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一種同時處理多份生物樣品的基片和生物芯片的制作方法

文檔序號:5997425閱讀:330來源:國知局
專利名稱:一種同時處理多份生物樣品的基片和生物芯片的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域
本實用新型涉及生物芯片技術(shù)領(lǐng)域。更具體地,涉及一種同時處理多份生物樣品的基片和生物芯片。
背景技術(shù)
生物芯片技術(shù)是隨著“人類基因組計劃”(human genome project,HGP)的進(jìn)展而發(fā)展起來的,它是上世紀(jì)90年代中期以來影響最深遠(yuǎn)的重大科技進(jìn)展之一,被廣泛應(yīng)用于基因序列分析、基因突變檢測及單核苷酸多態(tài)性分析、基因組文庫圖型分析以及疾病的基因診斷等領(lǐng)域。
所謂生物芯片是由固定于不同種類基片上的高密度的寡核苷酸分子、基因片段、多肽分子或蛋白的微陣列組成,常用的基片有玻片、膜片、塑料片和硅片等。
生物芯片的特點是一次試驗?zāi)艿玫酱罅康纳飳W(xué)信息。然而,目前的大多數(shù)生物芯片或者不適合用于同時處理多份生物樣品,或者雖然可以同時處理多份生物樣品,但是操作煩瑣或成本昂貴。
因此,本領(lǐng)域特別需要一種通用的、操作方便且能同時處理多份生物樣品的基片和生物芯片。

發(fā)明內(nèi)容
本實用新型的目的就是提供一種通用的、操作方便且能同時處理多份生物樣品的基片和生物芯片。
在本實用新型的第一方面,提供了一種生物芯片基片,所述的基片具有基片本體、位于基片本體上的溝槽、以及由溝槽隔開的反應(yīng)區(qū),溝槽的寬度為1~5mm,深0.5~1.5mm。
在另一優(yōu)選例中,溝槽的寬度為2~4mm,深0.75~1.25mm。
在一優(yōu)選例中,所述溝槽的形狀是半園、長方、楔形或梯形。
在另一優(yōu)選例中,所述反應(yīng)區(qū)的數(shù)目為2-50個,更佳地為4-40個。
在另一優(yōu)選例中,所述反應(yīng)區(qū)的形狀為矩形。
在本實用新型的第二方面,提供了一種生物芯片,它包括生物芯片基片,所述的基片具有基片本體、位于基片本體上的溝槽、以及由溝槽隔開的反應(yīng)區(qū),溝槽的寬度為1~5mm,深0.5~1.5mm;和基片支架,所述的基片支架具有1-10個放置基片的基片孔,并且在基片孔底部四周具有突起的裙邊。
在另一優(yōu)選例中,所述的生物芯片還包括支架蓋,所述的支架蓋具有支架蓋本體和位于四周的向下突緣。
在另一優(yōu)選例中,所述的基片支架具有2-6個基片孔。
在另一優(yōu)選例中,所述的生物芯片還包括載玻片,所述載玻片的大小與基片孔相對應(yīng)。


圖1顯示了本實用新型一個基片實例的俯視圖。
圖2顯示了本實用新型一個基片實例的側(cè)視圖。
圖3顯示了本實用新型一個基片支架實例的俯視圖。
圖4顯示了圖3所示的基片支架沿A-A’的縱切面圖。
圖5顯示了圖3所示的基片支架沿B-B’的橫切面圖。
圖6顯示了本實用新型的基片與支架組裝后的俯視圖。
圖7顯示了本實用新型的基片與支架組裝后的縱切面圖(沿A-A’)。
圖8顯示了本實用新型的基片與支架組裝后蓋上清潔的無毛邊的標(biāo)準(zhǔn)載玻片發(fā)生生化反應(yīng)的縱切面圖(沿B-B’)。
圖9顯示了本實用新型的一個支架蓋實例的俯視圖。
圖10顯示了本實用新型的支架蓋的橫切或縱切面圖。
圖11顯示了本實用新型支架與蓋組裝后的縱切面圖。
圖12顯示了本實用新型的基片與支架組裝并蓋上清潔的無毛邊的標(biāo)準(zhǔn)載玻片后,再蓋上支架蓋發(fā)生生化反應(yīng)的縱切面圖。
具體實施方式
參見圖1和圖2。本實用新型基片的材質(zhì)沒有特別限制,較佳的材質(zhì)是玻璃或塑料。
基片的尺寸沒有特別限制,可以是任何常規(guī)尺寸。一種代表性的尺寸是25.5×75.0×2.00mm。
