[0070] 采用凍干稀釋液對噬菌體MS2懸液進行稀釋,稀釋成Ct值約18-20的噬菌體溶 液,分裝于0. 6mLEP管中,每管120uL,轉入-80°C冰箱預凍過夜,然后用西蒙的真空冷凍干 燥機進行凍干(型號為FD5-3),條件為-50°C,0. 2mTorr。5小時后即可收獲,-20°C冷凍保 存。
[0071] 6、均勻性測試
[0072] 取_20°C保存的噬菌體MS2內標質控品10管用200uL樣本稀釋液稀釋,震蕩混勻, 離心后各取50uL進行熒光RT-PCR檢測,并作統(tǒng)計分析,評估噬菌體MS2內標質控品的均勻 性。
[0073] 7、穩(wěn)定性測試
[0074] 不同時間點取_20°C保存的噬菌體MS2內標質控品3管進行熒光RT-PCR測定,并 進行統(tǒng)計分析各取樣時間點的噬菌體MS2內標質控品的穩(wěn)定性;前8個月每隔兩個月取樣 一次,后8個月每隔一個月取樣一次,并進行熒光RT-PCR測定,統(tǒng)計分析。
[0075] 實施例2 :大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品的均勻性測試
[0076] 取_20°C保存的實施例1制備的噬菌體MS2的標準品9管用200uL樣本稀釋液稀 釋,震蕩混勻離心后各取50uL進行熒光RT-PCR檢測,檢測體系與方法同實施例1,并進行統(tǒng) 計分析,評估噬菌體MS2內標質控品的均勻性,實驗結果見附圖2,數據整理如下表:
[0077]
[0078] 采用相對標準偏差即變異系數來評價均勻性,用CV表示:
[0079] 平均值X= (Ctl+Ct2+Ct3+· · · ·+Ct9)/9
[0080]標準差:α
[0081]
[0082] 式中η為檢驗總數
[0083] CV=標準差/平均值=1. 2%
[0084] 結果表明CV< 5%,各管之間差異不顯著,均勾性良好。
[0085] 實施例3 :大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品的穩(wěn)定性分析
[0086] 不同時間點取_20°C保存的實施例1制備的噬菌體MS2內標質控品3管進行熒光 RT-PCR測定,檢測體系與方法同實施例1,并進行統(tǒng)計分析各取樣時間點的噬菌體MS2內標 質控品的穩(wěn)定性;前8個月每隔兩個月取樣一次,后8個月每隔一個月取樣一次,并進行熒 光RT-PCR測定,統(tǒng)計分析。結果見下表:
[0087]
[0088] 大腸桿菌噬菌體MS2的RT-PCR檢測Ct值的回歸方差分析結果見下表:
[0089]
[0090] F值小于F臨界值,表明各取樣時間點的噬菌體MS2內標質控品的變化差異不明 顯,-20°C保存,16個月內MS2內標質控品的穩(wěn)定性良好,故其保質期定為12個月是可行的。
[0091] 實施例4 :大腸桿菌菌體MS2內標質控品的一個應用實例
[0092] 1、樣品材料及儀器設備:
[0093] 腸道病毒71型核酸檢測試劑盒(RT-PCR-熒光探針法):廣東和信健康科技有限 公司;0. 6ml離心管,移液器吸頭,離心機(配0. 6ml轉子或適配器),推薦使用進口離心管 和帶濾芯移液器吸頭進行操作,檢測過程中勿使用帶熒光物質的一次性乳膠手套。
[0094] 待檢樣本:5株EV71的臨床分離株,廣州呼吸疾病研究所;
[0095] 內標:實施例1制備的大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品,
[0096] 陰性對照品:超純水
[0097] 強陽性對照品:滅活腸道病毒71型的凍干品,Ct值在18-21之間;
[0098] 臨界陽性對照品:滅活腸道病毒71型的凍干品,Ct值在27-30之間;
[0099] 核酸提取試劑,RT-PCR的擴增體系以及引物與探針同實施例1。
[0100] 2、核酸提取:
