專利名稱:人同源盒基因LHX4全長(zhǎng)cDNA序列的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及一種人同源盒基因序列,具體涉及人同源盒基因LHX4的全長(zhǎng)cDNA序列。
同源盒基因(homeobox gene)是1983年在瑞士Gehring實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)的一類基因,它們因在其基因外顯子3′端共同具有一段長(zhǎng)180個(gè)堿基對(duì)、高度保守的同源盒序列而得名,同源盒基因的表達(dá)產(chǎn)物是一類重要的轉(zhuǎn)錄因子,是發(fā)育的主控基因。由這段序列所翻譯出的蛋白質(zhì)更具保守性,并富含堿性氨基酸,因此稱為同源盒區(qū)(homeodomain)。LIM同源盒基因(LIM homeoboxgene)屬于同源盒基因家族,它不僅具有同源盒結(jié)構(gòu),而且含有兩個(gè)富含半胱氨酸和組氨酸的LIM結(jié)構(gòu)域。LIM結(jié)構(gòu)域的名稱是由LIM家族中三個(gè)基因Lin-11(線蟲(chóng))、Isl-1(鼠)和Mec-3(線蟲(chóng))名稱的首字母縮寫而成。LIM同源盒轉(zhuǎn)錄因子(LIM homeodomain transcription factor,LIM-HD)是指LIM同源盒基因的蛋白質(zhì)表達(dá)產(chǎn)物,大多表達(dá)在神經(jīng)系統(tǒng),具有早期特征的的形成及后期調(diào)控組織特異性基因的表達(dá)等功能,因而這些基因決定脊柱和非脊柱動(dòng)物發(fā)育中組織和細(xì)胞特異性分化。
LHX4基因(LIM homeobox gene 4)屬于LIM同源盒基因家族。1994年,美國(guó)Hung Li等人依據(jù)同源盒區(qū)最保守的氨基酸序列“KIWFQNRR”設(shè)計(jì)了一個(gè)含有編碼同源盒序列羧基端14個(gè)氨基酸序列的基因克隆,然后用這段基因序列去篩選小鼠胚胎cDNA文庫(kù)后得到一個(gè)1196bp的cDNA陽(yáng)性克隆。這個(gè)克隆含有一段編碼170個(gè)氨基酸的翻譯區(qū),它的位置從3′poly-A一直延伸到homeobox的5′端,因而它與LHX3有較高的同源性而命名為L(zhǎng)HX4(Li Hung,Witte DP,Branford WW et al.Gsh-4 encodes a LIM-typehomeodomain is expressed in the developing central nervous system and isrequired for early postnatal survival.The EMBO J,1994,132876-2885)。但由于LHX4基因在機(jī)體內(nèi)的表達(dá)量很低,此后國(guó)內(nèi)外一直沒(méi)有獲得小鼠或其他物種LHX4基因的cDNA全長(zhǎng)序列。
本發(fā)明的目的是提供一種可以在成人中樞神經(jīng)系統(tǒng)組織中得到表達(dá)的人LHX4基因的cDNA全長(zhǎng)序列。
本發(fā)明的發(fā)明人以LHX4 pBluescript質(zhì)粒(Li H,Witte DP,Branford WWet al.Gsh-4 encodes a LIM-type homeodomain is expressed in the developingcentral nervous system and is required for early postnatal survival.The EMBO J,1994,132876-2885對(duì)該質(zhì)粒有詳細(xì)描述)中小鼠LHX4基因cDNA 3′端部分序列為探針,應(yīng)用放射性原位雜交技術(shù)篩選人脊髓cDNA文庫(kù),在數(shù)百個(gè)陽(yáng)性克隆中意外地得到一個(gè)含有完整的開(kāi)放性閱讀框架(opening reading frame,ORF)、3′端有明顯的Poly A結(jié)構(gòu)的陽(yáng)性克隆。它編碼一個(gè)含399個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì),與已知小鼠LHX4蛋白質(zhì)僅有3個(gè)不同的氨基酸。該克隆的核酸序列與小鼠LHX4(AF135415)cDNA序列有92%的相似性,具體表示為GACGTCGCATGCTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGGGAATTCGATTGGTGGCGACGACTCCTGGAGCCCGTCAGTATCGGCGGAATTCGCGGCCGCGTCGACCGGAGAGCGAGATCAAAGGGATTGGAAACAGACTGGGGACTGGCGGGGGGAGGGGGCCGGCCAGCCTGTGGAGTCCTCCCTGAGAAGCGGAGGGCCCGGCTTCCACCGTGACTCCAGCGGCCTGCTTGGGGTTTTAATTATTATTTTGAAATTTCTGAATCGAGCTAGAGCGAGAGAGCGAGAGATCTCCGTAGACTGCGACTCGCTGGCTTTCGCTCCGAGATGATGCAGAGTGCGACTGTCCCCGCGGAAGGGGCTGTCAAGGGGCTCCCGGAGATGCTAGGTGTGCCGATGCAACAGATTCCCCAGTGCGCTGGCTGCAACCAGCACATCCTGGACAAGTTCATCCTGAAGGTCCTGGACAGACACTGGCACAGCTCCTGCCTCAAGTGTGCAGACTGCCAGATGCAGCTGGCGGACAGGTGCTTCTCCAGGGCTGGGAGCGTCTACTGCAAGGAGGACTTCTTCAAGCGCTTCGGCACAAAATGCACGGCCTGCCAGCAGGGTATCCCCCCAACCCAGGTGGTCCGCAAGGCCCAGGACTTTGTCTACCACCTGCACTGCTTTGCTTGCATCATCTGCAACCGGCAGCTGGCCACGGGGGACGAATTCTACCTCATGGAGGACGGGCGGCTGGTGTGCAAGGAAGACTACGAGACAGCCAAGCAGAACGATGACTCAGAGGCTGGAGCTAAGCGGCCCCGGACCACCATCACAGCCAAGCAGCTGGAGACATTAAAGAATGCATACAAGAACTCCCCCAAGCCTGCCCGGCACGTGAGGGAGCAGCTGTCCTCAGAGACAGGCCTGGACATGAGGGTCGTACAGGTTTGGTTTCAGAACAGAAGGGCCAAAGAGAAACGCCTGAAGAAGGATGCAGGGCGGCACCGCTGGGGGCAGTTCTATAAGAGCGTCAAGAGGAGCCGGGGCAGCAGCAAGCAGGAGAAGGAGAGCTCTGCAGAGGACTGTGGGGTTAGTGACAGTGAGCTGAGCTTCCGAGAGGATCAAATTCTCTCAGAACTTGGCCACACCAATAGGATTTATGGCAACGTGGGGGACGTTACAGGCGGACAGTTAATGAATGGGAGCTTCTCCATGGACGGGACAGGACAATCCTATCAGGACTTGAGGGATGGGAGCCCCTATGGAATCCCCCAGTCTCCATCCTCCATATCGTCCCTGCCATCCCACGCTCCTTTGCTCAATGGGCTGGATTACACGGTGGACAGTAATTTGGGCATCATTGCGCATGCAGGGCAGGGAGTAAGCCAGACGCTGAGAGCCATGGCTGGGGGACCCACCTCTGACATCTCCACAGGAAGCAGTGTAGGCTATCCCGACTTTCCAACTAGCCCAGGCTCTTGGCTCGATGAAATGGATCATCCTCCTTTTTAAACTTCTCTCCTCCCCACCCTACCTGCCCCCCTGGCTTGAGAGAATATCTTCAAGGATCAAAAGAGACTTGCCTTTTAAGGATCGAAAGTACGCCAATGTGAATTTCCATTATTTTCAATGGAAGTCCTCCGCTGATTCCTAGAAGGCTGTGAGACCACACTAGGGCATTGTTTCCCTGGGGAAGCAGTGGGAGAGCAGACTCATCTCAGAACACAGCACAGGGGGTAATGGCCTAGAGCTCTAGGGACACTGGCTTGTTGGGTCTCTCCCCTGCTGTTCTGCTTAGGGGCTTGGCTGCTCAGTGCTTTGGTAGCACAAGGTGACTGTGATAGGCCCCCTTGGCCTTTGGGAACTTTGCTCCAACTGGTGTGTCTCACACAATGCCTCGTCGACGCGGCCGCGAATTCCAGCTGAGCGCCGGTCGCTACCATTACCAGTTGGTCTGGTGTCAAAATCACTAGTGAATTCGCGGCCGCCTGCAGGTCGACCATATGGGAGAGCTCCCAACGCGTTGGATGCArAGC通過(guò)RHGB4(Radiation Hybridization GeneBridge4)法和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)檢索兩種方法對(duì)上述人LHX4基因的外顯子區(qū)域進(jìn)行了劃分,結(jié)果發(fā)現(xiàn)人LHX4基因包含6個(gè)外顯子。外顯子序列為
ATGGATCATCCTCCTTTT其中同源盒區(qū)(homeodomain)由外顯子2和3共同表達(dá)構(gòu)成;LIM結(jié)構(gòu)域1(LIM domain 1)由外顯子5表達(dá),LIM結(jié)構(gòu)域2(LIM domain 2)由外顯子4表達(dá)。
接著,本發(fā)明的發(fā)明人利用已得到的人LHX4基因cDNA序列為探針,在成人多組織表達(dá)Array膜(multiple tissue expression array,MTE array)上通過(guò)放射性雜交的方法,研究了LHX4基因在成人不同組織中的表達(dá)情況,結(jié)果顯示全腦、大腦皮層、脊髓和胎腦有雜交信號(hào)出現(xiàn)。其中以胎腦信號(hào)最強(qiáng)。其余由強(qiáng)到弱依次為脊髓、全腦和大腦皮層,而人體其他組織中則沒(méi)有雜交信號(hào)出現(xiàn)。
他人和本發(fā)明的發(fā)明人都用實(shí)驗(yàn)證明,LHX4是軀體運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元發(fā)育和分化過(guò)程中發(fā)揮重要作用,是調(diào)節(jié)運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元發(fā)育分化和軸突投射模式形成的一類重要轉(zhuǎn)錄因子(Sharma K,Sheng HZ,Lettier K et al.LIM homeoboxfactors Lhx3and LHX4 assign subtype identities for motor neurons.Cell,1998,95817-828;Thor S and Thomas JB.The Drosophila islet gene governs axonpathfinding and neurotransmitter identity.Neuron,1997,18397-407)。
本發(fā)明中使用的英文縮寫及其中文意義為英文縮寫 其中文意義Amp 氨芐青霉素BSA 牛血清白蛋白dCTP 2′-脫氧胞苷三磷酸ddH2O雙蒸水DEPC 焦碳酸二乙酯IPTG 異丙基硫代-β-D-半乳糖苷NC 硝酸纖維素NTP 三磷酸核苷PEG 聚乙二醇SDS 十二烷基硫酸鈉SSC 標(biāo)準(zhǔn)檸檬酸鹽氯化鈉溶液Tris 三羥甲基氨基甲烷X-gal5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷下面用實(shí)施例結(jié)合附圖對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步詳細(xì)說(shuō)明。
圖1為L(zhǎng)HX4-pBluescript II SK(+/-)質(zhì)粒圖譜。
圖2為L(zhǎng)HX4 pBluescript II SK(+/-)質(zhì)粒中所插入的小鼠LHX4翻譯區(qū)序列,圖中黑色下劃線的區(qū)域即為探針的序列。
圖3為探針的PCR擴(kuò)增和玻璃奶純化結(jié)果(L200bp Ladder,A探針的PCR擴(kuò)增,B探針的玻璃奶純化)。
圖4為放射性原位雜交篩庫(kù)示意圖(A第一輪雜交,B第二輪雜交,C第三輪雜交)。
圖5為第一輪雜交的克隆進(jìn)行PCR鑒定(L200bp Ladder,C-陰性對(duì)照,C+陽(yáng)性對(duì)照,1-7依次為陽(yáng)性克隆SC1,SC4,SC6,SC7,SC8,SC11,SC14)。
