用于圖像分析識別的方法和系統(tǒng)的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明提供了用于識別第一關(guān)注對象的計算機(jī)實施的方法。第一關(guān)注對象包括兩個標(biāo)識符和樣本部分。該方法包括使包括兩個標(biāo)識符的第一關(guān)注對象成像。使包括該兩個標(biāo)識符的第一關(guān)注對象成像生成第一組圖像數(shù)據(jù)。該方法還包括確定第一關(guān)注對象在光學(xué)傳感器的視場中的位置以及從第一組圖像數(shù)據(jù)確定兩個標(biāo)識符。該方法還包括基于兩個標(biāo)識符識別第一關(guān)注對象。
【專利說明】用于圖像分析識別的方法和系統(tǒng)
[0001]相關(guān)申請的交叉引用
[0002]本申請要求于2011年9月30日提交的第61/541，453號美國臨時申請的優(yōu)先權(quán)的權(quán)益,該申請的全部內(nèi)容通過弓I用并入本文。

【背景技術(shù)】
[0003]通常，為了提高效率，越來越需要自動化系統(tǒng)。例如，自動化生物樣本處理儀器的進(jìn)步允許對樣本進(jìn)行更快、更高效、且高吞吐量的分析。這些類型的系統(tǒng)可比先前的系統(tǒng)測定更多數(shù)量的樣本。因此，經(jīng)受各個測定的樣本利用標(biāo)識符標(biāo)記或標(biāo)出。
[0004]以前，系統(tǒng)或儀器的操作員可能必須通過讀取樣本容納裝置、機(jī)架或測定芯片上的標(biāo)識符手動地跟蹤或驗證樣本。該種手動跟蹤或驗證可能是勞動密集型的并且具有高操作失誤(如樣本錯誤跟蹤或不適當(dāng)?shù)臏y試)概率。此外，期望被測定的樣本數(shù)目越多將會越耗時和麻煩。
[0005]其他更自動化的系統(tǒng)可在測試前掃描標(biāo)識符，以跟蹤或驗證樣本。然而，這些系統(tǒng)通常需要額外的部件。此外，標(biāo)識符可能由系統(tǒng)誤讀或不能由系統(tǒng)讀取。


【發(fā)明內(nèi)容】

[0006]在一個示例性實施方式中，提供了用于識別第一關(guān)注對象的計算機(jī)實施的方法。該第一關(guān)注對象包括樣本部分和兩個標(biāo)識符。該方法包括使包括兩個標(biāo)識符的第一關(guān)注對象成像。使包括兩個標(biāo)識符的第一關(guān)注對象成像生成第一組圖像數(shù)據(jù)。該方法還包括確定第一關(guān)注對象在光學(xué)傳感器的視場中的位置和從第一組圖像數(shù)據(jù)確定兩個標(biāo)識符。該方法還包括基于兩個標(biāo)識符識別第一關(guān)注對象。

【專利附圖】

【附圖說明】
[0007]圖1示出了根據(jù)本文中描述的各實施方式的示例性關(guān)注對象
[0008]圖2是示出了可實施本教導(dǎo)的實施方式的計算機(jī)系統(tǒng)的框圖；
[0009]圖3是示出了可實施本教導(dǎo)的實施方式的示例性儀器的框圖；
[0010]圖4示出了根據(jù)本文中描述的各實施方式的示例性用于成像的光學(xué)系統(tǒng)；
[0011]圖5示出了根據(jù)本文中描述的各實施方式的關(guān)注對象的圖像和相關(guān)的標(biāo)識符；
[0012]圖6示出了根據(jù)本文中描述的各實施方式的用于通過圖像分析識別對象的方法的流程圖；
[0013]圖7示出了根據(jù)本文中描述的各實施方式的標(biāo)識符；
[0014]圖8A示出了根據(jù)本文中描述的各實施方式的另一標(biāo)識符；
[0015]圖SB示出了根據(jù)本文中描述的各實施方式的在預(yù)處理之后的圖8A所示的標(biāo)識符；以及
[0016]圖9示出了根據(jù)本文中描述的各實施方式的示例性工作流。

【具體實施方式】
[0017]與本文中描述的各實施方式相關(guān)的方法的示例性系統(tǒng)包括以下申請中描述的系統(tǒng):第61/541,453號美國臨時專利申請?zhí)?案卷號:LT00578PR0)、第61/541，515號美國臨時專利申請(案卷號:1^00578?1?03)、第61/541，342號美國臨時專利申請(案卷號:LT00581PR0)、第 29/403，049 號美國臨時專利申請(案卷號:LT00582DES)、第 61/541，495號美國臨時專利申請(案卷號:1^00583?1?0)、第61/541，366號美國臨時專利申請(案卷號:LT00584.1PR0)、以及第61/541，371號美國臨時專利申請(案卷號:LT00594PR0)，以上所有申請都是在2011年9月30日提交的，并且以上所有申請都通過引用整體地并入本文。與本文中描述的各實施方式相關(guān)的方法的不例性系統(tǒng)包括在于2012年6月15日提交的第61/660，343號美國臨時專利申請(案卷號:LT00702PR02)中描述的系統(tǒng)，該申請的全部內(nèi)容通過引用并入本文。
[0018]為了更全面地理解本發(fā)明，下面將描述大量具體細(xì)節(jié)，如具體配置、參數(shù)、示例等。但是，應(yīng)理解這些描述并不用于限制本發(fā)明的范圍，而是用于對更好地描述示例性實施方式。
[0019]如上所述，由于系統(tǒng)需要處理的項目數(shù)量的增加，因此期望更自動化的系統(tǒng)。此夕卜，還期望例如更準(zhǔn)確且更有效的識別、跟蹤、驗證、安全和兼容性檢查。因此，樣本和測定通常利用機(jī)器可讀的標(biāo)識符進(jìn)行標(biāo)記。標(biāo)識符的示例可為字母數(shù)字字符或條形碼。
[0020]本申請涉及讀取關(guān)注對象上的標(biāo)識符，更具體地，本申請涉及通過分析關(guān)注對象上標(biāo)識符的圖像來識別對象。
[0021]條形碼是關(guān)于其所標(biāo)記對象的數(shù)據(jù)的機(jī)器可讀表示，通常為平行線的變化寬度和間隔的形式。一種條形碼使用條和間隔將128字符ASCII和符號編碼。編碼是基于每個條和間隔的寬度。每個條或間隔具有在一個單位至4個單位之間變化的寬度。每個字符以三個條和三個間隔進(jìn)行編碼，并且寬度總和為11個單位。
[0022]應(yīng)認(rèn)識到本文中描述的方法和系統(tǒng)可實施在各種類型的系統(tǒng)、儀器和機(jī)器中。例如，各實施方式可實施在對多個樣本執(zhí)行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)的儀器中。
