xì)胞生長(zhǎng)因子（VEGF)，也稱作VEGF-A或血管通透因子（VPF)，被報(bào)道成 正常和異常血管發(fā)生二者的樞軸調(diào)節(jié)物。Ferrara and Davis_Smyth(1997)Endocrine Rev. 18:4-25 ;Ferrara(1999)J. Mol. Med. 77:527-543〇
[0012] 抗 VEGF 抗體"貝伐單抗"（Bevacizumab)，也稱作 "BV"、"rhuMAb VEGF"、或 "AvastinK"，是依照 Presta et al.(1997)Cancer Res. 57:4593-4599 生成的一種重組 人源化抗VEGF單克隆抗體，當(dāng)前在美國(guó)獲得批準(zhǔn)用于治療轉(zhuǎn)移性結(jié)腸直腸癌、非小細(xì)胞肺 癌、和轉(zhuǎn)移性乳腺癌。與其它癌癥治療方法一樣，Avastin?.療法與某些副作用有關(guān)，包括升 尚的尚血壓的風(fēng)險(xiǎn)。
[0013] 當(dāng)特定基因中的不同等位基因?qū)е虏煌硇蜁r(shí)，群體中存在遺傳多態(tài)性。此類多 態(tài)性可以在決定治療性藥物的功效和安全性中發(fā)揮作用。例如，已經(jīng)顯示了 VEGF中的特定 多態(tài)性與乳腺癌的發(fā)病率有關(guān)。Schneider et al. (2008)Breast Cancer Research and Treatment 111:157-63〇
[0014] 別的預(yù)示特定療法的功效或安全性的多態(tài)性的鑒定可用于更好地為那些會(huì)最佳 地受益于該療法的患者調(diào)整該療法。
[0015] 發(fā)明概述
[0016] 本發(fā)明部分基于VEGF中如下的多態(tài)性的鑒定，所述多態(tài)性在正在經(jīng)歷抗VEGF療 法（包括用Avastin ^)的患者中預(yù)示升高的受益于VEGF拮抗劑治療的可能性和/或升高 的高血壓的風(fēng)險(xiǎn)。
[0017] -方面，本發(fā)明提供一種預(yù)測(cè)患者是否處于升高的與VEGF拮抗劑治療有關(guān) 的高血壓的風(fēng)險(xiǎn)的方法，包括對(duì)自所述患者分離的樣品篩選選自VEGF(-1498C/T)和 VEGF(-634G/C)的基因組多態(tài)性，其中若相應(yīng)的基因型包含VEGF(-1498C)或VEGF(-634G)， 則患者處于升高的與VEGF拮抗劑治療有關(guān)的高血壓的風(fēng)險(xiǎn)。在一些實(shí)施方案中，所述VEGF 拮抗劑是抗VEGF抗體，例如貝伐單抗。在一些實(shí)施方案中，所述治療進(jìn)一步包括施用抗腫 瘤組合物。在一些實(shí)施方案中，所述患者正在治療癌癥，例如乳腺癌。
[0018] 另一方面，本發(fā)明提供一種用于預(yù)測(cè)患者是否處于升高的與VEGF拮抗劑治療有 關(guān)的高血壓的風(fēng)險(xiǎn)的試劑盒，包括對(duì)VEGF中選自下組的多態(tài)性特異性的第一寡核苷酸和 第二寡核苷酸：VEGF(-1498C/T)和VEGF(-634G/C)。在一些實(shí)施方案中，所述試劑盒中的所 述寡核苷酸對(duì)于擴(kuò)增VEGF中包含這些多態(tài)性之一的區(qū)域是有用的。
[0019] 另一方面，本發(fā)明提供一種預(yù)測(cè)患者是否具有升高的受益于VEGF拮抗劑治療的 可能性的方法，包括對(duì)自所述患者分離的樣品篩選VEGF(-2578C/A)或VEGF(-1154G/A)處 的基因組多態(tài)性，其中若相應(yīng)的基因型包含VEGF(-2578AA)或VEGF(1154AA)，則患者具有 升高的受益于VEGF拮抗劑治療的可能性。在一些實(shí)施方案中，所述VEGF拮抗劑是抗VEGF 抗體，例如貝伐單抗。在一些實(shí)施方案中，所述治療進(jìn)一步包括施用抗腫瘤組合物。在一些 實(shí)施方案中，所述患者正在治療癌癥，例如乳腺癌。
[0020] 另一方面，本發(fā)明提供一種用于預(yù)測(cè)患者是否具有升高的受益于VEGF拮抗劑治 療的可能性的試劑盒，包括對(duì)VEGF中選自下組的多態(tài)性特異性的第一寡核苷酸和第二寡 核苷酸：VEGF(-2578C/A)和VEGF(-1154G/A)。在一些實(shí)施方案中，所述試劑盒中的所述寡 核苷酸對(duì)于擴(kuò)增VEGF中包含這些多態(tài)性之一的區(qū)域是有用的。
[0021] 本發(fā)明涉及下述各項(xiàng)。
[0022] 1. -種預(yù)測(cè)患者是否處于升高的與VEGF拮抗劑治療有關(guān)的高血壓的風(fēng)險(xiǎn)的方 法，包括對(duì)自所述患者分離的樣品篩選VEGF(-1498C/T)處的基因組多態(tài)性，其中若相應(yīng)的 基因型包含VEGF (-1498C)，則患者處于升高的與VEGF拮抗劑治療有關(guān)的高血壓的風(fēng)險(xiǎn)。
