鯽魚鯉皰疹病毒2型特異性pcr檢測(cè)試劑盒及檢測(cè)方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及養(yǎng)殖技術(shù)領(lǐng)域,特別涉及一種鯽魚鯉皰瘆病毒2型的基因檢測(cè)試劑及 檢測(cè)方法,適用于鯽魚鯉皰瘆病毒2型的流行病學(xué)監(jiān)測(cè)、鯉皰瘆病毒2型的檢測(cè)及基因工程 技術(shù)等領(lǐng)域。
【背景技術(shù)】
[0002] 鯉皰瘆病毒2型(Cyprinidherpesvirus2,CyHV-2),又稱皰瘆病毒性造血器官 壞死病病毒(Herpesviralhaematopoieticnecrosisvirus,HVHNV)或金魚造血器官壞死 病毒(Goldfishhaematopoieticnecrosisvirus,GFHNV)。該病毒在 1992-1993 年首次在 日本養(yǎng)殖的金魚被分離鑒定,也是該病的首次報(bào)道,曾給日本金魚養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大的經(jīng) 濟(jì)損失,死亡率高達(dá)100%。該病毒2009年在我國(guó)江蘇地區(qū)首次出現(xiàn),瀕死魚的血液會(huì)順著 鰓絲流出,漁民稱之為"鰓出血",2010年在該地區(qū)廣泛暴發(fā),2011~2012年,該病毒繼續(xù)蔓 延,導(dǎo)致鯽魚主要養(yǎng)殖區(qū)的異育銀鯽暴發(fā)了 "鰓出血"病,死亡率達(dá)80%以上。根據(jù)流行病 學(xué)調(diào)查,綜合電鏡觀察、分子檢測(cè)和回歸感染實(shí)驗(yàn),確定"鰓出血"病原為CyHV-2。該病傳播 范圍廣、傳染性強(qiáng)、發(fā)病快、致死率高,已給我國(guó)鯽魚養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失,成為我 國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖中危害最為嚴(yán)重的病毒性疾病之一。為了及早發(fā)現(xiàn)養(yǎng)殖魚類是否被CyHV-2感 染,有必要建立一種快速、準(zhǔn)確、靈敏的檢測(cè)方法。
[0003] 傳統(tǒng)病毒病的診斷需要進(jìn)行病毒分離,細(xì)胞培養(yǎng),電鏡觀察以及免疫檢測(cè)等方法, 缺乏對(duì)病毒進(jìn)行快速、準(zhǔn)確、敏感的檢測(cè)方法。PCR方法具有操作簡(jiǎn)單、特異、快速、敏感等優(yōu) 點(diǎn),正逐步應(yīng)用于病原微生物的檢測(cè)與研宄中。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0004] 本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是,克服現(xiàn)有技術(shù)的不足,提供一種鯽魚鯉皰瘆病毒2 型特異性PCR檢測(cè)方法,能快速、高效地用于鯉皰瘆病毒2型的檢測(cè)。
[0005] 本發(fā)明通過下述技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的。
[0006] 1.鯽魚鯉皰瘆病毒2型的PCR快速檢測(cè)試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括: [0007] (1) 2X反應(yīng)混合緩沖液,包含以下成分:
[0008] KC1,
[0009] MgCl2,
[0010] Tris-HCl,pH5. 8,
[0011] dNTP;
[0012] (2)檢測(cè)引物的設(shè)計(jì)合成:上游引物C-F:5'-CGCAGCGGGATCATCCCAATC-3',下游引 物C-R:5' -CGATGTGTATTTCATATAGTG-3',濃度為 10y M ;