圖6為第二輪雜交Lhx4特異性引物PCR鑒定結(jié)果(L200bp Ladder,C-陰性對(duì)照,C+陽(yáng)性對(duì)照,1-13依次為陽(yáng)性克隆SC11,SC12,SC13,SC14,SC61,SC62,SC63,SC64,SC71,SC111,SC112,SC141,SC143)。
圖7為第二輪雜交λgt11引物PCR鑒定結(jié)果(L200bp Ladder,C-陰性對(duì)照,1-13依次為陽(yáng)性克隆SC11,SC12,SC13,SC14,SC61,SC62,SC63,SC64,SC71,SC111,SC112,SC141,SC143)。
圖8為第三輪雜交Lhx4特異性引物PCR鑒定結(jié)果(L200bp Ladder,C-陰性對(duì)照,1-5依次為陽(yáng)性克隆SC112,SC613,SC1111,SC1411,SC712)。
圖9為第三輪雜交λgt11引物鑒定結(jié)果(L200bp Ladder,C-陰性對(duì)照,C+陽(yáng)性對(duì)照,1-5依次為陽(yáng)性克隆SC112,SC613,SC1111,SC1411,SC712)。
圖10為陽(yáng)性克隆插入片段的玻璃奶純化(1-5依次為陽(yáng)性克隆SC112,SC613,SC1111,SC1411,SC712)。
圖11為L(zhǎng)HX4基因全長(zhǎng)cDNA序列圖12為Promega柱純化法回收純化探針(L200bp Ladder,A純化的LHX4探針)。
圖13為MTE Array膜與人LHX4 cDNA探針雜交結(jié)果。
圖14為L(zhǎng)HX4基因所含6個(gè)外顯子序列實(shí)施例1.人同源盒基因LHX4全長(zhǎng)cDNA序列的篩選和克隆一.材料主要化學(xué)試劑IPTG、X-gal(Promega公司),DEPC、明膠、溴化乙錠(Sigma公司),Tris堿、Agar、Agarose(GIBCO-BRL公司),SDS(Promega公司)、麥芽糖(Merck公司),其它各種試劑均為進(jìn)口或國(guó)產(chǎn)分析純?cè)噭?br>
主要儀器Mili-Q超純水系統(tǒng)(Milipore公司),紫外分光光度計(jì)(Beckman),紫外交聯(lián)儀(Bio-Rad GS Gene LinkerTM),PCR儀(PE公司480型),數(shù)碼相機(jī)和掃描儀(Kodak公司),冷凍高速離心機(jī)、冷凍臺(tái)式離心機(jī)、臺(tái)式離心機(jī)、溫箱、電泳儀、紫外檢測(cè)儀(均為國(guó)產(chǎn))。
質(zhì)粒LHX4-pBluescript質(zhì)粒(美國(guó)NIH Hui Z和Heiner Westphal實(shí)驗(yàn)室饋贈(zèng))cDNA文庫(kù)人脊髓cDNA文庫(kù)(Clontech公司)探針標(biāo)記Ex Taq PCR系統(tǒng)(TaKaRa公司),Primer-a-Gene labelingSystem(Promega公司),玻璃奶DNA純化回收試劑盒(北京原平公司),雜交Hybond雜交膜(Amersham公司),Express雜交液(Clontech公司),雜交爐(Heraeus公司),[α-32P]dCTP(北京亞輝公司),X光片(Fuji公司)克隆菌種E.Coil.DH5α,Y1090(本室存貨,可從一般商業(yè)專業(yè)公司購(gòu)買);載體T-EASY Vector(Promega公司);引物λgt11的上下游引物(Sangon公司);PCREX Taq PCR體系和Pyrobest Taq PCR體系(TaKaRa公司)。
序列分析測(cè)序儀PE公司377型測(cè)序儀(大連TaKaRa公司);序列分析美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)網(wǎng)站BLAST程序DNASIS 4.0軟件(Hitachi軟件公司)。
二.方法1.小鼠LHX4-pBluescript質(zhì)粒的獲得和測(cè)序由于我們得到了國(guó)外實(shí)驗(yàn)室饋贈(zèng)的插入小鼠LHX4部分cDNA片段的LHX4-pBluescript質(zhì)粒,為了保證插入序列的準(zhǔn)確,我們對(duì)其進(jìn)行了擴(kuò)增和測(cè)序。
1.1.小鼠LHX4-pBluescript質(zhì)粒的擴(kuò)增和純化(1).以2μl連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化200μl E.coli DH5α感受態(tài)細(xì)菌。轉(zhuǎn)化后的DH5-α10μl涂布于LB/Agar/Amp+/IPTG+/X-Gal+的平板上37℃培養(yǎng)18~20小時(shí)。
(2).重組克隆的篩選和鑒定。挑選白色透明菌落,接種到50ml LB/Amp+(100μg Amp/ml LB),220rpm,37℃搖菌12小時(shí)。以堿裂解法小提質(zhì)粒。質(zhì)粒溶于20μl。以Hind III、BamH I雙酶切鑒定重組質(zhì)粒。2.0μl 10x MultBuffer、1.0μl Hind III(20U/μl)、1.0μl BamH I(10U/μl)、0.8μl RNase A(10mg/ml,Promega)、0.2μl BSA、10μl Plasmid preparation、共20μl混勻,37℃保溫2小時(shí),以1.5%瓊脂糖凝膠電泳鑒定酶切產(chǎn)物。用200bp PCRLadder(華美公司)作DNA大小的參照物。
(3).質(zhì)粒測(cè)序模板的提取a.挑取陽(yáng)性克隆接菌到6ml LB/Amp+液體培養(yǎng)基中,37℃、220rpm搖菌12~16小時(shí)。
b.室溫離心收集細(xì)菌,以200μl GTE(50mM glucose,25mM Tris.HClpH8.0,10mMEDTA)懸浮細(xì)菌。
c.加300μl新鮮配置的裂解液(0.2M NaOH,1%SDS),溫和顛倒離心管10次以混勻內(nèi)容物,置冰上5分鐘。
d.加300μl中和液(3M KAC,5M HAC,pH4.8),溫和顛倒離心管12~14次以混勻內(nèi)容物。置冰上5分鐘。
e.室溫12,000rpm離心10分鐘。
f.轉(zhuǎn)移上清至新離心管,加4μl RNase A(10mg/ml),37℃溫育30分鐘。
g.以500μl等體積氯仿酚抽提兩次,再以500μl氯仿抽提一次,留取上清。
h.加等體積異丙醇,混勻,室溫10,000rpm離心10分鐘。
i.棄上清,以75%乙醇洗滌沉淀,吸盡殘液。