[0023]根據(jù)本文中描述的實施方式，包括處于一個或多個反應(yīng)點之內(nèi)的一個或多個樣本的基底可由一個以上標(biāo)識符標(biāo)出。具有至少兩個標(biāo)識符以供讀取使得更加確認(rèn)標(biāo)識符讀取是正確的。在一些情況下，標(biāo)識符可能不能由系統(tǒng)檢測到。在其他情況下，標(biāo)識符可能被不準(zhǔn)確地讀取并且識別不正確的樣本或測定。通過具有一個以上的標(biāo)識符，可進(jìn)行另外的檢查以識別樣本。
[0024]在各實施方式中，本文中描述的設(shè)備、儀器、系統(tǒng)和方法可用于檢測一種或多種關(guān)注的生物成分。這些關(guān)注的生物成分可以是任何合適的生物目標(biāo)，該生物目標(biāo)包括但不限于DNA序列(包括無細(xì)胞DNA)、RNA序列、基因、寡核苷酸、分子、蛋白質(zhì)、生物標(biāo)記物、細(xì)胞(例如，循環(huán)腫瘤細(xì)胞)或任何其他合適的目標(biāo)生物分子。
[0025]在各實施方式中，該生物成分可以在應(yīng)用中與各種PCR、qPCR和/或dPCR方法和系統(tǒng)結(jié)合使用，這些應(yīng)用例如是胎兒診斷、多重dPCR、病毒檢測和量化標(biāo)準(zhǔn)、基因分型、測序驗證、突變檢測、轉(zhuǎn)基因生物檢測、稀有等位基因檢測和拷貝數(shù)變異。本公開的實施方式通常涉及用于監(jiān)測或測量大量小體積樣本的生物反應(yīng)的設(shè)備、儀器、系統(tǒng)和方法。例如，如本文中所使用的，樣本可稱為樣本體積或反應(yīng)體積。
[0026]雖然通常適用于處理大量樣本的定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qPCR)，但應(yīng)當(dāng)認(rèn)識到根據(jù)本文中描述的各實施方式可以使用任何合適的PCR方法。例如，合適的PCR方法包括(但不限于)數(shù)字PCR、等位基因特異性PCR、不對稱PCR、連接介導(dǎo)PCR、多重PCR、巢式PCR、qPCR、基因組步移、以及橋式PCR。
[0027]如下所述，例如，根據(jù)本文中描述的各實施方式，反應(yīng)點可包括(但不限于)通孔、孔、凹陷、點、腔、樣本保持區(qū)、以及反應(yīng)室。
[0028]此外，如本文中所使用的，熱循環(huán)可包括例如使用熱循環(huán)儀，等溫擴(kuò)增，熱對流，紅外介導(dǎo)熱循環(huán)，或解旋酶擴(kuò)增。在一些實施方式中，芯片可與內(nèi)置式加熱元件集成。在各實施方式中，芯片可與半導(dǎo)體集成。
[0029]例如，根據(jù)各實施方式，目標(biāo)檢測可為(但不限于)熒光檢測、正或負(fù)離子檢測、pH值檢測、電壓檢測、或電流檢測，或其組合。
[0030]本文中描述的各實施方式具體適用于數(shù)字PCR(dPCR)。在數(shù)字PCR中，包含較少量的目標(biāo)多核苷酸序列或目標(biāo)核苷酸序列的溶液可分成大量的小測試樣本，從而每個樣本基本包含目標(biāo)核苷酸序列的一個分子或不包含目標(biāo)核苷酸序列。當(dāng)將樣本隨后在PCR協(xié)議，程序或?qū)嶒炛袩嵫h(huán)時，包含目標(biāo)核苷酸序列的樣本被擴(kuò)增并產(chǎn)生正的檢測信號，而不包含目標(biāo)核苷酸序列的樣本沒有被擴(kuò)增并且不產(chǎn)生檢測信號。使用泊松統(tǒng)計，原始溶液中目標(biāo)核苷酸序列的數(shù)量可與產(chǎn)生正檢測信號的樣本數(shù)量相關(guān)聯(lián)。根據(jù)本教導(dǎo)的各實施方式，正檢測和負(fù)檢測可通過擴(kuò)增質(zhì)量指示符來確定或驗證。
[0031]
[0032]在各實施方式中，基底可具有多個樣本區(qū)或反應(yīng)點，其被配置成用于接收多個樣本，其中反應(yīng)點可通過位于反應(yīng)點和熱覆蓋件(heated cover) 210之間的蓋密封在基底中。樣本保持器的一些示例可包括(但不限于)多孔板(如標(biāo)準(zhǔn)的微量滴定96孔板、384孔板、微型卡、通孔陣列)或基本平的保持器(如玻璃片或塑料片)。樣本保持器的各實施方式中的反應(yīng)點可包括以形成在樣本保持器基底的表面上規(guī)則或不規(guī)則的陣列圖案化的凹穴、凹陷、脊?fàn)钔黄?、及其組合。
[0033]根據(jù)本教導(dǎo)的各實施方式，每個反應(yīng)點可具有約1.3納升的體積?？商娲?，每個反應(yīng)點的體積可小于1.3納升。這可通過例如減小反應(yīng)點104的直徑和/或樣本保持器的厚度來實現(xiàn)。例如，每個反應(yīng)點104可具有小于或等于I納升、小于或等于100微微升、小于或等于30微微升、或小于或等于10微微升的體積。在其他實施方式中，一些或全部反應(yīng)點104的體積為I納升到20納升。
[0034]在一些實施方式中，反應(yīng)點為通孔。在這些示例中，每個通孔具有約1.3納升的體積?？商娲?，每個通孔的體積可小于1.3納升。這可通過例如減小通孔的直徑和/或樣本保持器基底的厚度實現(xiàn)。例如，每個通孔可具有小于或等于I納升、小于或等于100微微升、小于或等于30微微升、或者小于或等于10微微升的體積。在其他實施方式中，一些或全部通孔的體積為I納升至20納升。
[0035]在各實施方式中，反應(yīng)點104的密度可為至少100個反應(yīng)點每平方毫米。在其他實施方式中，可能具有反應(yīng)點的更高密度。例如，芯片100內(nèi)的反應(yīng)點104的密度可大于或等于150個反應(yīng)點每平方毫米、大于或等于200個反應(yīng)點每平方毫米、大于或等于500個反應(yīng)點每平方毫米、大于或等于1000個反應(yīng)點每平方毫米、大于或等于10000個反應(yīng)點每平方毫米。
[0036]在一些實施方式中，反應(yīng)點為通孔。因此，樣本保持器基底內(nèi)的通孔的密度可大于或等于150個通孔每平方毫米、大于或等于200個通孔每平方毫米、大于或等于500個通孔每平方毫米、大于或等于1000個通孔每平方毫米、大于或等于10，000個通孔每平方毫米。
[0037]圖1示出根據(jù)各實施方式的標(biāo)記有兩個標(biāo)識符的基底100。多個樣本可包括在用于在一個基底100上進(jìn)行測試的反應(yīng)點區(qū)102中。反應(yīng)點區(qū)102示出為陣列。在其他示例中，反應(yīng)點區(qū)可包括一個樣本。在一些實施方式中，多個基底100可以位于用于測試的系統(tǒng)中。例如，兩個、四個、或二十個基底100可放置在用于測試的儀器系統(tǒng)中。在一些實施方式中，測定成分也可與樣本一起預(yù)裝載至反應(yīng)點中。
[0038]圖1所示的實施方式中的機(jī)器可讀標(biāo)識符為條形碼104和字母數(shù)字代碼106。然而，應(yīng)認(rèn)識到，根據(jù)本文中描述的實施方式，機(jī)器可讀標(biāo)識符可以是例如條形碼、文本、數(shù)字、QR碼、或其他符號，及其任何組合。還應(yīng)當(dāng)注意，字母數(shù)字標(biāo)識符也是人類可讀的，并且可相對于機(jī)器讀取的結(jié)果進(jìn)行驗證。