[0101] 提取前準備:用樣本稀釋液分別將EV71強陽性對照品、EV71臨界陽性對照品、RNA 內標(噬菌體MS2)稀釋至200μL,稀釋后為凍干前的濃度,Ct值基本保持不變,混勻并短 暫離心,備用。
[0102] 試劑盒中各組分(除TaqDNA聚合酶和M-MLV反轉錄酶)充分解凍并混勻。
[0103] 所有步驟均在室溫下進行,離心機的溫度設定在25°C。詳細操作過程如下:
[0104] (1)取200μ1核酸提取液A于η(η=樣本數+3個外標質控品)個0· 6ml離心管 中,每管加入5μ1內標(陰性對照不用加內標);
[0105] (2)每管分別加入待檢樣本、陰性對照品、強陽性對照品、臨界陽性對照品各 50μ1,作好標記,充分混勻并短暫離心,室溫靜置3分鐘;
[0106] (3)每管加入200μ1核酸提取液Β,充分混勻,13000rpm離心10分鐘,吸棄上清;
[0107] (4)每管加入200μ1核酸提取液C,顛倒數次混勻,13000rpm離心5分鐘,吸棄上 清,開蓋在室溫或55 °C放置2~5分鐘,晾干;
[0108] (5)每管加入25μ1樣本稀釋液,蓋上管蓋,用手指彈管底部或振蕩器震蕩,使核 酸充分溶解,短暫離心使液體全部落于管底部,冰上或4°C放置,用于RT-PCR檢測。
[0109] 3、RT_PCR擴增:
[0110] RT-PCR擴增包括腸道病毒71型基因和內標基因擴增反應。
[0111] (1)配液(在試劑準備區(qū)進行):取出擴增反應液,室溫融化后充分混勻,短暫離 心,并按反應個數η(η=樣本數+3個外標質控品)分別取反應液和酶按照以下配比配置反 應液:
[0112]
[0113] 計算好各試劑用量,加入適當體積于一支離心管中,充分混勻,短暫離心,然后按 20μ1/管分裝到透明PCR八排管或96孔PCR反應板中,轉移至樣本處理區(qū);
[0114] (2)加樣(在樣本處理區(qū)進行):分別加入5μ1步驟2中處理好的待測樣本或對 照品,蓋好管蓋(透明平蓋),轉移至核酸擴增區(qū);
[0115] (3)RT-PCR擴增(在核酸擴增區(qū)進行):
[0116] 將反應管/板置于ABIPrism7500全自動熒光定量PCR儀樣品槽中。熒光素 FAM/R0X同時勾選,FAM熒光指示腸道病毒71型,R0X熒光指示內標。熒光采集為55°C。 Instrument窗口設置條件如下:
[0117]
[0118]
[0119] 4、結果分析
[0120] 結果判定標準:
[0121]
[0122] 檢測結果:
[0123] 五株EV71病毒檢測結果:Ct彡35. 00,熒光增幅明顯,有典型S型曲線,為陽性 (圖3),MS2Ct彡35. 00,增幅明顯,為陽性(圖4),滿足作為內標質控品的要求。
[0124] 以上所述實施例的各技術特征可以進行任意的組合,為使描述簡潔,未對上述實 施例中的各個技術特征所有可能的組合都進行描述,然而,只要這些技術特征的組合不存 在矛盾,都應當認為是本說明書記載的范圍。
[0125] 以上所述實施例僅表達了本發(fā)明的幾種實施方式,其描述較為具體和詳細,但并 不能因此而理解為對發(fā)明專利范圍的限制。應當指出的是,對于本領域的普通技術人員來 說,在不脫離本發(fā)明構思的前提下,還可以做出若干變形和改進,這些都屬于本發(fā)明的保護 范圍。因此,本發(fā)明專利的保護范圍應以所附權利要求為準。
【主權項】