j.以33.6μl ddH2O懸浮沉淀,加6.4μl 5M NaCl,40μl 13%PEG8000,混勻,冰浴20分鐘。
k. 4℃ 12,000rpm離心12分鐘,小心吸盡上清。
l.以10μlddH2O溶解質(zhì)粒沉淀。以0.8%瓊脂糖凝膠電泳鑒定質(zhì)粒并測(cè)定質(zhì)粒濃度。只有無(wú)RNA污染,且超螺旋成分含量大于90%的質(zhì)粒才能用于測(cè)序。
1.2.測(cè)序?qū)⑸鲜黾兓蟮馁|(zhì)粒20μl送大連TaKaRa公司,使用377型測(cè)序儀(PE公司)測(cè)序。
2.小鼠LHX4 cDNA探針的制備2.1. PCR擴(kuò)增特異的部分LHX4 cDNA片段(1).合成上下游引物引物濃度為100μmol上游引物(primer 1)5′gccatcgctggggccagttc3′下游引物(primer 2)5′ctaaaaaggaggatggtcc3′(2).PCR擴(kuò)增PCR buffer 2μl、DNTP 2μl、primer 1 1μl、primer 2 1μl、Ex Taq 0.5μl、模板0.5μl和ddH2O 13μl,共20μl于94℃變性3-5分鐘。94℃ 40秒,60℃ 1分鐘,72℃ 1分鐘,30個(gè)循環(huán)。72℃延伸10分鐘。結(jié)束反應(yīng)后1.5%Agarose凝膠電泳鑒定。
2.2. PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的純化玻璃奶(Glass milk)法回收DNA片段DNA樣品經(jīng)1×TAE緩沖液配制的瓊脂糖凝膠電泳,EB染色后,長(zhǎng)波紫外燈下切下欲回收DNA片段,在Eppendorf管中搗碎,加入3倍體積的溶膠液,60℃水浴5分鐘(其間輕搖Eppendorf管數(shù)次使膠完全溶化),加入10μl玻璃奶,用加樣器混勻,室溫靜置5分鐘,離心8000rpm數(shù)秒,去上清,加125μl漂洗液,用加樣器吸漂洗液將玻璃奶沖散均勻,8000rpm離心去上清(重復(fù)3次),再加20μl TE或滅菌蒸餾水,混勻,60℃水浴5分鐘,離心15000rpm數(shù)秒,回收上清備用。
2.3.小鼠LHX4 cDNA探針的同位素標(biāo)記采用隨機(jī)引物標(biāo)記試劑盒標(biāo)記(Prime-a-Gene Labeling System,Promega),操作步驟同Promega公司操作手冊(cè)。用于標(biāo)記的DNA來(lái)源于PCR擴(kuò)增的片段。(1).25ng的DNA,用水補(bǔ)足30μl,98℃變性4分鐘,快速放到冰上。(2).依次向管中加入以下試劑成分 體積 終濃度5×標(biāo)記緩沖液 10μldNTP混合物(無(wú)dCTP) 2μl 每種20μM10mg/ml BSA 2μl 400μg/ml(3).將1,2兩管混勻,然后加入成分 體積 終濃度〔α-32P〕dCTP 5μl 50μ Ci,3,000/mmolKlenow酶(5U/μl)1μl 100U/ml室溫標(biāo)記1小時(shí),取1μl按下述方法測(cè)定標(biāo)記效率,剩余的探針98℃變性5分鐘后加入雜交液中。將1μl標(biāo)記產(chǎn)物稀釋500倍,取5μl按三氯乙酸沉淀法測(cè)定標(biāo)記效率。探針的比活度一般約為1×108~1×109cpm/μg.。
3.人脊髓cDNA文庫(kù)的篩選3.1.cDNA文庫(kù)滴度的測(cè)定(1).宿主菌Y1090的活化從瓊脂平板上挑取單克隆Y1090菌落于LB培養(yǎng)液中含10mM MgSO4,0.2%麥芽糖),37℃搖過(guò)夜。離心后用10mM MgSO4再次懸浮,置于4℃。
(2).將原裝的人脊髓cDNA文庫(kù)分裝后,進(jìn)行如下稀釋
5μl原液取5μl 取5μl 取5μl+→ +→ →+ +500μl SM 500μl SM500μl SM500μl SM1∶1021∶1041∶1051∶1061 234(3).將1,2,3,4號(hào)稀釋液2μl,加入200μl活化好的Y1090宿主菌中,混勻后置于37℃水浴中吸附15-20分鐘。
(4).化頂層膠(0.7%Agrose+LB+1.5%Agar+10mM MgSO4),以3ml/管分裝,置于50℃水浴中。
(5).將(3)中2,3,4號(hào)混合液加入(4)中分好的頂層膠中,迅速到入鋪好底層的90mm平板中(LB+1.5%Agar+10mM MgSO4),搖勻,吹干。倒置于37℃溫箱中培養(yǎng)7-8小時(shí),觀察,記生長(zhǎng)克隆數(shù)。
3.2.噬菌斑原位雜交篩選cDNA文庫(kù)(1).準(zhǔn)備30塊130mm平板,鋪底層膠(LB+1.5%Agar+10mM MgSO4),風(fēng)干30分鐘后置37℃ 1小時(shí)。
(2).配頂層膠(0.7%Agrose+LB+1.5%Agar+10mM MgSO4),按7ml/管分裝,50℃保溫。
(3).按1∶100稀釋噬菌體液(5μl/500μl SM),取稀釋液3μl置于300μl Y1090菌中混勻后,37℃吸附20分鐘。
(4).將(3)中每份混合物加入(2)的每一管中,并迅速鋪?lái)攲樱蹈珊蟮怪?7℃培養(yǎng)7-8小時(shí)。
(5).待到嗜菌斑生長(zhǎng)的透亮,均勻,直徑接近1.5mm左右時(shí)停止培養(yǎng),將平皿置4℃保存,以加固培養(yǎng)基硬度。這時(shí)每個(gè)平板上約有3萬(wàn)個(gè)克隆,總共鋪100萬(wàn)個(gè)克隆。
(6).將NC膜(132mm,0.45μ)30張編號(hào),平板依NC膜順序編號(hào)。
(7).將NC膜置于平板頂層膠面上1-2分鐘,轉(zhuǎn)移噬菌體DNA至硝酸纖維素膜上,并對(duì)NC膜進(jìn)行標(biāo)記。
(8).將NC膜印跡面朝上置于3M濾紙上晾干。并依次通過(guò)變性液(0.5NNaOH,1.5M NaCl)5分鐘×2次,中和液(0.5M Tris-HCl,pH7.4,1.5M NaCl)5分鐘,漂洗液(2×SSC)短暫漂洗。晾干,置80℃烘烤2小時(shí)固定DNA。
(9).雜交液100ml(6×SSC,0.5%SDS,5×Denhardt)預(yù)熱至68℃。
(10).鮭精DNA(10mg/ml)1ml,98℃變性5分鐘,加入預(yù)熱的雜交液中,與NC膜預(yù)雜交1-2小時(shí)。
(11).更換雜交液并加入變性探針,68℃雜交18小時(shí)。雜交期間保持均勻震蕩和恒溫。
(12).雜交后以I液(0.1%SDS+2×SSC)洗膜三次,15分鐘/次。II液(0.1%SDS+1×SSC)洗膜兩次,并監(jiān)測(cè)信號(hào)強(qiáng)度。