[0039]計算機(jī)實施的系統(tǒng)
[0040]根據(jù)本文中描述的實施方式，檢測和處理標(biāo)識符的方法可在計算機(jī)系統(tǒng)中實施。
[0041]本領(lǐng)域技術(shù)人員將認(rèn)識到，各實施方式的操作可使用硬件、軟件、固件或其組合(視情況而定)來實施。例如，一些處理可使用處理器或軟件、固件或硬連線邏輯控制下的其他數(shù)字電路來執(zhí)行。(術(shù)語“邏輯”在本文中是指如由本領(lǐng)域技術(shù)人員所認(rèn)識到的能夠執(zhí)行上述功能的固定的硬件，可編程邏輯和/或其適當(dāng)?shù)慕M合)。軟件和固件可存儲在非瞬態(tài)計算機(jī)可讀介質(zhì)上。一些其他過程可使用模擬電路來實現(xiàn)，這對本領(lǐng)域普通技術(shù)人員來說是眾所周知的。此外，存儲器或其他存儲裝置，以及通信部件也可使用在本發(fā)明的實施方式中。
[0042]圖2是示出了根據(jù)各實施方式的可用于執(zhí)行處理功能的計算機(jī)系統(tǒng)200的框圖。執(zhí)行實驗的儀器可與示例性計算系統(tǒng)200連接。根據(jù)各實施方式，可能使用的儀器為圖2的熱循環(huán)儀系統(tǒng)200或圖3的熱循環(huán)儀系統(tǒng)300。計算系統(tǒng)200可包括一個或多個處理器(如處理器204)。例如，處理器204可使用通用或?qū)Ｓ锰幚硪?如微處理器、控制器或其他控制邏輯)實施。在該示例中，處理器204與總線202或其他通信介質(zhì)連接。
[0043]此外，應(yīng)當(dāng)理解，圖2的計算系統(tǒng)200可以任何形式實施，如對于給定應(yīng)用或環(huán)境可能是期望的或恰當(dāng)?shù)臋C(jī)架式計算機(jī)、大型機(jī)、超級計算機(jī)、服務(wù)器、客戶機(jī)、臺式計算機(jī)、筆記本電腦、平板計算機(jī)、手持式計算設(shè)備(例如，PDA、蜂窩電話、智能電話、掌上電腦等)，集群網(wǎng)格(cluster grid)，上網(wǎng)本，嵌入式系統(tǒng)，或任何其他類型的專用或通用計算設(shè)備)。此外，計算系統(tǒng)200可包括傳統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)或與LIS/LIMS設(shè)施的集成，其中傳統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)包括客戶機(jī)/服務(wù)器環(huán)境和一個或多個數(shù)據(jù)庫服務(wù)器。大量傳統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)在本領(lǐng)域是已知的，包括局域網(wǎng)(LAN)或廣域網(wǎng)(WAN)，并且包括無線和/或有線部件。此外，客戶機(jī)/服務(wù)器環(huán)境、數(shù)據(jù)庫服務(wù)器和網(wǎng)絡(luò)在本領(lǐng)域被充分記載。根據(jù)本文中描述的各實施方式，計算系統(tǒng)200可配置成與分布式網(wǎng)絡(luò)中的一個或多個服務(wù)器連接。計算系統(tǒng)200可從分布式網(wǎng)絡(luò)接收信息或更新。計算系統(tǒng)200還可傳輸將存儲在分布式網(wǎng)絡(luò)中的信息，該信息可由與分布式網(wǎng)絡(luò)連接的其他客戶機(jī)訪問。
[0044]計算系統(tǒng)200可包括總線202或用于傳送信息的其他通信機(jī)構(gòu)，并且處理器204與總線202聯(lián)接以處理信息。
[0045]計算系統(tǒng)200還包括與總線202聯(lián)接用于存儲將由處理器204執(zhí)行的指令的存儲器206，該存儲器可以是隨機(jī)訪問存儲器(RAM)或其他動態(tài)存儲器。存儲器206還可用于在執(zhí)行將由處理器204執(zhí)行的指令期間存儲臨時變量或其他中間信息。計算系統(tǒng)200還包括與總線202聯(lián)接用于存儲處理器204的靜態(tài)信息和指令的只讀存儲器(ROM) 208或其他靜態(tài)存儲設(shè)備。
[0046]計算系統(tǒng)200還可包括存儲設(shè)備210，如磁盤、光盤、或固態(tài)驅(qū)動器(SSD)，其被提供并聯(lián)接至總線202用于存儲信息和指令。存儲設(shè)備210可包括介質(zhì)驅(qū)動器和可移動存儲接口。介質(zhì)驅(qū)動器可包括支持固定的或可移動的存儲介質(zhì)的驅(qū)動器或其他機(jī)構(gòu)，如硬盤驅(qū)動器、軟盤驅(qū)動器、磁帶驅(qū)動器、光盤驅(qū)動器、CD或DVD驅(qū)動器(R或RW)、閃盤驅(qū)動器或其他可移動的或固定的介質(zhì)驅(qū)動器。如這些示例所示，存儲介質(zhì)可包括計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，該存儲介質(zhì)中存儲有具體的計算機(jī)軟件、指令或數(shù)據(jù)。
[0047]在可替代性實施方式中，存儲設(shè)備210可包括其他類似的媒介用于允許計算機(jī)程序或其他指令或數(shù)據(jù)加載到計算系統(tǒng)200中。這種媒介可包括例如允許將軟件和數(shù)據(jù)從存儲設(shè)備210傳送至計算機(jī)系統(tǒng)200的可移動存儲單元和接口，如程序盒式存儲器和盒式存儲器接口，可移動存儲器(例如，閃速存儲器或其他可移動存儲模塊)和存儲器插槽，以及其他可移動存儲單元和接口。
[0048]計算系統(tǒng)200還可包括通信接口 218。通信接口 218可用于允許軟件和數(shù)據(jù)在計算系統(tǒng)200和外部設(shè)備之間傳送。通信接口 218的示例可包括調(diào)制解調(diào)器、網(wǎng)絡(luò)接口(如以太網(wǎng)或其他NIC卡)、通信端口(例如，USB端口、RS-232C串行端口)、PCMCIA插槽和PCMCIA卡、藍(lán)牙等。通過通信接口 218傳送的軟件和數(shù)據(jù)可以是能夠由通信接口 218接收的電子的、電磁的、光學(xué)的和其他信號的形式。這些信號可由通信接口 218通過諸如無線介質(zhì)、導(dǎo)線或電纜、光纖、或其他通信介質(zhì)的通道發(fā)送和接收。通道的一些示例包括電話線、蜂窩電話鏈路、RF鏈路、網(wǎng)絡(luò)接口、局域網(wǎng)或廣域網(wǎng)、以及其他通信通道。
