本申請涉及生物檢測,具體涉及一種用于檢測急性出血性結(jié)膜炎病原體的核酸組合、包含其的試劑盒及其用途。
背景技術(shù):
1、急性出血性結(jié)膜炎(ahc)屬于法定報告?zhèn)魅静≈械谋悅魅静?,主要通過接觸傳染傳播,極容易發(fā)生聚集性疫情。該病還具有潛伏期短、起病急、眼刺激癥狀重、結(jié)膜充血、傳染性較強、傳播易實現(xiàn)等特點,全世界范圍內(nèi)均有流行。
2、在夏秋季節(jié)一個地區(qū)、單位集中出現(xiàn)多數(shù)急性結(jié)膜炎患者或醫(yī)院門診、醫(yī)務(wù)室驟然出現(xiàn)眾多潛伏期極短、急劇發(fā)病、接觸傳播很快的急性結(jié)膜炎患者,須高度警惕急性出血性結(jié)膜炎的流行。
3、急性出血性結(jié)膜炎的診斷需依據(jù)病史、接觸史、流行病學(xué)史結(jié)合臨床癥狀、體征作出ahc臨床診斷。急性出血性結(jié)膜炎確切診斷須待實驗室病原學(xué)證實:(一)結(jié)膜拭子涂擦或結(jié)膜刮取物培養(yǎng)分離出ev70或ca24v。(二)結(jié)膜刮片間接免疫熒光技術(shù)、酶聯(lián)免疫吸附試驗檢測出病毒抗原。(三)雙相血清學(xué)檢查。病人恢復(fù)期血清抗ev70或抗ca24v?抗體比急性期血清抗體滴度升高4倍或4倍以上。(四)逆轉(zhuǎn)錄多聚酶鏈反應(yīng)法測出結(jié)膜標(biāo)本ev70。臨床診斷加以上實驗室病原檢查任何一項陽性者為確診病例。急性出血性結(jié)膜炎現(xiàn)有的核酸診斷方法只基于ev70和ca24v這兩種主要的病原進行核酸檢測。
4、因此亟需建立能夠同時檢測出多種急性出血性結(jié)膜炎病原體的方法。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、基于此,有必要至少提供一種用于檢測急性出血性結(jié)膜炎病原體的核酸組合、包含其的試劑盒及其用途。
2、在本申請的第一方面,提供一種用于檢測急性出血性結(jié)膜炎病原體的核酸組合,所述核酸組合包括選自如下構(gòu)成的群組中的一組或多組:引物探針組1:序列如seq?id?no:1~3所示用于檢測腸道病毒70型(ev70)的上下游引物和探針;引物探針組2:序列如seq?idno:?4~6所示用于檢測柯薩奇病毒a組24型變種(ca24v)的上下游引物和探針;引物探針組3:序列如seq?id?no:?7~9所示用于檢測腺病毒b亞屬(adv?b)的上下游引物和探針;以及,引物探針組4:序列如seq?id?no:?10~12所示用于檢測腺病毒d亞屬(adv?d)的上下游引物和探針。
3、在本申請的第二方面,提供一種試劑盒,其包含如第一方面所述的核酸組合。
4、在本申請的第三方面,提供一種用于檢測急性出血性結(jié)膜炎病原體的方法,包括如下步驟:提取待測樣本的核酸,得到核酸樣本;使用第二方面所述的試劑盒對所述核酸樣本進行pcr擴增;以及,獲得并分析結(jié)果。
5、本申請示例性提供一種高效快速低成本鑒別急性出血性結(jié)膜炎病原體的方法,可以采用熒光定量pcr方法,對患者樣本提取核酸,針對腸道病毒70型(ev70)、柯薩奇a24型變異株(ca24v)和腺病毒保守區(qū)域進行擴增,達到快速檢測和鑒別引起急性出血性結(jié)膜炎病原體的目的。該方法的優(yōu)勢至少在于檢測成本、檢測效率高的同時兼顧了靈敏度和特異性,對于急性出血性結(jié)膜炎的流行病學(xué)檢測具有重要意義。
1.一種用于檢測急性出血性結(jié)膜炎病原體的核酸組合,其特征在于,所述核酸組合包括選自如下構(gòu)成的群組中的一組或多組:
2.如權(quán)利要求1所述的核酸組合,其特征在于,其還包括引物探針組5:序列如seq?idno:?13~15所示用于檢測gapdh的上下游引物和探針。
3.一種試劑盒,其特征在于,其包含如權(quán)利要求1或2所述的核酸組合。
4.如權(quán)利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述引物探針組1、所述引物探針組2和用于檢測腺病毒的引物探針組均各自標(biāo)記有熒光報告基團且彼此之間互不相同且互不干擾;
5.如權(quán)利要求4所述的試劑盒,其特征在于,所述熒光報告基團選自由fam、hex、vic、rox、cy5和quasar?705構(gòu)成的群組。
6.如權(quán)利要求3~5中任一項所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包含陽性質(zhì)控品和/或陰性質(zhì)控品;
7.一種用于檢測急性出血性結(jié)膜炎病原體的方法,其特征在于,包括如下步驟:
8.如權(quán)利要求7所述的方法,其特征在于,在進行pcr擴增的每個反應(yīng)體系中,每對所述引物對的濃度均為100?nm~500?nm,每個所述探針的濃度均為50?nm~250?nm。
9.如權(quán)利要求7或8所述的方法,其特征在于,在進行pcr擴增的每個反應(yīng)體系中,所述dna聚合酶的濃度為5?u/μl~15u?/μl,所述逆轉(zhuǎn)錄酶的濃度為5?u/μl~10?u/μl,mg2+的濃度為4?mm~6?mm,dntp(u)s的濃度為0.2?mm~0.4?mm。
10.如權(quán)利要求9所述的方法,其特征在于,所述方法滿足如下1)~2)所示條件中的一項或多項: