基于計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的親權(quán)鑒定檢索方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了一種基于計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的親權(quán)鑒定檢索方法，包括以下步驟：A.通過genemapper軟件導(dǎo)入數(shù)據(jù)樣本；B.對計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中的所有樣本進(jìn)行XY/XX讀取并分為男性樣本和女性樣本；C.將指定的子代樣本分別與計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中男性樣本和女性樣本進(jìn)行二聯(lián)體檢索，篩選出符合二聯(lián)體親權(quán)關(guān)系的假定父和假定母；再進(jìn)行二聯(lián)體親權(quán)計(jì)算，得出疑似父母；D.將疑似父、母以及指定子代樣本按照三聯(lián)體計(jì)算方法計(jì)算出與指定子代樣本符合三聯(lián)體親權(quán)關(guān)系的生物學(xué)父母。本發(fā)明能夠方便找出符合親權(quán)關(guān)系的父母，降低單親檢索假陽性的樣本量，提高親權(quán)判定準(zhǔn)確度以及可靠性。
【專利說明】基于計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的親權(quán)鑒定檢索方法

【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及法醫(yī)遺傳學(xué)【技術(shù)領(lǐng)域】，特別是一種利用計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫對親權(quán)鑒定過程 中的三聯(lián)體樣本進(jìn)行檢索的方法。

【背景技術(shù)】
[0002] 親權(quán)鑒定是指通過對人類遺傳標(biāo)記的檢測，根據(jù)遺傳規(guī)律分析，判定父母與孩子 間是否為親生關(guān)系。親權(quán)鑒定一般分為二聯(lián)體親權(quán)鑒定和三聯(lián)體親權(quán)鑒定，二聯(lián)體親權(quán)鑒 定是指被檢測男子與孩子之間的親子關(guān)系鑒定，三聯(lián)體親權(quán)鑒定是指被檢測男子、孩子生 母與孩子之間的親子關(guān)系鑒定。
[0003] 近年來，隨著計(jì)算機(jī)的普及，警方及地方的大型DNA法醫(yī)物證實(shí)驗(yàn)室都建立了計(jì) 算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)，用于樣本的數(shù)據(jù)存儲以及個(gè)體識別和親權(quán)鑒定的檢索，因此計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù) 庫系統(tǒng)的建立在尋找被拐賣兒童以及查找犯罪份子方面發(fā)揮的作用越來越大。然而，由于 中國人口基數(shù)大，而法醫(yī)物證初期使用DNA進(jìn)行檢測的時(shí)候所用的基因座數(shù)量較少，并且 不同的實(shí)驗(yàn)室選用的試劑盒不一致，這就造成除了國家規(guī)定的必檢基因座以外還存在著不 同的基因座。當(dāng)計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中存儲有大量的樣本DNA數(shù)據(jù)時(shí)，利用父親或者母親數(shù) 據(jù)進(jìn)行檢索時(shí)會出現(xiàn)數(shù)十個(gè)或者幾十個(gè)樣本都符合孟德爾遺傳定律的情況。在這種情況下 計(jì)算機(jī)便無法對親代和子代的關(guān)系進(jìn)行有效的判定，需要人工干預(yù)證實(shí)。此時(shí)，便需要實(shí)驗(yàn) 室增加被檢索樣本的檢測基因座，或者加入生母或者父親的樣本，人工進(jìn)行三聯(lián)體計(jì)算，排 除假陽性樣本；不僅增加了成本，而且操作繁瑣、工作量大、耗時(shí)長且容易出錯。