[0049]計算系統(tǒng)200可通過總線202聯(lián)接至顯示器212 (如陰極射線管(CRT)或液晶顯示器(IXD))，其中顯示器212用于為計算機(jī)用戶顯示信息。例如，包括字母數(shù)字鍵和其他鍵的輸入設(shè)備214與總線202聯(lián)接，以為處理器204傳遞信息和命令選擇。輸入設(shè)備還可以是配置有觸摸屏輸入能力的顯示器(如IXD顯示器)。另一種用戶輸入設(shè)備是光標(biāo)控制裝置216，如用于為處理器204傳遞方向信息和命令選擇以及用于控制光標(biāo)在顯示器212上移動的鼠標(biāo)、軌跡球或光標(biāo)方向鍵。該輸入設(shè)備通常具有在兩個軸線上的兩個自由度(第一軸線(例如，x)和第二軸線(例如，y))從而允許設(shè)備指定面中的位置。計算系統(tǒng)200提供數(shù)據(jù)處理并提供該數(shù)據(jù)的置信水平。與本教導(dǎo)的實施方式的某些實施符合的，數(shù)據(jù)處理和置信度由計算系統(tǒng)200提供以響應(yīng)處理器204執(zhí)行包含在存儲器206中的一個或多個指令的一個或多個序列。該指令可從另一個計算機(jī)可讀介質(zhì)(如存儲設(shè)備210)讀入存儲器206。執(zhí)行包含在存儲器206中的指令序列導(dǎo)致處理器204執(zhí)行本文中描述的過程?？商娲?，硬連線電路可用于代替軟件指令或與軟件指令組合，以實施本教導(dǎo)的實施方式。因此本教導(dǎo)的實施方式的實施不限于硬件電路和軟件的任何具體組合。
[0050]本文中使用的術(shù)語“計算機(jī)可讀介質(zhì)”和“計算機(jī)程序產(chǎn)品”通常是指涉及向處理器204提供用于執(zhí)行的一個或多個序列或一個或多個指令的任何介質(zhì)。當(dāng)執(zhí)行時，通常被稱為“計算機(jī)程序代碼”的該指令(其可以以計算機(jī)程序的形式或其他分組的形式分組)使計算系統(tǒng)200能夠執(zhí)行本發(fā)明的實施方式的特征和功能。非瞬態(tài)計算機(jī)可讀介質(zhì)的這些和其他形式可包括但不限于非易失性介質(zhì)、易失性介質(zhì)和傳輸介質(zhì)。非易失性介質(zhì)包括例如固態(tài)盤、光盤或磁盤，如存儲設(shè)備210。易失性介質(zhì)包括動態(tài)存儲器，如存儲器206。傳輸介質(zhì)包括同軸線纜、銅線、及光纖，包括包含總線202的電線。
[0051]計算機(jī)可讀介質(zhì)的常見形式包括例如軟盤(floppy disk)、軟盤(flexibledisk)、硬盤、磁帶、或任何其他磁性介質(zhì)、CD-ROM、任何其他光學(xué)介質(zhì),穿孔卡、紙帶、任何其他具有孔圖案的物理介質(zhì)、RAM、PROM、和EPROM、FLASH-EPR0M、或任何其他存儲器芯片或盒式存儲器、如下所述的載波、或者計算機(jī)可讀取的任何其他介質(zhì)。
[0052]各種形式的計算機(jī)可讀介質(zhì)可涉及向處理器204運送用于執(zhí)行的一個或多個指令的一個或多個序列。例如，該指令最初可攜帶在遠(yuǎn)程計算機(jī)的磁盤上。遠(yuǎn)程計算機(jī)可將該指令加載到其動態(tài)存儲器中并使用調(diào)制解調(diào)器通過電話線路發(fā)送該指令。計算系統(tǒng)200的本地調(diào)制解調(diào)器可接收電話線路上的數(shù)據(jù)并使用紅外發(fā)射器將信號轉(zhuǎn)換為紅外信號。與總線202聯(lián)接的紅外檢測器可接收紅外信號中攜帶的數(shù)據(jù)并將該數(shù)據(jù)放置在總線202上?？偩€202將該數(shù)據(jù)運送至存儲器206，處理器204從存儲器206獲取指令并執(zhí)行指令。由存儲器206接收的指令可選地在由處理器204執(zhí)行之前或執(zhí)行之后存儲在存儲設(shè)備210上。
[0053]應(yīng)當(dāng)理解的是，為了清楚起見，以上描述參考不同的功能單元和處理器對本發(fā)明的實施方式進(jìn)行描述。然而，顯而易見的是，可使用不同的功能單元、處理器或域之間的任何合適的功能分布而不偏離本發(fā)明。例如，上述的將由單獨的處理器或控制器執(zhí)行的功能可由同一處理器或控制器執(zhí)行。因此，參考具體的功能單元僅應(yīng)視為參考合適的裝置，以提供所描述的功能性，而不是指示嚴(yán)格的邏輯或物理結(jié)構(gòu)或組織。
[0054]PCR 儀器
[0055]如上所述，根據(jù)各實施方式可使用的儀器為(但不限于)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)儀器。圖3是示出可實施本教導(dǎo)的實施方式的示例性儀器的框圖。PCR儀器300可包括放置在多個樣本312上方的熱覆蓋件310，該多個樣本312包含在基底(未示出)中。在各實施方式中，基底可以是具有多個樣本區(qū)的玻璃片或塑料片，樣本區(qū)在其與熱覆蓋件310之間具有覆蓋件。基底的一些示例可包括(但不限于)多孔板(例如標(biāo)準(zhǔn)的微量滴定96孔板、384孔板)、或微型卡、或基本平的支承件(如玻璃片或塑料片)?；椎母鲗嵤┓绞街械姆磻?yīng)點可包括形成在基底的表面上規(guī)則或不規(guī)則的陣列圖案化的凹穴、凹陷、脊?fàn)钔黄?、及其組合。PCR儀器的各實施方式包括樣本塊314、用于加熱和冷卻的元件316、熱交換器318、控制系統(tǒng)320和用戶接口 322。根據(jù)本教導(dǎo)的熱塊組件的各實施方式包括圖3中PCR儀器300的部件314-318。
[0056]實時PCR儀器300具有光學(xué)系統(tǒng)324。在圖3中，光學(xué)系統(tǒng)324可具有發(fā)射電磁能的照射源(未示出)、光學(xué)傳感器、檢測器、或成像器(未示出)，用于從基底中的樣本312接收電磁能、和用于將電磁能從每個DNA樣本導(dǎo)引至成像器的光學(xué)器件340。對于圖3中PCR儀器200和圖3中實時PCR儀器300的實施方式，控制系統(tǒng)320可用于控制檢測系統(tǒng)、熱覆蓋件、以及熱塊組件的功能?？刂葡到y(tǒng)320可通過圖3中的實時PCR儀器300和圖3中的PCR儀器300的用戶接口 322由終端用戶訪問。另外，如圖2所示的計算機(jī)系統(tǒng)200可用于提供圖3的PCR儀器300的控制功能以及用戶接口功能。此外，圖2的計算機(jī)系統(tǒng)200可提供數(shù)據(jù)處理、顯示和報告準(zhǔn)備功能。所有這些儀器控制功能可本地地專用于PCR儀器，或者圖2的計算機(jī)系統(tǒng)200可提供對下面將更詳細(xì)討論的控制、分析、以及報告功能的部分或全部的遠(yuǎn)程控制。
