本發(fā)明屬于熒光定量pcr領(lǐng)域,具體涉及一種多重?zé)晒鈖cr法聯(lián)合檢測(cè)呼吸道病原體的試劑盒。
背景技術(shù):
急性呼吸道感染有較高的發(fā)病率和死亡率,特別是下呼吸道感染造成極大的疾病負(fù)擔(dān),全球有20%的學(xué)齡前兒童死于下呼吸道感染(sari),90%的死亡病例歸因于肺炎。肺炎或急性肺炎是發(fā)熱呼吸道癥侯群的主要感染形式,也是造成兒童發(fā)病和死亡的主要原因。
1歲以內(nèi)兒童肺炎發(fā)病率為0.01~0.68次/人年,5歲以內(nèi)兒童肺炎發(fā)病率為0.14~0.66次/人年;肺炎死亡率在1歲以下兒童為485/10萬~890/10萬,5歲以下兒童為184/10萬~1223/10萬。(數(shù)據(jù)來源參考“中國(guó)大陸肺炎發(fā)病率與死亡率”)。
現(xiàn)階段臨床上對(duì)呼吸道病原體主要通過臨床癥狀、分離培養(yǎng)及免疫檢測(cè)等常規(guī)手段進(jìn)行診斷及病原體排查。分離培養(yǎng)耗時(shí)耗力,需要嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)室環(huán)境、通常需要3天才能確診;而免疫檢測(cè)靈敏度低,且存在“窗口期”,感染后3~7天才能檢測(cè)出相應(yīng)的抗原或抗體。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于提供一種多重?zé)晒鈖cr法聯(lián)合檢測(cè)呼吸道病原體的試劑盒,主要采取多重實(shí)時(shí)熒光pcr法對(duì)呼吸道病原體進(jìn)行檢測(cè)。
為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:
本發(fā)明在一個(gè)試劑盒內(nèi)包含常見的11種呼吸道病原體檢測(cè)(甲型流感病毒通用型、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、人副流感病毒的1/2/3型、腺病毒、肺炎支原體、肺炎衣原體、嗜肺軍團(tuán)菌、肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌、a族鏈球菌),通過3個(gè)反應(yīng)緩沖液進(jìn)行擴(kuò)增,每個(gè)反應(yīng)緩沖液包含四個(gè)熒光通道,能夠排查臨床上90%的病原體感染。
所述試劑盒包括如下;反應(yīng)液a包含甲型流感特異性引物及探針、乙型流感特異性引物及探針、腺病毒特異性引物及探針、呼吸道合胞病毒特異性引物及探針;
反應(yīng)液b包含肺炎支原體特異性引物及探針、肺炎衣原體特異性引物及探針、副流感病毒特異性引物及探針、內(nèi)控特異性引物及探針;
反應(yīng)液c包含嗜肺軍團(tuán)菌特異性引物及探針、肺炎鏈球菌特異性引物及探針、流感嗜血桿菌特異性引物及探針、a族鏈球菌特異性引物及探針;
酶混合液包含熱啟動(dòng)taq酶及m-mlv酶;
陽性對(duì)照包含特異性質(zhì)粒及te水;
陰性對(duì)照包含te水。
引物探針序列:
試劑組分配方:
反應(yīng)液a配方:tris(ph8.8)20mmol/l,kcl60mmol/l,mgcl22.5mmol/l,edta·2na0.1mmol/l,1%dmso,datp200μmol/l,dgtp200μmol/l,dctp200μmol/l,dttp200μmol/l,甲型流感病毒上游引物417nmol/l,甲型流感病毒下游引物417nmol/l,甲型流感病毒探針125nmol/l,乙型流感病毒上游引物417nmol/l,乙型流感病毒下游引物417nmol/l,乙型流感病毒探針125nmol/l,腺病毒上游引物417nmol/l,腺病毒下游引物417nmol/l,腺病毒探針125nmol/l,呼吸道合胞病毒上游引物417nmol/l,呼吸道合胞病毒下游引物417nmol/l,呼吸道合胞病毒探針125nmol/l。
反應(yīng)液b配方:tris(ph8.8)20mmol/l,kcl60mmol/l,mgcl22.5mmol/l,edta·2na0.1mmol/l,1%dmso,datp200μmol/l,dgtp200μmol/l,dctp200μmol/l,dttp200μmol/l,肺炎支原體上游引物417nmol/l,肺炎支原體下游引物417nmol/l,肺炎支原體探針125nmol/l,肺炎衣原體上游引物417nmol/l,肺炎衣原體下游引物417nmol/l,肺炎衣原體探針125nmol/l,副流感病毒上游引物417nmol/l,副流感病毒下游引物417nmol/l,副流感病毒探針125nmol/l,內(nèi)控上游引物417nmol/l,內(nèi)控下游引物417nmol/l,內(nèi)控探針125nmol/l。