一種本實用新型的基片1具有基片本體12、位于基片本體上的溝槽14、以及由溝槽隔開的反應(yīng)區(qū)16。溝槽16的寬度通常為2.0±1.0mm,深1.0±0.5mm,長度通常與基片的長短軸尺寸一致。溝槽的形狀可以是半園、長方、楔形、梯形、或其他形狀。
溝槽14將基片劃分為相對獨立的方陣式反應(yīng)區(qū)16(或稱為“方陣”)。反應(yīng)區(qū)的大小沒有特別限制,可以是任何合適的常規(guī)尺寸。一種優(yōu)選的方案是共16個反應(yīng)區(qū),各反應(yīng)區(qū)的大小可相同或不同,例如4個角的方陣尺寸為9.50×11.75mm,其他方陣尺寸為7.00×11.75mm。
參見圖3、圖4和圖5。本實用新型基片支架材質(zhì)沒有特別限制,較佳的材質(zhì)是塑料。
基片支架的尺寸沒有特別限制,可以是任何常規(guī)尺寸。一種代表性基片支架的尺寸為98.5×95.0×3.50mm。
基片支架2具有1-10個用于放置基片的基片孔24(例如3個基片孔)。基片孔的長寬與基片一致,深度也與基片厚度相對應(yīng)(例如當(dāng)基片厚2.0mm時,基片孔的深度為2.0±0.2mm)。此外,在基片孔底部四周突出寬和高均為例如1.0mm的裙邊26,以便基片穩(wěn)定地放在空格內(nèi)不至于掉出。
在優(yōu)選例中,基片支架的四周還可設(shè)置邊框區(qū)22,其厚度低于基片支架的本體區(qū)28。
此外,在基片支架上可如圖3示標(biāo)注數(shù)字和字母,這樣基片上的每個方陣都有唯一的位置。
在本實用新型的另一優(yōu)選例中,本實用新型的生物芯片還含有支架蓋。圖9和10顯示了本實用新型的一種支架蓋4,它具有支架蓋本體42和位于四周的向下突緣44,突緣的形狀通常與基片支架的邊框區(qū)22相匹配。支架蓋的尺寸與基片支架相對應(yīng)。一種優(yōu)選方式是當(dāng)蓋上支架蓋后,支架蓋的突緣44正好與基片支架的邊框區(qū)22相貼合(圖11)。一種優(yōu)選的支架蓋尺寸是長98.5mm,寬95.0mm,高5.0mm。
下面結(jié)合具體實施例,進(jìn)一步闡述本實用新型。應(yīng)理解,這些實施例僅用于說明本實用新型而不用于限制本實用新型的范圍。下列實施例中未注明具體條件的實驗方法,通常按照常規(guī)條件如Sambrook等人,分子克隆實驗室手冊(New YorkCold Spring Harbor Laboratory Press,1989)中所述的條件,或按照制造廠商所建議的條件。
實施例1基片及其支架使用說明1.基片和支架的制備用玻璃或塑料制備圖1和圖2所示的基片其中,基片尺寸是25.5×75.0×2.00mm。溝槽的寬度為2.0mm,深1.0mm,長度與基片的長短軸尺寸一致。溝槽的形狀是半園,4個角的方陣尺寸為9.50×11.75mm,其他方陣尺寸為7.00×11.75mm。
用玻璃或塑料制備圖3-5所示的基片支架,尺寸為98.5×95.0×3.50mm?;Ъ芫哂?個基片孔。各基片孔的長寬與基片一致,深度為2.0mm。此外,在基片孔底部四周突出寬和高均為例如1.0mm的裙邊。
2.基片氨基化或醛基化處理用常規(guī)的標(biāo)準(zhǔn)載玻片的預(yù)處理方法(如包括清洗、強酸活化、氨基化、醛基化等步驟)對基片進(jìn)行氨基化或醛基化處理。
3.點樣本實用新型設(shè)計的基片長寬尺寸與標(biāo)準(zhǔn)載玻片完全相同,因此可方便地放入點樣儀的玻片槽內(nèi)并固定。在點樣儀內(nèi)的針架上橫向每隔9mm(與基片長軸方向上的方陣間距一致)裝1根點樣針,共4根,同時點4個探針陣列,適合做大規(guī)模點樣生產(chǎn)。
4.探針固定后基片的清洗點樣結(jié)束探針固定好后,基片先用0.1%SDS洗1遍,再用去離子水洗2遍,避光,室溫下晾干備用,若減壓干燥,更好。
5.雜交和洗滌用戶可根據(jù)實際的標(biāo)本量一次實驗選擇1張基片(可同時處理16個樣本),2張基片(可同時處理32個樣本),3張基片(可同時處理48個樣本)。
6.生物芯片的組裝將基片放入支架內(nèi)(圖6和圖7)。
