專利名稱：HIV感染疾病進(jìn)展分子標(biāo)志物miR-31的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及HIV感染預(yù)后診斷領(lǐng)域，具體來說涉及一種HIV感染疾病進(jìn)展分子標(biāo)志物miR-31，其可應(yīng)用于在HIV感染早期進(jìn)行預(yù)后評(píng)估，以給患者及時(shí)有效地隨訪、治療等干預(yù)措施，以延長生存時(shí)間，提高生存質(zhì)量。
背景技術(shù)：
microRNA (miRNA)是近年來的研究熱點(diǎn),它是一種廣泛存在于真核生物中的單鏈小分子RNA，不具編碼功能，但它能夠結(jié)合于基因序列的側(cè)翼區(qū)域阻遏或抑制靶mRNA的翻譯，具有高度的保守性、時(shí)序性和組織特異性，目前在腫瘤、血液病、病毒感染等多種疾病的臨床診斷、治療及預(yù)后評(píng)價(jià)等領(lǐng)域發(fā)揮了重要作用。 艾滋病是一個(gè)世界性的重大傳染病，嚴(yán)重威脅人們的健康和影響經(jīng)濟(jì)社會(huì)的發(fā)展。HIV感染后，疾病進(jìn)展速度不同，一般經(jīng)8-10年進(jìn)入艾滋病期，稱為“典型進(jìn)展者”。但10%的感染者，在感染三年甚至一年內(nèi)⑶4+T細(xì)胞顯著下降至350個(gè)/微升以下，稱為“快速進(jìn)展者”。如快速進(jìn)展者診斷后不能定期隨訪及盡早治療，則發(fā)病率及死亡率將持續(xù)上升，且增加傳播風(fēng)險(xiǎn)。目前，我國經(jīng)性途徑HIV感染者不斷增加，男男性接觸中快速進(jìn)展者比例較高，如果在HIV感染早期能對預(yù)后進(jìn)行有效預(yù)測，區(qū)分快速進(jìn)展者及典型進(jìn)展者，個(gè)體化合理安排病人的隨訪及治療，不僅可以提高HIV感染者的生存時(shí)間及生存質(zhì)量，對國家的艾滋病防治工作亦具有重要意義。目前，HIV感染疾病進(jìn)展及預(yù)后評(píng)價(jià)的方式主要有以下幾種CD4+T細(xì)胞數(shù)量、病毒載量、免疫活化等其他指標(biāo)。CD4+T細(xì)胞數(shù)量是HIV感染的靶細(xì)胞，可有效反映機(jī)體免疫狀態(tài)，但其檢測需要流式細(xì)胞儀，儀器及相應(yīng)試劑價(jià)格昂貴，技術(shù)要求高，不適合普遍開展，且快速進(jìn)展者及典型進(jìn)展者在HIV感染早期，CD4+T細(xì)胞數(shù)量差異不夠顯著，不易對未來的疾病進(jìn)展進(jìn)行有效預(yù)測；病毒載量在HIV感染早期波動(dòng)較大，且并不與臨床免疫狀態(tài)完全平行；免疫活化等指標(biāo)雖有報(bào)道可預(yù)測疾病預(yù)后，但對設(shè)備要求高，需要專業(yè)人員的分析，標(biāo)本最好選用新鮮標(biāo)本，儲(chǔ)存運(yùn)輸不便，難以推廣。近年來的研究表明，HIV感染和miRNA密切相關(guān)，miRNA可以通過作用于病毒本身或作用于免疫系統(tǒng)從而影響疾病進(jìn)展，因此對HIV感染疾病進(jìn)展的診斷也可能有相應(yīng)的作用。與HIV感染相關(guān)的miRNA種類較多且作用不一，已有研究表明在HIV感染后miRNA普遍下調(diào)，miR-17/92基因簇可抑制HIV感染等。雖然已在該領(lǐng)域進(jìn)行了一些研究，但是HIV感染早期疾病快速進(jìn)展者的miRNA表達(dá)變化目前還沒有研究，在臨床和研究中，需尋找可有效預(yù)測疾病預(yù)后的miRNA標(biāo)志物。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明提供了一種新的HIV感染疾病進(jìn)展相關(guān)的miRNA作為疾病進(jìn)展的分子標(biāo)志物，該 miRNA 為 miR-31，其序列為 5’-AGGCAAGAUGCUGGCAUAGCU-3’ (SEQ ID NO: I)。