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配糖體化合物、硫醚的制造方法、醚、醚的制造方法、配糖體化合物及核酸的制造方法與流程

文檔序號:11509207閱讀:494來源:國知局
配糖體化合物、硫醚的制造方法、醚、醚的制造方法、配糖體化合物及核酸的制造方法與流程

本申請是申請?zhí)枮?01280052136.6(國際申請?zhí)枮閜ct/jp2012/071517)的原申請的分案申請,該原申請的申請日為2012年8月24日,發(fā)明名稱為“配糖體化合物、硫醚的制造方法、醚、醚的制造方法、配糖體化合物的制造方法及核酸的制造方法”。

本發(fā)明為關(guān)于一種配糖體(glycoside)化合物、硫醚的制造方法、醚、醚的制造方法、配糖體化合物的制造方法以及核酸的制造方法。



背景技術(shù):

作為dna、rna等核酸的制造(合成)方法,舉例來說,可使用亞磷酰胺(phosphoramidite)法等。利用亞磷酰胺法的核酸合成原料可使用核苷的亞磷酰胺(以下,有時僅稱為“亞磷酰胺”)。前述亞磷酰胺的2’-位保護(hù)基團(tuán)可使用多種保護(hù)基團(tuán),諸如tbdms(叔丁基二甲基甲硅烷基[tert-butyldimethylsilyl])基團(tuán)、tom(三異丙基甲硅烷氧基甲基[triisopropylsilyloxymethyl])基團(tuán)、ace(雙(2-乙酰氧基乙氧基)甲基[bis(2-acetoxyethoxy)methyl])基團(tuán)等。例如,就tom-亞酰胺(amidite)而言,已載于下述非專利文獻(xiàn)1等。

先行技術(shù)文獻(xiàn)

非專利文獻(xiàn)

非專利文獻(xiàn)1

http://www.glenresearch.com/technical/tb_rna_tom_deprotection.pdf(2011年(平成23年)8月18日檢索)



技術(shù)實現(xiàn)要素:

發(fā)明要解決的問題

然而,tom-亞酰胺、ace-亞酰胺等的常規(guī)亞磷酰胺因其高制造成本而難以用作醫(yī)藥品等的合成原料。此外,tbdms-亞酰胺在以偶聯(lián)(縮合)反應(yīng)合成核酸時,會有核酸收率及純度不高的情況。

于此,本發(fā)明的目的在于提供一種配糖體化合物、硫醚的制造方法、醚、醚的制造方法、配糖體化合物的制造方法,其可提供一種亞磷酰胺,該亞磷酰胺可以低成本制造且可以高收率及高純度制造核酸。進(jìn)一步而言,本發(fā)明的目的在于提供一種使用前述亞磷酰胺的核酸制造方法,其可以高收率及高純度制造核酸。

用于解決問題的方案

為了達(dá)成前述目的,本發(fā)明的配糖體化合物為下述化學(xué)式(1)所示的配糖體化合物、其對映異構(gòu)體、互變異構(gòu)體、立體異構(gòu)體或其鹽。

前述化學(xué)式(1)中,b為具有核酸堿基骨架的原子團(tuán),并任選地具有保護(hù)基團(tuán);

r1及r2分別為氫原子或保護(hù)基團(tuán);

或者,r1與r2也可成為一體而形成下述化學(xué)式(r1r2a)或(r1r2b)所示原子團(tuán);

各r1a分別為氫原子、直鏈或支化的烷基、或者直鏈或支化的烷氧基,且可相同也可相異;

r3為下述化學(xué)式(r3)所示的基團(tuán):

前述化學(xué)式(r3)中,l1為亞乙基(-ch2ch2-),但除鍵合到相對于[d1]的α位的1個氫原子以外,其它氫原子任選地被直鏈或支化的烷基取代;

n為正整數(shù);和

[d1]為吸電子基團(tuán)。

本發(fā)明的第1硫醚制造方法為制造下述化學(xué)式(103)所示硫醚的方法,其為使下述化學(xué)式(101a)及(101b)所示硫醇或硫代烷氧化物(thioalkoxide)與下述化學(xué)式(102)所示鹵化物進(jìn)行偶聯(lián)反應(yīng),而制出下述化學(xué)式(103)所示的硫醚。

前述化學(xué)式(101a)、(101b)及(103)中,r4及r5分別為烴基、直鏈或支化的烷基、直鏈或支化的烯基、直鏈或支化的炔基、芳基、直鏈或支化的芳烷基、環(huán)烷基、環(huán)烯基、直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、直鏈或支化的環(huán)基烷基(cyclylalkyl)、或者直鏈或支化的烷氧基烷基,且可相同也可相異;

前述化學(xué)式(101a)及(101b)中,m1及m2分別為氫原子或金屬,且可相同也可相異;

前述化學(xué)式(102)及(103)中,n為正整數(shù);和

前述化學(xué)式(102)中,x1及x2分別為鹵素,且可相同也可相異。

本發(fā)明的第2硫醚制造方法為制造下述化學(xué)式(103)所示硫醚的方法,其為使下述化學(xué)式(103b)所示硫醚與下述化學(xué)式(104)所示醇在鹵化劑及路易斯酸存在下進(jìn)行偶聯(lián)反應(yīng),而制出下述化學(xué)式(103)所示的硫醚。

前述化學(xué)式(103b)、(104)及(103)中,r4、r5及r6分別為烴基、直鏈或支化的烷基、直鏈或支化的烯基、直鏈或支化的炔基、芳基、直鏈或支化的芳烷基、環(huán)烷基、環(huán)烯基、直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、直鏈或支化的環(huán)基烷基、或者直鏈或支化的烷氧基烷基,且可相同也可相異;

前述化學(xué)式(103b)及(103)中,n為2以上的整數(shù)。

本發(fā)明的醚為下述化學(xué)式(106)所示的醚、其對映異構(gòu)體、互變異構(gòu)體、立體異構(gòu)體或者其鹽。

前述化學(xué)式(106)中,r4為烴基、直鏈或支化的烷基、直鏈或支化的烯基、直鏈或支化的炔基、芳基、直鏈或支化的芳烷基、環(huán)烷基、環(huán)烯基、直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、直鏈或支化的環(huán)基烷基、或者直鏈或支化的烷氧基烷基;

n為正整數(shù);

l1為亞乙基(-ch2ch2-),但除鍵合到相對于[d1]的α位的1個氫原子以外,其它氫原子任選地被直鏈或支化的烷基取代;和

[d1]為吸電子基團(tuán)。

本發(fā)明的醚的制造方法為制造前述本發(fā)明的醚的方法,其為使下述化學(xué)式(103)所示硫醚與下述化學(xué)式(105)所示醇在鹵化劑及路易斯酸存在下進(jìn)行偶聯(lián)反應(yīng),而制出前述本發(fā)明的醚。

前述化學(xué)式(103)及(105)中,r4與前述化學(xué)式(106)中的定義相同,r5為烴基、直鏈或支化的烷基、直鏈或支化的烯基、直鏈或支化的炔基、芳基、直鏈或支化的芳烷基、環(huán)烷基、環(huán)烯基、直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、直鏈或支化的環(huán)基烷基、或者直鏈或支化的烷氧基烷基,且可與r4相同或相異;

前述化學(xué)式(103)中,n與前述化學(xué)式(106)中的定義相同;和

前述化學(xué)式(105)中,l1及[d1]與前述化學(xué)式(106)中的定義相同。

本發(fā)明的配糖體化合物的制造方法為前述本發(fā)明的配糖體化合物、其對映異構(gòu)體、互變異構(gòu)體、立體異構(gòu)體或其鹽的制造方法,包含:偶聯(lián)步驟,其為使下述化學(xué)式(107)所示配糖體化合物與下述化學(xué)式(106)所示的醚在鹵化劑及路易斯酸存在下進(jìn)行偶聯(lián)反應(yīng),以制造下述化學(xué)式(1a)所示的配糖體化合物;且,下述化學(xué)式(1a)所示配糖體化合物為前述化學(xué)式(1)中r1及r2成為一體而形成前述化學(xué)式(r1r2a)或(r1r2b)所示原子團(tuán)的配糖體化合物。

前述化學(xué)式(107)及(1a)中,l2為前述化學(xué)式(r1r2a)或(r1r2b)所示的原子團(tuán),b與前述化學(xué)式(1)中的定義相同;

前述化學(xué)式(106)中,r4為烴基、直鏈或支化的烷基、直鏈或支化的烯基、直鏈或支化的炔基、芳基、直鏈或支化的芳烷基、環(huán)烷基、環(huán)烯基、直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、直鏈或支化的環(huán)基烷基、或者直鏈或支化的烷氧基烷基;

前述化學(xué)式(106)及(1a)中,l1、n及[d1]與前述化學(xué)式(1)中的定義相同。

本發(fā)明的核酸制造方法為含有下述化學(xué)式(i)所示結(jié)構(gòu)的核酸的制造方法,其特征在于包含:縮合步驟,其為使前述化學(xué)式(1)所示的配糖體化合物為下述化學(xué)式(2)所示的配糖體化合物的本發(fā)明配糖體化合物進(jìn)行縮合反應(yīng)。

前述化學(xué)式(i)中,b與前述化學(xué)式(1)中的定義相同;

r100為氫原子或羥基;

各b可相同也可相異,且各r100可相同也可相異;

m為正整數(shù)。

前述化學(xué)式(2)中,

b、r1及r3與前述化學(xué)式(1)中的定義相同,條件是r1為保護(hù)基團(tuán);

r2a及r2b分別為氫原子或任意的取代基,且可相同也可相異;

或者,r2a及r2b也可與它們所鍵合的氮原子成為一體而形成非芳香環(huán),前述非芳香環(huán)任選地具有除前述氮原子以外的氮原子、氧原子或硫原子,且任選地具有取代基;和

r2c為氫原子、吸電子基團(tuán)或任意的取代基,且可任選地被吸電子基團(tuán)[d2]取代。

發(fā)明的效果

若根據(jù)本發(fā)明的配糖體化合物、硫醚的制造方法、醚、醚的制造方法、配糖體化合物的制造方法,則可提供一種可以低成本制造并可高收率且高純度制造核酸的亞磷酰胺。此外,若按照本發(fā)明的核酸制造方法,則可使用前述亞磷酰胺而高收率且高純度地制造核酸。

附圖說明

圖1為實施例6所制得的核酸(純化前)的hplc圖表。

圖2為實施例6所制得的核酸(純化后)的hplc圖表。

圖3為實施例6所制得的核酸(純化后)的質(zhì)譜圖。

具體實施方式

以下,就本發(fā)明舉例予以詳細(xì)說明。但本發(fā)明并不受到下述說明所局限。

本說明書使用的用語只要未特別提及,即可以該技術(shù)領(lǐng)域一般使用的意義來使用。

若根據(jù)本發(fā)明,舉例來說,可獲得下述[1]~[5]中的1種或多種效果。但這些效果僅供例示而不局限本發(fā)明。

[1]前述化學(xué)式(1)所示的本發(fā)明配糖體化合物中,前述化學(xué)式(2)所示的配糖體化合物(亞磷酰胺)可適于用作核酸的合成原料。前述化學(xué)式(2)所示配糖體化合物(亞磷酰胺)與tom-亞酰胺和ace-亞酰胺等相較下,吸電子基團(tuán)[d1]離磷酸基更遠(yuǎn),[d1]與磷酸基的相互作用較弱。因此,配糖體化合物(2)較tom-亞酰胺和ace-亞酰胺等的常規(guī)亞酰胺更易合成,可在高純度下制得。

[2]由于本發(fā)明的配糖體化合物與常規(guī)的ace-亞酰胺和tom-亞酰胺等相較下可以低成本制造,而適用于醫(yī)藥原料等。

[3]為本發(fā)明配糖體化合物的合成中間產(chǎn)物的前述化學(xué)式(103)所示硫醚及前述化學(xué)式(106)所示的醚通過前述本發(fā)明的制造方法進(jìn)行制造從而可低成本制造。因此,更低成本地制得本發(fā)明的配糖體化合物。

[4]特別地,前述化學(xué)式(103)所示硫醚作為醫(yī)藥品(不限于本發(fā)明的配糖體化合物)的合成中間產(chǎn)物甚為有用。若根據(jù)本發(fā)明的前述第1及第2硫醚制造方法,則可較常規(guī)技術(shù)更高收率且低成本地合成出前述化學(xué)式(103)所示硫醚。

[5]本發(fā)明的核酸制造方法通過使用前述化學(xué)式(2)所示的本發(fā)明配糖體化合物(亞磷酰胺),可高純度且高收率地制造核酸。具體來說,例如也可在與dna合成并駕齊驅(qū)的純度下進(jìn)行rna合成。此外,雖然理由尚未明朗化,但舉例來說,可以想見的是,與ace-亞酰胺和tom-亞酰胺等相較下縮合反應(yīng)(偶聯(lián)反應(yīng))時的位阻較少而導(dǎo)致縮合反應(yīng)(偶聯(lián)反應(yīng))效率提升等。此外,前述化學(xué)式(2)所示的本發(fā)明配糖體化合物也容易進(jìn)行伴隨縮合反應(yīng)(偶聯(lián)反應(yīng))的脫保護(hù)反應(yīng)。

1.配糖體化合物

本發(fā)明的配糖體化合物如前述,為下述化學(xué)式(1)所示配糖體化合物、其對映異構(gòu)體、互變異構(gòu)體、立體異構(gòu)體或者其鹽。

前述化學(xué)式(1)中,b為具有核酸堿基骨架的原子團(tuán),且任選地具有保護(hù)基團(tuán);

r1及r2分別為氫原子或保護(hù)基團(tuán);

或者,r1與r2也可成為一體而形成下述化學(xué)式(r1r2a)或(r1r2b)所示原子團(tuán);

各r1a分別為氫原子、直鏈或支化的烷基、或者直鏈或支化的烷氧基,且可相同也可相異;

r3為下述化學(xué)式(r3)所示的基團(tuán):

前述化學(xué)式(r3)中,l1為亞乙基(-ch2ch2-),但除鍵合到相對于[d1]的α位的1個氫原子以外,其它氫原子任選地被直鏈或支化的烷基取代;

n為正整數(shù);

[d1]為吸電子基團(tuán)。注意,“鍵合到相對于[d1]的α位”意指:鍵合到與[d1]所鍵合的碳原子相同的碳原子。

前述化學(xué)式(1)中,吸電子基團(tuán)[d1]優(yōu)選為氰基、硝基、烷磺?;Ⅺu素、芳磺?;⑷u甲基或三烷氨基。前述三鹵甲基可列舉如三氯甲基或三氟甲基等。此外,前述化學(xué)式(1)中,l1中的前述直鏈或支化的烷基例如可為碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基。l1特別優(yōu)選為未取代的亞乙基(-ch2ch2-)。此外,前述化學(xué)式(1)中,n并未特別受限,但舉例來說在1~30的范圍,且優(yōu)選在1~20的范圍。

前述化學(xué)式(1)中,r1如前述為氫原子或保護(hù)基團(tuán)。保護(hù)基團(tuán)r1并未特別受限,但舉例來說,為下述化學(xué)式(r1a)、(r1b)、(r1c)及(r1d)中任一者所表示的取代基。

前述化學(xué)式(r1a)中,r11~r13分別為直鏈或支化的烷氧基、直鏈或支化的烷基或者不存在,且可相同也可相異;

r11~r13各自存在時,可為1個或者多個,且有多個時可相同也可相異;

前述化學(xué)式(r1b)中,r14~r16分別為氫原子、直鏈或支化的烷基、或者直鏈或支化的烷氧基,且可相同也可相異;

前述化學(xué)式(r1c)中,r17~r19分別為氫原子,鹵素,烴基,直鏈或支化的烷基,直鏈或支化的烯基,直鏈或支化的炔基,直鏈或支化的鹵烷基,芳基,雜芳基,直鏈或支化的芳烷基,環(huán)烷基,環(huán)烯基,直鏈或支化的環(huán)烷基烷基,直鏈或支化的環(huán)基烷基,直鏈或支化的羥烷基,直鏈或支化的烷氧基烷基,直鏈或支化的氨烷基,直鏈或支化的雜環(huán)基烯基,直鏈或支化的雜環(huán)基烷基,直鏈或支化的雜芳烷基,甲硅烷基,甲硅氧基烷基(silyloxyalkylgroup),單烷基甲硅烷基、二烷基甲硅烷基或三烷基甲硅烷基,或者單烷基甲硅氧基烷基、二烷基甲硅氧基烷基或三烷基甲硅氧基烷基,且可相同也可相異;