[0057]已為了說明和描述的目的，提供了本教導(dǎo)的各實施的以下描述。該描述不是詳盡的并且不使本教導(dǎo)限于公開的具體形式。根據(jù)上述教導(dǎo)，可進(jìn)行修改和變型，或者可以通過實現(xiàn)本教導(dǎo)來獲得修改和變型。此外，所描述的實施包括軟件，但是本教導(dǎo)可實施為硬件和軟件的組合或僅以硬件實現(xiàn)。本教導(dǎo)可利用面向?qū)ο蠛头敲嫦驅(qū)ο缶幊滔到y(tǒng)實施。
[0058]用于成像的光學(xué)系統(tǒng)
[0059]圖4示出了根據(jù)本文中描述的實施方式用于成像的示例性光學(xué)系統(tǒng)400。應(yīng)認(rèn)識至|J，光學(xué)系統(tǒng)400為示例性光學(xué)系統(tǒng)，而且本領(lǐng)域的技術(shù)人員將認(rèn)識到其他光學(xué)系統(tǒng)可用于使關(guān)注對象成像。如本文中描述的，根據(jù)各實施方式，關(guān)注對象可以是基底。例如，包括在相機(jī)404中的光學(xué)傳感器402可使關(guān)注對象410成像。例如，關(guān)注對象可以是包括用于測定的樣本的基底、陣列芯片、或多個陣列芯片。光學(xué)傳感器402可以是CCD傳感器以及相機(jī)404可以是(XD相機(jī)。此外,光學(xué)傳感器包括相機(jī)透鏡406。
[0060]取決于關(guān)注對象，根據(jù)各實施方式，發(fā)射濾光器408被選擇以使關(guān)注對象410成像。在其他實施方式中，發(fā)射濾光器408可改變?yōu)槭箯年P(guān)注對象發(fā)射的熒光發(fā)射成像。
[0061]光學(xué)系統(tǒng)400可使反射光源412使關(guān)注對象410成像。來自光源412的光可在由分束器420反射至關(guān)注對象410之前通過非球面體414、聚焦器/分散器416、和激發(fā)濾光器418而被濾光。光學(xué)系統(tǒng)400還可包括場透鏡422。
[0062]圖像
[0063]如上所述，如圖4所示的光學(xué)系統(tǒng)400可使關(guān)注對象成像。關(guān)注對象可以是基底?；卓梢允窍钠?，如陣列芯片(如圖1所示)。如圖5所示，關(guān)注對象還可以是多個基底。在圖5所示的示例性圖像500中，四個基底502、504、506、和508包括在圖像500中。應(yīng)認(rèn)識到，根據(jù)本文中描述的各實施方式，圖像可包括一個或多個對象。每個基底包括兩個標(biāo)識符。例如，基底502由標(biāo)識符510和標(biāo)識符512標(biāo)出。如上所述，例如，標(biāo)識符可以是符號、字母數(shù)字代碼、或條形碼。在圖像500中，基底502具有作為字母數(shù)字碼的標(biāo)識符510和作為條形碼的標(biāo)識符512。根據(jù)其他實施方式，例如，被成像的對象可包括這樣的標(biāo)識符，其為符號、字母數(shù)字碼、或條形碼的任意組合。
[0064]在光學(xué)傳感器402 (圖4)使包括標(biāo)識符(如條形碼)的至少一個對象成像之后，圖像被分析以讀取該標(biāo)識符。例如，與掃描方法相反，利用該圖像讀取條形碼標(biāo)識符。
[0065]標(biāo)識符可用于識別對象或基底上包括的測定。與標(biāo)識符相關(guān)聯(lián)的測定類型可存儲在數(shù)據(jù)庫或存儲器(如存儲器206 (圖2))中。如果對象利用兩個標(biāo)識符標(biāo)記，根據(jù)本文中描述的實施方式，每個標(biāo)識符可被獨立地確定。在這種情況下，每個標(biāo)識符確定可通過確定另一標(biāo)示符是否是相關(guān)聯(lián)來進(jìn)行驗證。標(biāo)識符關(guān)聯(lián)可存儲在計算機(jī)系統(tǒng)200的存儲器206(圖2)中。在其他實施方式中，在確定圖像中多個基底的標(biāo)識符和相關(guān)聯(lián)的測定類型之后，可確定在同一運行中測試的測定類型的兼容性。
[0066]例如，如果基底502,504,506和508將在PCR儀器300 (圖3)中被測試，在根據(jù)圖像500 (圖5)識別基底502、504、506和508之后，處理器204 (圖2)可確定與基底502、504,506和508相關(guān)聯(lián)的測定類型是否兼容。
[0067]此外，如果不能讀取圖像500中的任何標(biāo)識符，這可能指示基底不位于正確的位置。如果系統(tǒng)不能識別基底，然后系統(tǒng)向用戶指示不正確的定位或不正確的基底，例如在用戶接口 322 (圖3)上顯示指示。
[0068]圖6示出根據(jù)本文中描述的實施方式的識別關(guān)注對象的示例性方法600的流程圖。如圖2所示，方法600的步驟可由處理器204實施。此外，由處理器204執(zhí)行該方法的指令可存儲在存儲器206中。
[0069]參照圖6，在步驟602中，關(guān)注對象可被成像。該關(guān)注對象包括兩個標(biāo)識符。這兩個標(biāo)識符與關(guān)注對象一起成像。如上所述，關(guān)注對象可利用光學(xué)系統(tǒng)400成像。響應(yīng)于關(guān)注對象的成像，生成圖像數(shù)據(jù)。圖像數(shù)據(jù)可存儲在存儲器206中(圖2)。
[0070]確定關(guān)注對象在圖像內(nèi)的位置
[0071 ] 參照圖6，在步驟604中，關(guān)注對象可定位在光學(xué)傳感器的視場中。此外，還如上所述，根據(jù)本文中描述的教導(dǎo)的實施方式，關(guān)注對象可以是基底。通過適當(dāng)?shù)囟ㄎ魂P(guān)注對象，圖像中的指示符將位于圖像上的期望位置。因此，可在期望位置分析圖像，以讀取該指示符。預(yù)期位置可處于關(guān)注區(qū)域(ROI)中。
[0072]指示符的期望位置可進(jìn)一步通過確定圖像中參考點來確定。根據(jù)各實施方式，圖像內(nèi)關(guān)注對象的中心由圖像分析技術(shù)確定。通過已知關(guān)注對象的參考點和尺寸,可搜索標(biāo)識符在圖像內(nèi)的期望位置和其他標(biāo)志。
[0073]關(guān)注對象的位置可由處理器204(圖2)確定。樣本區(qū)102(圖1)可用于確定R0I。例如，樣本區(qū)102可包括孔。更具體地，因為關(guān)注對象的尺寸和指示符在關(guān)注對象上的位置均預(yù)先確定，所以樣本區(qū)可用于確定R0I，在ROI中可在圖像中搜索指示符。ROI可以呈諸如矩形的形狀，在該矩形中可預(yù)期在圖像中找到指示符。這樣，處理器204可執(zhí)行指令分析圖像數(shù)據(jù)，以讀取指示符。
[0074]返回參照圖6，在步驟606中，在關(guān)注對象上標(biāo)出的標(biāo)識符被確定。也就是說，標(biāo)識符被讀取，以使關(guān)注對象可被識別。
