專利名稱:Dna保存溶劑及其保存方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及一種DNA(deoxyribonucleic acid,脫氧核糖核酸)的保存,特別是涉及一種DNA保存溶劑及其保存方法。
背景技術(shù):
DNA是染色體的重要組成充分,是真核生物的遺傳基本物質(zhì),含有物種個(gè)體的遺傳信息,可用于構(gòu)建基因組文庫、分離所需的基因和檢測相關(guān)的分子標(biāo)記等。由于DNA所含的遺傳信息量大,并且容易獲取,具有極其穩(wěn)定的化學(xué)性質(zhì),是目前種質(zhì)資源和遺傳資源收集和保存的主要內(nèi)容之一。DNA分子的序列結(jié)構(gòu)具有三個(gè)重要特性(1)不同個(gè)體序列不一樣;(2)終生不變;同一人體各不同部位細(xì)胞中的DNA序列相同。因此DNA分子本身具備檔案的特性,即具有長期穩(wěn)定性、信息屬性、個(gè)體特異性和可以備查的屬性。實(shí)際上,在疾病基因組學(xué)、藥物基因組學(xué)、群體遺傳學(xué)和進(jìn)化等研究領(lǐng)域,DNA是最可靠的證據(jù)和研究過程的基本材料,被廣泛應(yīng)用。同時(shí)生命科學(xué)研究者日益認(rèn)識(shí)到保存DNA 對于今后系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展的重要性,各國紛紛開始保存DNA。世界上最早開始實(shí)施大規(guī)模DNA保存的是冰島的Decode公司,全部DNA樣本極其相關(guān)資料來自于將近1/3的冰島成年人和90%以上的冰島老年人。利用其建立的生物樣本庫,Decode找到了心肌梗塞等20 多種疾病的致病基因。隨后英國、美國、以色列等國家研究單位建立了類似的遺傳資源樣本庫,并且以色列對外銷售這些資料齊全的人DNA樣本。為了維持DNA結(jié)構(gòu)的完整性,避免DNA大規(guī)模斷裂和降解,DNA最佳保存方法是干粉_80°C或者液氮低溫保存,但要制成干粉則需要大量的DNA,取材困難,在實(shí)際DNA樣本資源收集中不具有操作性。而用無水乙醇保存DNA,雖然可以事先分裝保存,但也存在反復(fù)凍融問題。而固相DNA保存技術(shù)是最近提出的新概念,適用于永久保存,并且這種方法的保存基質(zhì)是否影響DNA后續(xù)實(shí)驗(yàn)、保存具體效果,目前無這方面的任何數(shù)據(jù),尚有待時(shí)間考驗(yàn)。 并且對于保存期間需要多次使用的樣本,需要重新提取DNA,操作復(fù)雜,并且容易導(dǎo)致DNA 斷裂,將導(dǎo)致一些對DNA質(zhì)量要求高的檢測實(shí)驗(yàn)無法進(jìn)行。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明要解決的技術(shù)問題是提供一種DNA保存溶劑及其保存方法。利用該DNA保存溶劑,可以很簡單地、長期保存DNA,并且DNA提取方便、避免DNA的反復(fù)凍融、成本低廉, 為今后基因組學(xué)研究、身份鑒別、基因診斷、基因治療、器官移植等提供最原始的DNA記錄。為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明的DNA保存溶劑,其組分包括甘油、TE緩沖液 (Tris-EDTA, EDTA 乙二胺四乙酸)、1_羧基-N,N,N-三甲基乙內(nèi)酯,其中,甘油的終體積為 25% 80% ;TE緩沖液的終濃度為IXTE 5XTE,pH值為6 8,優(yōu)選1XTE,pH值7. 6 ; 1-羧基-N,N,N-三甲基乙內(nèi)酯的終濃度為1 6mol/L,優(yōu)選3mol/L。上述甘油和1-羧基-N,N,N-三甲基乙內(nèi)酯作用主要是維持液態(tài)環(huán)境。