前述化學(xué)式(r1d)中,r20~r22分別為氫原子或者直鏈或支化的烷基,且可相同也可相異。

前述化學(xué)式(r1a)中,r11~r13優(yōu)選分別為碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷氧基、碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基或者不存在,且可相同也可相異。r11~r13如前述,各自存在時可為1個也可為多個,且有多個時可相同也可相異。前述化學(xué)式(r1b)中,r14~r16優(yōu)選分別為氫原子、碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基或者碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷氧基,且可相同也可相異。前述化學(xué)式(r1c)中,r17~r19優(yōu)選分別為氫原子,鹵素,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基,碳數(shù)2~12的直鏈或支化的烯基,碳數(shù)2~12的直鏈或支化的炔基,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的鹵烷基,碳數(shù)5~24的芳基,碳數(shù)5~24的雜芳基,碳數(shù)6~30的直鏈或支化的芳烷基,碳數(shù)3~24的環(huán)烷基,碳數(shù)3~24的環(huán)烯基,碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)烷基烷基,碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)基烷基,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的羥烷基,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷氧基烷基,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的氨烷基,碳數(shù)5~30的直鏈或支化的雜環(huán)基烯基,碳數(shù)4~30的直鏈或支化的雜環(huán)基烷基,碳數(shù)6~30的直鏈或支化的雜芳烷基,甲硅烷基,碳數(shù)1~12的甲硅氧基烷基,烷基碳數(shù)1~12的單烷甲硅烷基、二烷甲硅烷基或三烷甲硅烷基,或者被烷基碳數(shù)1~12的單烷基甲硅烷氧基、二烷基甲硅烷氧基或三烷基甲硅烷氧基取代的碳數(shù)1~12的烷基,且可相同也可相異。前述化學(xué)式(r1d)中,r20~r22優(yōu)選分別為氫原子或碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基,且可相同也可相異。

本發(fā)明的配糖體化合物中,前述化學(xué)式(r1a)所示的取代基優(yōu)選為下述化學(xué)式(r1a2)所示的取代基。

前述化學(xué)式(r1a2)中,r11~r13分別為氫原子、直鏈或支化的烷氧基、或者直鏈或支化的烷基,且可相同也可相異。

前述化學(xué)式(r1a2)中,r11~r13更優(yōu)選分別為氫原子、碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷氧基或者碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基,且可相同也可相異。

本發(fā)明的配糖體化合物中,前述化學(xué)式(1)中,r1更優(yōu)選為氫原子或者下述化學(xué)式(r1aa)、(r1ba)、(r1ca)、(r1cb)或(r1da)所示的取代基。

此外,本發(fā)明的配糖體化合物中的前述化學(xué)式(r1r2a)及(r1r2b)中,各r1a如前述,分別為氫原子、直鏈或支化的烷基、或者直鏈或支化的烷氧基,且可相同也可相異。前述直鏈或支化的烷基更優(yōu)選為碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基。前述直鏈或支化的烷氧基更優(yōu)選為碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷氧基。

本發(fā)明的配糖體化合物中,前述化學(xué)式(1)所示配糖體化合物優(yōu)選為下述化學(xué)式(2)所示的配糖體化合物。

前述化學(xué)式(2)中,b、r1及r3與前述化學(xué)式(1)中的定義相同,條件是r1為保護(hù)基團(tuán),r2a及r2b分別為氫原子或任意的取代基,且可相同也可相異;

或者,r2a及r2b也可與它們所鍵合的氮原子成為一體而形成非芳香環(huán),前述非芳香環(huán)任選地具有除前述氮原子以外的氮原子、氧原子或硫原子,且任選地具有取代基;

r2c為氫原子、吸電子基團(tuán)或任意的取代基,且可任選地被吸電子基團(tuán)[d2]取代。

前述化學(xué)式(2)中,r2a及r2b分別為氫原子,鹵素,烴基,直鏈或支化的烷基,直鏈或支化的烯基,直鏈或支化的炔基,直鏈或支化的鹵烷基,芳基,雜芳基,直鏈或支化的芳烷基,環(huán)烷基,環(huán)烯基,直鏈或支化的環(huán)烷基烷基,直鏈或支化的環(huán)基烷基,直鏈或支化的羥烷基,直鏈或支化的烷氧基烷基,直鏈或支化的氨烷基,直鏈或支化的雜環(huán)基烯基,直鏈或支化的雜環(huán)基烷基,直鏈或支化的雜芳烷基,甲硅烷基,甲硅氧基烷基,單烷基甲硅烷基、二烷基甲硅烷基或三烷基甲硅烷基,或者單烷基甲硅氧基烷基、二烷基甲硅氧基烷基或三烷基甲硅氧基烷基,且優(yōu)選任選地進(jìn)一步被或未被吸電子基團(tuán)取代。此外,r2a及r2b也可與它們所鍵合的氮原子成為一體而形成5或6元的非芳香環(huán),其中前述非芳香環(huán)可具有或不具有除前述氮原子以外的氮原子、氧原子或硫原子,也可進(jìn)一步具有或不具有取代基。

前述化學(xué)式(2)中,r2a及r2b更優(yōu)選分別為氫原子,鹵素,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基,碳數(shù)2~12的直鏈或支化的烯基,碳數(shù)2~12的直鏈或支化的炔基,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的鹵烷基,碳數(shù)5~24的芳基,碳數(shù)5~24的雜芳基,碳數(shù)6~30的直鏈或支化的芳烷基,碳數(shù)3~24的環(huán)烷基,碳數(shù)3~24的環(huán)烯基,碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)烷基烷基,碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)基烷基,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的羥烷基,碳數(shù)2~12的直鏈或支化的烷氧基烷基,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的氨烷基,碳數(shù)5~30的直鏈或支化的雜環(huán)基烯基,碳數(shù)4~30的直鏈或支化的雜環(huán)基烷基,碳數(shù)6~30的直鏈或支化的雜芳烷基,甲硅烷基,碳數(shù)1~12的甲硅氧基烷基,烷基碳數(shù)1~12的單烷基甲硅烷基、二烷基甲硅烷基或三烷基甲硅烷基,或者被烷基碳數(shù)1~12的單烷基甲硅烷氧基、二烷基甲硅烷氧基或三烷基甲硅烷氧基取代的碳數(shù)1~12的烷基,且可進(jìn)一步被或未被吸電子基團(tuán)取代。此外,r2a及r2b也可與它們所鍵合的氮原子成為一體而形成5或6元的非芳香環(huán)。前述非芳香環(huán)可具有或不具有除前述氮原子以外的氮原子、氧原子或硫原子,且可進(jìn)一步具有或不具有取代基。

前述化學(xué)式(2)中,r2a及r2b更優(yōu)選分別為甲基、乙基、異丙基或叔丁基,或者r2a及r2b與它們所鍵合的氮原子成為一體而形成哌啶基、嗎啉基、吡咯烷基、硫代嗎啉基或其它的含氮脂環(huán)基。更具體舉例來說,前述化學(xué)式(2)中,-nr2ar2b更優(yōu)選為二異丙基氨基、二乙基氨基、乙基甲基氨基、吡咯烷基(特別是吡咯烷-1-基)、哌啶基(特別是哌啶-1-基)、嗎啉基(特別是嗎啉-1-基)、硫代嗎啉基(特別是硫代嗎啉-1-基)或者芳氨基。

前述化學(xué)式(2)中,r2c優(yōu)選為氫原子,鹵素,烴基,直鏈或支化的烷基,直鏈或支化的烯基,直鏈或支化的炔基,直鏈或支化的鹵烷基,芳基,雜芳基,直鏈或支化的芳烷基,環(huán)烷基,環(huán)烯基,直鏈或支化的環(huán)烷基烷基,直鏈或支化的環(huán)基烷基,直鏈或支化的羥烷基,直鏈或支化的烷氧基烷基,直鏈或支化的氨烷基,直鏈或支化的雜環(huán)基烯基,直鏈或支化的雜環(huán)基烷基,直鏈或支化的雜芳烷基,甲硅烷基,甲硅氧基烷基,單烷基甲硅烷基、二烷基甲硅烷基或三烷基甲硅烷基,或者單烷基甲硅氧基烷基、二烷基甲硅氧基烷基或三烷基甲硅氧基烷基,且進(jìn)一步優(yōu)選可被或未被吸電子基團(tuán)[d2]取代。

前述化學(xué)式(2)中,r2c為氫原子,鹵素,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基,碳數(shù)2~12的直鏈或支化的烯基,碳數(shù)2~12的直鏈或支化的炔基,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的鹵烷基,碳數(shù)5~24的芳基,碳數(shù)5~24的雜芳基,碳數(shù)6~30的直鏈或支化的芳烷基,碳數(shù)3~24的環(huán)烷基,碳數(shù)3~24的環(huán)烯基,碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)烷基烷基,碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)基烷基,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的羥烷基,碳數(shù)2~12的直鏈或支化的烷氧基烷基,碳數(shù)1~12的直鏈或支化的氨烷基,碳數(shù)6~30的直鏈或支化的雜環(huán)基烯基,碳數(shù)4~30的直鏈或支化的雜環(huán)基烷基,碳數(shù)6~30的直鏈或支化的雜芳烷基,甲硅烷基,碳數(shù)1~12的甲硅氧基烷基,烷基碳數(shù)1~12的單烷基甲硅烷基、二烷基甲硅烷基或三烷基甲硅烷基,被烷基碳數(shù)1~12的單烷基甲硅烷氧基、二烷基甲硅烷氧基或三烷基甲硅烷氧基取代的碳數(shù)1~12的烷基,且更優(yōu)選進(jìn)一步可被或未被吸電子基團(tuán)[d2]取代。

前述化學(xué)式(2)中,r2c更優(yōu)選為被吸電子基團(tuán)[d2]取代的直鏈或支化的烷基。前述化學(xué)式(2)中,r2c更優(yōu)選為被吸電子基團(tuán)[d2]取代的碳數(shù)1至12的直鏈或支化的烷基。

前述化學(xué)式(2)中,就r2c而言,前述吸電子基團(tuán)[d2]優(yōu)選為氰基、硝基、烷磺?;?、鹵素、芳磺酰基、三鹵甲基或三烷氨基。前述三鹵甲基可列舉如三氯甲基或三氟甲基等。

前述化學(xué)式(2)中,r2c特別優(yōu)選為烯基或乙炔基,或者與[d2]共同形成被吸電子基團(tuán)[d2]取代的氰乙基。

本發(fā)明的配糖體化合物中,前述化學(xué)式(1)所示的配糖體化合物更優(yōu)選為下述化學(xué)式(3)所示的配糖體化合物。

前述化學(xué)式(3)中,b及n為與前述化學(xué)式(1)中的定義相同,dmtr為4,4’-二甲氧基(三苯基甲基)。

本發(fā)明的配糖體化合物中,前述化學(xué)式(1)中,b的核酸堿基并未特別受限,但優(yōu)選為具有天然核酸堿基骨架的原子團(tuán)。前述天然核酸堿基可具有也可不具有保護(hù)基團(tuán)。前述天然核酸堿基更優(yōu)選為腺嘌呤、胞嘧啶、鳥嘌呤、尿嘧啶、胸腺嘧啶或其它含氮芳香環(huán)。前述化學(xué)式(1)中,b更優(yōu)選在腺嘌呤9位的氮、胞嘧啶1位的氮、鳥嘌呤9位的氮、尿嘧啶1位的氮或胸腺嘧啶1位的氮處與前述化學(xué)式(1)中的d-核糖骨架鍵合。此外,b的核酸堿基也可為被任意的取代基取代的核酸堿基(例如,前述的腺嘌呤、胞嘧啶、鳥嘌呤、尿嘧啶及胸腺嘧啶等的核酸堿基),也可未被取代。前述取代基可列舉如鹵素、?;?、烷基、芳烷基、烷氧基、烷氧基烷基、羥基、氨基、單烷氨基、二烷氨基、羧基、氰基及硝基等。所述取代基可為0個、1個或多個(例如2~3個),且在有多個時,可為單一種類或為多種類。

此外,b為如前述,可具有或不具有保護(hù)基團(tuán)。例如,b的前述核酸堿基在環(huán)外具有氨基(氨基取代基)時(例如前述核酸堿基為腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶等時),前述氨基也可受到保護(hù)基團(tuán)保護(hù)。前述氨基的保護(hù)基團(tuán)并未特別受限,例如也可與已知的核酸化學(xué)所用的保護(hù)基團(tuán)等相同。前述氨基的保護(hù)基團(tuán)可例舉如?;G笆鲺;膳e例如苯甲?;?、4-甲氧基苯甲?;?、乙?;⒈;⒍□;?、異丁?;?、苯基乙?;⒈窖趸阴;?、4-叔丁基苯氧基乙?;?-異丙基苯氧基乙酰基等。此外,除酰基以外,還可舉例如(二甲氨基)亞甲基等。

本發(fā)明的配糖體化合物中,前述化學(xué)式(1)所示的配糖體化合物更優(yōu)選為下述化學(xué)式(1aac)、(1cac)、(1gpac)或(1u)所示的配糖體化合物。

前述化學(xué)式(1aac)、(1cac)、(1gpac)及(1u)中,n與前述化學(xué)式(1)中的定義相同。

前述化學(xué)式(1)中,從合成的容易性等觀點來看,特別優(yōu)選n=1。

此外,諸如本發(fā)明的配糖體化合物和醚等的由本發(fā)明所提供的新穎化合物(以下,有時僅稱為“本發(fā)明的化合物”)存有對映異構(gòu)體、互變異構(gòu)體或立體異構(gòu)體(例如:幾何異構(gòu)體、構(gòu)象異構(gòu)體及光學(xué)異構(gòu)體)等的異構(gòu)體時,所有異構(gòu)體均含括在本發(fā)明的化合物中。例如,表示本發(fā)明的配糖體化合物的化學(xué)式(前述化學(xué)式(1)、(2)及(3)等)為以配糖體的糖骨架為d-核糖的型態(tài)來描繪表示,但也可為其對映異構(gòu)體(即l-核糖)。此外,本發(fā)明的化合物在可能形成鹽的情況下,其鹽也含括在本發(fā)明的化合物內(nèi)。前述本發(fā)明的化合物的鹽可為酸加成鹽,也可為堿加成鹽。再者,形成前述酸加成鹽的酸可為無機(jī)酸也可為有機(jī)酸,形成前述堿加成鹽的堿可為無機(jī)堿也可為有機(jī)堿。前述無機(jī)酸并未特別受限,但可舉例如硫酸、磷酸、氫氟酸、鹽酸、氫溴酸、氫碘酸、次氟酸、次氯酸、次溴酸、次碘酸、亞氟酸(fluorousacid)、亞氯酸、亞溴酸、亞碘酸、氟酸(fluorineacid)、氯酸、溴酸、碘酸、過氟酸、過氯酸、過溴酸及過碘酸等。前述有機(jī)酸并未特別受限,但可舉例如對甲苯磺酸、甲磺酸、草酸、對溴苯磺酸、碳酸、琥珀酸、檸檬酸、苯甲酸及乙酸等。前述無機(jī)堿并未特別受限,但可舉例如氫氧化銨、堿金屬氫氧化物、堿土金屬氫氧化物、碳酸鹽及碳酸氫鹽等,更具體來說,則可舉例如氫氧化鈉、氫氧化鉀、碳酸鉀、碳酸鈉、碳酸氫鈉、碳酸氫鉀、氫氧化鈣及碳酸鈣等。前述有機(jī)堿也未特別受限,但可舉例如乙醇胺、三乙胺及三(羥甲基)氨基甲烷等。所述鹽的制造方法也未特別受限,舉例來說,可以通過下述方法進(jìn)行制造:利用已知方法使諸如前述的酸或堿適當(dāng)附加到前述電子供體-受體連結(jié)分子等。此外,取代基等存有異構(gòu)體時可為任何異構(gòu)體,例如:在“萘基”的情況下,可為1-萘基也可為2-萘基;在“丙基”的情況下,可為正丙基也可為異丙基。

于本發(fā)明中,舉例來說,“烷基”包含直鏈狀或支化的烷基。前述烷基的碳數(shù)并未特別受限,舉例來說為1~30,且優(yōu)選為1~12、1~6或1~4。前述烷基可舉例如甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、仲丁基和叔丁基、戊基、己基、庚基、辛基、壬基、癸基、十一烷基、十二烷基、十三烷基、十四烷基、十五烷基、十六烷基、十七烷基、十八烷基、十九烷基及二十烷基等。且優(yōu)選舉例如甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基、異戊基、新戊基、正己基及異己基等。在結(jié)構(gòu)中含有烷基的基團(tuán)(烷氨基、烷氧基等)或衍生自烷基的基團(tuán)(鹵烷基、羥烷基、氨烷基、烷?;?也同樣適用。