反應(yīng)液c配方:tris(ph8.8)20mmol/l,kcl60mmol/l,mgcl22.5mmol/l,edta·2na0.1mmol/l,1%dmso,datp200μmol/l,dgtp200μmol/l,dctp200μmol/l,dttp200μmol/l,肺炎鏈球菌上游引物417nmol/l,肺炎鏈球菌下游引物417nmol/l,肺炎鏈球菌探針125nmol/l,嗜肺軍團(tuán)菌上游引物417nmol/l,嗜肺軍團(tuán)菌下游引物417nmol/l,嗜肺軍團(tuán)菌探針125nmol/l,a族鏈球菌上游引物417nmol/l,a族鏈球菌下游引物417nmol/l,a族鏈球菌探針125nmol/l,流感嗜血桿菌上游引物417nmol/l,流感嗜血桿菌下游引物417nmol/l,流感嗜血桿菌探針125nmol/l。
酶混合液配方:taq酶4u/μl,m-mlv酶10u/μl。
本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)在于:
發(fā)明的優(yōu)點(diǎn):本發(fā)明的優(yōu)勢(shì)為1、靈敏度達(dá)到500copies/ml;2、擴(kuò)增完后直接得到結(jié)果,無需后續(xù)操作,獲得樣本后3小時(shí)就能得到結(jié)果;3、無窗口期,一經(jīng)感染就能檢測(cè)出來。
發(fā)明的有益效果:1、提高檢測(cè)靈敏度,增加檢出率,縮短患者的病程;2、明確病因,提高用藥準(zhǔn)確率,避免濫用藥物;3、減少手工操作,縮短檢測(cè)流程,降低檢測(cè)成本。
附圖說明
圖1反應(yīng)液a特異性結(jié)果圖。
圖2反應(yīng)液b特異性結(jié)果圖。
圖3反應(yīng)液c特異性結(jié)果圖。
圖4反應(yīng)液a線性靈敏度結(jié)果圖。
圖5反應(yīng)液b線性靈敏度結(jié)果圖。
圖6反應(yīng)液c線性靈敏度結(jié)果圖。
具體實(shí)施方式
實(shí)施例1
1、反應(yīng)液的配制
(1)反應(yīng)液a的配制
取10ml容量瓶,分別加入0.5mol/ltrizma?hcl64μl,0.5mol/ltrizma?base336μl,1mol/lmgcl225μl,1mol/lkcl600μl,0.5mol/ledta·2na2μl,dmso100μl,dntps90μl,50μmol/l的甲型流感病毒上下游引物各83.4μl,50μmol/l甲型流感病毒探針25μl,50μmol/l的乙型流感病毒上下游引物各83.4μl,50μmol/l乙型流感病毒探針25μl,50μmol/l的腺病毒上下游引物各83.4μl,50μmol/l腺病毒探針25μl,50μmol/l的呼吸道合胞病毒上下游引物各83.4μl,50μmol/l呼吸道合胞病毒探針25μl。用雙重蒸餾水補(bǔ)足體積到10ml,翻轉(zhuǎn)使之充分混勻,將液體轉(zhuǎn)移到10ml燒杯中,按1ml/支分裝到離心管中,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
(2)反應(yīng)液b的配制
取10ml容量瓶,分別加入0.5mol/ltrizma?hcl64μl,0.5mol/ltrizma?base336μl,1mol/lmgcl225μl,1mol/lkcl600μl,0.5mol/ledta·2na2μl,dmso100μl,dntps90μl,50μmol/l的肺炎支原體上下游引物各83.4μl,50μmol/l肺炎支原體探針25μl,50μmol/l的肺炎衣原體上下游引物各83.4μl,50μmol/l肺炎衣原體探針25μl,50μmol/l的副流感病毒上下游引物各83.4μl,50μmol/l副流感病毒探針25μl,50μmol/l的內(nèi)控上下游引物各83.4μl,50μmol/l內(nèi)控探針25μl。用雙重蒸餾水補(bǔ)足體積到10ml,翻轉(zhuǎn)使之充分混勻,將液體轉(zhuǎn)移到10ml燒杯中,按1ml/支分裝到離心管中,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
(3)反應(yīng)液c的配制