1. 一種大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品的制備方法,其特征在于,包括以下步驟: (1) 宿主菌的制備:挑大腸桿菌ATCC 15597菌種接種在固體培養(yǎng)基上培養(yǎng);再挑取單 菌落接種至液體培養(yǎng)基中,擴大培養(yǎng),得到含宿主菌的培養(yǎng)液; (2) 噬菌體MS2單克隆的制備:挑噬菌體MS2用雙層瓊脂平板培養(yǎng)法培養(yǎng)18-24小時, 再挑取單個噬菌斑至含宿主菌的液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)20-24h,得到含噬菌體MS2的培養(yǎng)液; (3) 噬菌體MS2的擴大培養(yǎng):將步驟(1)制備的含宿主菌的培養(yǎng)液接種到液體培養(yǎng)基 中,培養(yǎng)4-5小時,得到細菌培養(yǎng)液,再將步驟(2)制備的含噬菌體MS2的培養(yǎng)液接種到細 菌培養(yǎng)液中,培養(yǎng)過夜,取培養(yǎng)液離心,收集上清液,過濾即得到純化的噬菌體MS2懸液; (4) 噬菌體MS2的分析檢測:取步驟(3)制備的噬菌體MS2用熒光RT-PCR法檢測Ct 值,并用雙層瓊脂法測效價; (5) 噬菌體MS2內標質控品的制備:用凍干稀釋液將噬菌體懸液稀釋至Ct值為18-20, 分裝于離心管中,真空冷凍干燥,將所得凍干品冷凍保存。2. 根據權利要求1所述的大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品的制備方法,其特征在于, 步驟(4)所述熒光RT-PCR法檢測Ct值針對噬菌體MS2的擴增引物為SEQ ID NO: 4和SEQ ID N0:5〇3. 根據權利要求1所述的大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品的制備方法,其特征在于,步 驟(4)所述熒光RT-PCR法檢測Ct值針對噬菌體MS2的探針為SEQ ID NO: 6。4. 根據權利要求1-3任一項所述的大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品的制備方法,其特 征在于,步驟(5)所述凍干稀釋液為含有質量分數為0.8-1. 2%的牛血清白蛋白和體積分 數為45-55%的吐溫20的水溶液。5. 根據權利要求1-3任一項所述的大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品的制備方法,其特 征在于,步驟(5)所述真空冷凍干燥的溫度為-50°C,壓力為0.2mT 〇rr,所述冷凍保存的溫 度為_20°C。6. -種大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品,其特征在于,由權利要求1-5任一項所述的制 備方法制備而成。7. 權利要求6所述的大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品在RNA病原體的熒光RT-PCR檢 測過程中作為內標質控品的應用。8. -種RNA病原體熒光RT-PCR檢測試劑盒,其特征在于,包含檢測試劑和內標質控品, 所述內標質控品為權利要求6所述的大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品。
【專利摘要】本發(fā)明涉及一種大腸桿菌噬菌體MS2內標質控品的制備方法、應用和試劑盒,該方法制備的噬菌體MS2內標質控品可作為在RNA病原體的熒光RT-PCR核酸檢測試劑盒的內標質控物質,在RNA病原體的RT-PCR檢測中能夠準確地監(jiān)控整個實驗過程,以此可作為評判實驗是否成功的標準。該方法制備的噬菌體MS2內標質控品有很好的穩(wěn)定性,易保存(凍干保存時間≥1年),方便運輸,安全性高,作為內標質控品可真正做到從樣本處理到擴增的全程質量檢測。
【IPC分類】C12Q1/70, C12N7/00, C12Q1/68
【公開號】CN105238765
【申請?zhí)枴緾N201510729592
【發(fā)明人】崔紅, 李哲群, 商興芳, 吳秋保, 曾家琨
【申請人】廣州呼研所生物技術有限公司, 廣東和信健康科技有限公司
【公開日】2016年1月13日
【申請日】2015年10月29日