參見圖8。用8道微量移液器同時取20μL的8個生物樣本,可以是PCR產(chǎn)物或血清等。將8個生物樣本加在基片長軸方向上的8個方陣(圖8,8道微量移液器的道間距為9mm,與基片方陣間距一致),形成位于方陣上的樣品32。重復(fù)操作,可完成16、32和48個樣本的加樣。
加樣完成后,將清潔的無毛邊的標(biāo)準(zhǔn)載玻片30蓋在基片表面,多余的生物樣本液體進(jìn)入溝槽,從而使各個方陣的生化反應(yīng)互不干擾(圖8),同時通過支架上的字母和數(shù)字確定每一個樣本的唯一位置(圖6,例如,從上往下,第一張基片第二行第三個方陣的位置為3B,第三張基片第一行的第四個方陣的位置為4E,依次類推);將蓋有載玻片的基片連同支架和支架蓋(圖12)放入合適溫度的濕盒中,雜交40~60分鐘;取出基片和載玻片用常規(guī)的洗滌程序進(jìn)行洗滌。
7.信號檢測熒光信號檢測若用戶檢測熒光信號,建議使用Scanarray4000;酶聯(lián)顯色檢測若用戶使用酶聯(lián)顯色檢測信號,雜交洗滌結(jié)束后將基片放入支架內(nèi),顯色后用辦公用掃描儀掃描即可;此外,本實用新型的基片也適合其他檢測方法,如化學(xué)發(fā)光等。
本實用新型的主要優(yōu)點在于1.由于基片上的溝槽將各個方陣隔開,每個方陣上可發(fā)生獨立的雜交或免疫等生化反應(yīng),相互之間不發(fā)生干擾;2.長軸方向的方陣格局適合使用常規(guī)的8道微量移液器及多針的點樣操作;3.基片處理和點樣以及隨后的雜交、洗滌和信號檢測與使用標(biāo)準(zhǔn)載玻片為基片的操作完全一致,無需任何附加操作;4.本基片要求的生化反應(yīng)體積只有3~20μL,所以反應(yīng)效率高,從而使檢測靈敏度進(jìn)一步提高。
5.本實用新型一次實驗最少可得到1個樣本、最多48個樣本的生物學(xué)信息,用戶可根據(jù)實際的樣本數(shù)靈活選擇。
應(yīng)理解,在閱讀了本實用新型的上述講授內(nèi)容之后,本領(lǐng)域技術(shù)人員可以對本實用新型作各種改動或修改,這些等價形式同樣落于本申請所附權(quán)利要求書所限定的范圍。
權(quán)利要求1.一種生物芯片基片,其特征在于,具有基片本體、位于基片本體上的溝槽、以及由溝槽隔開的反應(yīng)區(qū),溝槽的寬度為1~5mm,深0.5~1.5mm。
2.如權(quán)利要求1所述的基片,其特征在于,所述溝槽的形狀是半園、長方、楔形或梯形。
3.如權(quán)利要求1所述的基片,其特征在于,所述反應(yīng)區(qū)的數(shù)目為2-50個。
4.如權(quán)利要求1所述的基片,其特征在于,所述反應(yīng)區(qū)的形狀為矩形。
5.一種生物芯片,其特征在于,它包括權(quán)利要求1所述的生物芯片基片,和基片支架,所述的基片支架具有1-10個放置基片的基片孔,并且在基片孔底部四周具有突起的裙邊。
6.如權(quán)利要求5所述的生物芯片,其特征在于,所述的生物芯片還包括支架蓋,所述的支架蓋具有支架蓋本體和位于四周的向下突緣。
7.如權(quán)利要求5所述的生物芯片,其特征在于,所述的基片支架具有2-6個基片孔。
8.如權(quán)利要求5所述的生物芯片,其特征在于,所述的生物芯片還包括載玻片,所述載玻片的大小與基片孔相對應(yīng)。
專利摘要本實用新型涉及生物芯片技術(shù)領(lǐng)域。具體地提供了一種同時處理多份生物樣品的基片,所述的基片具有基片本體、位于基片本體上的溝槽、以及由溝槽隔開的反應(yīng)區(qū)。還提供了一種包含所述的生物芯片基片和基片支架的生物芯片,所述的基片支架具有1-10個放置基片的基片孔,并且在基片孔底部四周具有突起的裙邊。本實用新型的生物芯片可靈活、簡便、高效、無干擾地處理多份生物樣品。
文檔編號G01N33/68GK2625895SQ0323258
公開日2004年7月14日 申請日期2003年6月27日 優(yōu)先權(quán)日2003年6月27日
發(fā)明者李久彤, 田曉峰, 張敏芳, 易進(jìn)華, 王毅 申請人:上海復(fù)旦張江生物醫(yī)藥股份有限公司
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