發(fā)明人發(fā)現(xiàn)，miR-31在HIV感染早期(120天)快速進(jìn)展者外周血單個(gè)核細(xì)胞中的含量相比典型進(jìn)展者明顯降低，可以預(yù)測感染一年后疾病進(jìn)展情況，由此可見，降低的miR-31與HIV感染疾病進(jìn)展及預(yù)后密切相關(guān)。在上述發(fā)現(xiàn)的基礎(chǔ)上，本發(fā)明提供了 miR-31在制備診斷HIV感染疾病進(jìn)展的診斷試劑中的用途。具體地,所述診斷試劑通過檢測被試者外周血單個(gè)核細(xì)胞中miR-31的含量,并與HIV感染典型進(jìn)展者平均水平相比較來診斷HIV感染疾病進(jìn)展，其中，miR-31在HIV感染快速進(jìn)展者外周血單個(gè)核細(xì)胞中的含量相對于典型進(jìn)展者顯著下降。在一個(gè)特定的實(shí)施方案中，使用定量PCR的方法來檢測被試者外周血單個(gè)核細(xì)胞中miR-31含量。本發(fā)明還提供了一種診斷HIV感染疾病進(jìn)展的診斷試劑盒，其包括(I)外周血單個(gè)核細(xì)胞總RNA提取試劑，(2) RNA 加 polyA 試劑，(3) RT-PCR 試劑，·(4)定量 PCR 試劑。其中，定量PCR試劑中包括HIV感染疾病進(jìn)展分子標(biāo)志物miR-31的特異性正向引物，優(yōu)選地，其序列為 5’ -CAAGATGCAGGCATCG-3’ (SEQ ID NO :7)。在一個(gè)特定的實(shí)施方案中，所述外周血單個(gè)核細(xì)胞總RNA提取試劑中包括序列為5，-CAACCTCCTAGAAAGA-3’ (SEQ ID NO :2)的 External Control-1 ;所述 RNA 加 polyA 試劑中包括序列為 5’-TGAGCAACGCGAACAA-3’ (SEQ ID NO :3)的 External Control-2 ;所述RT-PCR 試劑中包括序列為 5’ -CAGTGGTATCAACGCACTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTVN-3’ (SEQ ID NO 4)的RT-Primer (其中，V為A或C或G，N為A或T或C或G);所述定量 PCR 試劑中包括序列分別為 5’ -CTCACACGACTCACGACAC-3’ (SEQ ID NO :5)和 5’ -CTCACACGACTCACGACACCAGTGGTATCAACGCACTC-3’ (SEQ ID NO :6)的通用反向引物 UPM-short 和UPM-long。使用本發(fā)明的HIV感染疾病進(jìn)展分子標(biāo)志物miR-31診斷HIV感染疾病進(jìn)展具有操作簡單，安全無創(chuàng)傷，高特異性，高靈敏性以及易于大量篩查的特點(diǎn)。
具體實(shí)施例方式I.外周血單個(gè)核細(xì)胞中總RNA的提取抽取11名HIV感染快速進(jìn)展者感染120天5ml血液，同時(shí)抽取6名HIV感染疾病典型進(jìn)展者及4名正常人對照血液各5ml作為對照，密度梯度離心法收集外周血單個(gè)核細(xì)胞,用PBSlml重懸細(xì)胞，置于I. 5ml的RNase/DNase-free離心管中。使用RNA提取試劑盒(北京曠博生物技術(shù)有限公司)自外周血單個(gè)核細(xì)胞中提取總RNA,每250 μ I外周血單個(gè)核細(xì)胞中加入I μ I (20ηΜ)序列為5’-CAACCTCCTAGAAAGA-3’(SEQ ID NO :2)的External Control-1 (上海生工生物工程技術(shù)有限公司合成)來監(jiān)控外周血單個(gè)核細(xì)胞中RNA的提取質(zhì)量。提取的總RNA使用Thermo NanoDrop2000c測定濃度。2.三步法定量檢測外周血單個(gè)核細(xì)胞中的miRNA(I)加 polyA 尾:i.在無RNA酶的PCR管(Axygen公司，200 μ I)中配制加polyA尾的反應(yīng)液，體系為 20 μ I。每 20 μ I 體系中加入 I μ I (20ηΜ)序列為 5’ -TGAGCAACGCGAACAA-3’ (SEQ IDNO 3)的External Control-2 (上海生工生物工程技術(shù)有限公司合成)來監(jiān)控miRNA的加