(13).將洗好的膜置3M濾紙上晾干后壓X光片,-70℃曝光24-72小時(shí)。
3.3.陽(yáng)性克隆的鑒定和純化(1).對(duì)照X光片,從培養(yǎng)皿上相應(yīng)部位挑取陽(yáng)性克隆噬菌斑,并將其懸浮于200μl SM(含20-30μl氯仿)溶液中,4℃過(guò)夜,使噬菌體從膠中釋放出來(lái)。
(2).用PCR鑒定陽(yáng)性噬菌斑,PCR條件同前。PCR重復(fù)一次,確保結(jié)果的準(zhǔn)確性。
(3).根據(jù)第一次挑出的陽(yáng)性噬斑含有10個(gè)單克隆噬斑估計(jì)。第二次鋪板使每個(gè)平板的克隆數(shù)達(dá)到100-200個(gè)/板。
(4).再次進(jìn)行噬菌斑原位雜交(方法同前)。使每板陽(yáng)性克隆數(shù)達(dá)占克隆總數(shù)的60%。
(5).挑取單克隆陽(yáng)性噬斑,PCR鑒定后,用λgt11載體引物擴(kuò)增插入序列。
LHX4特異性引物PCR鑒定上游引物(primer 1)5′gccatcgctggggccagttc3′下游引物(primer 2)5′ctaaaaaggaggatggtcc3′λgt11載體引物
Forward Primer5′GGTGGCGACGACTCCTGGAGCCCG3′Reverse Primer5′TTGACACCAGACCAACTGGTAATG3′PCR反應(yīng)體系EX PCR buffer 2μl、DNTP 2μl、Forward primer 0.4μl、Reverse primer 0.4μl、Ex Taq 0.2μl、模板1μl和ddH2O 14μl共20μl于94℃變性3-5分鐘;94℃ 40秒,55℃ 1分鐘,72℃ 1分鐘,30個(gè)循環(huán);72℃延伸10分鐘;結(jié)束反應(yīng)后1.5%Agarose凝膠電泳鑒定。
(6).對(duì)擴(kuò)增到(大于1.2Kb)的陽(yáng)性克隆準(zhǔn)備進(jìn)行克隆測(cè)序。
3.4.克隆和測(cè)序(1).對(duì)陽(yáng)性克隆進(jìn)行高保真PCR擴(kuò)增使用TaKaRa公司Pyrobest Taq酶(ProofReading)系統(tǒng)Pyrobest buffer 5μl、dNTP 4μl、forward primer 1μl、reverse primer 1μl、Pyrobest Taq 0.5μl、模板2.5μl和ddH2O 36μl,共50μl于94℃變性3-5分鐘;94℃ 40秒,55℃ 1分鐘,72℃ 2分鐘,30個(gè)循環(huán);72℃延伸10分鐘;結(jié)束反應(yīng)后1.5%Agarose凝膠電泳鑒定。
(2).PCR產(chǎn)物的純化玻璃奶純化(方法同前)。
(3).回收片段與PGEM-T EASY載體的連接連接體系為2×Rapidligation buffer 5μl、PCR回收片段(30ng)3μl、PGEM-T EASY載體1μl、T4 DNA ligase(3 Weiss Unit/ul)1μl,共10μl于4℃連接12小時(shí)。
(4).重組子轉(zhuǎn)化E.coil.DH5a菌株a.感受態(tài)的制備來(lái)自單菌落的DH5a經(jīng)過(guò)夜活化后,1∶100接種于50mlLB培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)2-3小時(shí)至OD600=0.4-0.6。冰浴10分鐘,立即于4℃,4000rpm離心10分鐘,棄上清,菌體重懸于10ml冰預(yù)冷的0.1mol/LCaCl2,冰浴20分鐘后4℃4000rpm離心10分鐘,收集菌體重懸于1-2ml預(yù)冷的0.1mol/L CaCl2中,放置4℃過(guò)夜備用。
b.轉(zhuǎn)化取200μl感受態(tài)細(xì)胞于無(wú)菌離心管中,加入連接產(chǎn)物4-6μl并混勻,冰浴中放置30分鐘,然后置42℃熱休克90秒,迅速轉(zhuǎn)入冰浴,2分鐘后加800μl LB培養(yǎng)基,37℃緩慢振動(dòng)培養(yǎng)1小時(shí)以恢復(fù)抗生素抗性。取100μl轉(zhuǎn)化菌液涂布于瓊脂平板(100μg/ml Amp+,X-gal+,IPTG+),室溫放置30分鐘后37℃孵箱倒置培養(yǎng)12-16小時(shí)待克隆形成。
(5).藍(lán)白斑篩選和質(zhì)粒的小量提取用接種環(huán)挑取平板中白色單菌落,接種于3-5ml Amp+的LB液體培養(yǎng)基中,37℃恒溫?fù)u床中振蕩過(guò)夜,使細(xì)菌生長(zhǎng)至對(duì)數(shù)晚期,然后將菌液轉(zhuǎn)入1.5mlEppendorf管,高速離心1分鐘,去上清。向沉淀中加入100μl冰預(yù)冷的溶液I[50mmol/L葡萄糖、25mmol/L Tris-HCl(pH8.0)、10mmol/L EDTA(pH8.0)]懸浮細(xì)胞,置冰浴中,再加入200μl現(xiàn)配的溶液II(0.2mol/L NaOH、1%SDS),上下顛倒Eppendorf管數(shù)次至液體變得清澈,加入150μl溶液III(5mol/L乙酸鉀60ml、冰乙酸11.5ml、水28.5ml),倒置Eppendorf管振蕩,使溶液充分混勻后,將Eppendorf管置冰浴中3-5分鐘,4℃ 12000rpm離心5分鐘,收集上清,加等體積平衡酚振蕩混合,12000rpm離心3分鐘,收集上層水相,再用酚∶氯仿∶異戊醇(25∶24∶1)抽提,加兩倍體積乙醇,混勻后室溫下放置15分鐘,4℃ 12000rpm離心5分鐘,去上清,用1ml 70%乙醇洗滌沉淀,去上清,空氣中干燥,然后將沉淀溶于20μl含RNA酶(20μg/ml)的水中,37℃保溫1小時(shí),-20℃凍存待用。
(6).酶切鑒定根據(jù)不同限制性內(nèi)切酶的具體要求進(jìn)行。
以ApaI、PstI雙酶切鑒定重組質(zhì)粒。2.0μl 10x Multbuffer,1.0μlApaI(10U/μl),1.0μl PstI(10U/μl),0.8μl RNase A(10mg/ml,Promega),0.2μl BSA,10μl Plasmid preparation共20μl混勻,37℃保溫2小時(shí),以1.5%Agrose凝膠電泳鑒定酶切產(chǎn)物。用200bp PCR Ladder(華美公司)作DNA大小的參照物。
(7).PEG法純化質(zhì)粒溶解在30μl中的質(zhì)粒(5-8μg),加10μl(30%PEG8000、1.5mol/LNaCl),冰上放置60分鐘。4℃ 12000rpm離心10分鐘,去上清,70%乙醇、100%乙醇各洗滌一次,空氣中干燥,再溶于20μl H2O中,作為測(cè)序反應(yīng)模板。