于本發(fā)明中,舉例來說,“烯基”包含直鏈狀或支化的的烯基。前述烯基可舉例如前述烷基中具有1個或多個雙鍵。前述烯基的碳數(shù)并未特別受限,舉例來說與前述烷基相同,且優(yōu)選為2~12或2~8。前述烯基舉例如乙烯基、1-丙烯基、2-丙烯基、1-丁烯基、2-丁烯基、3-丁烯基、1,3-丁二烯基及3-甲基-2-丁烯基等。

于本發(fā)明中,舉例來說,“炔基”包含直鏈狀或支化的的炔基。前述炔基可舉例如前述烷基中具有1個或多個三鍵等。前述炔基的碳數(shù)并未特別受限,例如與前述烷基相同,且優(yōu)選為2~12或2~8。前述炔基可舉例如乙炔基、丙炔基及丁炔基等。舉例來說,前述炔基也可更具有1個或多個雙鍵。

于本發(fā)明中,舉例來說,“芳基”包含單環(huán)芳香族烴基及多環(huán)芳香族烴基。前述單環(huán)芳香族烴基可舉例如苯基等。前述多環(huán)芳香族烴基可舉例如1-萘基、2-萘基、1-蒽基、2-蒽基、9-蒽基、1-菲基、2-菲基、3-菲基、4-菲基及9-菲基等。優(yōu)選舉例如苯基、1-萘基及2-萘基等的萘基等。

于本發(fā)明中,舉例來說,“雜芳基”包含單環(huán)芳香族雜環(huán)基及稠合芳香族雜環(huán)基。前述雜芳基可舉例如呋喃基(例如:2-呋喃基、3-呋喃基)、噻吩基(例如:2-噻吩基、3-噻吩基)、吡咯基(例如:1-吡咯基、2-吡咯基、3-吡咯基)、咪唑基(例如:1-咪唑基、2-咪唑基、4-咪唑基)、吡唑基(例如:1-吡唑基、3-吡唑基、4-吡唑基)、三唑基(例如:1,2,4-三唑-1-基、1,2,4-三唑-3-基、1,2,4-三唑-4-基)、四唑基(例如:1-四唑基、2-四唑基、5-四唑基)、噁唑基(例如:2-噁唑基、4-噁唑基、5-噁唑基)、異噁唑基(例如:3-異噁唑基、4-異噁唑基、5-異噁唑基)、噻唑基(例如:2-噻唑基、4-噻唑基、5-噻唑基)、噻二唑基、異噻唑基(例如:3-異噻唑基、4-異噻唑基、5-異噻唑基)、吡啶基(例如:2-吡啶基、3-吡啶基、4-吡啶基)、噠嗪基(例如:3-噠嗪基、4-噠嗪基)、嘧啶基(例如:2-嘧啶基、4-嘧啶基、5-嘧啶基)、呋咕基(furazanyl)(例如:3-呋咕基)、吡嗪基(例如:2-吡嗪基)、噁二唑基(例如:1,3,4-噁二唑-2-基)、苯并呋喃基(例如:2-苯并[b]呋喃基、3-苯并[b]呋喃基、4-苯并[b]呋喃基、5-苯并[b]呋喃基、6-苯并[b]呋喃基、7-苯并[b]呋喃基)、苯并噻吩基(例如:2-苯并[b]噻吩基、3-苯并[b]噻吩基、4-苯并[b]噻吩基、5-苯并[b]噻吩基、6-苯并[b]噻吩基、7-苯并[b]噻吩基)、苯并咪唑基(例如:1-苯并咪唑基、2-苯并咪唑基、4-苯并咪唑基、5-苯并咪唑基)、二苯并呋喃基、苯并噁唑基、苯并噻唑基、喹喔啉基(例如:2-喹喔啉基、5-喹喔啉基、6-喹喔啉基)、噌啉基(例如:3-噌啉基、4-噌啉基、5-噌啉基、6-噌啉基、7-噌啉基、8-噌啉基)、喹唑啉基(例如:2-喹唑啉基、4-喹唑啉基、5-喹唑啉基、6-喹唑啉基、7-喹唑啉基、8-喹唑啉基)、喹啉基(例如:2-喹啉基、3-喹啉基、4-喹啉基、5-喹啉基、6-喹啉基、7-喹啉基、8-喹啉基)、酞嗪基(例如:1-酞嗪基、5-酞嗪基、6-酞嗪基)、異喹啉基(例如:1-異喹啉基、3-異喹啉基、4-異喹啉基、5-異喹啉基、6-異喹啉基、7-異喹啉基、8-異喹啉基)、嘌呤基(puryl)、喋啶基(例如:2-喋啶基、4-喋啶基、6-喋啶基、7-喋啶基)、咔唑基、菲啶基、吖啶基(例如:1-吖啶基、2-吖啶基、3-吖啶基、4-吖啶基、9-吖啶基)、吲哚基(例如:1-吲哚基、2-吲哚基、3-吲哚基、4-吲哚基、5-吲哚基、6-吲哚基、7-吲哚基)、異吲哚基、吩嗪基(例如:1-吩嗪基、2-吩嗪基)或吩噻嗪基(例如:1-吩噻嗪基、2-吩噻嗪基、3-吩噻嗪基、4-吩噻嗪基)等。

于本發(fā)明中,舉例來說,“環(huán)烷基”為環(huán)狀飽和烴基,碳數(shù)并未特別受限,但舉例來說為3~24或3~15。前述環(huán)烷基可舉例如環(huán)丙基、環(huán)丁基、環(huán)戊基、環(huán)己基、環(huán)庚基、環(huán)辛基、橋環(huán)烴基(bridgedcyclichydrocarbongroup)及螺環(huán)烴基等,且優(yōu)選為環(huán)丙基、環(huán)丁基、環(huán)戊基、環(huán)己基及橋環(huán)烴基等。

于本發(fā)明中,“橋環(huán)烴基”可舉例如雙環(huán)[2.1.0]戊基、雙環(huán)[2.2.1]庚基、雙環(huán)[2.2.2]辛基及雙環(huán)[3.2.1]辛基、三環(huán)[2.2.1.0]庚基、雙環(huán)[3.3.1]壬烷、1-金剛烷基或2-金剛烷基等。

于本發(fā)明中,“螺環(huán)烴基”可舉例如螺[3.4]辛基等。

于本發(fā)明中,舉例來說,“環(huán)烯基”包含環(huán)狀不飽和脂肪族烴基,碳數(shù)則例如為3~24或3~7。前述的基團(tuán)可舉例如環(huán)丙烯基、環(huán)丁烯基、環(huán)戊烯基、環(huán)己烯基及環(huán)庚烯基等,且優(yōu)選為環(huán)丙烯基、環(huán)丁烯基、環(huán)戊烯基及環(huán)己烯基等。舉例來說,前述環(huán)烯基包含環(huán)中具有不飽和鍵的橋環(huán)烴基及螺環(huán)烴基。

于本發(fā)明中,“芳烷基”可舉例如芐基、2-苯乙基及萘基甲基等,“環(huán)烷基烷基”或“環(huán)基烷基”則可舉例如環(huán)己基甲基或金剛烷基甲基等,“羥烷基”則可舉例如羥甲基或2-羥乙基等。

于本發(fā)明中,舉例來說,“烷氧基”包含前述烷基-o-基,可舉例如甲氧基、乙氧基、正丙氧基、異丙氧基及正丁氧基等,“烷氧基烷基”可舉例如甲氧基甲基等,“氨烷基”可舉例如2-氨基乙基等。

于本發(fā)明中,“環(huán)基”為任意的環(huán)狀原子團(tuán),且優(yōu)選為非芳香族的飽和或不飽和環(huán)狀取代基。其碳數(shù)并未特別受限,但例如為3~24。

于本發(fā)明中,“雜環(huán)基”可舉例如1-吡咯啉基、2-吡咯啉基、3-吡咯啉基、1-吡咯烷基、2-吡咯烷基、3-吡咯烷基、吡咯烷酮、1-咪唑啉基、2-咪唑啉基、4-咪唑啉基、1-咪唑烷基、2-咪唑烷基、4-咪唑烷基、咪唑烷酮、1-吡唑啉基、3-吡唑啉基、4-吡唑啉基、1-吡唑烷基、3-吡唑烷基、4-吡唑烷基、哌啶酮、哌啶子基、2-哌啶基、3-哌啶基、4-哌啶基、1-哌嗪基、2-哌嗪基、哌嗪酮、2-嗎啉基、3-嗎啉基、嗎啉代、四氫吡喃基或四氫呋喃基等。

于本發(fā)明中,“雜環(huán)基烷基”可舉例如哌啶基甲基、哌嗪基甲基等,“雜環(huán)基烯基”可舉例如2-哌啶基乙烯基等,“雜芳烷基”可舉例如吡啶基甲基及喹啉-3-基甲基等。

于本發(fā)明中,“甲硅烷基”包含式r3si-所示的基團(tuán),其中r可獨立選自前述烷基、芳基及環(huán)烷基,可舉例如三甲基甲硅烷基及叔丁基二甲基甲硅烷基等,“甲硅烷氧基”可舉例如三甲基甲硅烷氧基等,“甲硅氧基烷基”則可舉例如三甲基甲硅烷氧基甲基等。

于本發(fā)明中,“亞烷基”可舉例如亞甲基、亞乙基或亞丙基等。

于本發(fā)明中,“酰基”并未特別受限,但可舉例如甲酰基、乙?;?、丙酰基、異丁酰基、戊?;?、異戊?;?、三甲基乙?;?、己?;?、環(huán)己?;?、苯甲?;鸵已豸驶取>徒Y(jié)構(gòu)中含有?;幕鶊F(tuán)(酰氧基、烷酰氧基等)而言也同樣適用。此外,本發(fā)明中,?;奶紨?shù)包含羰基的碳,舉例來說,碳數(shù)1的烷?;??;?為指甲?;?。

于本發(fā)明中,“鹵素”為指任意的鹵元素,可舉例如氟、氯、溴或碘。

于本發(fā)明中,“全氟烷基”并未特別受限,但可舉例如衍生自碳數(shù)1~30的直鏈或支化的烷基的全氟烷基。前述“全氟烷基”可更具體舉例如衍生自甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、異丁基、仲丁基及叔丁基、戊基、己基、庚基、辛基、壬基、癸基、十一烷基、十二烷基、十三烷基、十四烷基、十五烷基、十六烷基、十七烷基、十八烷基、十九烷基及二十烷基等基團(tuán)的全氟烷基。就結(jié)構(gòu)中含有全氟烷基的基團(tuán)(全氟烷磺酰基、全氟?;?而言也同樣適用。

于本發(fā)明中,前述各種基團(tuán)任選地被取代。前述取代基可舉例如羥基、羧基、鹵素、鹵化烷基(例如:cf3、ch2cf3、ch2ccl3)、硝基、亞硝基、氰基、烷基(例如:甲基、乙基、異丙基、叔丁基)、烯基(例如:乙烯基)、炔基(例如:乙炔基)、環(huán)烷基(例如:環(huán)丙基、金剛烷基)、環(huán)烷基烷基(例如:環(huán)己基甲基、金剛烷基甲基)、環(huán)烯基(例如:環(huán)丙烯基)、芳基(例如:苯基、萘基)、芳烷基(例如:芐基、苯乙基)、雜芳基(例如:吡啶基、呋喃基)、雜芳烷基(例如:吡啶基甲基)、雜環(huán)基(例如:哌啶基)、雜環(huán)基烷基(例如:嗎啉甲基)、烷氧基(例如:甲氧基、乙氧基、丙氧基、丁氧基)、鹵化烷氧基(例如:ocf3)、烯氧基(例如:乙烯氧基、烯丙氧基)、芳氧基(例如:苯氧基)、烷氧羰基(例如:甲氧羰基、乙氧羰基、叔丁氧羰基)、芳烷氧基(例如:芐氧基)、氨基[烷氨基(例如:甲氨基、乙氨基、二甲氨基)、?;被?例如:乙酰氨基、苯甲酰氨基)、芳烷氨基(例如:芐氨基、三苯甲基氨基)、羥氨基]、烷氨基烷基(例如:二乙氨基甲基)、氨磺?;约把醮?oxo)等。

此外,于本發(fā)明中,前述各種基團(tuán)為雜環(huán)或含有雜環(huán)時,“碳數(shù)”還包含構(gòu)成前述雜環(huán)的雜原子數(shù)。

2.硫醚的制造方法

于本發(fā)明中,第1硫醚制造方法如前所述,為一種制造下述化學(xué)式(103)所示硫醚的方法,其為使下述化學(xué)式(101a)及(101b)所示硫醇或硫代烷氧化物與下述化學(xué)式(102)所示鹵化物進(jìn)行偶聯(lián)反應(yīng),以制造下述化學(xué)式(103)所示硫醚。

前述化學(xué)式(101a)、(101b)及(103)中,r4及r5分別為烴基、直鏈或支化的烷基、直鏈或支化的烯基、直鏈或支化的炔基、芳基、直鏈或支化的芳烷基、環(huán)烷基、環(huán)烯基、直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、直鏈或支化的環(huán)基烷基、或者直鏈或支化的烷氧基烷基,且可相同也可相異;

前述化學(xué)式(101a)及(101b)中,m1及m2分別為氫原子或金屬,且可相同也可相異;

前述化學(xué)式(102)及(103)中,n為正整數(shù);

前述化學(xué)式(102)中,x1及x2分別為鹵素,且可相同也可相異。

舉例來說,前述化學(xué)式(103)所示的硫醚化合物可用作醫(yī)藥品合成的有用中間產(chǎn)物。在常規(guī)的合成法中,硫醚化合物(103)僅能以低收率制得。然而,本發(fā)明人找出可高效率將其合成的方法,終至于發(fā)明出本發(fā)明的第1及第2硫醚制造方法。若根據(jù)本發(fā)明的硫醚制造方法,舉例來說,可如后述實施例1所示,以相對于鹵化物(102)為70%以上的高收率制得硫醚化合物(103)。

前述化學(xué)式(101a)、(101b)及(103)中,r4及r5分別為碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基、碳數(shù)2~12的直鏈或支化的烯基、碳數(shù)2~12的直鏈或支化的炔基、碳數(shù)5~24的芳基、碳數(shù)6~30的直鏈或支化的芳烷基、碳數(shù)3~24的環(huán)烷基、碳數(shù)3~24的環(huán)烯基、碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)基烷基、或碳數(shù)2~30的直鏈或支化的烷氧基烷基,且可相同也可相異。另外,前述化學(xué)式(101a)、(101b)及(103)中,r4及r5特別優(yōu)選為甲基。

m1及m2也未特別受限,但可舉例如氫原子、堿金屬、堿土金屬及過渡金屬等,且優(yōu)選為氫原子、鈉、鉀、鈣、鎂、鋁、鋅、鐵、銅、釔或鉍。m1及m2為金屬時,其價數(shù)任意。另外,m1及m2的原子數(shù)在前述化學(xué)式(101a)及(101b)中與硫醇的分子數(shù)以1:1表示,但并不限于此。舉例來說,m1或m2為x價(x為正整數(shù))的金屬離子,m1或m2的原子數(shù)相對于前述化學(xué)式(101a)或(101b)中的硫醇分子數(shù)可為1/x。此外,(101a)及(101b)所示的硫代烷氧化物也可各自相異,但若相同則(103)的合成簡便,較為理想。

前述化學(xué)式(102)中,n未特別受限,但例如為1~30,且優(yōu)選為1~20。

前述化學(xué)式(101a)及(101b)所示的硫代烷氧化物與前述化學(xué)式(102)所示鹵化物的偶聯(lián)反應(yīng)條件并未特別受限。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)溶劑并未特別受限,但可舉例如:丙酮和甲乙酮等的酮類;二乙醚、thf(四氫呋喃)和二噁烷等的醚類;和乙腈等的腈類等。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)時間并未特別受限,舉例來說為30分鐘~4小時,且優(yōu)選為30分鐘~2小時,更優(yōu)選為30分鐘~1小時。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)溫度并未特別受限,但舉例來說為15~40℃,且優(yōu)選為15~37℃,更優(yōu)選為20~37℃。前述化學(xué)式(101a)及(101b)所示硫代烷氧化物的濃度與前述化學(xué)式(102)所示鹵化物的濃度也未特別受限,可適當(dāng)設(shè)定。前述化學(xué)式(101a)及(101b)所示的硫代烷氧化物與前述化學(xué)式(102)所示鹵化物的物質(zhì)量比也未特別受限,例如可以是化學(xué)計量混合比,也可為其它的任意比。前述化學(xué)式(101a)及(101b)所示硫代烷氧化物的摩爾數(shù)相對于前述化學(xué)式(102)所示鹵化物的摩爾數(shù)舉例來說為1~10倍,且優(yōu)選為2~7倍,更優(yōu)選為3~5倍。舉例來說,前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)條件可參考已知的硫代烷氧化物與鹵化物的偶聯(lián)反應(yīng)等的條件來適當(dāng)設(shè)定,也可參考后述的實施例1來設(shè)定。已知反應(yīng)的參考文獻(xiàn)可列舉如后述實施例1所記載的參考文獻(xiàn)等。