另外,本發(fā)明的DNA保存方法,包括步驟(1)提取 DNA;其中,該DNA可從生物的任何細(xì)胞、按照常規(guī)的提取方法進(jìn)行提取及純化;(2)將DNA溶于如上所述的DNA保存溶劑中進(jìn)行保存。其中,DNA保存的最終濃度可以為1 lOyg/L,如eyg/L左右,優(yōu)選2 3yg/ L。如DNA保存濃度很低,如直接大用量實(shí)驗(yàn),保存溶劑中高濃度的甘油有可能影響后續(xù)的實(shí)驗(yàn),而高保存濃度的DNA在實(shí)際應(yīng)用中需要進(jìn)一步稀釋后才能實(shí)驗(yàn),不影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)。所述保存溫度可以為-20°C _196°C。與傳統(tǒng)的DNA保存技術(shù)相比較,本發(fā)明具有如下優(yōu)點(diǎn)(1)制作簡單、成本低廉,只需要低溫冰凍保存即可;(2)由于含有高濃度的甘油,使得DNA—直處于液態(tài)環(huán)境中,避免機(jī)械切割力損害,從而能有效地防止DNA降解,因此,DNA保存效果好、保存期長。(3)由于DNA保存于液態(tài)環(huán)境中,從冰箱或液氮中拿出來后,不需溶解,就可直接取樣或分裝,從而避免了反復(fù)凍融。因此,本發(fā)明能長期保存DNAjB 20年以上。
具體實(shí)施例方式以下實(shí)施例中的甘油、TE中的組分(^^8堿、!1(^014)、1-羧基-隊(duì)隊(duì)^三甲基乙內(nèi)酯都是市售產(chǎn)品。
附圖是實(shí)施例3的基因組DNA電泳圖,其中,孔1為DNA分子標(biāo)記,孔2為實(shí)施例 3中按照實(shí)施例1保存的DNA,孔3為實(shí)施例3中按照實(shí)施例2保存的DNA。實(shí)施例1一、樣本DNA的提取采用FlexiGene DNA Kit(QIAGEN, Cat. No. 51206)試劑盒抽提肺癌患者外周血中的基因組DNA。具體步驟如下向300 μ 1血液樣本中加入750 μ 1 Buffer TOl,上下顛倒5次使其混勻。接著在 12,OOOrpm轉(zhuǎn)速下離心Imin0離心后倒掉上層清液,再加入150 μ 1 Buffer FG2及1· 5μ 1 蛋白酶溶液,立即振蕩,直至沉淀完全溶解。接下來離心3 k,然后65°C水浴5min。當(dāng)溶液從紅色變?yōu)殚蠙炀G色后,加入150μ 1 100%異丙醇,上下充分顛倒離心管,使其混合,直至DNA析出,呈肉眼可見的線狀或塊狀。然后在12,OOOrpm轉(zhuǎn)速下離心;3min。離心后倒掉上層清液,再加入150 μ 1 70%乙醇,并振蕩k。接著重新在12,OOOrpm轉(zhuǎn)速下離心;3min, 離心后倒掉上層清液,自然風(fēng)干沉淀,直至所有的液體都蒸發(fā)掉。二、保存向上述含有DNA的離心管中加入500 μ 1的DNA冰凍保存溶劑(即保存溶劑溫度為0°C )后,37°C過夜,保證DNA充分溶解,然后于-80°c冰箱保存。其中,DNA冰凍保存溶劑的組成為終體積為35 %的甘油、終濃度為 IXTE(pH7. 6)、終濃度為3mol/L的1_羧基—N,N, N-三甲基乙內(nèi)酯。
實(shí)施例2采用實(shí)施例1中的DNA抽提方法,抽取實(shí)施例1的肺癌患者外周血300 μ 1進(jìn)行 DNA抽提,然后向含有該DNA的離心管中加入500 μ 1的1ΧΤΕ(ρΗ7. 6),37°C過夜,保證充分溶解后,于-80°C冰箱保存。實(shí)施例3實(shí)施例1和實(shí)施例2中的DNA保存1個(gè)月后,每個(gè)工作日的10點(diǎn)和16點(diǎn)將實(shí)施例1和實(shí)施例2保存的DNA取出,置于37°C溫箱15分鐘,使實(shí)施例1和實(shí)施例2中的DNA 充分溶解后,然后-80度保存,連續(xù)反復(fù)凍融6月,進(jìn)行加速實(shí)驗(yàn)。各取反復(fù)凍融3個(gè)月后,取按照實(shí)施例1和實(shí)施例2保存的DNA 6μ 1,用0. 8% (0. 8g/100ml)瓊脂糖進(jìn)行電泳鑒定,電泳結(jié)果如說明書附圖所示。