[0013] (3)Taq酶;
[0014] (4)滅菌的ddH20 ;
[0015] (5)陽性對(duì)照液:鯽魚鯉皰瘆病毒2型基因組DNA;
[0016] (6)陰性對(duì)照液:健康鯽魚基因組DNA。
[0017] 2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的試劑盒,其特征在于,采用試劑盒檢測(cè)鯽魚鯉皰瘆病毒2 型的方法為:
[0018] (1)鯽魚鯉皰瘆病毒2型DNA的提?。喝■w、脾臟、腎臟組織,加入滅菌處理的雙蒸 水,用玻璃勾衆(zhòng)器充分研磨后,置于_20°C冰箱反復(fù)凍融3次,6000rpm低溫離心10分鐘,取 上清,加入200yLTris-飽和酚,充分振蕩混勻后,靜置5分鐘,然后12000rpm離心5分鐘, 取上清液加入等量的酚:氯仿:異戊醇抽提二次,取上清加入2倍體積的異丙醇,混勻后,靜 置10分鐘,12000rpm離心10分鐘,去掉上清后,加入的75%的乙醇,靜置5分鐘,12000rpm 離心10分鐘,去掉上清,置于真空干燥箱干燥后,用ddH20溶解,即為試驗(yàn)用DNA模板,提取 的DNA模板置于-70°C保存?zhèn)溆茫?br>[0019] (2)PCR反應(yīng)體系:采用PCR反應(yīng)體系,在PCR反應(yīng)管內(nèi)分別加入2X反應(yīng)混合緩 沖液,上游引物、下游引物,Taq DNA聚合酶,DNA模板,用滅菌超純水加至總體積,同時(shí)分別 用陽性對(duì)照液和陰性對(duì)照液作為模板,設(shè)置陽性和陰性對(duì)照組,混合均勻后離心數(shù)秒,置于 PCR反應(yīng)儀上;
[0020] (4)PCR反應(yīng)條件:95°C預(yù)變性5分鐘;然后95°C變性30秒,55°C退火30秒,72°C 延伸30秒,共循環(huán)30次;72°C延伸10分鐘,最后4°C保存;
[0021] (5)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè):PCR反應(yīng)結(jié)束后,取產(chǎn)物在1. 5%瓊脂糖凝膠(含溴化乙 錠0. 5 y g/mL)上,使用TAE緩沖液進(jìn)行電泳,在紫外透射儀下觀察PCR產(chǎn)物,檢查PCR產(chǎn)物 的預(yù)期大?。?br>[0022] (6)結(jié)果與判定:在紫外燈下觀察并與標(biāo)準(zhǔn)分子量相對(duì)照,若檢測(cè)樣品在526bp處 出現(xiàn)明亮的條帶,而陰性對(duì)照沒有目的條帶,則為鯉皰瘆病毒2型陽性;若陽性對(duì)照可見目 的條帶,而檢測(cè)樣品無目的條帶出現(xiàn),則為陰性,沒有或不是所要檢測(cè)的目的鯉皰瘆病毒2 型。
[0023] 優(yōu)選的技術(shù)方案為:
[0024] 1.鯽魚鯉皰瘆病毒2型的PCR快速檢測(cè)試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括:
[0025] (3) 2X反應(yīng)混合緩沖液1.OmL,包含以下成分:
[0026]
【主權(quán)項(xiàng)】
1. 鯽魚鯉皰瘆病毒2型的PCR快速檢測(cè)試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括: (1)2X反應(yīng)混合緩沖液,包含以下成分: KCl, MgCl2, Tris-HCl,pH5. 8, dNTP ; ⑵檢測(cè)引物的設(shè)計(jì)合成:上游引物C-F :5' -CGCAGCGGGATCATCCCAATC-3',下游引物 C-R :5' -CGATGTGTATTTCATATAGTG-3',濃度為 10 y M ; (3) Taq 酶; ⑷滅菌的ddH20 ; (5) 陽性對(duì)照液:鯽魚鯉皰瘆病毒2型基因組DNA ; (6) 陰性對(duì)照液:健康鯽魚基因組DNA。
2. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的試劑盒,其特征在于,采用試劑盒檢測(cè)鯽魚鯉皰瘆病毒2型的 方法為: (1) 鯽魚鯉皰瘆病毒2型DNA的提取:取鰓、脾臟、腎臟組織,加入滅菌處理的雙蒸水, 用玻璃勻漿器充分研磨后,置于_20°C冰箱反復(fù)凍融3次,6000rpm低溫離心10分鐘,取上 清,加入200 y L Tris-飽和酚,充分振蕩混勻后,靜置5分鐘,然后12000rpm離心5分鐘, 取上清液加入等量的酚:氯仿:異戊醇抽提二次,取上清加入2倍體積的異丙醇,混勻后,靜 置10分鐘,12000rpm離心10分鐘,去掉上清后,加入的75 %的乙醇,靜置5分鐘,12000rpm 離心10分鐘,去掉上清,置于真空干燥箱干燥后,用CldH2O溶解,即為試驗(yàn)用DNA模板,提取 的DNA模板置于-70 °C保存?zhèn)溆茫? (2) PCR反應(yīng)體系:采用PCR反應(yīng)體系,在PCR反應(yīng)管內(nèi)分別加入2 X反應(yīng)混合緩沖液, 上游引物、下游引物,Taq DNA聚合酶,DNA模板,用滅菌超純水加至總體積,同時(shí)分別用陽性 對(duì)照液和陰性對(duì)照液作為模板,設(shè)置陽性和陰性對(duì)照組,混合均勻后離心數(shù)秒,置于PCR反 應(yīng)儀上; (4) PCR反應(yīng)條件:95 °C預(yù)變性5分鐘;然后95 °C變性30秒,55 °C退火30秒,72 °C延伸 30秒,共循環(huán)30次;72 °C延伸10分鐘,最后4°C保存; (5) PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè):PCR反應(yīng)結(jié)束后,取產(chǎn)物在1.5%瓊脂糖凝膠(含溴化乙錠 0. 5 y g/mL)上,使用TAE緩沖液進(jìn)行電泳,在紫外透射儀下觀察PCR產(chǎn)物,檢查PCR產(chǎn)物的 預(yù)期大??; (6) 結(jié)果與判定:在紫外燈下觀察并與標(biāo)準(zhǔn)分子量相對(duì)照,若檢測(cè)樣品在526bp處出現(xiàn) 明亮的條帶,而陰性對(duì)照沒有目的條帶,則為鯉皰瘆病毒2型陽性;若陽性對(duì)照可見目的條 帶,而檢測(cè)樣品無目的條帶出現(xiàn),則為陰性,沒有或不是所要檢測(cè)的目的鯉皰瘆病毒2型。
【專利摘要】本發(fā)明屬于生殖技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種公開了鯽魚鯉皰疹病毒2型特異性PCR檢測(cè)試劑盒及檢測(cè)方法。本發(fā)明所述的鯽魚鯉皰疹病毒2型的PCR快速檢測(cè)試劑盒,包括:2×反應(yīng)混合緩沖液1.0mL;優(yōu)選設(shè)計(jì)的上、下游引物;Taq DNA聚合酶;陽性對(duì)照液;陰性對(duì)照液;ddH2O。本發(fā)明克服了現(xiàn)有鯉皰疹病毒2型檢測(cè)方法的不足,提供一種新型PCR快速檢測(cè)試劑盒及檢測(cè)方法。本發(fā)明對(duì)鯽魚鯉皰疹病毒2型進(jìn)行臨床診斷不僅切實(shí)可行,且具有快速、準(zhǔn)確、特異的優(yōu)點(diǎn),滿足了臨床診斷的要求,為檢測(cè)鯽魚鯉皰疹病毒2型提供了便利條件。
【IPC分類】C12Q1-70, C12Q1-68
【公開號(hào)】CN104846124
【申請(qǐng)?zhí)枴緾N201510264013
【發(fā)明人】雷燕, 肖洋, 盧剛, 張文文, 張會(huì)軍, 馬家好
【申請(qǐng)人】廣州利洋水產(chǎn)科技股份有限公司
【公開日】2015年8月19日
【申請(qǐng)日】2015年5月21日