前述偶聯(lián)反應(yīng)可列舉如下述流程1-2的反應(yīng)。下述流程1-2的上段反應(yīng)與后述實施例1的反應(yīng)相同。

前述化學(xué)式(102)所示鹵化物的制造方法也未特別受限。舉例來說,若可能取得前述鹵化物的市售品等,也可將其直接使用。例如,前述流程1-2中的化合物(102-2)已由aurorafinechemicalsllc公司(美國)作市售。舉例來說,前述化合物(102-2)也可依照head,franks.h.,journalofthechemicalsociety,feb.,1012-15,1965的方法合成。此外,舉例來說,也可以氫鹵酸等將低聚甲醛水解來制造前述化學(xué)式(102)所示鹵化物。前述水解反應(yīng)的反應(yīng)溶劑并未特別受限,但舉例來說優(yōu)選為水。此外,舉例而言,也可進(jìn)一步對濃厚的前述氫鹵酸水溶液加入鹵化磺酸等,在體系中進(jìn)行前述水解反應(yīng)。前述水解反應(yīng)時間并未特別受限,例如為1~24小時,且優(yōu)選為1~12小時,更優(yōu)選為2~6小時。前述水解反應(yīng)溫度并未特別受限,但例如為-20~35℃,且優(yōu)選為-10~30℃,更優(yōu)選為-5~25℃。各反應(yīng)物質(zhì)的濃度、物質(zhì)量比等也未特別受限,可適當(dāng)予以設(shè)定。前述水解反應(yīng)的反應(yīng)條件舉例來說可參考已知低聚甲醛水解反應(yīng)等的條件來適當(dāng)設(shè)定,也可參考后述實施例1來設(shè)定。例如,前述流程1-2的化合物(102-1)與后述實施例1的化合物(1002)為同一化合物,可依照實施例1來制造。已知反應(yīng)的參考文獻(xiàn)可舉例如后述實施例1所記載的參考文獻(xiàn)等。

其次,本發(fā)明的第2硫醚制造方法如前述般為一種制造下述化學(xué)式(103)所示硫醚的方法,其為使下述化學(xué)式(103b)所示硫醚與下述化學(xué)式(104)所示的醇在鹵化劑及路易斯酸存在下進(jìn)行偶聯(lián)反應(yīng),以制造下述化學(xué)式(103)所示硫醚。

前述化學(xué)式(103b)、(104)及(103)中,r4、r5及r6分別為烴基、直鏈或支化的烷基、直鏈或支化的烯基、直鏈或支化的炔基、芳基、直鏈或支化的芳烷基、環(huán)烷基、環(huán)烯基、直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、直鏈或支化的環(huán)基烷基、或者直鏈或支化的烷氧基烷基,且可相同也可相異;

前述化學(xué)式(103b)及(103)中,n為2以上的整數(shù)。

前述化學(xué)式(103b)、(104)及(103)中,r4、r5及r6分別為碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基、碳數(shù)2~12的直鏈或支化的烯基、碳數(shù)2~12的直鏈或支化的炔基、碳數(shù)5~24的芳基、碳數(shù)6~30的直鏈或支化的芳烷基、碳數(shù)3~24的環(huán)烷基、碳數(shù)3~24的環(huán)烯基、碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)基烷基、或是碳數(shù)6~30的直鏈或支化的烷氧基烷基,且可相同也可相異。前述化學(xué)式(103b)、(104)及(103)中,r4、r5及r6特別優(yōu)選為甲基。

本發(fā)明的第2硫醚制造方法中,前述鹵化劑并未特別受限,但優(yōu)選為選自于由n-氯琥珀酰亞胺、n-溴琥珀酰亞胺、n-碘琥珀酰亞胺、碘、溴及氯所構(gòu)成群組中的至少一種。另外,前述路易斯酸也未特別受限,但優(yōu)選為選自于由全氟烷基羧酸、全氟烷基磺酸、烷基磺酸及其鹽所構(gòu)成群組中的至少一種。前述路易斯酸特別優(yōu)選為三氟甲磺酸的銀鹽。此外,本發(fā)明的第2硫醚制造方法中,優(yōu)選使前述偶聯(lián)反應(yīng)在分子篩共存下進(jìn)行。

本發(fā)明的第2硫醚制造方法中,前述化學(xué)式(103b)所示硫醚與前述化學(xué)式(104)所示的醇的偶聯(lián)反應(yīng)條件并未特別受限。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)溶劑雖未特別受限,但可舉例如:丙酮、甲乙酮及苯乙酮等的酮類;二乙醚、thf(四氫呋喃)及二噁烷等的醚類;和乙腈等的腈類等。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)時間并未特別受限,但舉例來說為1~12小時,且優(yōu)選為1~8小時,更優(yōu)選為1~4小時。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)溫度并未特別受限,舉例來說優(yōu)選為-75~0℃,且優(yōu)選為-60~-10℃,更優(yōu)選為-50~-40℃。前述化學(xué)式(103b)所示硫醚及前述化學(xué)式(104)所示的醇的濃度也未特別受限,可適當(dāng)予以設(shè)定。前述化學(xué)式(103b)所示硫醚及前述化學(xué)式(104)所示的醇的物質(zhì)量比也未特別受限,舉例來說,可為化學(xué)計量混合比,也可為其它任意的比。其它反應(yīng)物質(zhì)的使用量也未特別受限。前述化學(xué)式(103b)所示硫醚的摩爾數(shù)相對于前述化學(xué)式(104)所示的醇的摩爾數(shù)舉例來說為0.5~2倍,且優(yōu)選為0.5~1倍,更優(yōu)選為0.5倍。前述鹵化劑的摩爾數(shù)相對于前述化學(xué)式(104)所示的醇的摩爾數(shù)舉例來說為1~2倍,且優(yōu)選為1~1.5倍,更優(yōu)選為1.2倍。前述路易斯酸的摩爾數(shù)相對于前述化學(xué)式(104)所示的醇的摩爾數(shù)舉例來說優(yōu)選為0.005~0.05倍,且優(yōu)選為0.01~0.025倍,更優(yōu)選為0.015倍。分子篩的使用量雖未特別受限,但相對于前述各反應(yīng)物質(zhì)優(yōu)選過剩使用。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)條件舉例來說也可參考已知的硫醚與醇的偶聯(lián)反應(yīng)等條件來予以適當(dāng)設(shè)定。已知的硫醚與醇的偶聯(lián)反應(yīng)的參考文獻(xiàn)可舉例如eur.pat.appl.(1995),ep639577a1。

本發(fā)明的第2硫醚制造方法中,前述硫醚與醇的偶聯(lián)反應(yīng)例可舉例如下述流程2-2所示反應(yīng)??扇绱艘佬蚴沽蛎训逆滈L延伸。另外,下述流程2-2中,“nis”表示n-碘琥珀酰亞胺,“tfoag”表示三氟甲磺酸的銀鹽,“ms”表示分子篩。舉例來說,化合物(105-1)可參考syntheticcommunications,16(13),1607-10;1986等來進(jìn)行合成,也可取得市售品。

3.醚

接著,如前所述,本發(fā)明的醚為下述化學(xué)式(106)所示的醚、其對映異構(gòu)體、互變異構(gòu)體、立體異構(gòu)體或其鹽。

前述化學(xué)式(106)中,r4為烴基、直鏈或支化的烷基、直鏈或支化的烯基、直鏈或支化的炔基、芳基、直鏈或支化的芳烷基、環(huán)烷基、環(huán)烯基、直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、直鏈或支化的環(huán)基烷基、或者直鏈或支化的烷氧基烷基;

n為正整數(shù);

l1為亞乙基(-ch2ch2-),但除鍵合到相對于[d1]的α位的1個氫原子以外,其它氫原子任選地被直鏈或支化的烷基取代;

[d1]為吸電子基團(tuán)。

前述化學(xué)式(106)中,r4優(yōu)選為碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基、碳數(shù)2~12的直鏈或支化的烯基、碳數(shù)2~12的直鏈或支化的炔基、碳數(shù)5~24的芳基、碳數(shù)6~30的直鏈或支化的芳烷基、碳數(shù)3~24的環(huán)烷基、碳數(shù)3~24的環(huán)烯基、碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)基烷基、或是碳數(shù)2~30的直鏈或支化的烷氧基烷基。前述化學(xué)式(106)中,r4特別優(yōu)選為甲基。

前述化學(xué)式(106)中,就l1而言,舉例來說,前述直鏈或支化的烷基也可為碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基。l1特別優(yōu)選為未取代的亞乙基(-ch2ch2-)。前述化學(xué)式(106)中,[d1]優(yōu)選為氰基、硝基、烷磺酰基、鹵素、硝基、芳磺?;?、三鹵甲基或三烷氨基。前述三鹵甲基可舉例如三氯甲基及三氟甲基等。前述化學(xué)式(106)中,n并未特別受限,但舉例來說為1~30的范圍,且優(yōu)選為1~20的范圍。

前述化學(xué)式(106)所示的本發(fā)明的醚優(yōu)選作為前述本發(fā)明的配糖體化合物的合成中間產(chǎn)物。然而,本發(fā)明的醚不局限于此,也可用于任何用途。

4.醚的制造方法

前述化學(xué)式(106)所示本發(fā)明的醚的制造方法并未特別受限,但優(yōu)選為前述本發(fā)明的醚的制造方法。如前所述,本發(fā)明的醚的制造方法為一種制造前述化學(xué)式(106)所示本發(fā)明的醚的方法,其為使下述化學(xué)式(103)所示硫醚與下述化學(xué)式(105)所示的醇在鹵化劑及路易斯酸存在下進(jìn)行偶聯(lián)反應(yīng),而制出前述化學(xué)式(106)所示的本發(fā)明的醚。

前述化學(xué)式(103)及(105)中,r4與前述化學(xué)式(106)中的定義相同;r5為烴基、直鏈或支化的烷基、直鏈或支化的烯基、直鏈或支化的炔基、芳基、直鏈或支化的芳烷基、環(huán)烷基、環(huán)烯基、直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、直鏈或支化的環(huán)基烷基、或者直鏈或支化的烷氧基烷基,且可與r4相同也可相異;

前述化學(xué)式(103)中,n與前述化學(xué)式(106)中的定義相同;

前述化學(xué)式(105)中,l1及[d1]與前述化學(xué)式(106)中的定義相同。

前述化學(xué)式(103)中,r5為碳數(shù)1~12的直鏈或支化的烷基、碳數(shù)2~12的直鏈或支化的烯基、碳數(shù)2~12的直鏈或支化的炔基、碳數(shù)5~24的芳基、碳數(shù)6~30的直鏈或支化的芳烷基、碳數(shù)3~24的環(huán)烷基、碳數(shù)3~24的環(huán)烯基、碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、碳數(shù)4~30的直鏈或支化的環(huán)基烷基、或碳數(shù)2~30的直鏈或支化的烷氧基烷基,且可相同也可相異。前述化學(xué)式(103)中,r5特別優(yōu)選為甲基。

本發(fā)明的醚的制造方法中,前述鹵化劑并未特別受限,但優(yōu)選為選自于由n-氯琥珀酰亞胺、n-溴琥珀酰亞胺、n-碘琥珀酰亞胺、碘、溴及氯所構(gòu)成群組中的至少一種。前述路易斯酸也未特別受限,但優(yōu)選為選自于由全氟烷基羧酸、全氟烷基磺酸、烷基磺酸及其鹽所構(gòu)成群組中的至少一種。前述路易斯酸特別優(yōu)選為三氟甲磺酸的銀鹽。此外,本發(fā)明的第2硫醚制造方法中,優(yōu)選使前述偶聯(lián)反應(yīng)在分子篩共存下進(jìn)行。

本發(fā)明的醚的制造方法中,前述化學(xué)式(103)所示硫醚與前述化學(xué)式(105)所示的醇的偶聯(lián)反應(yīng)條件并未特別受限。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)溶劑雖未特別受限,但可舉例如:丙酮、甲乙酮及苯乙酮等酮類;二乙醚、thf(四氫呋喃)及二噁烷等醚類;和乙腈等的腈類。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)時間并未特別受限,但舉例來說為1~12小時,且優(yōu)選為1~8小時,更優(yōu)選為1~4小時。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)溫度并未特別受限,但舉例來說為-75~0℃,且優(yōu)選為-60~-10℃,更優(yōu)選為-50~-40℃。前述化學(xué)式(103)所示硫醚及前述化學(xué)式(105)所示的醇的濃度也未特別受限,可適當(dāng)予以設(shè)定。前述化學(xué)式(103)所示硫醚與前述化學(xué)式(105)所示的醇的物質(zhì)量比也未特別受限,舉例來說可為化學(xué)計量混合比,也可為其它任意的比。另外,其它反應(yīng)物質(zhì)的使用量也未特別受限。前述化學(xué)式(103)所示硫醚的摩爾數(shù)相對于前述化學(xué)式(105)所示的醇的摩爾數(shù)可舉例如0.5~2倍,且優(yōu)選為0.5~1倍,更優(yōu)選為0.5倍。前述鹵化劑的摩爾數(shù)相對于前述化學(xué)式(105)所示的醇的摩爾數(shù)例如為1~2倍,且優(yōu)選為1~1.5倍,更優(yōu)選為1.2倍。前述路易斯酸的摩爾數(shù)相對于前述化學(xué)式(105)所示的醇的摩爾數(shù)例如為0.005~0.05倍,且優(yōu)選為0.01~0.025倍,更優(yōu)選為0.015倍。分子篩的使用量未特別受限,但相對于前述各反應(yīng)物質(zhì)優(yōu)選過剩使用。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)條件舉例來說可參考已知的硫醚與醇的偶聯(lián)反應(yīng)等的條件而予以適當(dāng)設(shè)定,也可參照后述實施例1的條件來適當(dāng)設(shè)定。已知的硫醚與醇的偶聯(lián)反應(yīng)的參考文獻(xiàn)可舉例如eur.pat.appl.(1995),ep639577a1。

此外,本發(fā)明的醚的制造方法中,前述化學(xué)式(103)所示硫醚的制造方法并未特別受限,但以前述本發(fā)明的第1或第2硫醚制造方法為優(yōu)選。也即,前述化學(xué)式(106)所示本發(fā)明的醚的制造方法更優(yōu)選包含:利用前述本發(fā)明的第1或第2硫醚制造方法來制造前述化學(xué)式(103)所示硫醚的步驟。

5.配糖體化合物的制造方法

本發(fā)明的配糖體化合物的制造方法并未特別受限,例如,可參考已知的配糖體(ace-亞酰胺等)的制造方法來適當(dāng)進(jìn)行。舉例來說,也可參考currentprotocolsinnucleicacidchemistry,unit2.16.1-2.16.31(2009).所記載的制造方法。

本發(fā)明的配糖體舉例來說優(yōu)選利用前述本發(fā)明的制造方法(配糖體化合物的制造方法)來制造。前述本發(fā)明的制造方法(配糖體化合物的制造方法)為如前述,其包含使下述化學(xué)式(107)所示的配糖體化合物與下述化學(xué)式(106)所示的醚在鹵化劑及路易斯酸存在下進(jìn)行偶聯(lián)反應(yīng)來制造下述化學(xué)式(1a)所示配糖體化合物的偶聯(lián)步驟,且下述化學(xué)式(1a)所示配糖體化合物為前述化學(xué)式(1)中的r1與r2成為一體而形成前述化學(xué)式(r1r2a)或(r1r2b)所示原子團(tuán)的配糖體化合物。

前述化學(xué)式(107)及(1a)中,l2為前述化學(xué)式(r1r2a)或(r1r2b)所示的原子團(tuán),b與前述化學(xué)式(1)中的定義相同;

前述化學(xué)式(106)中,r4為烴基、直鏈或支化的烷基、直鏈或支化的烯基、直鏈或支化的炔基、芳基、直鏈或支化的芳烷基、環(huán)烷基、環(huán)烯基、直鏈或支化的環(huán)烷基烷基、直鏈或支化的環(huán)基烷基、或者直鏈或支化的烷氧基烷基;