【發(fā)明內(nèi)容】

[0004] 本發(fā)明需要解決的技術(shù)問題是提供一種基于計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的親權(quán)鑒定中三 聯(lián)體樣本檢索的方法，從而方便找出符合親權(quán)關(guān)系的父母，降低單親檢索假陽性的樣本量， 提高親權(quán)判定準(zhǔn)確度以及可靠性。
[0005] 為解決上述技術(shù)問題，本發(fā)明所采取的技術(shù)方案如下。
[0006] 基于計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的親權(quán)鑒定檢索方法，包括以下步驟： A. 通過genemapper軟件導(dǎo)入指定的子代樣本以及與指定的子代樣本相關(guān)的數(shù)據(jù)樣 本； B. 對計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中的所有樣本進(jìn)行XY/XX讀取，將樣本分為男性樣本和女性樣 本； C. 將指定的子代樣本分別與計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中男性樣本和女性樣本進(jìn)行二聯(lián)體檢 索，篩選出符合二聯(lián)體親權(quán)關(guān)系的m個(gè)假定父和η個(gè)假定母；將指定子代樣本分別與m個(gè)假 定父和η個(gè)假定母進(jìn)行二聯(lián)體親權(quán)計(jì)算，得到ml個(gè)疑似父和nl個(gè)疑似母；其中ml < m，nl < η ； D. 將ml個(gè)疑似父、nl個(gè)疑似母以及指定子代樣本按照三聯(lián)體計(jì)算方法計(jì)算出與指定 子代樣本符合三聯(lián)體親權(quán)關(guān)系的生物學(xué)父、母。
[0007] 本發(fā)明步驟C中所述的二聯(lián)體計(jì)算方法為：按照二聯(lián)體親權(quán)指數(shù)計(jì)算公式以及計(jì) 算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中設(shè)定的基因頻率分別計(jì)算出指定子代樣本與每個(gè)假定父的親權(quán)指數(shù)值 和每個(gè)假定母的親權(quán)指數(shù)值，最后分別篩選出符合遺傳規(guī)律的疑似父和疑似母；所述二聯(lián) 體親權(quán)指數(shù)計(jì)算公式為：

【權(quán)利要求】
1. 基于計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的親權(quán)鑒定檢索方法，其特征在于包括以下步驟： A. 通過genemapper軟件導(dǎo)入指定的子代樣本以及與指定的子代樣本相關(guān)的數(shù)據(jù)樣 本； B. 對計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中的所有樣本進(jìn)行XY/XX讀取，將樣本分為男性樣本和女性樣 本； C. 將指定的子代樣本分別與計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中男性樣本和女性樣本進(jìn)行二聯(lián)體檢 索，篩選出符合二聯(lián)體親權(quán)關(guān)系的m個(gè)假定父和η個(gè)假定母；將指定子代樣本分別與m個(gè)假 定父和η個(gè)假定母進(jìn)行二聯(lián)體親權(quán)計(jì)算，得到ml個(gè)疑似父和nl個(gè)疑似母；其中ml < m，nl < η ； D. 將ml個(gè)疑似父、nl個(gè)疑似母以及指定子代樣本按照三聯(lián)體計(jì)算方法計(jì)算出與指定 子代樣本符合三聯(lián)體親權(quán)關(guān)系的生物學(xué)父、母。
2. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的親權(quán)鑒定檢索方法，其特征在于步 驟C中所述的二聯(lián)體計(jì)算方法為：按照二聯(lián)體親權(quán)指數(shù)計(jì)算公式以及計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中 設(shè)定的基因頻率分別計(jì)算出指定子代樣本與每個(gè)假定父的親權(quán)指數(shù)值和每個(gè)假定母的親 權(quán)指數(shù)值，最后分別篩選出符合遺傳規(guī)律的疑似父和疑似母；所述二聯(lián)體親權(quán)指數(shù)計(jì)算公 式為：
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3. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的親權(quán)鑒定檢索方法，其特征在于步 驟D中所述的三聯(lián)體計(jì)算方法為：根據(jù)步驟C獲得的符合遺傳規(guī)律的疑似父、疑似母以及指 定子代樣本按照三聯(lián)體親權(quán)計(jì)算公式進(jìn)行計(jì)算，并結(jié)合步驟C獲得的親權(quán)指數(shù)值篩選出符 合遺傳定律的生物學(xué)父母；所述三聯(lián)體親權(quán)計(jì)算公式為：
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【文檔編號】G06F17/30GK104112023SQ201410368913
【公開日】2014年10月22日 申請日期:2014年7月30日 優(yōu)先權(quán)日:2014年7月30日
【發(fā)明者】譚笑丹 申請人:譚笑丹