尾及反轉(zhuǎn)錄質(zhì)量。
權(quán)利要求
1.一種HIV感染疾病進(jìn)展分子標(biāo)志物miR-31，其序列如SEQ ID NO 1所示。
2.權(quán)利要求I所述HIV感染疾病進(jìn)展分子標(biāo)志物miR-31在制備HIV感染預(yù)后的診斷試劑中的用途。
3.權(quán)利要求2所述用途，其中，所述 診斷試劑通過檢測被試者外周血單個(gè)核細(xì)胞中miR-31的含量，并與HIV感染典型進(jìn)展者平均水平相比較來判斷HIV感染疾病進(jìn)展。
4.權(quán)利要求3所述用途，其中，miR-31在HIV感染快速進(jìn)展者外周血單個(gè)核細(xì)胞中的含量相對于典型進(jìn)展者顯著下降。
5.權(quán)利要求3所述用途，其中，使用定量PCR的方法來檢測被試者外周血單個(gè)核細(xì)胞中miR-31 含量。
6.一種診斷HIV感染疾病進(jìn)展的診斷試劑盒，其包括 (1)外周血單個(gè)核細(xì)胞總RNA提取試劑，(2)RNA 加 polyA 試劑，(3)RT-PCR 試劑， (4)定量PCR試劑； 其中，定量PCR試劑中包括權(quán)利要求I所述HIV感染疾病進(jìn)展標(biāo)志物miR-31的特異性正向引物。
7.權(quán)利要求6所述診斷試劑盒，其中，所述外周血單個(gè)核細(xì)胞總RNA提取試劑中包括序列為 SEQ ID NO 2 的 External Control-1。
8.權(quán)利要求6所述診斷試劑盒，其中，所述RNA加polyA試劑中包括序列為SEQID NO:3的 External Control-2。
9.權(quán)利要求6所述診斷試劑盒，其中，所述RT-PCR試劑中包括序列為SEQID NO 4的RT-Primer0
10.權(quán)利要求6所述診斷試劑盒，其中，所述定量PCR試劑中包括序列分別為SEQIDNO 5和6的通用反向引物UPM-short和UPM-long。
11.權(quán)利要求6所述診斷試劑盒，其中，所述HIV感染疾病進(jìn)展分子標(biāo)志物miR-31的特異性正向引物的序列如SEQ IDNO 7所示。
全文摘要
本發(fā)明提供了一種HIV感染疾病進(jìn)展分子標(biāo)志物miR-31，及其在制備HIV感染疾病進(jìn)展診斷試劑中的用途。HIV感染快速進(jìn)展者miR-31在外周血單個(gè)核細(xì)胞中的含量比典型進(jìn)展者及正常對照外周血單個(gè)核細(xì)胞中的含量低，能夠預(yù)測感染一年后疾病進(jìn)展程度。本發(fā)明還提供了一種診斷HIV感染疾病進(jìn)展的診斷試劑盒。使用本發(fā)明的HIV感染疾病進(jìn)展分子標(biāo)志物miR-31診斷疾病進(jìn)展具有操作簡單，安全無創(chuàng)傷，高特異性，高靈敏性以及易于大量篩查的特點(diǎn)。
文檔編號(hào)C12Q1/68GK102839174SQ20121030597
公開日2012年12月26日 申請日期2012年8月24日 優(yōu)先權(quán)日2012年8月24日
發(fā)明者尚紅, 李啟靖, 張子寧, 徐俊杰, 付雅靜 申請人:中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院, 北京曠博生物技術(shù)有限公司