前述化學(xué)式(106)及(1a)中,l1、n及[d1]為與前述化學(xué)式(1)中的定義相同。

前述化學(xué)式(107)所示配糖體的取得方法并未特別受限。例如,可取得市售品,也可利用已知方法制造。前述偶聯(lián)反應(yīng)(前述流程4)中,前述鹵化劑并未特別受限,但優(yōu)選為選自于由n-氯琥珀酰亞胺、n-溴琥珀酰亞胺、n-碘琥珀酰亞胺、碘、溴及氯所構(gòu)成群組中的至少一種。另外,前述路易斯酸也未特別受限,但優(yōu)選為選自于由全氟烷基羧酸、全氟烷基磺酸、烷基磺酸及其鹽所構(gòu)成群組中的至少一種。前述路易斯酸特別優(yōu)選為三氟甲磺酸或其鹽。

本發(fā)明的配糖體化合物的制造方法中,前述化學(xué)式(107)所示配糖體化合物與前述化學(xué)式(106)所示的醚的偶聯(lián)反應(yīng)條件并未特別受限。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)溶劑并未特別受限,但可舉例如:丙酮、甲乙酮及苯乙酮等酮類;二乙醚、thf(四氫呋喃)及二噁烷等醚類;和乙腈等的腈類等。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)時間并未特別受限,但可舉例如1~12小時,且優(yōu)選為1~8小時,更優(yōu)選為1~4小時。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)溫度并未特別受限,可舉例如-75~0℃,且優(yōu)選為-60~-10℃,更優(yōu)選為-50~-40℃。前述化學(xué)式(107)所示配糖體化合物及前述化學(xué)式(106)所示的醚的濃度也未特別受限,可適當(dāng)予以設(shè)定。前述化學(xué)式(107)所示配糖體化合物與前述化學(xué)式(106)所示的醚的物質(zhì)量比也未特別受限,例如可為化學(xué)計量混合比,也可為其它任意的比。另外,其它反應(yīng)物質(zhì)的使用量也未特別受限。前述化學(xué)式(107)所示配糖體化合物的摩爾數(shù)相對于前述化學(xué)式(106)所示的醚的摩爾數(shù)可舉例如1~5倍,且優(yōu)選為1~3倍,更優(yōu)選為1~1.5倍。前述鹵化劑的摩爾數(shù)相對于前述化學(xué)式(106)所示的醚的摩爾數(shù)可舉例如1~3倍,且優(yōu)選1~2倍,更優(yōu)選為1~1.5倍。前述路易斯酸的摩爾數(shù)相對于前述化學(xué)式(106)所示的醚的摩爾數(shù)可舉例如0.005~0.05倍,且優(yōu)選為0.01~0.025倍,更優(yōu)選為0.015倍。前述偶聯(lián)反應(yīng)的反應(yīng)條件舉例來說可如前所述,參照已知的配糖體化合物的亞酰胺合成等條件來予以適當(dāng)設(shè)定,也可參考后述實施例2至5中任一者的條件來適當(dāng)設(shè)定。

本發(fā)明的配糖體化合物的制造方法優(yōu)選更含有:脫保護(hù)步驟,其為使前述原子團(tuán)l2從前述化學(xué)式(1a)所示的配糖體化合物脫保護(hù),以制造下述化學(xué)式(1b)所示的配糖體化合物。于此情況下,下述化學(xué)式(1b)所示配糖體化合物為前述化學(xué)式(1)中r1及r2為氫原子的配糖體化合物。

于前述化學(xué)式(1b)中,b、l1、n及[d1]與前述化學(xué)式(1)中的定義相同。

于前述脫保護(hù)步驟中,脫保護(hù)反應(yīng)的條件并未特別受限,但舉例來說可使用已知的脫保護(hù)劑。前述脫保護(hù)劑并未特別受限,但可舉例如氟化氫吡啶、氟化氫三乙胺、氟化銨、氫氟酸、氟化四丁基銨等。前述脫保護(hù)反應(yīng)的反應(yīng)溶劑并未特別受限,但可舉例如:丙酮等的酮類;二乙醚及thf(四氫呋喃)等的醚類;或者甲醇及乙醇等醇類;和乙腈等的腈類等。前述脫保護(hù)反應(yīng)的反應(yīng)時間并未特別受限,但可舉例如30分鐘~24小時,且以2~12小時為優(yōu)選,更優(yōu)選為2~4小時。前述脫保護(hù)反應(yīng)的反應(yīng)溫度并未特別受限,但可舉例如0~100℃,且以20~60℃為優(yōu)選,更優(yōu)選為20~50℃。前述化學(xué)式(1a)所示配糖體化合物及前述脫保護(hù)劑的濃度也未特別受限,可適當(dāng)予以設(shè)定。前述化學(xué)式(1a)所示配糖體化合物與前述脫保護(hù)劑的物質(zhì)量比也未特別受限,例如可為化學(xué)計量混合比,也可為其它任意的比。另外,其它反應(yīng)物質(zhì)的使用量也未特別受限。前述脫保護(hù)劑的摩爾數(shù)相對于前述化學(xué)式(1a)所示配糖體化合物的摩爾數(shù)可舉例如0.1~20倍,且以0.2~10倍為優(yōu)選,更優(yōu)選為1~5倍。前述脫保護(hù)反應(yīng)的反應(yīng)條件舉例來說可參考已知的配糖體中類似的脫保護(hù)反應(yīng)等的條件來適當(dāng)設(shè)定,也可參照后述實施例2至5中任一者的條件來適當(dāng)設(shè)設(shè)定。

本發(fā)明的配糖體化合物的制造方法更優(yōu)選包含:保護(hù)基團(tuán)導(dǎo)入步驟,其為對前述化學(xué)式(1b)導(dǎo)入保護(hù)基團(tuán)r1及r2,以制造下述化學(xué)式(1c)所示的配糖體化合物。此時,下述化學(xué)式(1c)所示的配糖體化合物為前述化學(xué)式(1)所示的配糖體化合物,但r1及r2為除氫原子、前述化學(xué)式(r1r2a)及(r1r2b)以外的基團(tuán)的情況。

前述化學(xué)式(1c)中,r1及r2為前述化學(xué)式(1)中除氫原子、前述化學(xué)式(r1r2a)及(r1r2b)以外的r1及r2;b、l1、n及[d1]與前述化學(xué)式(1)中的定義相同。

前述保護(hù)基團(tuán)導(dǎo)入步驟的反應(yīng)條件未特別受限,舉例來說也可參考已知的配糖體化合物的類似反應(yīng)等來適當(dāng)設(shè)定。前述保護(hù)基團(tuán)導(dǎo)入步驟中,例如,前述r1及r2可同時(在同一步驟中)導(dǎo)入,也可在導(dǎo)入r1后再附加r2,尚可在導(dǎo)入r2后導(dǎo)入r1。舉例來說,優(yōu)選在導(dǎo)入r1后導(dǎo)入r2。保護(hù)基團(tuán)r1及r2并未特別受限,但可舉例如前所述。

保護(hù)基團(tuán)r1的導(dǎo)入反應(yīng)中,保護(hù)基團(tuán)導(dǎo)入劑僅需依r1來適當(dāng)選擇即可。反應(yīng)溶劑雖未特別受限,但可舉例如吡啶等的極性溶劑、乙腈等的腈類、四氫呋喃等的醚類等。反應(yīng)時間未特別受限,但可舉例如30分鐘~24小時,且優(yōu)選為2~12小時,更優(yōu)選為2~4小時。反應(yīng)溫度雖未特別受限,但可舉例如0~100℃,且以10~60℃為佳,更優(yōu)選為20~30℃。所用配糖體化合物及保護(hù)基團(tuán)導(dǎo)入劑的濃度也未特別受限,可適當(dāng)予以設(shè)定。前述配糖體化合物與前述保護(hù)基團(tuán)導(dǎo)入劑的物質(zhì)量比也未特別受限,舉例來說可為化學(xué)計量混合比,也可為其它任意的比。另外,其它反應(yīng)物質(zhì)的使用量也未特別受限。前述保護(hù)基團(tuán)導(dǎo)入劑的摩爾數(shù)相對于前述配糖體化合物的摩爾數(shù)舉例來說為1~100倍,且以1~20倍為優(yōu)選,更優(yōu)選為1~5倍。保護(hù)基團(tuán)r1的導(dǎo)入反應(yīng)的反應(yīng)條件舉例來說可參考已知的配糖體化合物的類似反應(yīng)的條件來適當(dāng)設(shè)定,也可參照后述實施例2至5中任一者的條件來適當(dāng)設(shè)定。

保護(hù)基團(tuán)r2的導(dǎo)入反應(yīng)中,保護(hù)基團(tuán)導(dǎo)入劑僅需依r2適當(dāng)選擇即可。反應(yīng)溶劑雖未特別限定,但可舉例如乙腈等的腈類、四氫呋喃等醚類及二氯甲烷等鹵化溶劑等。反應(yīng)時間并未特別受限,但舉例來說為30分鐘~24小時,且優(yōu)選1~12小時,更優(yōu)選4~6小時。反應(yīng)溫度并未特別受限,但舉例來說為-80~30℃,且優(yōu)選為-70~0℃,更優(yōu)選為-50~-40℃。所用配糖體化合物及保護(hù)基團(tuán)導(dǎo)入劑的濃度也未特別受限,可適當(dāng)設(shè)定。前述配糖體化合物與前述保護(hù)基團(tuán)導(dǎo)入劑的物質(zhì)量比也未特別受限,例如可為化學(xué)計量混合比,也可為其它任意的比。另外,其它反應(yīng)物質(zhì)的使用量也未特別受限。前述保護(hù)基團(tuán)導(dǎo)入劑的摩爾數(shù)相對于前述配糖體化合物的摩爾數(shù)舉例來說為1~20倍,且優(yōu)選為1~5倍,更優(yōu)選為1~1.5倍。保護(hù)基團(tuán)r2的導(dǎo)入反應(yīng)的反應(yīng)條件舉例來說可參考已知的配糖體化合物的類似反應(yīng)條件來適當(dāng)設(shè)定,也可參考如后述實施例2或3的條件來適當(dāng)設(shè)定。

另外,前述各反應(yīng)步驟中,反應(yīng)生成物的純化方法也未特別受限,可參考已知方法等來適當(dāng)進(jìn)行。

此外,本發(fā)明的配糖體化合物的制造方法中,前述化學(xué)式(106)所示的醚更優(yōu)選以前述本發(fā)明的醚的制造方法來制造。另外,其中間產(chǎn)物的硫醚(103)更優(yōu)選以前述本發(fā)明的第1或第2硫醚制造方法來制造。借此,可以更佳的收率制得本發(fā)明的配糖體化合物。

6.核酸制造方法

本發(fā)明的核酸制造方法如前所述,為含有下述化學(xué)式(i)所示結(jié)構(gòu)的核酸的制造方法,其特征在于包含使本發(fā)明的配糖體化合物進(jìn)行縮合反應(yīng)的縮合步驟,且前述化學(xué)式(1)所示配糖體化合物為下述化學(xué)式(2)所示的配糖體化合物。

前述化學(xué)式(i)中,b與前述化學(xué)式(1)、(2)或(3)中的定義相同,r100為氫原子或羥基;

各b可相同也可相異,且各r100可相同也可相異;

m為正整數(shù)。

本發(fā)明的核酸制造方法的反應(yīng)條件并未特別受限,舉例來說可與一般的亞磷酰胺法等同樣地進(jìn)行。舉例來說,本發(fā)明的核酸制造方法也可使用一般的核酸自動合成裝置等來制造(合成)。即,前述化學(xué)式(2)所示本發(fā)明的配糖體化合物可用作自動核酸合成裝置用的亞酰胺。本發(fā)明的核酸制造方法通過使用前述化學(xué)式(2)所示本發(fā)明的配糖體化合物而可高純度且高收率地制造核酸。具體舉例來說,也可在等同dna合成程度的純度下來合成rna。其理由雖未明朗,但舉例來說,可以想見的是,與tbdms-亞酰胺、tom-亞酰胺、ace-亞酰胺等相較下縮合反應(yīng)(偶聯(lián)反應(yīng))時的位阻較少而導(dǎo)致縮合反應(yīng)(偶聯(lián)反應(yīng))效率提升等。此外,前述化學(xué)式(2)所示的本發(fā)明配糖體化合物也容易進(jìn)行伴隨縮合反應(yīng)(偶聯(lián)反應(yīng))的脫保護(hù)反應(yīng)。

本發(fā)明的核酸制造方法中,舉例來說,含有前述化學(xué)式(i)所示結(jié)構(gòu)的核酸為下述化學(xué)式(ii)所示的核酸:

前述化學(xué)式(ii)中,b、r100及m與前述化學(xué)式(i)中的定義相同,各b可相同也可相異,且各r100可相同也可相異,z為氫原子或磷酸基;并且

該制造方法也可含有下述步驟a1~a6。

[步驟a1]

使酸作用于下述化學(xué)式(201)所示配糖體化合物而使5’位的羥基脫保護(hù),進(jìn)而制造下述化學(xué)式(202)所示的配糖體化合物的步驟。

前述化學(xué)式(201)及(202)中,m及b與前述化學(xué)式(ii)中的定義相同;

r1及r2c與前述化學(xué)式(2)中的定義相同;

各r200分別表示氫原子、酰氧基或下述化學(xué)式(203)所示取代基,且可相同也可相異;

t為氫原子、酰氧基或下述化學(xué)式(203)或(204)所示的取代基;

e為酰基或下述化學(xué)式(204)所示的取代基;

e及t中的至少之一為下述化學(xué)式(204)所示的取代基;

前述化學(xué)式(203)中,[d1]、l1及n與前述化學(xué)式(2)中的定義相同;

前述化學(xué)式(204)中,l3為連接子(linker),[s]為固相載體;

q為單鍵或下述化學(xué)式(205)所示的取代基;

前述化學(xué)式(205)中,r2c與前述化學(xué)式(2)中的定義相同。

前述化學(xué)式(201)及(202)中,e的前述?;膳e例如乙?;⒈;?、丁?;?、異丁酰基、苯甲酰基、4-甲氧基苯甲酰基、苯基乙?;?、苯氧乙?;?、4-叔丁基苯氧乙?;?、4-異丙基苯氧乙?;?。t及r200的前述酰氧基中的?;蚕嗤?/p>

前述化學(xué)式(204)中,前述l3(連接子)可舉例如:從3-氨丙基、長鏈(longchain)烷氨(lcaa)基及2-(2-羥乙基磺酰基)乙醇中的任一者衍生而成的基團(tuán);以及琥珀?;?。前述[s](固相載體)則可舉例如:可控孔徑玻璃(controlledporeglass;cpg)、草?;?可控孔徑玻璃(參照alul等,nucleicacidsresearch,vol.19,1527(1991)等)、tentagel支持體-氨基聚乙二醇衍生物化支持體(參照wright等,tetrahedronletters,vol.34,3373(1993)等)、多孔聚苯乙烯與二乙烯基苯的共聚物等。

前述化學(xué)式(201)及(202)中,t優(yōu)選為前述化學(xué)式(203)所示的取代基,且e優(yōu)選為下述化學(xué)式(204-1)或(204-2)所示的化合物。

前述化學(xué)式(204-1)及(204-2)中,lcaa及cpg與前述化學(xué)式(204)中的定義相同。前述化學(xué)式(204-2)中,[d2]與前述化學(xué)式(2)中的定義相同。

使用于本步驟a1的前述酸并未特別受限,但可舉例如鹵化羧酸等。前述鹵化羧酸可舉例如三氟乙酸、二氯乙酸和三氯乙酸等。舉例來說,也可使前述酸溶解于適當(dāng)?shù)娜軇┖笤僮魇褂?。該溶液的濃度并未特別受限,但舉例來說為1~5重量%。前述溶劑也未特別受限,但可舉例如二氯甲烷等的鹵化溶劑、乙腈等的腈類及水等,且可單獨使用也可并用多種。本步驟a1的反應(yīng)溫度并未特別受限,但優(yōu)選為20℃~50℃。反應(yīng)時間也未特別受限,可視使用的酸種類及反應(yīng)溫度等而異,但可舉例如1分鐘~1小時。另外,前述酸的使用量(摩爾數(shù))也未特別受限,但相對于前述配糖體化合物(201)中的糖(或堿)的摩爾數(shù)可舉例如1~100倍,且優(yōu)選1~10倍。

[步驟a2]

使核酸單體化合物在活化劑存在下與前述步驟a1中制得的配糖體化合物(202)進(jìn)行縮合,以制造下述化學(xué)式(206)所示配糖體化合物的步驟。

前述化學(xué)式(206)中,b、e、m、r1、r200、t及r2c與前述化學(xué)式(201)中的定義相同,且各b、各r200以及各r2c分別可相同也可相異。