(8).測(cè)序?qū)?7).中純化好的測(cè)序反應(yīng)模板20μl送大連TaKaRa公司測(cè)序。
3.5陽(yáng)性克隆的序列分析cDNA序列的翻譯使用的是DNASIS 4.0版本(Hitachi軟件公司)。DNA及蛋白質(zhì)的同源性比較用BLAST軟件[20]與NCBI GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比較。
三、結(jié)果1.小鼠LHX4-pBluescript II SK(+/-)質(zhì)粒的插入序列和探針制備1.1.探針序列的選擇根據(jù)對(duì)小鼠LHX4-pBluescript II SK(+/-)質(zhì)粒(見(jiàn)圖1)的插入片段的測(cè)序結(jié)果,選擇小鼠LHX4 3′端特異的cDNA序列為探針不包含LIM結(jié)構(gòu)域和homeobox結(jié)構(gòu)域(序列見(jiàn)圖2)。
1.2.探針的純化用PCR的方法,以質(zhì)粒為模板,擴(kuò)增所需的cDNA片段,并用玻璃奶純化(結(jié)果見(jiàn)圖3)。
2.放射性原位雜交法篩選人脊髓cDNA文庫(kù)2.1.放射性原位雜交在第一輪雜交中,人脊髓cDNA文庫(kù)共鋪100萬(wàn)個(gè)克隆,雜交后挑選25個(gè)克隆,經(jīng)PCR鑒定7個(gè)陽(yáng)性克隆為SC1,SC4,SC6,SC7,SC8,SC11,SC14。將第一輪雜交陽(yáng)性克隆再次鋪板,第二輪雜交后共挑選21個(gè)克隆經(jīng)LHX4特異性引物和λgt11載體特異性引物PCR鑒定后,去除插入片段<1.2Kb的克隆,得到13個(gè)陽(yáng)性克隆,分別為SC11,SC12,SC13,SC14,SC61,SC62,SC63,SC64,SC71,SC111,SC112,SC141,SC143。第三輪雜交后共挑選70個(gè)單克隆,經(jīng)LHX4特異性引物和λgt11載體特異性引物PCR鑒定后,挑選5個(gè)陽(yáng)性克隆為SC112,SC613,SC1111,SC1411,SC712.(結(jié)果見(jiàn)圖4~圖9)。
3.陽(yáng)性克隆的鑒定及序列分析3.1.將陽(yáng)性克隆的插入片段克隆入T-Easy載體并進(jìn)行序列分析將λgt11引物擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物玻璃奶純化后與T-Easy載體相連,酶切鑒定陽(yáng)性克隆并進(jìn)行測(cè)序(結(jié)果見(jiàn)圖10)。
3.2.SC712序列分析我們將6個(gè)樣品的質(zhì)粒純化后送大連TaKaRa公司測(cè)序,測(cè)序由PE公司的377型測(cè)序儀進(jìn)行。序列回報(bào)后我們應(yīng)用NCBIBlast2.0程序和ORF Finder程序,我們發(fā)現(xiàn)SC712克隆的序列有完整的ORF(opening reading frame,開(kāi)放性閱讀框架),3′端有明顯的Poly A結(jié)構(gòu)。其核酸序列與小鼠LHX4(AF135415)cDNA序列有92%的相似性。編碼一個(gè)含399個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì),與已知小鼠LHX4蛋白質(zhì)僅有3個(gè)不同的氨基酸。因此,我們可以確認(rèn)克隆到了一個(gè)人的LHX4基因全長(zhǎng)cDNA序列(序列見(jiàn)圖3)。
實(shí)施例2.人同源盒基因LHX4在成人不同組織中的表達(dá)一.材料主要儀器HEAR hybrid雜交爐(Heraeus公司),掃描儀(Kodak公司)。
主要試劑Huamn Ubiquitin Control cDNA Probes(Clontech公司,5ng/μl),ExpressHyb雜交液(Clontech公司),鮭精DNA(10mg/ml,ssDNA,GIBCO-BRL公司),C0t-1 DNA(1mg/ml,Gibrco公司),20×SSC(pH7.0),20%SDS(Sigma公司),洗膜液12×SSC,1%SDS,洗膜液20.1×SSC,0.5%SDS,玻璃奶純化試劑盒(原平公司),PCR產(chǎn)物純化試劑盒(Promega公司),EX Taq PCR系統(tǒng)(TaKaRa公司)。
雜交膜MTE Arrary膜(Multiple Tissue Expression Arrary,Clontech公司)放射自顯影α-32P dCTP(北京亞輝公司),X光片(Kodak公司),X光片壓片盒(汕頭醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)儀器廠),D-72顯影液,定影液(浙江嘉興市南湖攝影儀器廠)。
二.方法1.探針的制備和純化1.1.PCR法擴(kuò)增探針(1).設(shè)計(jì)引物Forward Primer5′atgatgcagagtgcgactgtc 3′Reverse Primer5′gtttaaaaaggaggatgatc 3′(2).PCR擴(kuò)增體系為TaKaRa公司Ex Taq PCR系統(tǒng)PCR buffer 2μl,DNTP 2μl,primer 1 1μl,primer 2 1μl,Ex Taq 0.5μl,模板0.5μl,ddH2O13μl,共20μl。擴(kuò)增條件
溫度 時(shí)間(分鐘)94℃ 30094℃ 03060℃ 03030個(gè)循環(huán)72℃ 03072℃ 10.004℃保存1.2.探針的純化對(duì)PCR擴(kuò)增后的產(chǎn)物用Promega柱純化的方法進(jìn)行純化(1).50μl PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中加入100μl純化緩沖液(direct purificationbuffer),充分混勻。
(2).再加入1ml PCR純化樹(shù)脂(wizard PCR preps DNA purificationresin),混勻。
(3).將上述液體全部加入5ml注射器中,并裝好小柱子(Wizard PCRpurification Spin Column)。將注射器緩慢推下使所有液體通過(guò)小柱子。
(4).卸下注射器,加入2ml 80%的異丙醇,裝好小柱子并將注射器緩慢推下使所有液體通過(guò)小柱子。
