專利名稱：一種myc基因snp檢測特異性引物和液相芯片的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明屈于分子生物學(xué)領(lǐng)域，涉及醫(yī)學(xué)和生物技術(shù)，具體的是涉及一種MYC基因 SNP檢測特異性引物和液相芯片。
背景技術(shù)：
MYC基因是較早發(fā)現(xiàn)的一組癌基因，包括C-MYC、N-MYC和L-MYC，分別定位于8號染色體、2號染色體和1號染色體。MYC基因結(jié)構(gòu)上由不編碼蛋白質(zhì)的第1外顯子和編碼蛋白質(zhì)的第2、3外顯子構(gòu)成。MYC基因屈于編碼核蛋白的癌基因，3個基因都編碼一種與細(xì)胞周期調(diào)控有關(guān)的核內(nèi)DNA結(jié)合蛋白。MYC基因家族及其產(chǎn)物可促進(jìn)細(xì)胞增殖、永生化、去分化和轉(zhuǎn)化等，在多種腫瘤形成過程中處于重要地位。MYC基因家族中的3個成員對腫瘤形成及在腫瘤類型方面存在差異。目前研究認(rèn)為，C-MYC的表達(dá)與腫瘤發(fā)生與轉(zhuǎn)歸密切相關(guān)，在誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡過程中也起重要作用，N-MYC 的表達(dá)與腫瘤的預(yù)后判斷有意義，而L-MYC的表達(dá)在不同的腫瘤中與腫瘤的易患性和預(yù)后表現(xiàn)不一樣。本發(fā)明目標(biāo)檢測的C-MYC基因突變位點(diǎn)，如表所示
權(quán)利要求
1.一種MYC基因SNP檢測液相芯片，其特征是，包括有(A).針對G203TSNP位點(diǎn)分別設(shè)計的野生型和突變型的ASPE引物每種ASPE引物由 5’端的tag序列和3’端針對目的基因SNP位點(diǎn)的特異性引物序列組成，所述特異性引物序列為針對野生型的檢測探針選自SEQ ID NO. USEQ ID NO. 18和SEQ ID NO. 19中的一條，和針對突變型的檢測探針選自SEQ ID NO. 2,SEQ ID NO. 20和SEQ ID NO. 21中的一條； 所述tag序列選自SEQ ID NO. 3-8中的任意兩條；(B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti-tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ ID NO. 9 SEQ ID NO. 14中兩條，且所述anti-tag序列能相應(yīng)地與(A)中所選的tag序列互補(bǔ)配對；(C).用于擴(kuò)增出需要檢測的、具有G203TSNP位點(diǎn)的目標(biāo)序列的引物。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的MYC基因SNP檢測液相芯片，其特征是，所述特異性引物序列為針對野生型的檢測探針為SEQ ID NO. 1和針對突變型的檢測探針為SEQ ID NO. 2。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的MYC基因SNP檢測液相芯片，其特征是，所述擴(kuò)增引物為SEQ IDN0. 15 SEQ ID NO. 16。
4.根據(jù)權(quán)利要求1-3任一項所述的MYC基因SNP檢測液相芯片，其特征是，所述ASPE 引物為由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 1組成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 2組成的序列。
5.根據(jù)權(quán)利要求1-3任一項所述的MYC基因SNP檢測液相芯片，其特征是，所述間隔臂為5-10個T。
6.一種用于MYC基因SNP檢測的特異性引物，其特征是，包括有SEQ ID NO. 1和SEQ ID NO. 2。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種MYC基因SNP檢測液相芯片，主要包括有每種由5’端的tag序列和3’端針對目的基因突變位點(diǎn)的特異性引物序列組成的ASPE引物，所述特異性引物序列為針對G203T位點(diǎn)野生型的SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.19中的一條和針對G203T位點(diǎn)突變型的SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.21中的一條；有anti-tag序列包被的微球；擴(kuò)增引物。本發(fā)明所提供的檢測液相芯片的檢測結(jié)果與測序法的吻合率高達(dá)100％，實現(xiàn)SNP位點(diǎn)的野生型和突變型并行檢測。
文檔編號C12N15/11GK102191336SQ201110153869
公開日2011年9月21日 申請日期2011年6月9日 優(yōu)先權(quán)日2011年6月9日
發(fā)明者吳詩揚(yáng), 羅小笛, 許嘉森 申請人:廣州益善生物技術(shù)有限公司