取10ml容量瓶,分別加入0.5mol/ltrizma?hcl64μl,0.5mol/ltrizma?base336μl,1mol/lmgcl225μl,1mol/lkcl600μl,0.5mol/ledta·2na2μl,dmso100μl,dntps90μl,50μmol/l的肺炎鏈球菌上下游引物各83.4μl,50μmol/l肺炎鏈球菌探針25μl,50μmol/l的嗜肺軍團(tuán)菌上下游引物各83.4μl,50μmol/l嗜肺軍團(tuán)菌探針25μl,50μmol/l的a族鏈球菌上下游引物各83.4μl,50μmol/la族鏈球菌探針25μl,50μmol/l的流感嗜血桿菌上下游引物各83.4μl,50μmol/l流感嗜血桿菌探針25μl。用雙重蒸餾水補(bǔ)足體積到10ml,翻轉(zhuǎn)使之充分混勻,將液體轉(zhuǎn)移到10ml燒杯中,按1ml/支分裝到離心管中,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
(4)酶混合液的配制
取10ml容量瓶,分別加入10000u/ml的taq酶4ml,25000u/ml的m-mlv酶4ml。用雙重蒸餾水補(bǔ)足體積到10ml,翻轉(zhuǎn)使之充分混勻,將液體轉(zhuǎn)移到10ml燒杯中,按100μl/支分裝到離心管中,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
(5)陰性對(duì)照的配制
取100ml容量瓶,加入生理鹽水定容至100ml,將液體轉(zhuǎn)移到10ml燒杯中,按500μl/支分裝到離心管中,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
(6)陽性對(duì)照的配制(濃度為5.0×103copies/ml)
取100ml容量瓶,分別加入5.0×107copies/ml甲型流感病毒、乙型流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、肺炎支原體、肺炎衣原體、副流感病毒、肺炎鏈球菌、嗜肺軍團(tuán)菌、a族鏈球菌和流感嗜血桿菌質(zhì)粒(各質(zhì)粒委托通用生物系統(tǒng)(安徽)有限公司合成)各10μl。用生理鹽水定容至100ml,將液體轉(zhuǎn)移到100ml燒杯中,按500μl/支分裝到離心管中,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
2、核酸提取
采用已備案的核酸提取試劑盒進(jìn)行核酸提取,提取后用微量紫外分光光度計(jì)測(cè)核酸純度,其od260/od280應(yīng)在1.6~2.0之間。
3、加樣上機(jī)
(1)反應(yīng)混合物配制
取出反應(yīng)液a、反應(yīng)液b、反應(yīng)液c、酶混合液室溫放置,使其充分溶解,配制反應(yīng)混合物(每測(cè)試配置體系:29.5μl反應(yīng)液+0.5μl酶混合液),按照需要計(jì)算好試劑用量,充分混合均勻后,3000-5000g離心5秒。
(2)加樣
取0.2ml擴(kuò)增管或者八聯(lián)管,加入30μl配制好的反應(yīng)混合物,然后將提取好的樣本取2μl加入擴(kuò)增管或八聯(lián)管,蓋好蓋子,稍微離心后置入熒光pcr擴(kuò)增儀內(nèi)。
(3)上機(jī)檢測(cè)
1)循環(huán)條件設(shè)置
38℃5分鐘,95℃10分鐘;進(jìn)入以下循環(huán):95℃15秒,58℃40秒(檢測(cè)信號(hào)),40循環(huán);25℃30秒。
2)儀器檢測(cè)通道選擇
熒光素設(shè)定為fam、rox、hex和cy5。
4、結(jié)果判斷
(1)陰性對(duì)照應(yīng)無ct值或者為0;陽性對(duì)照ct值應(yīng)≤36;反應(yīng)液b中cy5通道ct值應(yīng)≤36;
(2)樣本測(cè)試結(jié)果應(yīng)以下表判斷
實(shí)施例2
1、試劑特異性驗(yàn)證
(1)實(shí)驗(yàn)樣本
采取10份特異性樣本對(duì)試劑的特異性進(jìn)行驗(yàn)證,其中4份為生理鹽水、1份為人偏肺病毒樣本、1份為風(fēng)疹病毒樣本、1份為麻疹病毒樣本、1份為肺炎克雷伯氏菌樣本、1份為大腸桿菌樣本、1份為金黃色葡萄球菌樣本。
(2)實(shí)驗(yàn)過程
用反應(yīng)液a、反應(yīng)液b、反應(yīng)液c、分別檢測(cè)以上10份特異性樣本,分析檢測(cè)結(jié)果,驗(yàn)證試劑的特異性。
(3)實(shí)驗(yàn)結(jié)果
三種反應(yīng)液檢測(cè)10份特異性樣本皆為陰性,表明試劑特異性好,無交叉反應(yīng)情況。具體結(jié)果見下表:
反應(yīng)液a特異性檢測(cè)結(jié)果
反應(yīng)液b特異性檢測(cè)結(jié)果
反應(yīng)液c特異性檢測(cè)結(jié)果
2、試劑精密性驗(yàn)證
(1)實(shí)驗(yàn)樣本
采取1份精密性樣本(濃度為5.0×103copies/ml)對(duì)試劑的精密性進(jìn)行驗(yàn)證,樣本配制方法為取100ml容量瓶,分別加入5.0×107copies/ml甲型流感病毒、乙型流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、肺炎支原體、肺炎衣原體、副流感病毒、內(nèi)控、肺炎鏈球菌、嗜肺軍團(tuán)菌、a族鏈球菌和流感嗜血桿菌質(zhì)粒各10μl,用生理鹽水定容至100ml。
(2)實(shí)驗(yàn)過程
用反應(yīng)液a、反應(yīng)液b、反應(yīng)液c、分別重復(fù)檢測(cè)以上精密性樣本10次,分析檢測(cè)結(jié)果,驗(yàn)證試劑的精密性。
(3)實(shí)驗(yàn)結(jié)果
三種反應(yīng)液檢測(cè)精密性樣本批內(nèi)變異系數(shù)(cv值)均<5%,表明試劑重復(fù)性好。具體結(jié)果見下表:
反應(yīng)液a精密性檢測(cè)結(jié)果
反應(yīng)液b精密性檢測(cè)結(jié)果
反應(yīng)液c精密性檢測(cè)結(jié)果
3、試劑最低檢測(cè)限驗(yàn)證
(1)實(shí)驗(yàn)樣本
采取1份最低檢測(cè)限樣本(濃度為5.0×102copies/ml)對(duì)試劑的最低檢測(cè)限進(jìn)行驗(yàn)證,樣本配制方法為取100ml容量瓶,分別加入5.0×103copies/ml的精密性樣本10ml,用生理鹽水定容至100ml。
(2)實(shí)驗(yàn)過程
用反應(yīng)液a、反應(yīng)液b、反應(yīng)液c、分別重復(fù)檢測(cè)以上最低檢測(cè)限樣本10次,分析檢測(cè)結(jié)果,驗(yàn)證試劑的最低檢測(cè)限。
(3)實(shí)驗(yàn)結(jié)果
三種反應(yīng)液檢測(cè)最低檢測(cè)限樣本均為陽性,試劑的最低檢測(cè)限為5.0×102copies/ml。具體結(jié)果見下表:
4、試劑線性靈敏度驗(yàn)證
(1)實(shí)驗(yàn)樣本
采取8份線型靈敏度樣本(濃度分別為5.0×108copies/ml、5.0×107copies/ml、5.0×106copies/ml、5.0×105copies/ml、5.0×104copies/ml、5.0×103copies/ml、5.0×102copies/ml、5.0×101copies/ml、)對(duì)試劑的線性進(jìn)行驗(yàn)證。
(2)實(shí)驗(yàn)過程
用反應(yīng)液a、反應(yīng)液b、反應(yīng)液c、分別檢測(cè)以上線性樣本,分析檢測(cè)結(jié)果,驗(yàn)證試劑的線性靈敏度。
(3)實(shí)驗(yàn)結(jié)果
三種反應(yīng)液檢測(cè)線型靈敏度樣本均為陽性,試劑的線性良好。具體結(jié)果見下圖4-6.
實(shí)施例3:檢測(cè)120臨床樣本的結(jié)果
1、按照實(shí)施例1所示的配制方法,配制試劑盒相關(guān)組分,于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
2、武漢市婦幼保健院收集了120例具有臨床呼吸道感染癥狀的患者咽拭子樣本及痰液樣本,采用德必碁生物科技(廈門)有限公司生產(chǎn)的核酸提取試劑(病毒型)進(jìn)行核酸提取,用紫外分光光度計(jì)檢測(cè)dna樣本的純度,120例樣本od260/od280皆在1.6~2.0之間。
3、按照實(shí)施例1所示的步驟,進(jìn)行dna加樣并上熒光定量pcr儀進(jìn)行檢測(cè),本次使用的儀器為abi7500.
4、按照實(shí)施例1所示判斷標(biāo)準(zhǔn),對(duì)結(jié)果進(jìn)行判讀并統(tǒng)計(jì),結(jié)果如下表:
以上所述僅為本發(fā)明的較佳實(shí)施例,凡依本發(fā)明申請(qǐng)專利范圍所做的均等變化與修飾,皆應(yīng)屬本發(fā)明的涵蓋范圍。
sequencelisting
<110>德必碁生物科技(廈門)有限公司
<120>一種多重?zé)晒鈖cr法聯(lián)合檢測(cè)呼吸道病原體的試劑盒
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