(5).將小柱子裝入1.5ml Eppendorf管中,8000rpm離心1分鐘,使異丙醇徹底從小柱子上去除。
(6).將小柱子換入到干凈的Eppendorf管中,并從頂部加入30μl的dd H2O,靜置1分鐘,然后12000rpm離心20秒,回收液體。
(7).將所回收的液體取2μl進(jìn)行瓊脂糖電泳,以檢測(cè)回收的效果。
1.3.探針的標(biāo)記采用隨機(jī)引物標(biāo)記試劑盒標(biāo)記(Prime-a-Gene Labeling System,Promega),操作步驟同Promega公司操作手冊(cè)。用于標(biāo)記的DNA來(lái)源于PCR擴(kuò)增的片段。
(1).25ng的DNA,用水補(bǔ)足30μl,98℃變性4分鐘,快速放到冰上。
(2).依次向管中加入以下試劑成分 體積終濃度5×標(biāo)記緩沖液 10μldNTP混合物(無(wú)dCTP) 2μl每種20μM10mg/ml BSA2μl400μg/ml(3).將1,2兩管混勻,然后加入成分 體積終濃度〔α-32P〕dCTP5μl50μ Ci,3,000/mmolKlenow酶(5U/μl) 1μl100U/ml室溫標(biāo)記1小時(shí),取1μl按下述方法測(cè)定標(biāo)記效率,剩余的探針98℃變性5分鐘后加入雜交液中。將1μl標(biāo)記產(chǎn)物稀釋500倍,取5μl按三氯乙酸沉淀法測(cè)定標(biāo)記效率。探針的比活度一般約為1×108~1×109cpm/μg.。
1.4. MTE Array膜與特異性探針的雜交(1).準(zhǔn)備ExpressHyb雜交液和鮭精DNA50-60℃預(yù)熱15ml ExpressHyb雜交液;98℃變性1.5mg鮭精DNA 5分鐘,并迅速置于冰浴中;將上述預(yù)熱好的ExpressHyb雜交液與變性后的鮭精DNA混勻。
(2).將MTE Array膜放入雜交管中并加入10ml步驟(1)中準(zhǔn)備好的雜交液。
(3).保持65℃,連續(xù)震蕩中持續(xù)預(yù)雜60分鐘。
(4).將標(biāo)記好的探針中加入30μg C0t-1 DNA,150μg鮭精DNA和50μl20×SSC,使總體積達(dá)到200μl。
(5).將上述步驟(4)中準(zhǔn)備好的探針98℃變性5分鐘,然后68℃ 30分鐘(6).將步驟(5)中準(zhǔn)備好的探針混合液加入剩下的5ml雜交液中,并確保兩種溶液能夠充分混合。
(7).從進(jìn)行MTE Array預(yù)雜的雜交管中棄去預(yù)雜液,加入步驟(6)中準(zhǔn)備好的雜交液,并盡量去除氣泡并使雜交液全面覆蓋膜。
(8).65℃持續(xù)震蕩雜交過(guò)夜(6-12小時(shí))。
(9).雜交完畢后,到掉雜交液。
(10).加入200ml洗膜液1,65℃持續(xù)震蕩洗膜20分鐘。重復(fù)這一過(guò)程4次。
(11).然后加入200ml 55℃預(yù)熱的洗膜液2,55℃持續(xù)震蕩洗膜20分鐘。重復(fù)這一過(guò)程2-3次,洗膜的程度可用mintor來(lái)檢測(cè)。
(12).洗膜完畢后,將膜置于3M的濾紙上,去掉多余的水分,但不要使膜干。并將膜包入塑料薄膜中。
(13).將步驟1中處理好的膜與X光片一同置入壓片盒中,-70℃壓片7天。
(14).x光片顯影,分析結(jié)果。
三、結(jié)果1.探針的制備和純化以人LHX4基因的質(zhì)粒為模板,經(jīng)過(guò)PCR擴(kuò)增和純化后,得到人LHX4 cDNA表達(dá)序列全長(zhǎng),以其做為MTE Array膜雜交的探針(結(jié)果見(jiàn)圖12)。
2.雜交及結(jié)果分析經(jīng)過(guò)多次反復(fù)雜交后,我們得到較為穩(wěn)定的雜交結(jié)果,并將雜交信號(hào)的位置與MTE Array膜上不同組織RNA的位置相比較,發(fā)現(xiàn)有雜交信號(hào)出現(xiàn)的位置依次是全腦,大腦皮層,脊髓,胎腦。其中尤以胎腦信號(hào)最強(qiáng),其次信號(hào)由強(qiáng)到弱依次為脊髓,全腦,大腦皮層(結(jié)果見(jiàn)圖13)。
上述結(jié)果表明,我們所克隆到的人LHX4 cDNA全長(zhǎng)序列在神經(jīng)組織具有特異性表達(dá),而且這種表達(dá)主要局限在成人的神經(jīng)系統(tǒng),但在成人神經(jīng)系統(tǒng)各組織的表達(dá)程度均明顯低于胎腦中的表達(dá)。由此我們可以推測(cè)人LHX4基因的表達(dá)并不止局限在胚胎組織中,在成人的神經(jīng)組織中也有特異性的表達(dá)。
權(quán)利要求
1.人同源盒基因LHX4全長(zhǎng)cDNA序列,包含如下序列的6個(gè)外顯子,AGCGAGAGATCTCCGTAGACTGCGACTCGCTGGCTTTCGCTCCGAGATGATGCAGAGTGCGACTGTCCCCGCGGAAGGGGCTGTCAAGGGGCTCCCGGAGATGCTAGGTGTGCCGATGCAACAGATTCCCCAGTGCGCTGGCTGCAACCAGCACATCCTGGACAAGTTCATCCTGAAGGTCCTGGACAGACACTGGCACAGCTCCTGCCTCAAGTGTGCAGACTGCCAGATGCAGCTGGCGGACAGGTGCTTCTCCAGGGCTGGGAGCGTCTACTGCAAGGAGGACTTCTTCAAGCGCTTCGGCACAAAATGCACGGCCTGCCAGCAGGGTATCCCCCCAACCCAGGTGGTCCGCAAGGCCCAGGACTTTGTCTACCACCTGCACTGCTTTGCTTGCATCATCTGCAACCGGAGCTGGCCACGGGGGACGAATTCTACCTCATGGAGGACGGGCGGCTGGTGTGCAAGGAAGACTACGAGACAGCCAAGCAGAACGATGACTCAGAGGCTGGAGCTAAGCGGCCCCGGACCACCATCACAGCCAAGCAGCTGGAGACATTAAAGAATGCATACAAGAACTCCCCCAAGCCTGCCGGCACGTGAGGGAGCAGCTGTCCTCAGAGACAGGCCTGGACATGAGGGTCGTACAGGTTTGGTTTCAGAACAGAAGGGCCAAAGAGAAACGCCTGAAGAAGGATGCAGGGCGGCACCGCTGGGGGCAGTTCTATAAGAGCGTCAAGAGGAGCCGGGGCAGCAGCAAGCAGGAGAAGGAGAGCTCTGCAGAGGACTGTGGGGTTAGTGACAGTGAGCTGAGCTTCCGAGAGGATCAAATTCTCTCAGAACTTGGCCACACCAATAGGATTTATGGCAACGTGGGGGACGTTACAGGCGGACAGTTAATGAATGGGAGCTTCTCCATGGACGGGACAGGACAATCCTATCAGGACTTGAGGGATGGGAGCCCCTATGGAATCCCCCAGTCTCCATCCTCCATATCGTCCCTGCATCCCACGCTCCTTTGCTCAATGGGCTGGATTACACGGTGGACAGTAATTTGGGCATCATTGCGCATGCAGGGCAGGGAGTAAGCCAGACGCTGAGAGCCATGGCTGGGGGACCCACCTCTGACATCTCCACAGGAAGCAGTGTAGGCTATCCCGACTTTCCAACTAGCCCAGGCTCTTGGCTCGATGAAATGGATCATCCTCCTTTT