從電泳圖中看出,實(shí)施例 1保存的DNA經(jīng)過連續(xù)3個(gè)月反復(fù)凍融后,孔2電泳結(jié)果顯示基因組DNA未降解;而實(shí)施例 2保存的DNA經(jīng)過連續(xù)3個(gè)月反復(fù)凍融后,孔3電泳結(jié)果顯示基因組DNA —片彌散,降解明顯。實(shí)施例4采用實(shí)施例1中的DNA抽提方法,將得到的小鼠肝臟DNA中加入DNA冰凍保存溶劑,使DNA的最終濃度為2 μ g/L,37°C過夜,保證DNA充分溶解,然后于_20°C冰箱保存。其中,DNA冰凍保存溶劑的組成為終體積為25%的甘油、終濃度為1ΧΤΕ(ρΗ6)、 終濃度為6mol/L的1-羧基-N,N,N-三甲基乙內(nèi)酯。本實(shí)施例中所保存的DNA分子結(jié)構(gòu)無破壞,能滿足下游實(shí)驗(yàn)(如PCR、基因芯片等)需要。實(shí)施例5采用實(shí)施例1中的DNA抽提方法,將得到的培養(yǎng)皿細(xì)胞DNA中加入DNA冰凍保存溶齊U,使DNA的最終濃度為3 μ g/L,37°C過夜,保證DNA充分溶解,然后于_196°C保存。其中,DNA冰凍保存溶劑的組成為終體積為80%的甘油、終濃度為5XTE(pH8)、 終濃度為lmol/L的1-羧基-N,N, N-三甲基乙內(nèi)酯。本實(shí)施例中所保存的DNA分子結(jié)構(gòu)無破壞,能滿足下游實(shí)驗(yàn)(如PCR、基因芯片等)需要。實(shí)施例6采用實(shí)施例1中的DNA抽提方法,將得到的人肝臟DNA中加入DNA冰凍保存溶劑, 使DNA的最終濃度為10 μ g/L, 37°C過夜,保證DNA充分溶解,然后于_120°C保存。其中,DNA冰凍保存溶劑的組成為終體積為60 %的甘油、終濃度為 2XTE(pH7. 5)、終濃度為5mol/L的1_羧基-N,N, N-三甲基乙內(nèi)酯。本實(shí)施例中所保存的DNA分子結(jié)構(gòu)無破壞,完全能滿足下游實(shí)驗(yàn)(如PCR、基因芯片等)需要。
權(quán)利要求
1.一種DNA保存溶劑,其特征在于該DNA保存溶劑的組分包括甘油、TE緩沖液、 1-羧基-N,N,N-三甲基乙內(nèi)酯,其中,甘油的終體積為25% 80%,TE緩沖液的終濃度為 IXTE 5XTE,1-羧基-N,N,N-三甲基乙內(nèi)酯的終濃度為1 6mol/L。
2.如權(quán)利要求1所述的DNA保存溶劑,其特征在于所述TE緩沖液的終濃度為IXTE, PH值為6 8。
3.如權(quán)利要求2所述的DNA保存溶劑,其特征在于所述TE緩沖液的pH值為7.6。
4.如權(quán)利要求1所述的DNA保存溶劑,其特征在于所述1-羧基-N,N,N-三甲基乙內(nèi)酯的終濃度為3mol/L。
5.如權(quán)利要求1-4任意一項(xiàng)所述的DNA保存方法,包括步驟(1)提取DNA ;(2)將DNA溶于如權(quán)利要求1所述的DNA保存溶劑中進(jìn)行保存。
6.如權(quán)利要求5所述的DNA保存方法,其特征在于所述保存溫度為_20°C -196°C。
7.如權(quán)利要求5所述的DNA保存方法,其特征在于所述DNA保存的最終濃度為1 10μ g/L。
8.如權(quán)利要求7所述的DNA保存方法,其特征在于所述DNA保存的最終濃度為2 3 μ g/L ο
全文摘要
本發(fā)明公開了一種DNA保存溶劑及其保存方法,該DNA保存溶劑的組分包括甘油、TE緩沖液、1-羧基-N,N,N-三甲基乙內(nèi)酯,其中,甘油的終體積為25%~80%,TE緩沖液的終濃度為1×TE~5×TE,1-羧基-N,N,N-三甲基乙內(nèi)酯的終濃度為1~6mol/L。該DNA保存方法,包括步驟(1)提取DNA;(2)將DNA溶于DNA保存溶劑中進(jìn)行保存。本發(fā)明制作簡單、成本低廉,而且保存效果好、保存期長,并避免反復(fù)凍融。為今后基因組學(xué)研究、身份鑒別、基因診斷、基因治療、器官移植等提供最原始的DNA記錄。
文檔編號(hào)C12N15/10GK102559654SQ20101059505
公開日2012年7月11日 申請日期2010年12月17日 優(yōu)先權(quán)日2010年12月17日
發(fā)明者連臻 申請人:上海元基融生物科技有限公司