于本步驟a2中,前述“核酸單體化合物”可舉例如前述化學(xué)式(2)所示本發(fā)明的配糖體化合物。雖然前述“核酸單體化合物”也可使用其它的配糖體化合物,但從反應(yīng)效率、目的生成物的收率、目的生成物的純度等觀點來看,優(yōu)選使用前述化學(xué)式(2)所示的配糖體化合物。此外,也可將前述化學(xué)式(2)所示的配糖體化合物與其它配糖體化合物一起使用。前述“其它配糖體化合物”可舉例如前述化學(xué)式(2)中將r3改成h(氫原子)或oh(羥基)的配糖體化合物。在本發(fā)明的核酸制造方法中,最低限度是使用1分子以上的前述化學(xué)式(2)所示本發(fā)明的配糖體化合物來制造核酸。此外,如后所述,也可將步驟a1~a4重復(fù)施行適當(dāng)次數(shù)以使本步驟a2中的縮合反應(yīng)重復(fù)多次。可借此使目的核酸(配糖體化合物(i)或(ii))的鏈長成為所需(預(yù)定)鏈長。本發(fā)明的核酸制造方法中,優(yōu)選使前述化學(xué)式(2)所示本發(fā)明的配糖體化合物進(jìn)行多分子聚合(縮聚)。借此,舉例來說,可進(jìn)行rna(即前述化學(xué)式(i)或(ii)中,r100全為羥基的核酸)的合成(制造)??蛇x地,為了合成dna(前述化學(xué)式(i)或(ii)中,r100全為氫原子的核酸),舉例來說,也可使前述化學(xué)式(2)所示本發(fā)明的配糖體化合物進(jìn)行多分子聚合(縮聚),再從所合成出的rna利用逆轉(zhuǎn)錄來進(jìn)行dna合成。為了合成出前述化學(xué)式(i)或(ii)中含有為氫的r100及為羥基的r100的核酸,舉例來說,也可使前述化學(xué)式(2)所示的配糖體化合物與前述化學(xué)式(2)中將r3改成h(氫原子)的配糖體化合物進(jìn)行縮合反應(yīng)。

于本步驟a2中,前述活化劑并未特別受限,舉例來說可與已知核酸合成所用的活化劑相同。前述活化劑可舉例如1h-四唑、5-乙基硫代四唑、4,5-二氯咪唑、4,5-二氰基咪唑、苯并三唑三氟甲磺酸鹽(benzotriazoletriflate)、咪唑三氟甲磺酸鹽、三氟甲磺酸吡啶鎓鹽(pyridiniumtriflate)、n,n-二異丙基乙基胺和2,4,6-可力丁/n-甲基咪唑等。

本步驟a2中,反應(yīng)溶劑并未特別受限,但可舉例如:乙腈等的腈類、四氫呋喃、二噁烷等的醚類等。所述溶劑可單獨使用也可并用多種。反應(yīng)溫度也未特別受限,但優(yōu)選為20℃~50℃。另外,反應(yīng)時間也未特別受限,可視使用的活化劑種類、反應(yīng)溫度等而異,但可舉例如1分鐘~1小時。前述核酸單體化合物的使用量(摩爾數(shù))并未特別受限,但相對于前述配糖體化合物(202)中的糖(或堿)的摩爾數(shù),可舉例如1~100倍,且優(yōu)選為1~10倍。前述活化劑的使用量也相同。

[步驟a3]

將前述步驟a2中未反應(yīng)的前述配糖體化合物(202)的5’位羥基加帽(capping)的步驟。

前述化學(xué)式(207)中,r300為甲基或苯氧甲基;

b、e、m、r200、t及r2c與前述化學(xué)式(5)中的定義相同。

在本步驟a3中,使加帽劑對前述步驟a2結(jié)束時未反應(yīng)的5’位羥基反應(yīng)而予以保護(hù)。前述加帽劑并未特別受限,但可舉例如乙酸酐、苯氧乙酸酐等。舉例來說,前述加帽劑也可制成溶液使用。前述溶液的溶劑并未特別受限,但可舉例如吡啶、二氯甲烷、乙腈、四氫呋喃及它們的混合溶劑等。前述溶液的濃度也未特別受限,但可舉例如0.05~1m。此外,在本步驟a3中,舉例來說也可并用4-二甲氨基吡啶、n-甲基咪唑等的適當(dāng)?shù)姆磻?yīng)促進(jìn)劑。反應(yīng)溫度雖未特別受限,但以20℃~50℃為優(yōu)選。另外,反應(yīng)時間并未特別受限,可視使用的加帽劑的種類及反應(yīng)溫度等而異,但可舉例如1~30分鐘。前述加帽劑的使用量(摩爾數(shù))未特別受限,但相對于前述配糖體化合物(202)中的糖(或堿)的摩爾數(shù),可舉例如1~100倍,且優(yōu)選為1~10倍。前述活化劑的使用量也相同。前述反應(yīng)促進(jìn)劑的使用量也相同。

[步驟a4]

使氧化劑作用于前述步驟a2中制造的配糖體化合物(206),而使前述化學(xué)式(206)中的亞磷酸基轉(zhuǎn)換成磷酸基的步驟。

前述化學(xué)式(208)中,b、e、m、r1、r200、t、及r2c與前述化學(xué)式(206)中的定義相同。

本步驟a4中的前述氧化劑并未特別受限,可舉例如碘、過氧化物(例如叔丁基過氧化氫)等。前述氧化劑也可制成溶液使用。前述溶液的溶劑并未特別受限,可舉例如吡啶、四氫呋喃、水、乙酸、二氯甲烷及它們的混合溶劑等。舉例來說,前述溶液可使用:使碘溶解于水、吡啶及四氫呋喃的混合溶劑而成的溶液;使碘溶解于吡啶與乙酸的混合溶劑而成的溶液;使過氧化物溶解于二氯甲烷而成的溶液等。前述溶劑的濃度也未特別受限,舉例來說為0.05~2m。反應(yīng)溫度未特別受限,但優(yōu)選為20℃~50℃。另外,反應(yīng)時間未特別受限,可視使用的氧化劑種類、反應(yīng)溫度等而異,舉例來說為1~30分鐘。前述氧化劑的使用量(摩爾數(shù))雖未特別受限,但相對于前述配糖體化合物(206)中的糖(或堿)的摩爾數(shù),可舉例如1~100倍,且優(yōu)選為1~10倍。

在本步驟a4后且在進(jìn)行后續(xù)步驟a5前,也可回到步驟a1。通過如此重復(fù)進(jìn)行適當(dāng)次數(shù)的步驟a1~a4,可使目的核酸(配糖體化合物(208))的鏈長成為所需(預(yù)定)鏈長。

[步驟a5]

從前述固相載體切出前述步驟a4制得的配糖體化合物(208),使各核酸堿基部位及各2’位羥基脫保護(hù)的步驟。

前述化學(xué)式(209)中,b、m、r1及r200與前述化學(xué)式(208)中的定義相同;

r100及z與前述化學(xué)式(ii)中的定義相同。

本步驟a5中,可對載有前述核酸(208)的固相載體添加切出劑,來進(jìn)行將前述配糖體化合物(208)(即預(yù)定鏈長的核酸)從固相載體切出的步驟(切出步驟)。前述切出劑并未特別受限,但可舉例如濃氨水及甲基胺等,且可單獨使用也可并用2種以上。舉例來說,也可使前述切出劑通過溶解于溶劑來使用。前述溶劑并未特別受限,但可舉例如水、甲醇、乙醇、異丙醇、乙腈、四氫呋喃或它們的混合溶劑等,且特別優(yōu)選乙醇。前述溶液的濃度也未特別受限,舉例來說,可制成使前述溶液中的氫氧化銨濃度為20~30重量%。前述氫氧化銨的濃度優(yōu)選為25~30重量%,更優(yōu)選為28~30重量%。前述切出劑的使用量(摩爾數(shù))并未特別受限,但相對于前述配糖體化合物(208)中的糖(或堿)的摩爾數(shù),可舉例如1~100倍,且優(yōu)選為1~10倍。前述活化劑的使用量也相同。前述切出步驟的反應(yīng)溫度并未特別受限,舉例來說為15℃~75℃,且優(yōu)選為15℃~50℃,較優(yōu)選為15℃~30℃,更優(yōu)選為18℃~25℃,且以20℃~25℃尤佳。反應(yīng)時間未特別受限,可視使用的氧化劑種類及反應(yīng)溫度等而異,舉例來說為1~24小時。

本步驟a5的前述2’位羥基的脫保護(hù)步驟中,脫保護(hù)劑并未特別受限,但可舉例如鹵化四烷基銨,更具體則可舉例如氟化四丁基銨。前述脫保護(hù)步驟中使用的溶劑并未特別限定,可舉例如四氫呋喃、n-甲基吡咯烷酮、n,n-二甲基甲酰胺、二甲亞砜及它們的混合溶劑等。此外,舉例來說,前述脫保護(hù)步驟中所產(chǎn)生的丙烯腈等的副生成物也可借烷基胺、硫醇或它們的混合物來捕捉。前述烷基胺可舉例如具有碳數(shù)1~10的直鏈狀烷基的烷基胺。前述硫醇可舉例如具有碳數(shù)1~10的直鏈狀烷基的烷基硫醇。前述脫保護(hù)步驟的反應(yīng)時間及反應(yīng)溫度并未特別受限,但優(yōu)選分別為30分鐘~50小時及10~70℃。前述脫保護(hù)劑的使用量相對于前述配糖體化合物(202)中的糖(或堿)的摩爾數(shù),舉例來說為10~1000倍,且優(yōu)選為50~200倍。前述捕捉劑的使用量也相同。另外,從前述脫保護(hù)步驟的反應(yīng)混合物中分離純化出目的生成物的配糖體化合物(209)的方法并未特別限定,可使用常規(guī)的純化方法。前述純化方法可舉例如過濾、洗脫、濃縮、中和、離心、層析法(硅膠柱、薄層、逆相ods、離子交換、凝膠過濾)、滲析及超濾等,且可單獨使用也可并用多種。

[步驟a6]

將前述步驟a5所制得的化合物(209)中的5’位羥基的保護(hù)基團(tuán)予以去除的步驟。

本步驟a6所使用的前述酸并未特別受限,但可舉例如鹵化羧酸和羧酸等。前述鹵化羧酸或羧酸可舉例如三氟乙酸、二氯乙酸、三氯乙酸及乙酸等。舉例來說,也可使前述酸溶解于適當(dāng)?shù)娜軇┖笫褂?。該溶液的濃度雖未特別受限,但可舉例如10~70重量%。前述溶劑也未特別受限,可舉例如二氯甲烷、乙腈、氯仿、乙醇、水、ph2~5的緩沖液及它們的混合溶劑等。前述緩沖液可舉例如乙酸緩沖液。本步驟a6的反應(yīng)溫度未特別受限,但優(yōu)選10℃~60℃。反應(yīng)時間也未特別受限,可視使用的酸種類及反應(yīng)溫度等而異,舉例來說為1分鐘~30分鐘。前述酸的使用量(摩爾數(shù))未特別受限,相對于前述配糖體化合物(209)中的糖(或堿)的摩爾數(shù),舉例來說為1~200倍,且優(yōu)選為1~20倍。

另也可依需要而使為前述步驟a6的目的生成物的前述化合物(ii)進(jìn)行分離純化。舉例來說,“分離”包括單離(isolation)。分離純化方法并未特別受限,可舉例如抽提、濃縮、中和、過濾、離心、逆相柱層析法、離子交換柱層析法、凝膠過濾柱層析法、高效液相層析法、滲析、超濾等,可單獨使用也可并用多種。

本步驟a5與前述步驟a6的順序也可前后調(diào)換。即,可在前述步驟a4后,使前述步驟a6先于前述步驟a5進(jìn)行,之后再進(jìn)行前述步驟a5。

本發(fā)明的核酸制造方法所制造的核酸的用途并未特別受限,舉例來說,可用于與已知核酸相同的用途。由于前述核酸可通過本發(fā)明的核酸制造方法來低成本且高純度地制造,因此其用途甚為廣泛,舉例來說,適于醫(yī)藥品制造等的用途。

以下通過實施例等來詳細(xì)說明本發(fā)明,但本發(fā)明并不受它們的局限。

[實施例]

[實施例1:emm化試劑(1004)的合成]

依照下述流程e1,合成出emm化試劑(1004)?!癳mm”為“氰基乙氧基甲氧基甲基(cyanoethoxymethoxymethyl)”的略稱(以下相同)。

[[1]雙(氯甲基)醚(1002)的合成]

于-5~0℃下將低聚甲醛(1001)(100g,3.33mol)與濃鹽酸(70ml,0.83mol)的混合物攪拌30分鐘。耗費4小時將氯磺酸(190ml,2.86mol)滴入該反應(yīng)混合物。更于-5~0℃下將其攪拌3小時后,進(jìn)一步于室溫下攪拌過夜。使用分液漏斗(partitioningfunnel)分離該反應(yīng)混合液的上層,再以冰水洗凈。將洗凈后的反應(yīng)混合液加入裝有冰的三角燒瓶,于冰浴中冷卻。一邊激烈攪拌該溶液,一邊緩緩加入40%氫氧化鈉水溶液至水層呈強(qiáng)堿(ph11)。以分液漏斗分離所得的生成物,于冰浴中加入碳酸鉀與氫氧化鉀并將其干燥。以過濾去除干燥劑,制得無色油狀物的目的化合物(1002)(158g,收率83%)。此外,該合成中的操作參考了saulr.buc,org.synth.,coll.vol.4,p.101(1963);vol.36,p.1(1956)。以下顯示化合物(1002)的機(jī)器分析值。

化合物(1002):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:5.55(4h,s).

[[2]雙(甲基硫代甲基)醚(1003)的合成]

將甲基硫代鈉·4.5水合物(330g,2.17mol)加入雙(氯甲基)醚(1002)(50g,0.43mol)的丙酮(720ml)溶液中,于室溫下激烈攪拌1小時。以硅藻土過濾反應(yīng)溶液后減壓濃縮濾液。添加二氯甲烷,該混合物以飽和碳酸氫鈉水溶液洗凈3次,再以飽和氯化鈉水溶液洗凈1次。以無水硫酸鈉干燥有機(jī)層,再減壓濃縮。減壓蒸餾(70~84℃,20~22mmhg(2.7~2.9kpa))粗生成物,制得無色油狀物的目的化合物(1003)(43.7g,收率74%)。該合成方法為將eur.pat.appl.(1994),ep604910a1所記載的合成方法進(jìn)一步改良而使目的化合物的收率(前述文獻(xiàn)中記載收率為48%)更為提高的合成方法。以下顯示化合物(1003)的機(jī)器分析值。

化合物(1003):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:4.77(4h,s),2.16(6h,s).

[[3]emm化試劑(1004)的合成]

使雙(甲基硫代甲基)醚(1003)(10.0g,72mmol)于氬氣環(huán)境下溶解于四氫呋喃(100ml)中。于該溶液中加入氰基乙醇(2.6g,36mmol)及10g的分子篩4a,攪拌10分鐘。對該混合物進(jìn)一步添加n-碘琥珀酰亞胺(9.8g,43mmol)并使其溶解,冷卻至0℃。冷卻后,添加三氟甲磺酸銀(0.28g,1.1mmol)并攪拌1小時。攪拌后添加乙酸乙酯,依序以飽和硫代硫酸鈉水溶液、飽和碳酸氫鈉水溶液及飽和氯化鈉水溶液洗凈該混合物。之后分離有機(jī)層,以無水硫酸鈉干燥后,減壓濃縮。以二氧化硅凝膠柱層析法(己烷:乙酸乙酯=4:1)純化其粗生成物,獲得無色油狀物的目的化合物(1004)(3.4g,收率58%)。以下顯示化合物(1004)的機(jī)器分析值。

化合物(1004):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:4.86(2h,s),4.73(2h,s),3.80(2h,t,j=6.3hz),2.64(2h,t,j=6.3hz),2.18(3h,s).

gc-ms(ei+):m/z161[m]+、84[ch2o(ch2)2cn]+、61[ch3sch2]+、54[(ch2)2cn]+

[實施例2:尿苷emm-亞酰胺(1009)的合成]

依照下述流程e2,合成出尿苷emm-亞酰胺(1009)。

[[1]3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)尿苷(1006)的合成]

于氬氣環(huán)境下,使3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)尿苷(1005)(0.50g,1.0mmol)溶解于四氫呋喃(5ml)后,更添加emm化試劑(1004)(0.26g,1.6mmol)攪拌。使其冷卻至-45℃后,添加三氟甲磺酸(0.24g,1.6mmol)攪拌10分鐘。攪拌后,添加n-碘琥珀酰亞胺(0.36g,1.6mmol),更攪拌5小時。反應(yīng)結(jié)束后添加三乙胺并猝滅反應(yīng)。更添加乙酸乙酯,該混合物以飽和硫代硫酸鈉水溶液洗凈2次,接著以飽和氯化鈉水溶液洗凈1次。以無水硫酸鈉干燥其有機(jī)層后,減壓濃縮。對殘渣添加乙酸乙酯,以飽和硫代硫酸鈉水溶液、飽和氯化鈉水溶液各洗凈1次。以無水硫酸鈉干燥其有機(jī)層后,減壓濃縮。以硅膠柱層析法(乙酸乙酯:己烷=1:1)純化所得粗生成物,制得目的化合物(1006)(0.51g,收率83%)。以下顯示化合物(1006)的機(jī)器分析值。

化合物(1006):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:8.41(1h,s),7.90(1h,d,j=7.8hz),5.72(1h,s),5.67(1h,d,j=8.3hz),5.15-5.08(2h,m),4.98(1h,d,j=6.8hz),4.84(1h,d,j=4.4hz),4.26-4.11(4h,m),4.04-3.97(2h,m),3.90-3.78(1h,m),2.70-2.65(2h,m),1.11-0.94(28h,m).