[0075]讀取標(biāo)識符
[0076]如上所述，指示符可以是條形碼。ROI內(nèi)的圖像數(shù)據(jù)由處理器204處理或分析。條形碼數(shù)據(jù)根據(jù)ROI內(nèi)的圖像數(shù)據(jù)來確定。圖7示出了成像的條形碼的示例。條形碼數(shù)據(jù)可通過在圖像中尋找條形碼的暗區(qū)和明區(qū)來確定。在一些實施方式中，可過濾圖像數(shù)據(jù)，以更清楚地限定條形碼的暗區(qū)和明區(qū)。
[0077]暗區(qū)和明區(qū)可通過本領(lǐng)域技術(shù)人員公知的取樣與過濾方法確定。圖像數(shù)據(jù)為暗區(qū)域還是明區(qū)域的決定可通過與預(yù)先確定的閾值進(jìn)行對比來確定。也就是說，條形碼的間隔和條被測量。
[0078]測量暗區(qū)和明區(qū)，并且可讀取條形碼。從關(guān)注對象中識別出條形碼之后，可確定與條形碼相關(guān)聯(lián)的數(shù)據(jù)。標(biāo)識符數(shù)據(jù)其相關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)存儲在存儲器206中。相關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)可包括試驗類型或其他信息(如樣本數(shù)據(jù))。
[0079]如上所述，指示符可以是字母數(shù)字代碼或其他符號。例如，可能的字母數(shù)字字符或符號的模板可存儲為二進(jìn)制圖像存儲在數(shù)據(jù)庫或存儲器206中。
[0080]可對圖像進(jìn)行預(yù)處理，以更清楚地創(chuàng)建限定的暗區(qū)和明區(qū)。例如，可確定包括字母數(shù)字指示符的圖像數(shù)據(jù)的灰度級。當(dāng)灰度級低于某個閾值級時，圖像數(shù)據(jù)可被確定為明區(qū)。為了示出預(yù)處理的效果，圖8A示出了預(yù)處理之前的字母數(shù)字字符。圖SB示出了預(yù)處理之后的字母數(shù)字字符。
[0081]如上所述，字母數(shù)字指示符可包括在ROI中。ROI內(nèi)的圖像數(shù)據(jù)被解析并可生成每個字符的二進(jìn)制圖。因此，所確定的二進(jìn)制圖可與存儲的字母數(shù)字字符模板進(jìn)行比較。可通過在存儲的模板中尋找匹配來確定每個字符。，字母數(shù)字代碼可以這種方式讀取。如果指示符是符號，則該符號可以相似的方式確定。
[0082]在確定了兩個指示符的結(jié)果之后，每個指示符結(jié)果可利用另一指示符結(jié)果驗證。也就是說，所確定的指不符應(yīng)與另一確定的指不符的同一關(guān)注對象相關(guān)聯(lián)。
[0083]此外，如上所述，如在步驟608中(圖6)，指示符識別關(guān)注對象或基底。測定類型可被識別。如果其他基底包括在系統(tǒng)中用于測試，可比較每個基底的測定類型，以檢查兼容性。如果確定基底不應(yīng)與其他基底運行，可在用戶接口上將錯誤指示符顯示給用戶。
[0084]圖9示出了根據(jù)讀取關(guān)注對象上的兩個標(biāo)識符的示例性工作程。此外，下面描述了根據(jù)各實施方式的兩個工作流示例。
[0085]從客戶機(jī)軟件(桌面)或儀器IXD面板:
[0086]I)用戶調(diào)用開始運行操作。
[0087]2)系統(tǒng)提示用戶輸入用于將被運行的基底的條形碼。
[0088]3)用戶物理地將四個基底加載到儀器中。
[0089]4)用戶從軟件調(diào)用“讀取條形碼”操作。
[0090]選擇A—用戶從軟件啟動開始OA運行工作流:
[0091]先決條件:
[0092]-用戶將至多四個基底加載至儀器
[0093]-用戶將實驗文件、模板文件或設(shè)置文件保存至軟件中的默認(rèn)文件位置
[0094]1.軟件創(chuàng)建基底運行對象
[0095]2.儀器捕獲所有基底的多個CXD圖像，其包括每個被加載芯片上的條形碼和字母數(shù)字代碼
[0096]3.對于每個基底圖像:
[0097]a.獲取條形碼區(qū)域并分析圖像以確定條形碼
[0098]b.獲取字母數(shù)字代碼區(qū)域并分析圖像以確定字母數(shù)字代碼
[0099]c.確定條形碼結(jié)果和字母數(shù)字結(jié)果
[0100]d.利用字母數(shù)字代碼結(jié)果驗證條形碼結(jié)果
[0101]e.從用于字母數(shù)字代碼的默認(rèn)文件位置檢索實驗文件
[0102]f.如果沒有找到實驗文件，從用于字母數(shù)字代碼的默認(rèn)文件位置檢索運行設(shè)置文件
[0103]g.如果發(fā)現(xiàn)運行設(shè)置文件，來自運行設(shè)置文件的唯一命名的協(xié)議被確定并查詢/檢索相關(guān)聯(lián)的運行協(xié)議
[0104]h.用戶可手動瀏覽/選擇用于基底的可替代性實驗文件、運行設(shè)置文件或模板文件
[0105]1.用戶可手動瀏覽/選擇用于基底的樣本設(shè)置文件
[0106]j.系統(tǒng)獲取用于基底的實驗文件名；用戶可手動更改文件名
[0107]4.應(yīng)用運行協(xié)議至OA運行對象
[0108]5.用戶調(diào)用開始OA運行操作
[0109]6.基于兼容性，驗證用于每個被加載OA的存在的實驗文件和運行協(xié)議
[0110]a.錯誤處理條件
[0111]7.對于每個被加載基底，利用以下信息創(chuàng)建/更新實驗文件:
[0112]a.運行協(xié)議
[0113]b.對孔位置的測定分配
[0114]c.對孔位置的樣本分配
[0115]8.開始OA運行命令A(yù)PI運行
[0116]選擇S—用戶從IXD面板啟動開始基底運行工作流:
[0117]先決條件:
[0118]-用戶將四個基底加載至儀器
[0119]-用戶將實驗文件或模板文件保存至儀器中的默認(rèn)文件位置
[0120]1.固件創(chuàng)建基底運行對象
[0121]2.儀器捕獲所有基底的多個CXD圖像，包括每個被加載芯片上的條形碼和芯片ID
[0122]3.對于每個芯片圖像:
[0123]a.獲取條形碼區(qū)域并分析圖像以確定條形碼
[0124]b.獲取字母數(shù)字代碼區(qū)域并分析圖像以確定字母數(shù)字代碼
[0125]c.返回條形碼結(jié)果和字母數(shù)字結(jié)果
[0126]d.利用字母數(shù)字代碼結(jié)果驗證條形碼結(jié)果
[0127]e.為字母數(shù)字代碼檢索來自默認(rèn)文件位置的實驗文件
[0128]f.用戶可手動瀏覽/選擇用于基底的可替代性實驗文件或模板文件
[0129]g.獲取用于基底的實驗文件名；用戶可手動更改文件名