2.按照權(quán)利要求1的人同源盒基因LHX4全長(zhǎng)cDNA,其特征在于其序列為GACGTCGCATGCTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGGGAATTCGATTGGTGGCGACGACTCCTGGAGCCCGTCAGTATCGGCGGAATTCGCGGCCGCGTCGACCGGAGAGCGAGATCAAAGGGATTGGAAACAGACTGGGGACTGGCGGGGGGAGGGGGCCGGCCAGCCTGTGGAGTCCTCCCTGAGAAGCGGAGGGCCCGGCTTCCACCGTGACTCCAGCGGCCTGCTTGGGGTTTTAATTATTATTTTGAAATTTCTGAATCGAGCTAGAGCGAGAGAGCGAGAGATCTCCGTAGACTGCGACTCGCTGGCTTTCGCTCCGAGATGATGCAGAGTGCGACTGTCCCCGCGGAAGGGGCTGTCAAGGGGCTCCCGGAGATGCTAGGTGTGCCGATGCAACAGATTCCCCAGTGCGCTGGCTGCAACCAGCACATCCTGGACAAGTTCATCCTGAAGGTCCTGGACAGACACTGGCACAGCTCCTGCCTCAAGTGTGCAGACTGCCAGATGCAGCTGGCGGACAGGTGCTTCTCCAGGGCTGGGAGCGTCTACTGCAAGGAGGACTTCTTCAAGCGCTTCGGCACAAAATGCACGGCTGCCAGCAGGGTATCCCCCCAACCCAGGTGGTCCGCAAGGCCCAGGACTTTGTCTACCACCTGCACTGCTTTGCTTGCATCATCTGCAACCGGCAGCTGGCCACGGGGGACGAATTCTACCTCATGGAGGACGGGCGGCTGGTGTGCAAGGAAGACTACGAGACAGCCAAGCAGAACGATGACTCAGAGGCTGGAGCTAAGCGGCCCCGGACCACCATCACAGCCAAGCAGCTGGAGACATTAAAGAATGCATACAAGAACTCCCCCAAGCCTGCCCGGCACGTGAGGGAGCAGCTGTCCTCAGAGACAGGCCTGGACATGAGGGTCGTACAGGTTTGGTTTCAGAACAGAAGGGCCAAAGAGAAACGCCTGAAGAAGGATGCAGGGCGGCACCGCTGGGGGCAGTTCTATAAGAGCGTCAAGAGGAGCCGGGGCAGCAGCAAGCAGGAGAAGGAGAGCTCTGCAGAGGACTGTGGGGTTAGTGACAGTGAGCTGAGCTTCCGAGAGGATCAAATTCTCTCAGAACTTGGCCACACCAATAGGATTTATGGCAACGTGGGGGACGTTACAGGCGGACAGTTAATGAATGGGAGCTTCTCCATGGACGGGACAGGACAATCCTATCAGGACTTGAGGGATGGGAGCCCCTATGGAATCCCCCAGTCTCCATCCTCCATATCGTCCCTGCCATCCCACGCTCCTTTGCTCAATGGGCTGGATTACACGGTGGACAGTAATTTGGGCATCATTGCGCATGCAGGGCAGGGAGTAAGCCAGACGCTGAGAGCCATGGCTGGGGGACCCACCTCTGACATCTCCACAGGAAGCAGTGTAGGCTATCCCGACTTTCCAACTAGCCCAGGCTCTTGGCTCGATGAAATGGATCATCCTCCTTTTTAAACTTCTCTCCTCCCCACCCTACCTGCCCCCCTGGCTTGAGAGAATATCTTCAAGGATCAAAAGAGACTTGCCTTTTAAGGATCGAAAGTACGCCAATGTGAATTTCCATTATTTTCAATGGAAGTCCTCCGCTGATTCCTAGAAGGCTGTGAGACCACACTAGGGCATTGTTTCCCTGGGGAAGCAGTGGGAGAGCAGACTCATCTCAGAACACAGCACAGGGGGTAATGGCCTAGAGCTCTAGGGACACTGGCTTGTTGGGTCTCTCCCCTGCTGTTCTGCTTAGGGGCTTGGCTGCTCAGTGCTTTGGTAGCACAAGGTGACTGTGATAGGCCCCCTTGGCCTTTGGGAACTTTGCTCCAACTGGTGTGTCTCACACAATGCCTCGTCGACGCGGCCGCGAATTCCAGCTGAGCGCCGGTCGCTACCATTACCAGTTGGTCTGGTGTCAAAATCACTAGTGAATTCGCGGCCGCCTGCAGGTCGACCATATGGGAGAGCTCCCAACGCGTTGGATGCATAGC
全文摘要
本發(fā)明涉及人同源盒基因LHX4的全長(zhǎng)cDNA序列。該序列包含6個(gè)外顯子。其表達(dá)產(chǎn)物在軀體運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元發(fā)育和分化過(guò)程中發(fā)揮重要作用,是調(diào)節(jié)運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元發(fā)育分化和軸突投射模式形成的一類重要轉(zhuǎn)錄因子。
文檔編號(hào)C07H21/00GK1353186SQ00133460
公開(kāi)日2002年6月12日 申請(qǐng)日期2000年11月7日 優(yōu)先權(quán)日2000年11月7日
發(fā)明者劉耀波, 范明, 于順, 周嚴(yán), 袁建剛, 強(qiáng)伯勤 申請(qǐng)人:中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所