[[2]2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)尿苷(1007)的合成]

使3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)尿苷(1006)(3.8g,6.3mmol)溶解于四氫呋喃(15ml)后,更添加氟化氫吡啶(1.6g,16mmol),于室溫下攪拌過夜。濾取所得沉淀物,減壓干燥而獲得1.6g的前述沉淀物。另一方面,對殘余的濾液添加甲苯,傾析并去除上清液。對去除上清液后的液體添加二異丙基醚,傾析并去除上清液,反復(fù)此操作直至獲得結(jié)晶。接著濾取所得沉淀物(結(jié)晶),減壓干燥而獲得0.5g的前述沉淀物(結(jié)晶)。將前述各沉淀物合計而獲得目的化合物(1007)(2.1g,收率92%)。以下顯示化合物(1007)的機(jī)器分析值。

化合物(1007):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:10.23(1h,br.s),7.90(1h,d,j=7.8hz),5.84(1h,d,j=2.9hz),5.59(1h,d,j=8.3hz),5.09(1h,d,j=7.0hz),4.98(1h,d,j=6.7hz),4.87(2h,s),4.25-4.22(3h,m),3.99(1h,s),3.83-3.69(5h,m),2.70-2.61(2h,m).

[[3]5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)尿苷(1008)的合成]

以吡啶共沸蒸餾2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)尿苷(1007)(2.1g,6.0mmol),再以真空泵餾除溶劑。進(jìn)行該操作3次。之后,添加4,4’-二甲氧基三苯甲基氯(2.6g,7.2mmol)和吡啶(10ml),攪拌2小時。攪拌后,添加二氯甲烷,該混合物以飽和碳酸氫鈉水溶液洗凈2次,接著以飽和氯化鈉水溶液洗凈1次。以無水硫酸鈉干燥該有機(jī)層后,減壓濃縮。再以硅膠柱層析法(丙酮:己烷=3:7,含0.05%吡啶→二氯甲烷:甲醇=9:1,含0.05%吡啶)純化所得粗生成物,獲得目的化合物(1008)(3.8g,收率96%)。以下顯示化合物(1008)的機(jī)器分析值。

化合物(1008):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:8.62(1h,br.s),7.99(1h,d,j=7.8hz),7.40-7.25(9h,m),6.90-6.84(4h,m),5.96(1h,d,j=2.0hz),5.28(1h,d,j=8.3hz),5.18(1h,d,j=6.8hz),5.03(1h,d,j=7.3hz),4.87(2h,d,j=7.3hz),4.48(1h,q,j=5.4hz),4.29(1h,dd,j=5.1,2.2hz),4.11-4.07(1h,m),3.87(2h,t,j=6.0hz),3.84(6h,s),3.55(2h,dd,j=9.0,2.2hz),2.76(1h,d,j=7.8hz),2.65(2h,t,j=6.6hz).

[[4]5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)尿苷3’-o-(2-氰基乙基n,n-二異丙基亞磷酰胺)(1009)的合成]

以吡啶共沸蒸餾5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)尿苷(1008)(3.7g,5.6mmol),并以真空泵餾除溶劑。進(jìn)行該操作3次。更于氬氣環(huán)境下添加四唑二異丙基銨(diisopropylammoniumtetrazolide)(1.2g,6.8mmol)與乙腈(10ml)。對該反應(yīng)溶液添加已溶解于乙腈(20ml)的2-氰基乙基-n,n,n’,n’-四異丙基亞磷酰二胺(2.0g,6.8mmol),于45℃下攪拌2小時。更添加二氯甲烷,該混合物以飽和碳酸氫鈉水溶液、飽和氯化鈉水溶液各洗凈1次。以無水硫酸鈉使經(jīng)洗凈的有機(jī)層干燥后,減壓濃縮。以硅膠柱層析法(丙酮:己烷=1:1,含0.05%吡啶)純化所得粗生成物,獲得目的化合物(1009)(4.3g,收率89%)。以下顯示化合物(1009)的機(jī)器分析值。

化合物(1009):

31p-nmr(162mhz,cdcl3)δ:153.5,151.9.

ms(fab+):m/z882[m+na]+

[實施例3:胞苷emm-亞酰胺(1014)的合成]

依照下述流程e3,合成出胞苷emm-亞酰胺(1014)。

[[1]n4-乙?;?3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)胞苷(1011)的合成]

以甲苯共沸蒸餾n4-乙?;?3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)胞苷(1010)(3.0g,5.7mmol),再以真空泵餾除溶劑。進(jìn)行該操作3次。使如此獲得的混合物于氬氣環(huán)境下溶解于四氫呋喃(30ml),添加emm化試劑(1004)(2.8g,18mmol)并攪拌。使其混合液冷卻至-45℃后,添加三氟甲磺酸(1.3g,8.8mmol)并攪拌10分鐘。更添加n-碘琥珀酰亞胺(2.0g,9.0mmol)攪拌5小時。反應(yīng)結(jié)束后,添加三乙胺并猝滅反應(yīng)。更添加乙酸乙酯,該混合物以飽和硫代硫酸鈉水溶液洗凈2次,再以飽和氯化鈉水溶液洗凈1次。以無水硫酸鈉使經(jīng)洗凈的有機(jī)層干燥后,減壓濃縮。對所得殘渣添加乙酸乙酯后,各以飽和硫代硫酸鈉水溶液、飽和氯化鈉水溶液洗凈1次。以無水硫酸鈉使經(jīng)洗凈的有機(jī)層干燥后,減壓濃縮而獲得目的化合物(1011)(5.3g,粗生成物)。以下顯示化合物(1011)的機(jī)器分析值。

化合物(1011):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:9.17(1h,s),8.30(1h,d,j=7.2hz),7.41(1h,d,j=7.8hz),5.79(1h,s),5.18(1h,d,j=6.8hz),5.03(d,1h,j=7.4hz),4.29(1h,d,j=13.7hz),4.23-4.10(5h,m),4.03-3.96(2h,m),3.87-3.75(1h,m),2.76-2.65(2h,m),2.24(3h,s),1.11-0.89(28h,m).

[[2]n4-乙酰基-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)胞苷(1012)的合成]

使n4-乙?;?3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)胞苷(1011)(5.2g,8.1mmol)于氬氣環(huán)境下溶解于四氫呋喃(30ml)。對其溶液添加三乙胺三氟化氫(1.6g,9.7mmol),于45℃下攪拌1小時。攪拌后放冷至室溫,濾取析出的沉淀物。以四氫呋喃將其洗凈后予以減壓干燥,制得目的化合物(1012)(1.5g,收率68%)。以下顯示化合物(1012)的機(jī)器分析值。

化合物(1012):

1h-nmr(400mhz,d2o)δ:8.24(1h,d,j=7.3hz),7.24(1h,d,j=7.8hz),5.92(1h,d,j=2.4hz),5.02(1h,d,j=6.8hz),4.89(1h,d,j=6.8hz),4.79-4.74(2h,m),4.29(1h,dd,j=4.9,2.9hz),4.17(1h,t,j=6.3hz),4.09-4.05(1.0h,m),3.90-3.85(1h,m),3.77-3.70(3h,m),2.67(2h,t,j=6.1hz),2.12(3h,s).

[[3]n4-乙?;?5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)胞苷(1013)的合成]

以吡啶共沸蒸餾n4-乙?;?2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)胞苷(1012)(0.70g,1.8mmol),并以真空泵餾除溶劑。進(jìn)行該操作3次。更添加4,4’-二甲氧基三苯甲基氯(0.91g,2.7mmol)及吡啶(10ml),攪拌4小時。反應(yīng)結(jié)束后,添加甲醇并減壓濃縮后,對殘渣添加二氯甲烷。使其以飽和碳酸氫鈉水溶液洗凈2次及以飽和氯化鈉水溶液洗凈1次。以無水硫酸鈉使洗凈的有機(jī)層干燥后,減壓濃縮。以硅膠柱層析法(乙酸乙酯:丙酮:己烷=1:1:1,含0.05%吡啶→1:1:0,含0.05%吡啶)純化所得粗生成物,而制得目的化合物(1013)(1.1g,收率87%)。以下顯示化合物(1013)的機(jī)器分析值。

化合物(1013):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:8.61(1h,br.s),8.49(1h,d,j=7.8hz),7.42-7.26(9h,m),7.09(1h,d,j=7.3hz),6.88-6.86(4h,m),5.94(1h,s),5.35(1h,d,j=6.8hz),5.11(1h,d,j=6.8hz),4.92(1h,d,j=7.3hz),4.87(1h,d,j=7.3hz),4.49-4.40(1h,m),4.29(1h,d,j=4.9hz),4.15-4.08(1h,m),3.86(t,2h,j=6.2hz),3.82(s,6h),3.63(dd,1h,j=10.6,2.6hz),3.55(dd,1h,j=10.6,2.6hz),2.64(2h,t,j=6.3hz),2.56(d,1h,j=8.8hz),2.21(3h,s).

[[4]n4-乙酰基-5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)胞苷3’-o-(2-氰基乙基n,n-二異丙基亞磷酰胺)(1014)的合成]

以乙腈共沸蒸餾n4-乙?;?5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)胞苷(1013)(1.0g,1.4mmol),并以真空泵餾除溶劑。進(jìn)行該操作3次。更于氬氣環(huán)境下添加四唑二異丙基銨(0.27g,1.6mmol)與乙腈(4ml)。對該反應(yīng)溶液添加已溶解于乙腈(1.5ml)的2-氰基乙基-n,n,n’,n’-四異丙基亞磷酰二胺(0.63g,2.1mmol),并于45℃下攪拌3小時。攪拌后添加二氯甲烷,該混合物以飽和碳酸氫鈉水溶液、飽和氯化鈉水溶液各洗凈1次。以無水硫酸鈉使已洗凈的有機(jī)層干燥后,減壓濃縮。以硅膠柱層析法(丙酮:己烷:乙酸異丙酯=1:2:1,含0.1%三乙胺→丙酮:己烷:乙酸乙酯=1:1:1,含0.1%三乙胺)純化所得粗生成物,制得目的化合物(1014)(0.9g,收率71%)。以下顯示化合物(1014)的機(jī)器分析值。

化合物(1014):

31p-nmr(162mhz,cdcl3)δ:153.6,151.5.

ms(fab+):m/z923[m+na]+

[實施例4:腺苷emm-亞酰胺(1019)的合成]

依照下述流程e4,合成出腺苷emm-亞酰胺(1019)。

[[1]n6-乙?;?3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)腺苷(1016)的合成]

對n6-乙?;?3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)腺苷(1015)(3.0g,5.4mmol)添加甲苯,再以真空泵餾除溶劑。進(jìn)行該操作3次,利用共沸蒸餾去除水分。使如此獲得的混合物于氬氣環(huán)境下溶解于四氫呋喃(30ml),添加emm化試劑(1004)(2.6g,16mmol)并攪拌。使其冷卻至-45℃后,添加三氟甲磺酸(2.4g,16mmol)并攪拌10分鐘。攪拌后,添加n-碘琥珀酰亞胺(3.7g,16mmol),攪拌5小時。反應(yīng)結(jié)束后,添加三乙胺并猝滅反應(yīng)。更添加乙酸乙酯,該混合物以飽和硫代硫酸鈉水溶液、飽和碳酸氫鈉水溶液各洗凈2次,接著以飽和氯化鈉水溶液洗凈1次。以無水硫酸鈉干燥其有機(jī)層后,減壓濃縮。對殘渣添加乙酸乙酯,該混合物再以飽和硫代硫酸鈉水溶液及飽和氯化鈉水溶液各洗凈1次。以無水硫酸鈉干燥其有機(jī)層后,減壓濃縮而獲得目的化合物(1016)(8.6g,粗生成物)。以下顯示化合物(1016)的機(jī)器分析值。

化合物(1016):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:8.68(1h,s),8.66(1h,s),8.33(1h,s),6.12(1h,s),5.08(1h,d,j=7.0hz),4.91-4.80(3h,m),4.67(1h,d,j=7.8hz),4.52(1h,d,j=4.3hz),4.25(1h,d,j=13.0hz),4.17(1h,d,j=9.4hz),4.09-4.02(2h,m),3.89-3.80(1h,m),2.67(2h,m),2.63(3h,s),1.11-0.98(28h,m).

[[2]n6-乙?;?2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)腺苷(1017)的合成]

使n6-乙酰基-3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)腺苷(1016)(8.2g,13mmol)于氬氣環(huán)境下溶解于四氫呋喃(40ml)。對該溶液添加三乙胺三氟化氫(2.4g,15mmol),于45℃下攪拌2小時。將其放冷至室溫,濾取析出的沉淀物。以四氫呋喃洗凈該沉淀物后,減壓干燥,僅由初晶(primarycrystal)取得目的化合物(1017)(1.2g,收率52%)。以下顯示化合物(1017)的機(jī)器分析值。

化合物(1017):

1h-nmr(400mhz,dmso-d6)δ:10.71(1h,s),8.71(1h,s),8.66(1h,s),6.17(1h,d,j=5.8hz),5.41(1h,d,j=5.4hz),5.20(2h,m),4.80-4.73(3h,m),4.65-4.60(2h,m),4.37-4.33(1h,m),4.00-4.01(1h,m),3.73-3.64(1h,m),3.61-3.51(2h,m),2.79-2.64(2h,m),2.22(3h,s).

[[3]n6-乙?;?5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)腺苷(1018)的合成]

以吡啶共沸蒸餾n6-乙?;?2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)腺苷(1017)(1.0g,2.4mmol),并以真空泵餾除溶劑。進(jìn)行該操作3次。之后,添加4,4’-二甲氧基三苯甲基氯(0.96g,2.8mmol)及吡啶(10ml),攪拌3小時。反應(yīng)結(jié)束后,添加甲醇并減壓濃縮,對殘渣添加二氯甲烷。將所得溶液以飽和碳酸氫鈉水溶液洗凈2次,再以飽和氯化鈉水溶液洗凈1次。以無水硫酸鈉干燥其有機(jī)層后,減壓濃縮。以硅膠柱層析法(丙酮:己烷:乙酸乙酯=1:2:2,含0.05%吡啶→1:1:1,含0.05%吡啶)純化所得粗生成物,獲得目的化合物(1018)(1.3g,收率76%)。以下顯示化合物(1018)的機(jī)器分析值。

化合物(1018):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:8.62-8.58(2h,m),8.17(1h,s),7.46-7.39(2h,m),7.37-7.20(7h,m),6.87-6.79(4h,m),6.20(1h,d,j=4.9hz),5.03-4.75(3h,m),4.52(1h,s),4.30-4.23(1h,m),4.12(2h,d,j=7.3hz),3.79(6h,s),3.79-3.69(2h,m),3.52-3.44(2h,m),2.61(3h,s),2.58(1h,d,j=5.5hz),2.51(2h,t,j=5.9hz).