[0130]4.為基底運行對象獲取運行協(xié)議
[0131]5.用戶調(diào)用開始基底運行操作
[0132]6.驗證用于每個被加載基底的存在的實驗文件和運行協(xié)議的兼容性
[0133]a.錯誤處理條件
[0134]7.對于每個被加載基底，利用以下信息創(chuàng)建/更新實驗文件:
[0135]a.運行協(xié)議
[0136]b.對孔位置的測定分配
[0137]c.對孔位置的樣本分配
[0138]8.固件開始基底運行
[0139]因此，根據(jù)以上描述，本公開的一些示例包括:
[0140]在一個示例中，提供了用于識別第一關(guān)注對象的計算機(jī)實施的方法，其中第一關(guān)注對象包括樣本部分和兩個標(biāo)識符。該方法包括:使包括兩個標(biāo)識符的第一關(guān)注對象成像，其中該成像的步驟生成第一組圖像數(shù)據(jù)；確定第一關(guān)注對象在光學(xué)傳感器的視場中的位置；從第一組成像數(shù)據(jù)確定兩個標(biāo)識符；以及基于兩個標(biāo)識符，識別第一關(guān)注對象。
[0141]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，權(quán)利要求1的計算機(jī)實施的方法還包括:使第二關(guān)注對象成像，其中第二關(guān)注對象包括兩個標(biāo)識符，其中該成像的步驟生成第二組圖像數(shù)據(jù)；確定第二基底在光學(xué)傳感器的視場中的位置，其中第二基底包括兩個標(biāo)識符和樣本部分；確定第二基底的兩個標(biāo)識符；以及基于第二關(guān)注對象的兩個標(biāo)識符，識別第二基底。
[0142]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，第一關(guān)注對象和第二關(guān)注對象為第一基底和第二基底。
[0143]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，計算機(jī)實施的方法還包括:確定在同一樣本運行中測試第一基底和第二基底的兼容性。
[0144]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，兩個標(biāo)識符之一為字母數(shù)字代碼。
[0145]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，兩個標(biāo)識符之一為條形碼。
[0146]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，識別的步驟包括:基于兩個標(biāo)識符中的每個獨立地驗證第一基底。
[0147]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，定位的步驟是基于位于光學(xué)傳感器的視場的預(yù)定區(qū)域內(nèi)的至少一個標(biāo)識符。
[0148]在其他示例中，提供了計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，該存儲介質(zhì)編碼有指令，該指令可由處理器執(zhí)行并用于識別第一關(guān)注對象，其中第一關(guān)注對象包括樣本部分和兩個標(biāo)識符。指令包括:用于使包括兩個標(biāo)識符的第一關(guān)注對象成像的指令，其中使包括兩個標(biāo)識符的第一關(guān)注對象成像生成第一組圖像數(shù)據(jù)；用于確定第一關(guān)注對象在光學(xué)傳感器的視場中的位置的指令；用于從第一組圖像數(shù)據(jù)確定兩個標(biāo)識符的指令；以及用于基于兩個標(biāo)識符識別第一關(guān)注對象的指令。
[0149]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，指令還包括:用于使第二關(guān)注對象成像的指令，其中第二關(guān)注對象包括兩個標(biāo)識符，以及使第二關(guān)注對象成像生成第二組圖像數(shù)據(jù)；用于確定第二基底在光學(xué)傳感器的視場中的位置的指令，其中第二基底包括兩個標(biāo)識符和樣本部分；用于確定第二基底的兩個標(biāo)識符的指令；以及用于基于第二關(guān)注對象的兩個標(biāo)識符識別第二基底的指令。
[0150]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，第一關(guān)注對象和第二關(guān)注對象為第一基底和第二基底。
[0151]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，計算機(jī)可讀介質(zhì)還包括用于確定在同一樣本運行中測試第一基底和第二基底的兼容性的指令。
[0152]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，兩個標(biāo)識符之一為字母數(shù)字代碼。
[0153]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，兩個標(biāo)識符之一為條形碼。
[0154]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，基于兩個標(biāo)識符識別第一關(guān)注對象包括:基于兩個標(biāo)識符中的每個獨立地驗證第一基底。
[0155]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，確定第一關(guān)注對象在光學(xué)傳感器的視場中的位置是基于位于光學(xué)傳感器的視場的預(yù)定區(qū)域中的至少一個標(biāo)識符。
[0156]在另一不例中，提供了用于識別第一基底的系統(tǒng)，其中第一基底包括兩個標(biāo)識符和樣本部分。該系統(tǒng)包括:處理器；存儲器，該存儲器編碼有指令，該指令可由處理器執(zhí)行并且包括:用于使包括兩個標(biāo)識符的第一關(guān)注對象成像的指令，其中使包括兩個標(biāo)識符的第一關(guān)注對象成像生成第一組圖像數(shù)據(jù)；用于確定第一關(guān)注對象在光學(xué)傳感器的視場中的位置的指令；用于從第一組圖像數(shù)據(jù)確定兩個標(biāo)識符的指令；以及用于基于兩個標(biāo)識符識別第一關(guān)注對象的指令。
[0157]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，兩個標(biāo)識符之一為字母數(shù)字代碼。
[0158]此外或可替代地，在上文公開的一個或多個示例中，兩個標(biāo)識符之一條形碼。
