專利名稱：一種pigu基因snp檢測特異性引物和液相芯片的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明屈于分子生物學領(lǐng)域，涉及醫(yī)學和生物技術(shù)，具體的是涉及一種PI⑶基因 SNP檢測特異性引物和液相芯片。
背景技術(shù)：
PIGU(phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class U)基因，又名CDC91L1，是GPI轉(zhuǎn)酰胺基酶的第五個亞基，該基因編碼的蛋白在細胞分裂調(diào)控過程中起
重要作用。本發(fā)明目標檢測的PI⑶基因突變位點，如表所示
權(quán)利要求
1.一種PI⑶基因SNP檢測液相芯片，其特征是，包括有(A).針對G86ASNP位點分別設(shè)計的野生型和突變型的ASPE引物每種ASPE引物由 5’端的tag序列和3’端針對目的基因SNP位點的特異性引物序列組成，所述特異性引物序列為針對野生型的檢測探針選自SEQ ID NO. USEQ ID NO. 18和SEQ ID NO. 19中的一條，和針對突變型的檢測探針選自SEQ ID NO. 2,SEQ ID NO. 20和SEQ ID NO. 21中的一條； 所述tag序列選自SEQ ID NO. 3 SEQ ID NO. 8中的任意兩條；(B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti-tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ ID NO. 9 SEQ ID NO. 14中兩條，且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對；(C).用于擴增出需要檢測的、具有G86ASNP位點的目標序列的引物。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的PIGU基因SNP檢測液相芯片，其特征是，所述特異性引物序列為針對野生型的檢測探針為SEQ ID NO. 1和針對突變型的檢測探針為SEQ ID NO. 2。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的PIGU基因SNP檢測液相芯片，其特征是，所述擴增引物為SEQ IDN0. 15 SEQ ID NO. 16。
4.根據(jù)權(quán)利要求1-3任一項所述的PIGU基因SNP檢測液相芯片，其特征是，所述ASPE 引物為由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 1組成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 2組成的序列。
5.根據(jù)權(quán)利要求1-3任一項所述的PIGU基因SNP檢測液相芯片，其特征是，所述間隔臂為5-10個T。
6.一種用于PI⑶基因SNP檢測的特異性引物，其特征是，包括有SEQ ID NO. 1和SEQ ID NO. 2。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種PIGU基因SNP檢測液相芯片，主要包括有每種由5’端的tag序列和3’端針對目的基因突變位點的特異性引物序列組成的ASPE引物，所述特異性引物序列為針對野生型的SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.19中的一條和針對突變型的SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.21中的一條；有anti-tag序列包被的微球；擴增引物。本發(fā)明所提供的檢測液相芯片的檢測結(jié)果與測序法的吻合率高達100％，實現(xiàn)SNP位點的野生型和突變型并行檢測。
文檔編號C12N15/11GK102191335SQ20111015386
公開日2011年9月21日 申請日期2011年6月9日 優(yōu)先權(quán)日2011年6月9日
發(fā)明者何嘉英, 許嘉森, 陳家欣 申請人:廣州益善生物技術(shù)有限公司