[[4]n6-乙酰基-5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)腺苷3’-o-(2-氰基乙基n,n-二異丙基亞磷酰胺)(1019)的合成]

以吡啶共沸蒸餾n6-乙?;?5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)腺苷(1018)(1.0g,1.4mmol),并以真空泵餾除溶劑。進(jìn)行該操作3次。更于氬氣環(huán)境下添加四唑二異丙基銨(0.31g,1.8mmol)與乙腈(3ml)。于該反應(yīng)溶液中加入已溶解于乙腈(1ml)的2-氰基乙基-n,n,n’,n’-四異丙基亞磷酰二胺(0.54g,1.8mmol),于40℃下攪拌4小時。更添加二氯甲烷,以飽和碳酸氫鈉水溶液、飽和氯化鈉水溶液各洗凈1次。以無水硫酸鈉使已洗凈的有機(jī)層干燥后,減壓濃縮。以硅膠柱層析法(丙酮:己烷:乙酸乙酯=2:2:1,含0.1%三乙胺)純化所得粗生成物,獲得目的化合物(1019)(1.1g,收率73%)。以下顯示化合物(1019)的機(jī)器分析值。

化合物(1019):

31p-nmr(162mhz,cdcl3)δ:152.7,152.6.

ms(fab+):m/z947[m+na]+、925[m+h]+

[實施例5:鳥苷emm-亞酰胺(1024)的合成]

依照下述流程e5,合成出鳥苷emm-亞酰胺(1024)。

[[1]n2-苯氧乙酰基-3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)鳥苷(1021)的合成]

使n2-苯氧乙?;?3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)鳥苷(1020)(3.5g,5.3mmol)溶解于四氫呋喃,添加甲苯后以真空泵餾除溶劑。進(jìn)行該操作3次,利用共沸蒸餾去除水分。使如此獲得的混合物于氬氣環(huán)境下溶解于四氫呋喃(30ml),添加emm化試劑(1004)(2.6g,16mmol)并攪拌。使其冷卻到-45℃后,添加三氟甲磺酸(2.4g,16mmol),攪拌10分鐘。之后,添加n-碘琥珀酰亞胺(3.6g,16mmol),更攪拌5小時。反應(yīng)結(jié)束后,添加三乙胺并猝滅反應(yīng)。接著,添加乙酸乙酯,以飽和硫代硫酸鈉水溶液、飽和碳酸氫鈉水溶液各洗凈2次,接著以飽和氯化鈉水溶液洗凈1次。以無水硫酸鈉使已洗凈的有機(jī)層干燥后,減壓濃縮。對所得殘渣添加乙酸乙酯,以飽和硫代硫酸鈉水溶液及飽和氯化鈉水溶液各洗凈1次。以無水硫酸鈉干燥該有機(jī)層后,減壓濃縮而獲得目的化合物(1021)(8.2g,粗生成物)。以下顯示化合物(1021)的機(jī)器分析值。

化合物(1021):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:11.79(1h,s),9.11(1h,s),8.04(1h,s),7.41-7.34(2h,m),7.13-6.97(3h,m),5.94(1h,s),5.08,4.97(2h,2d,j=7.2hz),4.87-4.67(2h,m),4.51-4.46(1h,dd,j=9.3,4.9hz),4.33-4.24(2h,m),4.15(1h,d,j=9.3hz),4.02(1h,dd,j=13.2,2.4hz),3.77-3.71(2h,m),2.76-2.53(2h,m),1.11-0.94(28h,m).

[[2]n2-苯氧乙酰基-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)鳥苷(1022)的合成]

使n2-苯氧乙?;?3’,5’-o-(四異丙基二硅氧烷-1,3-二基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)鳥苷(1021)(8.0g,10mmol)于氬氣環(huán)境下溶解于四氫呋喃(40ml)。添加三乙胺三氟化氫(2.0g,12mmol),于35℃下攪拌2小時。對濾液添加甲苯并進(jìn)行傾析。接著添加二乙醚并進(jìn)行傾析。反復(fù)該操作直至獲得結(jié)晶。濾取沉淀物并減壓干燥,僅從初晶取得目的化合物(1022)(0.90g,收率38%)。以下顯示化合物(1022)的機(jī)器分析值。

化合物(1022):

1h-nmr(400mhz,dmso-d6)δ:11.78(2h,br.s),8.32(1h,s),7.41-7.31(2h,m),7.07-6.98(3h,m),6.00(1h,d,j=5.8hz),5.37(1h,s),5.18(1h,s),4.88(2h,s),4.85-4.78(2h,m),4.72-4.59(3h,m),4.34(1h,m),4.00(1h,m),3.75-3.56(3h,m),2.79-2.69(2h,m).

[[3]n2-苯氧乙?;?5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)鳥苷(1023)的合成]

以吡啶共沸蒸餾n2-苯氧乙?;?2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)鳥苷(1022)(0.70g,1.3mmol),以真空泵餾除溶劑。進(jìn)行該操作3次。使如此所得的混合物在氬氣環(huán)境下溶解于吡啶(7ml)與四氫呋喃(7ml),添加分子篩4a并攪拌10分鐘。之后,添加4,4’-二甲氧基三苯甲基氯(0.54g,1.6mmol),更攪拌4小時。反應(yīng)結(jié)束后,添加二氯甲烷,以飽和碳酸氫鈉水溶液洗凈2次,再以飽和氯化鈉水溶液洗凈1次。以無水硫酸鈉使經(jīng)洗凈的有機(jī)層干燥后,減壓濃縮。以硅膠柱層析法(二氯甲烷:乙腈:甲醇=300:100:8,含0.05%吡啶)純化所得粗生成物,制得目的化合物(1023)(0.80g,收率73%)。以下顯示化合物(1023)的機(jī)器分析值。

化合物(1023):

1h-nmr(400mhz,cdcl3)δ:11.82(1h,s),8.63(1h,s),7.84(1h,s),7.43-7.21(9h,m),6.86-6.82(4h,m),6.06(1h,d,j=5.9hz),4.95(1h,t,j=5.7hz),4.78(2h,m),4.67-4.63(2h,m),4.50-4.45(1h,m),4.30-4.26(1h,m),3.81(6h,s),3.79-3.67(2h,m),3.44(2h,dd,j=10.6,3.7hz),2.91(1h,s),2.64-2.56(2h,m),1.66(3h,s).

[[4]5n2-苯氧乙?;?5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)鳥苷3’-o-(2-氰基乙基n,n-二異丙基亞磷酰胺)(1024)的合成]

以吡啶共沸蒸餾n2-苯氧基乙?;?5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)鳥苷(1023)(0.70g,0.84mmol),并以真空泵餾除溶劑。進(jìn)行該操作3次。于氬氣環(huán)境下,對如此所得的混合物添加四唑二異丙基銨(0.16g,0.92mmol)與乙腈(2ml)。于其反應(yīng)溶液中加入已溶解于乙腈(1ml)的2-氰基乙基-n,n,n’,n’-四異丙基亞磷酰二胺(0.51g,1.7mmol),并于40℃下攪拌5小時。攪拌后,添加二氯甲烷,以飽和碳酸氫鈉水溶液、飽和氯化鈉水溶液各洗凈1次。以無水硫酸鈉使經(jīng)洗凈的有機(jī)層干燥后,減壓濃縮。以硅膠柱層析法(乙酸乙酯:乙腈=40:1,含0.1%三乙胺)純化所得粗生成物,獲得目的化合物(1024)(0.56g,收率65%)。以下顯示化合物(1024)的機(jī)器分析值。

化合物(1024):

31p-nmr(162mhz,cdcl3)δ:152.7,152.6.

ms(fab+):m/z1055[m+na]+、1033[m+h]+

[實施例6:使用尿苷emm-亞酰胺(1009)合成尿苷40-鏈節(jié)(mer)(u40mer)]

使用實施例2合成的尿苷emm-亞酰胺(1009)及核酸自動合成機(jī)(expedite8909dna/rna合成儀:appliedbiosystems社的商品名),合成出下述序列編號1的序列所示的尿苷40鏈節(jié)。

5’-uuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuu-3’(序列編號1)

本實施例的尿苷40-鏈節(jié)合成過程中,固相載體使用已借連接子鍵合有2’-o-叔丁基二甲基甲硅烷基-5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)尿苷的cpg固相載體。再者,核酸單體化合物使用5’-o-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-o-(2-氰基乙氧基甲氧基甲基)尿苷3’-o-(2-氰基乙基n,n-二異丙基亞磷酰胺)即尿苷emm-亞酰胺(1009),縮合劑使用5-芐基巰基-1h-四唑,氧化劑使用碘溶液,加帽溶液則使用苯氧基乙酸溶液與n-甲基咪唑溶液。在此條件下,使前述核酸單體化合物縮合39次后,在固相上使5’端的羥基脫保護(hù),使用濃氨水-乙醇混合液(3:1),于40℃下耗費4小時從cpg固相載體切出及使各磷酸部位脫保護(hù)。使如此制得的反應(yīng)混合物減壓下濃縮后,于30℃下在含有0.67%硝基甲烷的1m氟化四丁基銨的dmso溶液中使其反應(yīng)4小時,使2’位羥基脫保護(hù)。對如此制得的溶液添加乙醇,使其發(fā)生沉淀,使該沉淀溶解于注射用水,即獲得含目的化合物(尿苷40-鏈節(jié))的水溶液。

將上述獲得的尿苷40-鏈節(jié)的hplc分析結(jié)果示于圖1。如圖所示,由于獲得了幾乎單一的尖峰,暗示了已獲得高純度的目的40-鏈節(jié)?;趫D1的峰強(qiáng)度所算出的尿苷40-鏈節(jié)的純度如圖所示,為74.64%(質(zhì)量比)。此外,將利用hplc將主峰部分分離純化后再次以hplc進(jìn)行分析的結(jié)果示于圖2。如圖所示,由于不純物的峰強(qiáng)度較圖1更為減低,暗示了目的的40-鏈節(jié)純度變得更高?;趫D2的峰強(qiáng)度所算出的尿苷40鏈節(jié)的純度如圖所示,為99.61%(質(zhì)量比)。此外,將該反應(yīng)混合物的質(zhì)譜分析結(jié)果(質(zhì)譜圖)顯示于圖3。如圖所示,觀測到分子量12184.52的分子離子峰。由于該分子量與目的的尿苷40-鏈節(jié)(u40mer)的分子量計算值12184.66顯示出良好的一致性,而確認(rèn)獲得了目的的尿苷40-鏈節(jié)(u40mer)。

另外,尿苷40-鏈節(jié)(u40mer)的hplc分析使用株式會社島津制作所的機(jī)器(hplc系統(tǒng))來測定,質(zhì)譜分析則以waters社的機(jī)器synaptg2(商品名)進(jìn)行。再者,使用胞苷emm-亞酰胺(1cac)(或(1014))、腺苷emm-亞酰胺(1aac)或鳥苷emm-亞酰胺(1gpac)的寡聚物合成也可與尿苷40-鏈節(jié)(u40mer)的合成相同地進(jìn)行。

[實施例7:使用4種emm-亞酰胺的rna合成]

使用實施例2合成的尿苷emm-亞酰胺(1009)、實施例3合成的胞苷emm-亞酰胺(1014)、實施例4合成的腺苷emm-亞酰胺(1019)及實施例5合成的鳥苷emm-亞酰胺(1024)共4種emm-亞酰胺,合成出各自以下述序列編號2~4表示的rna。

5’-auacuauucgacacgcgaaguuccccacaccggaacuucgcgugucgaauaguauucuucgg-3’(序列編號2)

5’-agcagcuguacauugacuuuagccccacaccggcuaaagucaauguacagcugcuucuucgg-3’(序列編號3)

5’-cuucgcgugucgaauaguauu-3’(序列編號4)

本實施例的合成中,除了核酸單體化合物使用尿苷emm-亞酰胺(1009)、胞苷emm-亞酰胺(1014)、腺苷emm-亞酰胺(1019)及鳥苷emm-亞酰胺(1024)共4種的emm-亞酰胺以外,與實施例6同樣地進(jìn)行。更具體來說,則是使前述4種emm-亞酰胺依照序列編號2~4中的任一者,使其從3’端側(cè)朝向5’端側(cè)依序縮合預(yù)定次數(shù)(序列編號2及3的合成為61次,序列編號4的合成為20次)來取代尿苷emm-亞酰胺(1009)的39次縮合。除此以外的條件則與實施例6完全相同。

將通過上述合成出的序列編號2~4的rna分別以hplc進(jìn)行分析,結(jié)果無論何者均獲得幾乎單一的尖銳尖峰。此現(xiàn)象暗示了,目的物的序列編號2~4的rna均為以高純度制得。將前述hplc的分析結(jié)果更詳盡地顯示如下。

基于前述hplc的峰強(qiáng)度比算出上述合成出的序列編號2的rna純度,結(jié)果為84.27%(質(zhì)量比)。此數(shù)值意味著使emm-亞酰胺縮合反應(yīng)61次的合成收率。即,1次縮合反應(yīng)的合成收率為約99.72%(質(zhì)量比)的高收率。此外,若以反應(yīng)混合物的質(zhì)譜分析來看,則觀測到分子量19756.13的分子離子峰。該分子量與序列編號2所示rna的分子量計算值(19755.71)顯示出良好的一致性。借此得以確認(rèn)已獲得目的物的序列編號2的rna。再者,將前述hplc的主要峰部分予以分離純化后,再次以hplc進(jìn)行分析。結(jié)果,不純物的峰強(qiáng)度更為降低,此暗示了目的物的序列編號2的rna已變得更高純度?;谇笆鲋饕宸蛛x純化后的峰強(qiáng)度比所算出的序列編號2的rna純度為96.47%(質(zhì)量比)。

此外,依據(jù)前述hplc的峰強(qiáng)度比,算出上述合成出的序列編號3的rna純度,結(jié)果為79.65%(質(zhì)量比)。此數(shù)值意味著使emm-亞酰胺縮合反應(yīng)61次的合成收率。即,1次縮合反應(yīng)的合成收率為約99.63%(質(zhì)量比)的高收率。若以該反應(yīng)混合物的質(zhì)譜分析來看,則觀測到分子量19755.70的分子離子峰。該分子量與序列編號3所示rna的分子量計算值(19755.71)顯示出良好的一致性。借此而得以確認(rèn)已獲得目的物的序列編號3的rna。再者,將前述hplc的主要峰部分予以分離純化后,再次以hplc進(jìn)行分析。結(jié)果,不純物的峰強(qiáng)度更為降低。依據(jù)前述主要峰分離純化后的峰強(qiáng)度比而算出的序列編號3的rna純度為95.37%(質(zhì)量比),較前述主要峰分離純化前更為高純度。

再者,依據(jù)前述hplc的峰強(qiáng)度算出上述合成的序列編號4的rna純度,結(jié)果為86.67%(質(zhì)量比)的高純度。若更以該反應(yīng)混合物的質(zhì)譜分析來看,則觀測到分子量6650.69的分子離子峰。該分子量與序列編號4所示rna的分子量計算值(6650.94)顯示出良好的一致性。借此得以確認(rèn)已獲得目的物的序列編號4的rna。更將主要峰部分以hplc予以分離純化,可借此更高純度地制得序列編號4的rna。

如同上述,依據(jù)本實施例,已確認(rèn)可使用對應(yīng)多種堿基的多種emm-亞酰胺而合成出任意序列的rna。此外,用于hplc及ms的測定機(jī)器則與實施例6相同。

以上為參照實施方案來說明本發(fā)明,但本發(fā)明并非局限在上述實施方案。本發(fā)明的構(gòu)成及詳細(xì)內(nèi)容可施加本領(lǐng)域普通技術(shù)人員在本發(fā)明的技術(shù)范疇(scope)內(nèi)所能理解的各種變更。

本申請主張以日本專利申請2011-184196號(2011年8月25日提出申請)作為基礎(chǔ)的優(yōu)先權(quán),并于此納入其全部的揭示內(nèi)容。

產(chǎn)業(yè)上的可利用性

如上述說明,若依照本發(fā)明的配糖體化合物、硫醚的制造方法、醚、醚的制造方法、配糖體化合物的制造方法,其可提供一種可以低成本地進(jìn)行制造并可高收率且高純度制造核酸的亞磷酰胺。此外,如依照本發(fā)明的核酸制造方法,則可使用前述亞磷酰胺而高收率且高純度地制造核酸。本發(fā)明所制造的前述硫醚、醚、配糖體化合物或核酸的用途未特別受限,可使用在廣泛的用途上。依據(jù)本發(fā)明,舉例來說,由于可低成本、高純度且高收率地制造它們,它們可適于用作醫(yī)藥品或其合成中間產(chǎn)物。

序列表

<110>株式會社博納克

<120>配糖體化合物、硫醚的制造方法、醚、醚的制造方法、配糖體化合物及核酸的制造方法

<130>tf12013two

<150>jp2011-184196

<151>2011-08-25

<160>4

<170>patentinversion3.5

<210>1

<211>40

<212>rna

<213>人工序列

<220>

<223>聚尿苷

<400>1

uuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuuu40

<210>2

<211>62

<212>rna

<213>人工序列

<220>

<223>核酸分子

<400>2

auacuauucgacacgcgaaguuccccacaccggaacuucgcgugucgaauaguauucuuc60

gg62

<210>3

<211>62

<212>rna

<213>人工序列

<220>

<223>核酸分子

<400>3

agcagcuguacauugacuuuagccccacaccggcuaaagucaauguacagcugcuucuuc60

gg62

<210>4

<211>21

<212>rna

<213>人工序列

<220>

<223>核酸分子

<400>4

cuucgcgugucgaauaguauu21

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