[0159]雖然已根據(jù)某些示例性實施方式、示例和應(yīng)用描述了本發(fā)明，但是對于本領(lǐng)域技術(shù)人員顯而易見的是，可進(jìn)行各種修改和改變而不背離本發(fā)明。
【權(quán)利要求】
1.用于識別第一關(guān)注對象的計算機(jī)實施的方法，其中所述第一關(guān)注對象包括兩個標(biāo)識符和樣本部分，所述計算機(jī)實施的方法包括: 使包括所述兩個標(biāo)識符的所述第一關(guān)注對象成像，其中該成像的步驟生成第一組圖像數(shù)據(jù)； 確定所述第一關(guān)注對象在光學(xué)傳感器的視場中的位置； 從所述第一組圖像數(shù)據(jù)確定所述兩個標(biāo)識符；以及 基于所述兩個標(biāo)識符，識別所述第一關(guān)注對象。
2.如權(quán)利要求1所述的計算機(jī)實施的方法，還包括: 使第二關(guān)注對象成像，其中所述第二關(guān)注對象包括兩個標(biāo)識符，以及該使第二關(guān)注對象成像的步驟生成第二組圖像數(shù)據(jù)； 確定第二基底在所述光學(xué)傳感器的視場中的位置，其中所述第二基底包括兩個標(biāo)識符和樣本部分； 確定所述第二基底的兩個標(biāo)識符；以及 基于所述第二關(guān)注對象的兩個標(biāo)識符，識別所述第二基底。
3.如權(quán)利要求2所述的計算機(jī)實施的方法，其中所述第一關(guān)注對象和所述第二關(guān)注對象為第一基底和第二基底。
4.如權(quán)利要求2所述的計算機(jī)實施的方法，還包括: 確定在同一樣本運行中測試所述第一基底和所述第二基底的兼容性。
5.如權(quán)利要求1所述的計算機(jī)實施的方法，其中所述兩個標(biāo)識符之一為字母數(shù)字代碼。
6.如權(quán)利要求1所述的計算機(jī)實施的方法，其中所述兩個標(biāo)識符之一為條形碼。
7.如權(quán)利要求1所述的計算機(jī)實施的方法，其中識別的步驟包括:基于所述兩個標(biāo)識符中的每個獨立地驗證所述第一基底。
8.如權(quán)利要求1所述的計算機(jī)實施的方法，其中定位的步驟是基于位于所述光學(xué)傳感器的視場的預(yù)定區(qū)域內(nèi)的至少一個所述標(biāo)識符進(jìn)行的。
9.計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，所述計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)編碼有指令，所述指令可由處理器執(zhí)行并用于識別第一關(guān)注對象，其中所述第一關(guān)注對象包括兩個標(biāo)識符和樣本部分，所述指令包括: 用于使包括所述兩個標(biāo)識符的所述第一關(guān)注對象成像的指令，其中使包括所述兩個標(biāo)識符的所述第一關(guān)注對象成像生成第一組圖像數(shù)據(jù)； 用于確定所述第一關(guān)注對象在光學(xué)傳感器的視場中的位置的指令； 用于從所述第一組圖像數(shù)據(jù)確定所述兩個標(biāo)識符的指令；以及 用于基于所述兩個標(biāo)識符識別所述第一關(guān)注對象的指令。
10.如權(quán)利要求9所述的計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，其中所述指令還包括: 用于使第二關(guān)注對象成像的指令，其中所述第二關(guān)注對象包括兩個標(biāo)識符，以及使第二關(guān)注對象成像生成第二組圖像數(shù)據(jù)； 用于確定第二基底在所述光學(xué)傳感器的視場中的位置的指令，其中所述第二基底包括兩個標(biāo)識符和樣本部分； 用于確定所述第二基底的兩個標(biāo)識符的指令；以及 用于基于所述第二關(guān)注對象的兩個標(biāo)識符識別所述第二基底的指令。
11.如權(quán)利要求10所述的計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，其中所述第一關(guān)注對象和所述第二關(guān)注對象為第一基底和第二基底。
12.如權(quán)利要求10所述的計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，還包括: 確定在同一樣本運行中測試所述第一基底和所述第二基底的兼容性。
13.如權(quán)利要求9所述的計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，其中所述兩個標(biāo)識符之一為字母數(shù)字代碼。
14.如權(quán)利要求9所述的計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，其中所述兩個標(biāo)識符之一為條形碼。
15.如權(quán)利要求9所述的計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，其中基于所述兩個標(biāo)識符識別所述第一關(guān)注對象包括:基于所述兩個標(biāo)識符中的每個獨立地驗證所述第一基底。
16.如權(quán)利要求9所述的計算機(jī)可讀存儲介質(zhì)，其中確定所述第一關(guān)注對象在光學(xué)傳感器的視場中的位置是基于位于所述光學(xué)傳感器的視場的預(yù)定區(qū)域中的至少一個所述標(biāo)識符進(jìn)行的。
17.用于識別第一基底的系統(tǒng)，其中所述第一基底包括兩個標(biāo)識符和樣本部分，所述系統(tǒng)包括: 處理器；以及 存儲器，編碼有指令，所述指令可由所述處理器執(zhí)行并且包括: 用于使包括所述兩個標(biāo)識符的所述第一關(guān)注對象成像的指令，其中使包括所述兩個標(biāo)識符的所述第一關(guān)注對象成像生成第一組圖像數(shù)據(jù)； 用于確定所述第一關(guān)注對象在光學(xué)傳感器的視場中的位置的指令； 用于從所述第一組圖像數(shù)據(jù)確定所述兩個標(biāo)識符的指令；以及 用于基于所述兩個標(biāo)識符識別所述第一關(guān)注對象的指令。
18.如權(quán)利要求17所述的系統(tǒng)，其中所述兩個標(biāo)識符之一為字母數(shù)字代碼。
19.如權(quán)利要求17所述的系統(tǒng)，其中所述兩個標(biāo)識符之一為條形碼。
【文檔編號】G01N35/00GK104395759SQ201280058512
【公開日】2015年3月4日 申請日期:2012年9月28日 優(yōu)先權(quán)日:2011年9月30日
【發(fā)明者】大衛(wèi)·方特斯丘, 沈明, 蘇文亮, 弗朗西斯·T·程 申請人:生命技術(shù)公司