[0023] 2. -種預(yù)測(cè)患者是否處于升高的與VEGF拮抗劑治療有關(guān)的高血壓的風(fēng)險(xiǎn)的方 法，包括對(duì)自所述患者分離的樣品篩選VEGF(-634G/C)處的基因組多態(tài)性，其中若相應(yīng)的 基因型包含VEGF (-634G)，則患者處于升高的與VEGF拮抗劑治療有關(guān)的高血壓的風(fēng)險(xiǎn)。
[0024] 3.項(xiàng)1或2的方法，其中所述VEGF拮抗劑是抗VEGF抗體。
[0025] 4.項(xiàng)3的方法，其中所述抗VEGF抗體是貝伐單抗。
[0026] 5.項(xiàng)1或2的方法，其中所述患者正在用VEGF拮抗劑治療癌癥。
[0027] 6.項(xiàng)5的方法，進(jìn)一步包括施用抗腫瘤組合物。
[0028] 7.項(xiàng)5的方法，其中所述癌癥是乳腺癌。
[0029] 8.項(xiàng)5的方法，其中所述VEGF拮抗劑是抗VEGF抗體。
[0030] 9.項(xiàng)8的方法，其中所述抗VEGF抗體是貝伐單抗。
[0031] 10.項(xiàng)8的方法，進(jìn)一步包括施用抗腫瘤組合物。
[0032] 11. -種用于預(yù)測(cè)患者是否處于升高的與VEGF拮抗劑治療有關(guān)的高血壓的風(fēng) 險(xiǎn)的試劑盒，包括對(duì)VEGF中選自下組的多態(tài)性特異性的第一寡核苷酸和第二寡核苷酸： VEGF(-1498C/T)和 VEGF(-634G/C)。
[0033] 12.項(xiàng)11的試劑盒，其中所述第一寡核苷酸和所述第二寡核苷酸可用于擴(kuò)增包含 VEGF中選自下組的多態(tài)性的部分VEGF基因 ：VEGF (-1498C/T)和VEGF (-634G/C)。
[0034] 13. -種預(yù)測(cè)患者是否具有升高的受益于VEGF拮抗劑治療的可能性的方法，包括 對(duì)自所述患者分離的樣品篩選VEGF (-2578C/A)處的基因組多態(tài)性，其中若相應(yīng)的基因型 包含VEGF (-2578AA)，則患者具有升高的受益于VEGF拮抗劑治療的可能性。
[0035] 14. -種預(yù)測(cè)患者是否具有升高的受益于VEGF拮抗劑治療的可能性的方法，包括 對(duì)自所述患者分離的樣品篩選VEGF (-1154G/A)處的基因組多態(tài)性，其中若相應(yīng)的基因型 包含VEGF (-1154AA)，則患者具有升高的受益于VEGF拮抗劑治療的可能性。
[0036] 15.項(xiàng)13或14的方法，其中所述VEGF拮抗劑是抗VEGF抗體。
[0037] 16.項(xiàng)15的方法，其中所述抗VEGF抗體是貝伐單抗。
[0038] 17.項(xiàng)13或14的方法，其中所述患者用VEGF拮抗劑治療癌癥。
[0039] 18.項(xiàng)17的方法，進(jìn)一步包括施用抗腫瘤組合物。
[0040] 19.項(xiàng)17的方法，其中所述癌癥是乳腺癌。
[0041] 20.項(xiàng)17的方法，其中所述VEGF拮抗劑是抗VEGF抗體。
[0042] 21.項(xiàng)20的方法，其中所述抗VEGF抗體是貝伐單抗。
[0043] 22.項(xiàng)20的方法，進(jìn)一步包括施用抗腫瘤組合物。
[0044] 23. -種用于預(yù)測(cè)患者是否具有升高的受益于VEGF拮抗劑治療的可能性的 試劑盒，包括對(duì)VEGF中選自下組的多態(tài)性特異性的第一寡核苷酸和第二寡核苷酸： VEGF(-2578C/A)和 VEGF(-1154G/A)。
[0045] 24.項(xiàng)11的試劑盒，其中所述第一寡核苷酸和所述第二寡核苷酸可用于擴(kuò)增包含 VEGF中選自下組的多態(tài)性的部分VEGF基因：VEGF(-2578C/A)和VEGF(-1154G/A)。
[0046] 發(fā)明詳述
[0047] 除非另有說(shuō)明，本發(fā)明的實(shí)施將采用分子生物學(xué)（包括重組技術(shù)）、微生物學(xué)、細(xì) 胞生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫學(xué)的常規(guī)技術(shù)，這些都在本領(lǐng)域的技術(shù)范圍內(nèi)。這些技術(shù)在文 獻(xiàn)中有充分解釋，諸如"Molecular Cloning:A Laboratory Manual"，第二版（Sambrook et al·，1989) ;"01igonucleotide Synthesis"（M.J.Gait 編，1984) ;"Animal Cell Culture"（R. I. Freshney 編，1987) ;"Metho